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中华病理学杂志 2024年第6期53卷 592-597页

作者：马莉杨海浪黄山花黄丽利王淳良梅金红南昌大学第一附属医院病理科、南昌大学分子病理学研究所南昌330000 南昌大学第一附属医院泌尿外科南昌330000 南昌大学第一附属医院神经外科南昌330000

目的探讨结直肠癌中dars2的表达情况及其临床意义。方法采用生物信息学工具基因表达谱交互分析版本2(gene expression profiling interactive analysis 2,GEPIA2)分析dars2在结直肠癌组织中的表达情况。采用免疫组织化学方法检测南昌大... 详细信息

目的探讨结直肠癌中dars2的表达情况及其临床意义。方法采用生物信息学工具基因表达谱交互分析版本2(gene expression profiling interactive analysis 2,GEPIA2)分析dars2在结直肠癌组织中的表达情况。采用免疫组织化学方法检测南昌大学第一附属医院的108例结直肠癌组织和30例正常结直肠上皮组织中dars2的表达情况。以结直肠癌细胞HCT116和SW480为研究对象,通过将小干扰RNA(siRNA)或dars2过表达质粒转染到细胞中,以检测敲低和过表达dars2对细胞功能的影响。使用CCK8检测试剂盒检测dars2对结直肠癌细胞增殖能力的影响,Transwell小室迁移实验检测dars2对结直肠癌细胞迁移能力的影响,使用蛋白质免疫印迹检测结直肠癌细胞中上皮-间质转化相关蛋白的表达。结果与正常结直肠上皮组织相比,dars2在结直肠癌组织中的表达显著上调。dars2在Ⅲ~Ⅳ期结直肠癌组织表达较Ⅰ~Ⅱ期高,临床基线数据表明dars2表达与N分期、M分期和病理分期相关(Pdars2高表达的结直肠癌患者具有较低的总体生存率(Pdars2过表达质粒后细胞增殖和迁移能力均显著增强(Pdars2后,上皮相关分子E-cadherin的表达上调,而间质相关分子N-cadherin和波形蛋白的表达下调,而过表达dars2后N-cadherin和波形蛋白的表达上调、E-cadherin的表达下调。结论dars2高表达与结直肠癌进展相关,敲低dars2可以抑制细胞增殖与迁移,并影响上皮-间质转化过程。

关键词：结直肠肿瘤细胞增殖细胞迁移分析 RNA干扰 dars2

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dars2调控EGFR促进膀胱癌的EMT、迁移及侵袭

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山西医科大学学报 2024年第3期55卷 280-287页

作者：李华锋张鸿毅肖克兵杨辉赵刚刚西安医学院第一附属医院泌尿外科西安710077

目的探讨线粒体天冬氨酰-tRNA合成酶2(dars2)对膀胱癌细胞上皮间质转化(EMT)、迁移及侵袭的作用及其机制。方法利用TIMER和GEPIA数据库分析dars2在膀胱尿路上皮癌(BLCA)中的表达及其与临床病理分期的关系。RT-qPCR检测人正常膀胱上皮细... 详细信息

目的探讨线粒体天冬氨酰-tRNA合成酶2(dars2)对膀胱癌细胞上皮间质转化(EMT)、迁移及侵袭的作用及其机制。方法利用TIMER和GEPIA数据库分析dars2在膀胱尿路上皮癌(BLCA)中的表达及其与临床病理分期的关系。RT-qPCR检测人正常膀胱上皮细胞SV-HUC-1,膀胱癌细胞5637、T24和TCCSUP中dars2 mRNA水平。TCCSUP细胞分为:control组(未转染)、si-NC组(转染阴性对照siRNA)、si-dars2-1组(胞转染dars2 siRNA-1)、si-dars2组(转染dars2 siRNA-2)、si-dars2+Vector组(转染dars2 siRNA-2+空载质粒)和si-dars2+OE-EGFR组(转染dars2 siRNA-2+EGFR过表达质粒)。Western blot检测dars2,EMT标志蛋白E-cadherin、N-cadherin、Vimentin及EGFR的表达水平。Transwell侵袭和细胞划痕实验分别检测细胞侵袭能力和迁移能力。结果dars2 mRNA水平在BLCA中显著上调,并与病理分期正相关(F=3.57,P=0.0289)。与永生化人正常膀胱上皮SV-HUC-1细胞相比,dars2在5637、T24和TCCSUP膀胱癌细胞中表达水平显著升高(Pdars2组中E-cadherin表达水平显著上调(Pdars2组细胞侵袭数目和细胞迁移率显著降低(Pdars2+Vector组相比,si-dars2+OE-EGFR组E-cadherin蛋白表达水平显著下降(Pdars2通过下调EGFR表达抑制膀胱癌的EMT、侵袭及迁移。

