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DBEST：一个实用的故障诊断专家系统开发工具

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微型计算机 1995年第6期15卷 34-37页

作者：陈兆乾赵京虎

本文介绍了一个基于故障诊断领域的专家系统开发工具ＤＢＥＳＴ的设计与实现。它在Ｗｉｎｄｏｗｓ环境下将多种知识表示方法和多种故障推理策略融为一体，是快速高效开发实用故障诊断专家系统的强有力的工具。文中着重介绍了模糊关系矩... 详细信息

本文介绍了一个基于故障诊断领域的专家系统开发工具ＤＢＥＳＴ的设计与实现。它在Ｗｉｎｄｏｗｓ环境下将多种知识表示方法和多种故障推理策略融为一体，是快速高效开发实用故障诊断专家系统的强有力的工具。文中着重介绍了模糊关系矩阵的知识表示，知识获取和推理方法。

关键词：故障诊断 DBEST 专家系统人工智能

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DBEST中基于模糊关系矩阵的推理

微型计算机 1996年第6期16卷 21-23页

作者：陈兆乾谢琪南京大学计算机科学与技术系

在故障诊断专家系统开发工具ＤＢＥＳＴ中运用模糊关系矩阵提出了一种模糊性知识的表示及推理方法，并且开发成功两个实用的故障专家系统，本文重点介绍了模糊关系矩阵的推理。

关键词：模糊关系矩阵故障诊断专家系统 DBEST

基于表达序列标签数据库(DBEST)的电子克隆技术

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黑龙江畜牧兽医 2003年第4期 19-19页

作者：于浩刘娣杨秀芹东北农业大学动物科技学院黑龙江哈尔滨150030

传统的克隆cDNA的方法是采用克隆原位杂交筛选cDNA文库或是利用基因特异引物(GSP)进行cDNA末端快速扩增(RACE),其特点是费时费力、花费高、成功率低.随着基因组测序和生物信息学技术的迅猛发展,尤其是国际联合序列数据库(Genbank+EMBL+D... 详细信息

传统的克隆cDNA的方法是采用克隆原位杂交筛选cDNA文库或是利用基因特异引物(GSP)进行cDNA末端快速扩增(RACE),其特点是费时费力、花费高、成功率低.随着基因组测序和生物信息学技术的迅猛发展,尤其是国际联合序列数据库(Genbank+EMBL+DDBJ)中的序列数目与日俱增,因此,基于DBEST的电子克隆(in silico cloning)技术在CDNA克隆方面与传统的方法相比具有事倍功半的优势.随着EST数据库的进一步完善,电子克隆已成为克隆新基因的主要方法之一.

关键词：表达序列标签数据库 DBEST 电子克隆技术

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基于断点检测的延安市植被动态变化研究

基于断点检测的延安市植被动态变化研究

作者：季烨云中国林业科学研究院

学位级别：硕士

黄土高原位于黄河中游地区,是世界上水土流失最为严重的区域之一。延安市是黄土高原的中心部分,水土流失严重、生态环境脆弱,但自三北防护林、天然林资源保护、退耕还林还草等工程实施以来,该区域生态环境得到了明显改善。为了探究其植... 详细信息

黄土高原位于黄河中游地区,是世界上水土流失最为严重的区域之一。延安市是黄土高原的中心部分,水土流失严重、生态环境脆弱,但自三北防护林、天然林资源保护、退耕还林还草等工程实施以来,该区域生态环境得到了明显改善。为了探究其植被变化及影响因素,本文利用2000-2019年Landsat TM/ETM+/OLI生长季遥感影像构建逐年NDVI最大值时间序列,采用断点检测算法DBEST发现植被的变化时间,并利用GF-1PMS遥感影像对不同类型的变化进行验证;建立了基于断点检测的多阶段时间趋势分析方法,对延安市植被变化时空分布特征进行了研究;采用相关、偏相关分析方法对气温降水数据和NDVI的关系进行探究。论文主要结论如下:(1)DBEST算法能够很好地检测出延安市NDVI时间序列的断点变化时间与变化类型,准确率分别达到91.67%和81.67%。断点的时空分布特征结果表明,植被发生变化的年份多在2012年之前,持续时间基本在1-4年之间;发生突变的区域极少,呈现变化幅度高的特点,且多是下降的态势,主要位于各县城区以及河流道路沿线;发生渐变的区域占主体,多处于上升态势,桥山和梁山两大天然林区上升幅度低于北部地区及洛河河谷上升幅度。(2)断点检测结果表明,延安62.47%的区域在研究期间发生明显的趋势变化,植被变化整体呈改善趋势。对该区域进行多阶段趋势分析,以断点及其变化结束时间划分时间序列并分段,最长时间段作为第一趋势段,若存在大于5年的第二长时间段则作为第二趋势段。延安市植被的多阶段趋势表明,第一趋势中,改善分布于大部分区域,且持续时间多长达16年以上,北部及中部改善程度较大;退化区域共占约3.26%,东南部分退化程度较轻。35.27%的区域无第二趋势且主要分布于北部和洛河河谷地区,在较长一段时间内植被保持稳定;27.20%的区域存在第二趋势。第二趋势中,植被基本不变和改善的区域主要位于延安市中部地区,趋势变化主要开始于2000或2014年,持续时长6-7年;植被退化区域趋势变化开始时间为2000或2013年,分布于西北吴起县边缘地区宜川、延长地区,持续时长超过7年。(3)多阶段趋势分析结果能够精确反映植被时空变化的动态趋势。对于仅存在第一趋势的区域,其第一趋势与总体趋势差别不大。对于存在第二趋势的区域,多阶段趋势分析方法可以检测出更多的趋势下降情况,而总体趋势只能得到改善或基本不变的结果。近年来延安市有林地、疏林地、灌木林地、未成林造林地均是改善情况明显,延安市生态建设工程取得了良好的效果。(4)延安市地区气候对植被变化有一定相关性,显著相关区域较小。2000-2015年降水量和年均气温因子不同的区域差异性明显,有以下变化规律。延安市整体年均气温呈平缓状态;年降水量上升趋势不显著,波动大,两者总体均由东南向西北递减,同时南部山区的降水量明显高于周围海拔低的区域。在时间尺度上,年NDVI最大值与年均气温、年降水量之间存在相关性,但相关系数均较低。在空间尺度上,不同区域气温和降水对植被的影响呈现不同相关性。年NDVI最大值分别与年均气温、年降水量呈显著相关的区域均较少,呈不显著正相关的区域面积最大。总体而言,延安市地区植被对降水更敏感。

