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Journal of Huazhong University of Science and Technology(Medical Sciences) 2009年第5期29卷 655-658页

作者：曾敬思 Cristina Mariade Souza Motta 福岛和贵龙泽香代子 Oliane Maria Correia Magalhes Rejane Pereira Neves 西村和子 department of dermatology and Venereology Union HospitalTongji Medical CollegeHuazhong University of Science and Technology Federal University of Pernambuco Av.Prof.Chavess/nCEP:50670-420RecifePernambucoBrazil Medical Mycology Research Center Chiba University

To re-identify and further group 25 isolates of Trichosporon spp. identified morphologically previously, sequences of d1/d2 region of large subunit （LSU） of ribosomal dNA （rdNA） of 25 tested strains for identification and those of ribosomal intergenic space 1 （IGS1） region of 11 strains for subgrouping were detected. The identifications of tested strains were changed except 6 strains. According to the alignment of the IGS1 region, 6 T. asahii isolates tested fell into 4 groups and 5 T. faecale isolates into 3 groups. Polymorphism of 2 T. japonicum isolates was found in 10 positions. With the alignments obtained in this research compared with the relative GenBank entries, it was found that T. asahii, T. faecale and T. japonicum species were divided into 7, 3 and 2 subtypes respectively. Morphological and biophysical methods are not sufficient for Trichosporon spp. identification. Sequencing becomes necessary for Trichosporon diagnosis. There is obvious diversity within a species.

关键词： Trichonsporon large subunit d1/d2 intergenic space 1

乌头霜霉病病原菌rdNA-ITS和28S rdNA d1/d2区序列分析

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中草药 2016年第15期47卷 2741-2746页

作者：欧洪李娜胡亮王婷何静王光志成都中医药大学/中药材标准化教育部重点实验室/中药资源系统研究与开发利用省部共建国家重点实验室培育基地四川成都611137

目的明确四川江油地区栽培乌头霜霉病病原菌乌头霜霉Peronospora aconiti rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2区序列,为病害诊断和防治提供理论基础。方法从病株收集病原菌分生孢子及菌丝,提取dNA,扩增rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2片段序列,进行... 详细信息

目的明确四川江油地区栽培乌头霜霉病病原菌乌头霜霉Peronospora aconiti rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2区序列,为病害诊断和防治提供理论基础。方法从病株收集病原菌分生孢子及菌丝,提取dNA,扩增rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2片段序列,进行测序分析,并构建邻接(neighbor-joining,NJ)发育树分析病原菌种类。结果检测出的病原菌rdNA-ITS序列与NCBI数据库中霜霉属***、***相似度为94%,28 S rdNA d1/d2区序列与霜霉属***、***、***相似度达97%。结论分子rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2区序列鉴定的结论和形态学鉴定的结论一致,乌头霜霉病病原菌为霜霉科霜霉属乌头霜霉Peronospora aconiti Yu,其rdNA-ITS和28 S rdNA d1/d2区序列可用于该病原物的鉴定。

关键词：乌头霜霉病乌头霜霉 rdNA-ITS 28 S d1/d2

利用28S rdNA d1/d2区和ITS rdNA序列鉴定甜瓜白粉病病原菌

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植物保护学报 2011年第1期38卷 47-51页

作者：刘建利北方民族大学生物科学与工程学院宁夏银川750021

为了明确宁夏干旱带压砂甜瓜白粉病病原菌,从病原菌分生孢子中提取dNA,PCR扩增ITS rdNA和28S rdNA d1/d2区段,测序后进行BLAST比对。结果表明,病原菌的ITS rdNA和28S rdNA d1/d2序列与菜豆叉丝单囊壳白粉菌Podosphaera phaseoli、凤仙... 详细信息

为了明确宁夏干旱带压砂甜瓜白粉病病原菌,从病原菌分生孢子中提取dNA,PCR扩增ITS rdNA和28S rdNA d1/d2区段,测序后进行BLAST比对。结果表明,病原菌的ITS rdNA和28S rdNA d1/d2序列与菜豆叉丝单囊壳白粉菌Podosphaera phaseoli、凤仙花叉丝单囊壳白粉菌***-sam inae、菊科叉丝单囊壳白粉菌***、苍耳单囊壳白粉菌***、瓜类单囊壳白粉菌***-nea等叉丝单囊壳属Podosphaera的多个种的ITS rdNA和28S rdNA d1/d2序列之间相似度均大于99%,鉴定甜瓜白粉病病原菌为叉丝单囊壳属Podosphaera。