关键词： dars2 膀胱癌 EGFR EMT 迁移侵袭

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dars2在肺腺癌中的表达及其对肿瘤增殖转移的影响

DARS2在肺腺癌中的表达及其对肿瘤增殖转移的影响

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作者：郑俊杰福建医科大学

学位级别：硕士

目的:据GLOBOCAN估计,2020年全球约有1930万新发癌症病例和1000万癌症患者死亡,其中肺癌的发病率和死亡率都位居前列。2015年的一项调查显示肺癌是中国最常见的癌症,也是癌症死亡的主要原因。肺癌对全球健康造成严重威胁,是一个重大的... 详细信息

目的:据GLOBOCAN估计,2020年全球约有1930万新发癌症病例和1000万癌症患者死亡,其中肺癌的发病率和死亡率都位居前列。2015年的一项调查显示肺癌是中国最常见的癌症,也是癌症死亡的主要原因。肺癌对全球健康造成严重威胁,是一个重大的卫生公共问题。探索肺癌的相关发病和侵袭机制,能为患者的早期诊断和治疗提供帮助。近年来,氨基酰-t RNA合成酶(Aminoacyl-t RNA Synthetase,AARS)不仅参与了多项生理过程,而且在癌症中具有重要的作用机制和临床意义。天冬氨酰-t RNA合成酶(Asp-t RNA Synthetase,Asp RS)是AARS中的一种,dars2是编码线粒体Asp RS的基因。有研究表明,dars2参与了肝癌的发生发展过程,但关于dars2与肺腺癌的相关研究甚少。因此,本课题旨在探讨dars2在肺腺癌中的表达水平,并分析dars2对肺腺癌细胞增殖、迁移和侵袭等生物学行为的影响,为肺腺癌的诊断和治疗提供新的思路与靶点。方法:1利用肿瘤免疫评估资源(Tumor Immune Estimation Resource,TIMER)数据库进行生物信息分析肿瘤组织与正常组织中dars2 m RNA的表达。2利用肿瘤基因图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库分析dars2m RNA表达水平与肺腺癌患者年龄、性别、TNM分期等临床特征的相关性。3通过使用高和低表达dars2数据集执行基因富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA),进行基因本体论(Gene Ontology,GO)功能和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析,初步探索dars2在肺腺癌中的信号通路。4通过小干扰核糖核酸(small interfering RNA,si RNA)实验下调dars2的表达并转染肺腺癌细胞A549和H1299,实时荧光定量聚合酶链式反应(quantitative Real-time Polymerase Chain Reaction,q RT-PCR)检测dars2表达水平验证干扰效率,筛选低表达稳转细胞株。5体外细胞实验采用CCK-8检测细胞增殖能力,流式细胞仪检测细胞凋亡水平,Transwell法检测细胞迁移能力和侵袭能力,验证dars2对肺腺癌生物学功能的影响。结果:1通过TIMER数据库提供的33种肿瘤数据中,发现dars2在多种癌组织中,特别是肺腺癌组织中显著高表达。2我们发现dars2的高表达与性别、TNM分期、T分期、M分期有显著相关性(P0.05)。3 GSEA分析结果显示主要显著富集在错配修复、不对称细胞分裂、染色体着丝粒区、浓缩染色体着丝粒区、DNA修复负调控、DNA复制负调控等细胞增殖相关信号通路。4 dars2敲减促进了肺腺癌细胞A549和H1299的凋亡,抑制了增殖、迁移和侵袭能力。结论:本研究发现dars2在肺腺癌组织中高表达,与患者的临床分期和转移情况相关,这提示dars2可以作为肺腺癌的一个生物学指标。GSEA分析dars2主要富集于细胞增殖等相关信号通路。体外细胞功能学实验验证了dars2敲减能显著促进肺腺癌细胞的凋亡,抑制增殖、迁移和侵袭能力,提示dars2在肺腺癌的发生发展和侵袭转移中起着重要作用。

