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准噶尔双峰驼dgat1基因外显子8序列生物信息学分析

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黑龙江畜牧兽医 2022年第21期 122-126,141,142页

作者：姚怀兵马强李玲闫慧郝泽林岳海涛王玉琢马英俊毋状元汪亮陈钢粮杨洁华实新疆大学生命科学与技术学院/新疆生物资源基因工程重点实验室乌鲁木齐830046 黑龙江省畜牧总站哈尔滨150069 新疆旺源万驼园有限公司新疆阿勒泰836500 新疆阿勒泰地区畜牧兽医站新疆阿勒泰836500 新疆旺源生物科技集团有限公司新疆阿勒泰836500 新疆畜牧科学院奶业研究所乌鲁木齐830000

为了研究准噶尔双峰驼二酰基甘油酰基转移酶1(diacylgycerol acyltransferase 1,dgat1)基因外显子8编码区的理化性质与结构,以及为寻找与双峰驼泌乳性状相关的分子遗传标记提供基础资料,试验对准噶尔双峰驼dgat1基因外显子8进行PCR扩增... 详细信息

为了研究准噶尔双峰驼二酰基甘油酰基转移酶1(diacylgycerol acyltransferase 1,dgat1)基因外显子8编码区的理化性质与结构,以及为寻找与双峰驼泌乳性状相关的分子遗传标记提供基础资料,试验对准噶尔双峰驼dgat1基因外显子8进行PCR扩增,利用生物信息学方法对dgat1蛋白结构、理化性质及信号肽、跨膜位置等进行分析,并比较了准噶尔双峰驼与其他物种dgat1氨基酸序列的进化关系。结果表明:准噶尔双峰驼dgat1基因外显子8扩增产物大小为421 bp,编码484个氨基酸,有1个保守域,位于62~468位氨基酸处。dgat1蛋白属于亲水性蛋白,且为不稳定的非经典分泌蛋白。二级结构中,α-螺旋占48.35%,延伸链占14.46%,β-转角占4.13%,无规则卷曲占33.06%,存在9个蛋白跨膜结构区域。骆驼科的双峰驼、单峰驼和野骆驼的dgat1蛋白独立成支,与牛dgat1蛋白的分子进化距离相距较远。准噶尔双峰驼dgat1基因外显子8序列及蛋白质结构与牛dgat1蛋白卷曲方式、立体空间结构方面基本一致。说明dgat1基因在物种间变异不大。

关键词：双峰驼 dgat1基因外显子8 蛋白质生物信息学分析

沙棘GPD1和dgat1双基因载体的构建及表达验证

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东北林业大学学报 2023年第7期51卷 10-14页

作者：赵思阳阮成江丁健卢顺光温秀凤胡建忠大连民族大学大连116600 水利部沙棘开发管理中心

为了提高沙棘种子的品质,选取大连民族大学校园内的沙棘‘实优1号’的种子为研究对象,用野生型拟南芥(Col-0)作为目的基因的转化受体,以沙棘种子油脂合成关键基因GPD1和dgat1为载体,通过In-fusion连接技术构建HrGPD1和Hrdgat1基因双价... 详细信息

为了提高沙棘种子的品质,选取大连民族大学校园内的沙棘‘实优1号’的种子为研究对象,用野生型拟南芥(Col-0)作为目的基因的转化受体,以沙棘种子油脂合成关键基因GPD1和dgat1为载体,通过In-fusion连接技术构建HrGPD1和Hrdgat1基因双价表达载体pCGD,采用农杆菌蘸花法获取转基因拟南芥植株,利用甲酯化和氯仿甲醇法对和野生型的拟南芥植株种子进行脂肪酸不同组份的比例及含油率检测。结果表明:拟南芥转基因2代与野生型相比,拟南芥2代种子油酸、亚油酸的比例分别提高了46.70%和9.35%,但种子含油率未明显提高。因此,同时表达沙棘HrGPD1和Hrdgat1基因提高了油酸、亚油酸含量,为高油酸沙棘优良品种的培育和改良提供了基因材料。

关键词：沙棘 GPD1基因 dgat1基因双基因载体异源表达

崂山奶山羊dgat1基因多态性及与泌乳性状的关系

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中国农业科学 2010年第22期43卷 4717-4724页

作者：王桂芝李成渤秦孜娟王建民戈新赵金山李培培王建华山东农业大学动物科技学院青岛市畜牧兽医研究所

【目的】探讨崂山奶山羊dgat1基因与泌乳性状的关系。【方法】以175只崂山奶山羊泌乳母羊为试验群体,利用PCR-SSCP方法和候选基因直接测序法检测dgat1-P1(包含第8外显子)、dgat1-P2(5’调控区内)、dgat1-P3和dgat1-P4位点在该群体中的... 详细信息