关键词：甜瓜白粉病 ITS rdNA 28S rdNA d1/d2

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传统绍兴黄酒酿造过程中酵母菌的动态监测

中国食品学报 2017年第12期17卷 201-206页

作者：臧威谢广发孙剑秋邹慧君沈赤钱斌周建弟白逢彦绍兴文理学院生命科学学院浙江绍兴312000 国家黄酒工程技术研究中心浙江绍兴312000 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

以绍兴黄酒大型生产企业加饭酒为样本,采用平板分离技术和26S r dNA d1/d2序列分析技术,对发酵醪液内酵母菌数量变化和种类组成进行动态监测。结果发现,在陶缸内进行前酵时醪液内酵母菌数量表现出"急升-稳定"的变化规律,在陶坛内进行后... 详细信息

以绍兴黄酒大型生产企业加饭酒为样本,采用平板分离技术和26S r dNA d1/d2序列分析技术,对发酵醪液内酵母菌数量变化和种类组成进行动态监测。结果发现,在陶缸内进行前酵时醪液内酵母菌数量表现出"急升-稳定"的变化规律,在陶坛内进行后酵时醪液内酵母菌数量遵循"缓升-缓降"的发展特征;总的来看,头耙之后直至发酵结束的近90 d的生产周期中,醪液内酵母菌数量时有波动,生活酵母缓慢减少的总趋势未曾明显改变。绍兴加饭酒发酵醪液中存在的酵母菌均被鉴定为酿酒酵母。基于Clustal X软件进行实验菌株与模式菌株之间26S rdNA d1/d2序列的比对,醪液内酵母菌种类单一却并不单纯,加饭酒的传统生产工艺并不是纯种酿酒酵母的发酵过程,至少有3个株系酿酒酵母参与生产,其中第Ⅱ类株系可能在酿酒时发挥更加重要的作用。加饭酒是绍兴黄酒市场常见的大宗产品,跟踪整个绍兴加饭酒酿造周期,探讨发酵醪液内酵母菌变化规律,所得研究结果在传统绍兴黄酒酿造的酵母菌研究方面具有代表性;对参与黄酒生产的酵母菌进行分离鉴定并收集菌种资源,可以为最终揭示传统绍兴黄酒的酿造机理奠定基础。

关键词：绍兴黄酒酵母菌数量酿酒酵母 26S rdNA d1/d2

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浙江雁荡山山脉叶栖酵母菌资源与物种多样性

生态学报 2018年第11期38卷 3920-3930页

作者：臧威刘春月谢广发沈赤刘新展邹彗君汤访评冯富娟孙剑秋白逢彦绍兴文理学院生命科学学院绍兴312000 东北林业大学生命科学学院哈尔滨150040 浙江古越龙山绍兴酒股份有限公司绍兴312000 中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室北京100101

对北雁荡山、中雁荡山、南雁荡山、西雁荡山和东雁荡山等广阔区域内的叶栖酵母菌资源进行考察,旨在弄清雁荡山山脉叶栖酵母菌资源和多样性。采用PdA平板对雁荡山地区的叶栖酵母菌资源进行分离和纯化,根据酵母菌培养物26S rdNA d1/d2序... 详细信息

对北雁荡山、中雁荡山、南雁荡山、西雁荡山和东雁荡山等广阔区域内的叶栖酵母菌资源进行考察,旨在弄清雁荡山山脉叶栖酵母菌资源和多样性。采用PdA平板对雁荡山地区的叶栖酵母菌资源进行分离和纯化,根据酵母菌培养物26S rdNA d1/d2序列和系统发育关系明确酵母菌的分类地位,分析该地区叶栖酵母菌群落的多样性、组成和分布情况。结果发现,分离自雁荡山山脉的1118株叶栖酵母菌可以被鉴定为56个已知类群和19个疑似新种,其中38种酵母菌在该地区比较常见。常见的酵母菌类群中,包括derxomyces属5种,Sporobolomyces属3种,Bannoa、Bulleribasidium、Rhodosporidiobolus、Symmetrospora、Taphrina、Tilletiopsi和Udeniomyces属各2种,Bullera、Coniochaeta、Coniosporium、Cryptococcus、Elsinoe、Erythrobasidium、Fellozyma、Golubevia、Kockovaella、Kondoa、Leucosporidium、Moesziomyces、Oberwinklerozyma、Phyllozyma、Ruinenia和Saitozyma属各1种。根据常见酵母菌类群的相对频率,在该地区分离到的叶栖酵母菌中derxomyces mrakii具有明显分布优势,并探讨了derxomyces mrakii株间26S rdNA d1/d2序列的稳定性和变异幅度。根据雁荡山地区常见叶栖酵母菌组成和相似程度,可以推测地理上相近地区的酵母菌物种分布具有更大相似性。基于雁荡山山脉常见叶栖酵母菌种类和数量而绘制出的物种累积曲线,证明雁荡山地区绝大多数的叶栖酵母菌种类已经被分离到,研究结果可以真实反映该地区叶栖酵母菌资源和物种多样性的存在状况。