关键词：肺腺癌 dars2 迁移侵袭

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基于生物信息学分析dars2基因在膀胱癌及泛癌中的表达和意义

基于生物信息学分析DARS2基因在膀胱癌及泛癌中的表达和意义

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作者：郭诗杰济宁医学院

学位级别：硕士

目的:dars2是编码天冬氨酰-tRNA合成酶(Asp-tRNA Synthetase,Asp RS)的基因,不仅具有催化蛋白质生物合成的经典功能,而且随着近年来更加深入的研究,已证明其参与部分肿瘤(肝癌、肺腺癌)的演化过程。然而,目前对dars2在膀胱尿路上皮癌(Bl... 详细信息

目的:dars2是编码天冬氨酰-tRNA合成酶(Asp-tRNA Synthetase,Asp RS)的基因,不仅具有催化蛋白质生物合成的经典功能,而且随着近年来更加深入的研究,已证明其参与部分肿瘤(肝癌、肺腺癌)的演化过程。然而,目前对dars2在膀胱尿路上皮癌(Bladder Urothelial Carcinoma,BLCA)中作用的认识是有限的。因此,本研究将基于多个数据库,利用生物信息学技术初步探究dars2在BLCA患者中表达情况,分析其与多种临床变量和预后的相关性;通过基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis,GSEA)探索dars2在BLCA发生发展中的潜在调控机制;分析在BLCA中dars2的表达与肿瘤免疫微环境之间的相关性;进一步评估dars2在泛癌中的表达情况及其与临床分期、预后的相关性。方法:本研究主要运用R语言及包括GEPIA2、TIMER、cBio Portal、COSMIC在内的多种在线网站对癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库中BLCA数据和基因表达综合(Gene Expression Omnibus,GEO)数据库中GSE7476数据集进行生物信息学分析。首先,利用R语言初步过滤筛选TCGA-BLCA及GSE7476数据集的完整数据;然后,R语言分析dars2分别在TCGA-BLCA和GSE7476数据集中的差异表达情况,并利用GEPIA2数据库进行验证;分析dars2与TNM分期、病理分级、性别、年龄、种族等不同临床病理特征间的相关性并利用单基因logistics回归分析评估dars2和每个临床变量之间的关系程度;绘制受试者工作特征曲线(Receiver operating characteristic curve,ROC),根据曲线下面积(Area under curve,AUC)分析变量dars2在区分膀胱尿路上皮癌组织和正常膀胱组织间的能力,并确定最佳阈值;使用Cox生存回归分析评估dars2表达在预后中的作用,单变量Cox回归中具有统计学意义的变量被进一步纳入多变量Cox回归;在c Bio Portal和COSMIC数据库中评估BLCA中dars2的突变频率及突变类型;为研究潜在机制,对BLCA样本按照dars2基因的表达值分成高低表达组(模拟类似过表达或者敲低该基因的效果),分析两组中的差异分子,得到与dars2可能关联的分子后行GSEA分析并可视化;基于ss GSEA算法分析dars2与BLCA免疫微环境相关性,并利用TIMER数据库验证,揭示其作为免疫治疗靶点的可能性;最后,从UCSC Xena数据库下载包括BLCA在内的33种癌症类型的基因组数据和相应临床数据后利用R语言、GEPIA2及TIMER数据库对dars2在泛癌中的表达情况,及其与预后、临床分期的相关性进行可视化分析。结果:与正常膀胱组织相比,dars2基因在BLCA组织中明显高表达,dars2表达水平的增加与不同的种族、T分期、M分期、临床分期、病理组织学分级、主要治疗结果、总生存期、疾病特异生存期、肿瘤状态均具有显著相关性。诊断性ROC曲线显示在预测BLCA结局上,变量dars2的预测能力有一定准确性(AUC=0.868,CI=0.798-0.937),最佳诊断临界值为4.065,灵敏度(84.2%)及特异度(81.1%)均较高。Cox生存回归分析显示,在BLCA患者中,dars2的高表达与预后不良明显相关,多变量Cox回归风险模型显示dars2表达水平是BLCA患者的独立预后因素。单基因GSEA分析表明dars2可能通过影响BLCA患者细胞周期检查点、细胞周期、有丝分裂纺锤体检查点、M期、DNA复制等通路发挥作用。基于ss GSEA分析的结果显示,dars2表达水平与多种免疫细胞的浸润水平显著相关。最后,从泛癌数据中的进一步分析表明,dars2在各种癌症组织与正常组织中的表达差异显著,同时其与多种癌症的临床分期和预后有关。结论:研究结果表明,dars2表达水平的增加与BLCA的进展显著相关,有可能通过促进肿瘤细胞周期、改变肿瘤免疫微环境促进BLCA进展,可以作为BLCA患者的一种新的预后生物标志物,并且有可能在多种肿瘤中推广。