【目的】探讨崂山奶山羊dgat1基因与泌乳性状的关系。【方法】以175只崂山奶山羊泌乳母羊为试验群体,利用PCR-SSCP方法和候选基因直接测序法检测dgat1-P1(包含第8外显子)、dgat1-P2(5’调控区内)、dgat1-P3和dgat1-P4位点在该群体中的多态性,并采用最小二乘方法分析dgat1-P4位点多态性与泌乳性状之间的关联效应。【结果】崂山奶山羊dgat1-P1和dgat1-P2位点不存在多态性。对崂山奶山羊高乳脂率和低乳脂率个体的dgat1-P3位点核苷酸序列比对,发现在序列600bp处即DAGT1-P4位点上存在着A→G的单核苷酸替换,对乳脂率有显著影响(P基因型为崂山奶山羊乳脂率性状最有利的基因型,A等位基因对乳脂率性状有正效应。【结论】在崂山奶山羊中发现候选基因dgat1存在多态性,且对乳脂率性状有显著效应,为开展崂山奶山羊的标记辅助选择提供了依据。

关键词：崂山奶山羊 dgat1基因泌乳量乳脂率乳蛋白率

牛dgat1基因K232A取代对3个品种奶牛群体部分经济性状的影响(英文)

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西北农林科技大学学报（自然科学版） 2006年第9期34卷 6-10,16页

作者：徐秀容高雪许尚忠张英汉李俊雅任红艳西北农林科技大学动物科技学院陕西杨凌712100 中国农业科学院畜牧研究所北京100094

利用单链构向多态性方法检测了牛dgat1基因第8外元AA→GC碱基突变,分析了该突变在三河牛、中国荷斯坦奶牛和中国西门塔尔奶牛中等位基因的分布频率,以及该突变对这3个品种奶牛群体产奶量、乳脂和乳蛋白含量的影响,并分析了该突变在鲁西... 详细信息

利用单链构向多态性方法检测了牛dgat1基因第8外元AA→GC碱基突变,分析了该突变在三河牛、中国荷斯坦奶牛和中国西门塔尔奶牛中等位基因的分布频率,以及该突变对这3个品种奶牛群体产奶量、乳脂和乳蛋白含量的影响,并分析了该突变在鲁西牛、晋南牛、秦川牛和南阳牛中等位基因分布频率。结果表明,编码赖氨酸的等位基因K在三河牛、中国荷斯坦牛和中国西门塔尔牛中的分布频率分别为0.17,0.33和0.04,在鲁西牛、晋南牛、秦川牛和南阳牛4个中国地方品种中的分布频率分别为0.72,0.39,0.46和0.83;K232A取代与三河牛的平均乳脂率相关(P=0.017),KK和KA基因型个体的平均乳脂率分别较AA基因型个体高0.80%和0.41%。

关键词： dgat1基因奶牛 K232A取代

水牛dgat1基因第17外显子多态性及其与乳成分含量的关联性分析

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云南农业大学学报 2013年第2期25卷 190-195页

作者：孟莉陈立苗永旺张永云赵素梅霍金龙李卫真云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南省红河州蒙自市期路白乡农业服务中心云南蒙自661199 云南农业大学农科专业基础实验教学示范中心云南昆明650201

二酰甘油酰基转移酶1(dgat1)在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛dgat1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛(F1:摩拉水牛×德宏水牛)的第17外... 详细信息

二酰甘油酰基转移酶1(dgat1)在乳脂合成过程中发挥重要作用,但水牛dgat1基因第17外显子遗传多态性及其与产奶性状的关联性还不清楚。本文采用PCR-SSCP结合DNA测序方法对48头德宏水牛和93头产奶杂交水牛(F1:摩拉水牛×德宏水牛)的第17外显子进行了多态性检测并结合乳成分数据进行了关联分析。在水牛dgat1基因第17外显子发现1个SNP位点,即c.1350C>G,其为同义替换。该SNP位点在德宏乳用和非乳用水牛中群体遗传组成相近,且不同基因型个体间的乳糖率、乳脂率及乳蛋白率无显著差异(P>0.05)。表明该SNP对水牛乳糖率、乳脂率及乳蛋白率等无显著影响。序列比对显示,水牛、普通牛、瘤牛、山羊和绵羊dgat1基因第17外显子间仅存在1个编码氨基酸差异,揭示其具有较高的保守性。

关键词：水牛 dgat1基因外显子17 SNPs 多态性

油桐dgat1基因在不同品种及种子发育阶段的表达模式

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中南林业科技大学学报 2014年第10期34卷 61-64页

作者：刘凯梁国校杨麒韦秋思梁文汇广西林业科学研究院广西南宁530002 天峨县林业局广西天峨547300 广西国营雅长林场广西百色452600

应用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR)技术,研究了油桐dgat1在不同品种以及种子不同发育阶段的表达模式。结果表明:dgat1在6个不同品种成熟种子中的相对表达量差异不明显,这种表达量与种仁含油率相关性也不明显。在油桐‘ZN... 详细信息

应用实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR)技术,研究了油桐dgat1在不同品种以及种子不同发育阶段的表达模式。结果表明:dgat1在6个不同品种成熟种子中的相对表达量差异不明显,这种表达量与种仁含油率相关性也不明显。在油桐‘ZN L-F52’种子不同发育阶段中,dgat1均有表达,在6、7、10月份表达量较低,而在8、9月份表达量高,相对表达量呈上调趋势,这与油桐种仁油脂形成规律相符合,说明该基因可能与油桐油脂合成调控有着密切的关系。