关键词： NDVI时间序列 DBEST 多阶段趋势气候时空变化

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电子基因表达谱分析平台的建立及其应用

浙江大学学报（工学版） 2006年第2期40卷 186-191页

作者：徐静吕炳建张昊陈俭朱益民谷雪梅来茂德浙江大学病理学与病理生理学系浙江杭州310031 浙江大学计算机科学与工程学系浙江杭州310027

建立了利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)序列表达标签(EST)数据库(DBEST)电子EST构建特定组织电子基因表达谱的生物信息学分析平台,并利用该平台构建了人正常结直肠组织电子基因表达谱.从DBEST获取人正常结直肠电子EST 20 370条,利... 详细信息

建立了利用美国国立生物技术信息中心(NCBI)序列表达标签(EST)数据库(DBEST)电子EST构建特定组织电子基因表达谱的生物信息学分析平台,并利用该平台构建了人正常结直肠组织电子基因表达谱.从DBEST获取人正常结直肠电子EST 20 370条,利用自行开发的GetUni程序包,与下载于本地的人类同一基因转录子(UniGene)数据库匹配,获得了含有4 196个非冗余基因的正常结直肠组织电子基因表达谱.经在线基因组分析工具(Webgestalt)证实,表达谱中97%的基因在结直肠组织中表达,除涉及细胞生长、发育、分化、凋亡等基因外,还包括人正常结直肠功能特异性基因;3%未得到Webgestalt证实的基因经手工回溯查找,确证其EST均来自人正常结直肠.GetUni程序包是一个高效准确的高通量电子EST数据分析平台,构建的人正常结直肠组织基因表达谱将为结直肠特异性标志物的筛选提供大量数据.

关键词： DBEST UniGene 结直肠基因表达谱生物信息学 Perl 5.0 GetUni程序包

“基因电脑克隆”软件SiClone的并行优化研究与实现

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生物数学学报 2006年第4期21卷 619-626页

作者：郎显宇陆忠华迟学斌中国科学院计算机网络信息中心超级计算中心

生物信息学中,发现、鉴别新基因是承上启下的一步,它既承接了过往如“基因组测序”的工作,又是未来“后基因时代”研究的基石．“基因电脑克隆”是利用计算手段发现、鉴别新基因的方法,SiClone软件实现了“基因电脑克隆”功能．本文对Si... 详细信息

生物信息学中,发现、鉴别新基因是承上启下的一步,它既承接了过往如“基因组测序”的工作,又是未来“后基因时代”研究的基石．“基因电脑克隆”是利用计算手段发现、鉴别新基因的方法,SiClone软件实现了“基因电脑克隆”功能．本文对SiClone软件操作的数据库提出并行处理方案,并详述了基于MPI(message passing interface)平台实现的并行优化版本PSiClone．根据已得到的EST数据库,展示了软件并行版PSiClone的运行性能,试验数据库EST序列条数仅仅是NCBI(The National Center for Biotechnology Information)DBEST庞大数据库的很小部分,这也暗示我们软件的并行工作对于大数据库的比较和运算将更有应用前景．

关键词： “基因电脑克隆” “后基因时代” PSiClone NCBI DBEST EST数据库

基于EST的家蚕基因电子表达谱平台的构建及应用

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