关键词：生物信息学 dars2 泛癌膀胱癌 R语言 TCGA

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dars2在肺腺癌中的表达及其初步功能研究

DARS2在肺腺癌中的表达及其初步功能研究

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作者：李锦新福建医科大学

学位级别：硕士

研究背景与目的:随着全球人口的迅速增长和老龄化,全世界的癌症发病率和死亡率都在迅速增长,据2020年全球癌症中心估计,该年全球有1930万新发癌症病例和近1000万癌症死亡病例,而肺癌又是其中除了女性乳腺癌外最常见的癌症,同时还是癌症... 详细信息

研究背景与目的:随着全球人口的迅速增长和老龄化,全世界的癌症发病率和死亡率都在迅速增长,据2020年全球癌症中心估计,该年全球有1930万新发癌症病例和近1000万癌症死亡病例,而肺癌又是其中除了女性乳腺癌外最常见的癌症,同时还是癌症死亡的首要原因。近几年,除了传统的手术、化疗与放疗外,靶向药物的发现为肺癌的治疗带来了新的希望,但由于个体差异和耐药现象,其远期疗效并不令人满意。多项研究证实高等真核生物的AARS（Aminoacyl-t RNA Synthetase,氨基酰-t RNA合成酶）参与了RNA剪接、转录和翻译调控、细胞凋亡、肿瘤发生等多种生物学过程。dars2是编码线粒体AARS之一的Asp RS（Asp-t RNA Synthetase,天冬氨酰-t RNA合成酶）的基因,最早于2007年由Scheper GC等人在LBSL（Leukoencephalopathy with brainstem and spinal cord involvement and lactate elevation,脑干脊髓白质病变及乳糖增高症）患者中发现。武汉大学中南医院的一项研究证实dars2的表达水平与肝癌的肿瘤大小、分化状态、BCLC（Barcelona Clinic Liver Cancer,巴塞罗那临床肝癌）分期、远处转移、门静脉侵犯及预后有关。但dars2与肺癌关系的研究国内外未见报道,在肺癌的发生发展中的作用尚未明确。因此,检测分析dars2在肺腺癌中的表达水平,研究dars2对肺腺癌细胞生物学行为的影响,为肺腺癌的诊断方法、治疗手段、改善预后提供实验依据。研究方法:本课题第一部分通过搜索TCGA（The Cancer Genome Atlas Program,癌症基因组图谱公共数据集）下载肺腺癌表达谱数据进行统计分析,并采用q RT-PCR（quantitative real-time Polymerase Chain Reaction,实时荧光定量聚合酶链式反应）、WB（Western blot,蛋白印迹实验）技术,对2019年5月至2020年5月间就诊于福建省立医院胸外科进行手术治疗的45位肺腺癌患者组织标本中的dars2表达量进行检测,分析dars2在癌组织和癌旁组织的表达差异以及dars2表达水平与性别、年龄、吸烟史、病理分期等临床病理特征之间的关系。第二部分在体外通过质粒转染、慢病毒包装构建dars2过表达的稳转肺癌A549和H1299细胞株,采用CCK-8（Cell Counting Kit-8,细胞计数试剂盒-8）法、流式细胞仪、Transwell法检测dars2过表达对肺腺癌A549细胞和H1299细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭等生物学行为的影响,初步探讨dars2在肺腺癌细胞中的生物学功能。研究结果:1.第一部分的TCGA数据分析结果显示,与对照组相比,dars2在肿瘤组中表达水平显著增加,dars2高表达还是影响肺腺癌患者预后的危险因素。qRT-PCR和WB实验也同样证实肺腺癌组织的dars2表达水平高于癌旁组织。2.第二部分的体外细胞实验发现过表达dars2可以促进肺腺癌细胞株A549细胞和H1299细胞的增殖,抑制A549细胞和H1299细胞凋亡,增强A549细胞和H1299细胞的迁移能力及侵袭能力。研究结论:本研究发现dars2在肺腺癌组织中表达增加,同时dars2高表达还是影响肺腺癌患者预后的危险因素,高dars2表达水平组的肺腺癌患者同期生存率均较低dars2表达水平组的患者低。体外细胞实验中过表达dars2可以促进肺腺癌细胞A549细胞和H1299细胞的增殖,抑制A549细胞和H1299细胞凋亡,增强A549细胞和H1299细胞的迁移能力及侵袭能力。研究说明dars2可能在肺癌的发生发展和侵袭转移中发挥重要作用。