关键词：酵母菌多样性雁荡山 26S rdNA d1/d2

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不对称还原丙酮酸乙酯菌株的筛选及鉴定

应用与环境生物学报 2012年第3期18卷 460-464页

作者：王丹李旺巩春甫杨四佳张强唐恺迪戚南昌银丽娟张杰杨志荣四川大学生命科学学院成都610065 成都医学院生物医学系成都610083 成都医学院基础医学院成都610083 成都医学院检验医学院成都610083

以丙酮酸乙酯为底物,从成都某化工厂污水池及其附近土壤中分离到36株可将丙酮酸乙酯不对称还原成(S)-乳酸乙酯的菌株.经过多次复筛,最终获得了一株具有较高催化活性的酵母菌BTY18-6.在以该菌株静息细胞为催化剂,催化不对称还原丙酮酸乙... 详细信息

以丙酮酸乙酯为底物,从成都某化工厂污水池及其附近土壤中分离到36株可将丙酮酸乙酯不对称还原成(S)-乳酸乙酯的菌株.经过多次复筛,最终获得了一株具有较高催化活性的酵母菌BTY18-6.在以该菌株静息细胞为催化剂,催化不对称还原丙酮酸乙酯合成(S)-乳酸乙酯的反应中,底物浓度为60 mmol/L时,底物转化率为86.9%,产物(S)-乳酸乙酯的ee值为88.7%.通过对其形态学、生理生化特征及其26S rdNA dl/d2区域的分析表明,BTY18-6为胶红酵母.

关键词：丙酮酸乙酯不对称还原 (S)-乳酸乙酯静息细胞 26S rdNA d1/d2 胶红酵母

新疆地区酸马奶中酵母菌的鉴定及其生物多样性分析

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微生物学报 2007年第4期47卷 578-582页

作者：倪慧娟包秋华孙天松陈霞张和平孟和毕力格王俊国于洁内蒙古农业大学乳品生物技术与工程教育部重点实验室呼和浩特010018

从新疆少数民族牧民家庭采集的28份传统工艺酿造酸马奶样品中分离出87株酵母菌,并对其进行了生理生化鉴定、分子生物学鉴定和生物多样性分析。生化试验结果表明,新疆地区酸马奶中的酵母菌为Saccharomyces unisporus(占总分离株的48.3%),... 详细信息

从新疆少数民族牧民家庭采集的28份传统工艺酿造酸马奶样品中分离出87株酵母菌,并对其进行了生理生化鉴定、分子生物学鉴定和生物多样性分析。生化试验结果表明,新疆地区酸马奶中的酵母菌为Saccharomyces unisporus(占总分离株的48.3%),Kluyveromyces marxianus(27.6%),Pichia membranaefaciens(15.0%)和Saccharomyces cerevisiae(9.2%)。选取其中的6株酵母菌和1株参考菌株,进行大亚基(26S)rdNA d1/d2区域(600bp左右)碱基序列分析,并通过GenBank进行同源序列搜索以确定各菌株的归属,进一步验证生理生化方法的正确性。从得到的结果中可以看出,***和***为新疆地区酸马奶中的优势菌。

关键词：酸马奶酵母菌生化鉴定 d1/d2 生物多样性

抗草甘膦酵母菌ZM-1的分离鉴定及其生长降解特性

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微生物学通报 2010年第9期37卷 1402-1409页

作者：汤鸣强尤民生福建农林大学应用生态研究所福建福州350002 福建师范大学福清分校生物与化学工程系福建福清350300

以福州市郊区的耕作土壤为研究材料,利用草甘膦为选择压力,通过富集、驯化培养,分离出一株对草甘膦具有高耐受和降解作用的酵母菌菌株ZM-1,结合生理生化特征及26S rdNA d1/d2区序列分析将其初步鉴定为胶红酵母菌(Rhodotorula mucilagino... 详细信息