关键词：油桐 dgat1基因不同品种及种子表达模式实时定量PCR技术

紫苏dgat1基因克隆及四尾栅藻表达载体构建

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生物技术通报 2014年第5期30卷 137-141页

作者：王莹莹刘玉姬妍茹张正海周广麒刘宇峰大连工业大学生物工程学院大连116034 黑龙江省科学院大庆分院大庆163319

利用RNAiso Plus试剂盒提取紫苏总RNA,以其为模板采用RT-PCR方法扩增出紫苏dgat1基因的cDNA编码区序列并构建克隆载体pMD-dgat1,再将克隆载体pMD-dgat1和pBI121空载体进行Xba I和BamH I双酶切,连接目的片段构建表达载体pBI121-dgat1。... 详细信息

利用RNAiso Plus试剂盒提取紫苏总RNA,以其为模板采用RT-PCR方法扩增出紫苏dgat1基因的cDNA编码区序列并构建克隆载体pMD-dgat1,再将克隆载体pMD-dgat1和pBI121空载体进行Xba I和BamH I双酶切,连接目的片段构建表达载体pBI121-dgat1。结果显示,克隆得到目的片段长度为1 657 bp,与GenBank中紫苏dgat1基因序列的最大同源性为97%,所构建表达载体pBI121-dgat1双酶切得到的两条片段长度与连接前一致。结果表明,成功转化四尾栅藻并得到表达,转化后四尾栅藻的油脂含量较转化前提高近1倍。

关键词：四尾栅藻 dgat1基因克隆表达载体构建

水牛dgat1基因第8外显子群体遗传特征分析

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西南农业学报 2012年第3期25卷 1101-1105页

作者：熊飞李卫真刘丽仙袁峰李大林苗永旺云南农业大学动物科学技术学院云南昆明650201 云南农业职业技术学院畜牧兽医系云南昆明650212 云南省家畜改良工作站云南昆明650225 云南巴福乐水牛技术研究所云南昆明650021

为了阐明河流型和沼泽型水牛dgat1基因的第8外显子的群体遗传差异和特征,采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序技术对11个水牛群体402份样品进行了群体变异检测,并结合GenBank数据库上已发表的牛科物种dgat1基因序列进行了比较分析。结果显示... 详细信息

为了阐明河流型和沼泽型水牛dgat1基因的第8外显子的群体遗传差异和特征,采用PCR-SSCP和PCR产物直接测序技术对11个水牛群体402份样品进行了群体变异检测,并结合GenBank数据库上已发表的牛科物种dgat1基因序列进行了比较分析。结果显示,河流型和沼泽型水牛dgat1基因第8外显子序列一致,序列全长为75 bp;与普通奶牛序列相比,河流型和沼泽型水牛dgat1基因第8外显子都为K等位基因,揭示其与水牛的高乳脂率、低泌乳量有关。序列比对发现K等位基因在牛科物种中普遍存在。本研究结果揭示了水牛中dgat1基因第8外显子的遗传特征,可为其奶用性状选育利用提供遗传背景资料。

关键词：水牛 dgat1基因 PCR-SSCP K232A变异

牛dgat1基因的K232A取代等位基因分布频率及对部分胴体性状的影响

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中国农业大学学报 2006年第4期11卷 11-15页

作者：徐秀容高雪许尚忠张英汉任红艳西北农林科技大学杨凌712100 中国农业科学院畜牧研究所北京100094

为研究肉牛与体脂相关的胴体性状的数量性状座位,利用单链构象多态性方法检测了牛dgat1基因K232A取代的2个等位基因K和A在实验群体中的分布频率,并分析了基因型对4个肉牛群体部分胴体性状的影响。结果表明,编码赖氨酸的等位基因K在地方... 详细信息

为研究肉牛与体脂相关的胴体性状的数量性状座位,利用单链构象多态性方法检测了牛dgat1基因K232A取代的2个等位基因K和A在实验群体中的分布频率,并分析了基因型对4个肉牛群体部分胴体性状的影响。结果表明,编码赖氨酸的等位基因K在地方黄牛品种鲁西牛、晋南牛、秦川牛和杂交牛利木赞牛×鲁西牛群体中的分布频率分别为0.75、0.39、0.40和0.35,在南阳牛中的分布频率最高,为0.83。在本研究中,牛dgat1基因的K232A取代对背膘厚度(P=0.88)、大理石花纹等级(P=0.13)和肌内脂肪(P=0.19)没有显著影响,但与腔油重/胴体重、嫩度显著相关,KK型和KA个体外脊肌肉剪切力低于AA型个体(P=0.037),而腔油重/胴体重明显高于AA型(P=0.045),而且KK型个体有更高的净肉率(P=0.018)。研究显示,编码赖氨酸的等位基因K在鲁西牛和南阳牛中分布频率高于秦川牛和晋南牛及已经报道的国外牛种,牛dgat1基因的K232A只与腔油重/胴体重、嫩度和净肉率相关。该实验相关性分析结果还有待在更大的群体中验证。

关键词： dgat1基因肉牛 SSCP 胴体性状