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Transcriptional regulatory network during axonal regeneration of dorsal root ganglion neurons:laser-capture microdissection and deep sequencing

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Neural Regeneration Research 2023年第9期18卷 2056-2066页

作者： Li-Li Zhao Tao Zhang Wei-Xiao Huang Ting-Ting Guo Xiao-Song Gu Model Animal Research Center and MOE Key Laboratory of Animal Models of Disease Nanjing UniversityNanjingJiangsu ProvinceChina Key Laboratory of Neuroregeneration of Jiangsu and Ministry of Education Co-innovation Center of NeuroregenerationNantong UniversityNantongJiangsu ProvinceChina School of Medicine and Life Sciences Nanjing University of Chinese MedicineNanjingJiangsu ProvinceChina

The key regulators and regeneration-associated genes involved in axonal regeneration of neurons after injury have not been clarified.In high-throughput sequencing,various factors influence the final sequencing results,including the number and size of cells,the depth of sequencing,and the method of cell separation.There is still a lack of research on the detailed molecular expression profile during the regeneration of dorsal root ganglion neuron axon.In this study,we performed lase r-capture microdissection coupled with RNA sequencing on dorsal root ganglion neurons at 0,3,6,and 12 hours and 1,3,and 7 days after sciatic nerve crush in rats.We identified three stages after dorsal root ganglion injury:early(3-12 hours),pre-regeneration(1 day),and regeneration(3-7 days).Gene expression patterns and related function enrichment res ults showed that one module of genes was highly related to axonal regeneration.We verified the up-regulation of activating transcription factor 3(Atf3),Kruppel like factor 6(Klf6),AT-rich inte raction domain 5A(Arid5α),CAMP responsive element modulator(Crem),and FOS like 1,AP-1 transcription factor Subunit(Fosl1) in dorsal root ganglion neurons after injury.Suppressing these transcription factors(Crem,Arid5o,Fosl1 and Klf6) reduced axonal regrowth in vitro.As the hub transcription factor,Atf3 showed higher expression and activity at the preregeneration and regeneration stages.G protein-coupled estrogen receptor 1(Gper1),inte rleukin 12a(Il12α),estrogen receptor 1(ESR1),and interleukin 6(IL6) may be upstream factors that trigger the activation of Atf3 during the repair of axon injury in the early stage.Our study presents the detailed molecular expression profile during axonal regeneration of dorsal root ganglion neurons after peripheral nerve injury.These findings may provide reference for the clinical screening of molecular targets for the treatment of peripheral nerve injury.

关键词： Arid5a Atf3 Crem dorsal root ganglion Fosl1 Klf6 laser-capture microdissection neuron smart-seq2 gene expression profile transcription factor

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非梗阻性无精子症患者睾丸组织Crem表达及意义

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现代妇产科进展 2020年第6期29卷 438-440页

作者：刘金于红玲孟凡伟山东大学齐鲁医院妇产科不孕不育诊疗中心济南250012

目的:探讨非梗阻性无精子症(NOA)患者睾丸组织中Crem表达及意义。方法:选取NOA患者28例和生精正常的梗阻性无精子症(OA)患者19例,收集睾丸活检组织,采用RT-PCR、免疫组化法及Western blot法检测睾丸组织中Crem mRNA及Crem蛋白表达。结果... 详细信息

目的:探讨非梗阻性无精子症(NOA)患者睾丸组织中Crem表达及意义。方法:选取NOA患者28例和生精正常的梗阻性无精子症(OA)患者19例,收集睾丸活检组织,采用RT-PCR、免疫组化法及Western blot法检测睾丸组织中Crem mRNA及Crem蛋白表达。结果:Crem蛋白主要表达于睾丸组织生精小管的精母细胞、精原细胞和早期精子细胞的细胞核。OA睾丸组织中Crem mRNA含量高于NOA睾丸组织[(0.028±0.022)vs(0.014±0.024)],OA睾丸组织中Crem蛋白表达高于NOA睾丸组织[(2.263±0.371)vs(1.145±0.535)],差异均有统计学意义(PCrem mRNA及蛋白表达下调可能是NOA发病的原因之一。

关键词： Crem 人睾丸组织生精功能

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小鼠Boule蛋白与Crem3′UTR结合并调节其表达

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重庆医学 2012年第24期41卷 2462-2464,2468页