关键词：肺腺癌 dars2 基因过表达生物学行为

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伴脑干和脊髓受累及白质乳酸正常的脑白质病一例

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中国神经免疫学和神经病学杂志 2020年第5期27卷 411-413页

作者：李浩洋刘爱翠杨燕文杨笑杨平秦晋魏世丽李季萌许小艳张庆宁夏医科大学 750004 宁夏医科大学总医院神经内科 750004 宁夏医科大学总医院神经电生理科

1 病例报告患者女,32岁。以“步态不稳11年,加重6个月”入院。21岁出现步态不稳,左右摇晃易摔倒;22岁感双下肢无力,自卧位和坐位时起立困难,上下楼梯需搀扶;23岁步态不稳较前加重,迈步不知远近、落脚不知深浅,夜晚较白天重。入院前6个... 详细信息

1 病例报告患者女,32岁。以“步态不稳11年,加重6个月”入院。21岁出现步态不稳,左右摇晃易摔倒;22岁感双下肢无力,自卧位和坐位时起立困难,上下楼梯需搀扶;23岁步态不稳较前加重,迈步不知远近、落脚不知深浅,夜晚较白天重。入院前6个月步态不稳再次加重,就诊当地医院考虑“脊髓后索病变”,给予口服B族维生素、叶酸片、辅酶和烟酰胺片等治疗后无好转。无视力、听力和语言障碍,无饮水呛咳、吞咽困难和二便障碍。否认肝炎、肺结核和水痘等传染病史,否认颅脑外伤和脑炎病史,无发热抽搐和夜盲症病史。20岁结婚,顺产两个男孩。父母系近亲结婚,否认其他家庭成员患有类似疾病。入院查体:意识清楚,言语清晰、流利,舌肌纤颤;双下肢肌力5 -级,双下肢膝腱反射和跟腱反射活跃;左侧Hoffmann征和Rossolimo征阳性,下颌反射、双侧掌颌反射阳性,右下肢 Babinski征可疑阳性;双侧指鼻试验、轮替实验、跟-膝胫试验均欠稳准,右下肢显著,Romberg(+);胸6水平以下痛觉减退,双髋以下音叉震动觉减退,双下肢关节位置觉、运动觉稍差,双足弓形足并足下垂,跨阈步态。

关键词：脑白质病脑干脊髓乳酸 dars2

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