以福州市郊区的耕作土壤为研究材料,利用草甘膦为选择压力,通过富集、驯化培养,分离出一株对草甘膦具有高耐受和降解作用的酵母菌菌株ZM-1,结合生理生化特征及26S rdNA d1/d2区序列分析将其初步鉴定为胶红酵母菌(Rhodotorula mucilaginosa)。菌株ZM-1能以草甘膦为唯一碳、氮源生长,对草甘膦的最高耐受浓度为50g/L。在草甘膦初始浓度为1g/L的无机盐培养基中,30℃、150r/min摇床振荡培养7d,草甘膦降解率为85.38%。适合菌株ZM-1生长及降解草甘膦的最佳条件为:草甘膦初始浓度1g/L,接种量4%,温度30℃,pH值5.5-6.0,装料量50mL/250mL。菌株ZM-1是一株良好的草甘膦耐受菌,可用于草甘膦污染环境的生物修复,也可能成为转基因抗草甘膦作物的一个很好资源。

关键词：草甘膦降解菌 26S rdNA d1/d2 系统发育分析降解特性

大湘西野生猕猴桃酿酒酵母的分离鉴定及其产物ACE抑制活性

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食品与机械 2018年第8期34卷 135-138页

作者：伍强万常彭娟娟曾豪余有贵邵阳学院食品与化学工程学院湖南邵阳422000 邵阳市酿酒工程技术研究中心湖南邵阳422000

通过平板划线、显微镜观察、WL培养基筛选、酒精度及血管紧张素转化酶(Angiotensin converting enzyme,ACE)抑制活性测定,对野生猕猴桃酿酒酵母进行分离筛选,再利用26S rdNA d1/d2区序列分析进行分子生物学鉴定。利用该菌株对野生猕猴... 详细信息

通过平板划线、显微镜观察、WL培养基筛选、酒精度及血管紧张素转化酶(Angiotensin converting enzyme,ACE)抑制活性测定,对野生猕猴桃酿酒酵母进行分离筛选,再利用26S rdNA d1/d2区序列分析进行分子生物学鉴定。利用该菌株对野生猕猴桃进行纯种发酵,研究不同发酵阶段中发酵醪液的ACE抑制率、酒精度及多肽浓度变化。结果表明,经分离筛选获得适于猕猴桃果酒发酵的野生酵母JM11为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),在发酵4 d时发酵醪液的ACE抑制率为(93. 0±2. 6)%,酒精度为(7. 8±0. 5)%Vol,多肽浓度为(2 652. 0±112. 4)μg/mL,说明该菌株可酿制果酒,制得的产品还具有良好的ACE抑制活性,可作为野生猕猴桃降血压型保健果酒发酵的专用菌种或选育野生猕猴桃专用菌种的出发菌株。

关键词：野生猕猴桃酿酒酵母 26S rdNA d1/d2 ACE抑制活性

葡萄酒中低产尿素酵母菌的分子生物学鉴定与评价

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食品与发酵工业 2010年第7期36卷 13-17页

作者：刘树文张剑钟其顶熊正河张辉周韩玲西北农林科技大学葡萄酒学院陕西杨凌712100 中国食品发酵工业研究院北京100027 中粮酒业有限公司北京100020

利用26S rdNA d1/d2区序列分析和5.8S-ITS区PCR-RFLP两种分子生物学方法对分离于葡萄酒中的8株野生酵母进行了鉴定。这些野生酵母分别属于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、葡萄有孢汉逊酵母(Hanseniaspora uvarum)、美极梅奇酵母(M... 详细信息

利用26S rdNA d1/d2区序列分析和5.8S-ITS区PCR-RFLP两种分子生物学方法对分离于葡萄酒中的8株野生酵母进行了鉴定。这些野生酵母分别属于酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae)、葡萄有孢汉逊酵母(Hanseniaspora uvarum)、美极梅奇酵母(Metschnikowia pulcherrima)、拜耳接合酵母(Zygosaccharomyces bailii)和近平滑假丝酵母(Candida parapsilosis)5个种。评价了分离得到的野生酵母代谢尿素的能力,并与活性干酵母相比较。不同的酵母菌株存在差异性,野生酵母代谢尿素的含量普遍高于活性干酵母。此外,葡萄汁中精氨酸的含量对发酵后尿素的含量具有明显的影响。

关键词： 26S rdNA d1/d2 5.8S-ITS 葡萄酒酵母尿素