作者：林昌海曾梅陈述卢亦路马用信四川大学华西医院医学遗传研究室暨生物治疗国家重点实验室

目的研究小鼠Boule蛋白与精子成熟相关基因Crem之间的相互作用,揭示Boule蛋白在精子发生过程中所起的作用。方法构建pGEX-Boule表达载体,将表达载体转化宿主菌(BL21)感受态细胞,诱导纯化出Boule蛋白,应用RT-PCR和凝胶滞后实验(EMSA)分析... 详细信息

目的研究小鼠Boule蛋白与精子成熟相关基因Crem之间的相互作用,揭示Boule蛋白在精子发生过程中所起的作用。方法构建pGEX-Boule表达载体,将表达载体转化宿主菌(BL21)感受态细胞,诱导纯化出Boule蛋白,应用RT-PCR和凝胶滞后实验(EMSA)分析与Boule蛋白结合的mRNA。结果表达载体pGEX-Boule构建成功,纯化出GST-Boule融合蛋白,RT-PCR和EMSA实验证明Boule蛋白能够结合Crem3′UTR。结论 Boule蛋白能够结合Crem3′UTR,可能通过调控Crem蛋白的表达作用于精子发生过程。

关键词： EMSA RNA结合蛋白 Boule Crem

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基于Crem理论的企业海外并购文化整合动态循环模型

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商业研究 2014年第6期 166-171页

作者：程达军深圳职业技术学院应用外国语学院广东深圳518055

受民族文化的发展历程、意识形态领域的差异和企业文化发展处于初级阶段的影响,我国企业海外并购过程中面临的文化风险更加复杂,在文化整合过程中存在着心态不成熟、方法不完善、体系不健全等问题。海外并购文化整合中的文化风险体系具... 详细信息

受民族文化的发展历程、意识形态领域的差异和企业文化发展处于初级阶段的影响,我国企业海外并购过程中面临的文化风险更加复杂,在文化整合过程中存在着心态不成熟、方法不完善、体系不健全等问题。海外并购文化整合中的文化风险体系具有风险、人、时间三个维度,通过动态循环的文化整合模式,可以在全面风险管理理念的指引下,使文化风险的整合充分发挥缓冲和指引的功能,从而有效实现两种文化体系的融合与创新,保证新的文化体系与企业经营之间的高度契合。

关键词：海外并购 Crem 文化整合

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The Extreme Summer Precipitation over East China during 1982-2007 Simulated by the LASG/IAP Regional Climate Model

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Atmospheric and Oceanic Science Letters 2012年第1期5卷 62-67页

作者： LIU Jing-Wei LI Bo ZHOU Tian-Jun ZENG Xian-Feng FENG Lei State Key Laboratory of Numerical modeling for Atmospheric Science and Geophysical Fluid Dynamics （LASG） Institute of Atmospheric Physics （lAP） Chinese Academy of Sciences Beijing 100029 China Graduate University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 China

The extreme summer precipitation over East China during 1982-2007 was simulated using the LASG/IAP regional climate model Crem(the Climate version of a Regional Eta-coordinate Model).The results show that the probability density functions(PDFs) of precipitation intensities are reasonably simulated,except that the PDFs of light and moderate rain are underestimated and that the PDFs of heavy rain are overestimated.The extreme precipitation amount(R95p) and the percent contribution of extreme precipitation to the total precipitation(R95pt) are also reasonably reproduced by the Crem.However,the R95p and R95pt over most of East China are generally overestimated,while the R95p along the coastal area of South China(SC) is underestimated.The bias of R95pt is consistent with the bias of precipitation intensity on wet days(SDII).The interannual variation for R95p anomalies(PC1) is well simulated,but that of R95pt anomalies(PC2) is poorly simulated.The skill of the model in simulating PC1(PC2) increases(decreases) from north to south.The bias of water vapor transport associated with the 95th percentile of summer daily precipitation(WVTr95) explains well the bias of the simulated extreme precipitation.

关键词：中国东部地区区域气候模型模式模拟夏季降水 IAP PDF格式概率密度函数 Crem

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Summer Extreme Temperatures over East China during 1984-2004 Simulated by LASG/IAP Regional Climate Model Crem

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Atmospheric and Oceanic Science Letters 2012年第1期5卷 68-73页

作者： ZENG Xian-Feng LIU Jing-Wei LI Bo GUO Zhun ZHOU Tian-Jun FENG Lei State Key Laboratory of Numerical Modeling.for A tmospheric Science and Geophysical Fluid Dynamics （LASG） Institute of Atmospheric Physics （IAP） Chinese Academy of Sciences Beijing 100029 China Graduate University of Chinese Academy of Sciences Beijing 100049 China Meteorology Center Lanzhou Airforce Lanzhou 730020 China

The authors examine extreme summer temperatures over East China during 1984-2004 using a regional climate model named Crem(the Climate version of Regional Eta-coordinate Model),which was developed by LASG/IAP.The results show that the main features of the extreme summer temperatures over East China are reproduced well by Crem,and the skill for the minimum temperature is higher than that for the maximum temperature,especially along the Yangtze-Huai River Valley(YHV).The simulated extreme temperatures are lower than those of observation,especially for the maximum temperature.The bias of extreme temperatures is consistent with the cold bias of the climatological mean summer surface air temperature.The skill of the model in simulating the interannual variability of extreme temperatures increases from north to south.The simulated interannual variation of the minimum temperature is more reasonable than the maximum temperature.The underestimation of net solar radiation at the surface leads to a cold bias of the climatological mean temperature.Furthermore,the model underestimates the light and moderate rain,while overestimates heavy rain.It causes the simulated minimum temperature more reasonable than the maximum temperature.

关键词：区域气候模式中国东部地区极端温度夏季气温 Crem IAP 模拟铸锭

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中国汉族男性非梗阻性无精子症患者易感基因的相关性研究

中国汉族男性非梗阻性无精子症患者易感基因的相关性研究

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作者：宋兵安徽医科大学

学位级别：硕士

第一部分中国汉族男性非梗阻性无精子症ETV5，HORMAD1和HORMAD2基因相关性研究目的：探讨ETV5，HORMAD1和HORMAD2基因多态性与非梗阻性无精子症的易感性。方法：应用Sequenom MassArray质谱阵列技术对368例已生育的汉族男性人群(对照... 详细信息

第一部分中国汉族男性非梗阻性无精子症ETV5，HORMAD1和HORMAD2基因相关性研究目的：探讨ETV5，HORMAD1和HORMAD2基因多态性与非梗阻性无精子症的易感性。方法：应用Sequenom MassArray质谱阵列技术对368例已生育的汉族男性人群(对照组)和361例汉族男性非梗阻性无精子症（实验组）ETV5基因的5个标签单核苷酸多态(single nucleotide polymorphism,SNP)位点(rs12631658, rs6444106, rs7430047,rs7433760, rs9824882)，HORMAD1基因3个SNP位点（rs1336900，rs16840074，rs6694531），HORMAD2基因8个SNP位点（rs8135823，rs11090601，rs4823073，rs5763779， rs718772，rs9620953，rs9625930， rs975704）进行基因型检测。应用Plink1.07软件对数据资料进行统计分析，比较对照组与病例组最小等位基因频率（MAF）及基因型差异，运用Haploview软件对ETV5、HORMAD1和HORMAD2基因进行单体型分析。结果：ETV5基因5个标签SNP，HORMAD13个SNP和HORMAD28个标签SNP的等位基因频率、基因型分布在实验组和对照组均无统计学差异（P＞0.05），进一步的单体型分析亦未显示统计学差异（P＞0.05）。当分析各SNP位点基因型在NOA亚组分布情况，我们发现HORMAD2基因rs718772位点最小等位基因频率（MAF）分布在双侧平均睾丸体积大于10ml组与小于10ml组中有显著性差异（P=0.035）。结论：检测的ETV5基因，HORMAD1和HORMAD2基因SNP位点多态性与汉族男性非梗阻性无精子症的发生可能不相关, HORMAD2基因rs718772位点SNP可能与NOA患者的睾丸发育有关。第二部分Crem信号通路基因单核甘酸多态性与NOA发生的关联性研究目的比较Crem信号通路相关基因Crem、ACT、Kif17b和SPAG8基因17个SNPs（single nucleotide polymorphisms, SNPs）位点的基因型频率、等位基因频率和单体型频率等在特发性非梗阻性无精子症（non-obstructive azoospermia，NOA）患者及正常生育男性间的分布，探讨这4种基因突变是否为NOA的致病因素。同时运用q-RT-PCR方法，研究Crem在NOA（生精阻滞）患者睾丸组织及正常睾丸组织的表达差异，探讨Crem基因在精子发生过程的作用及意义。方法我们选择361例特发性非梗阻性无精子症（NOA）作为实验组，368例精液质量正常的男性作为对照组。采用Sequenome Massarray质谱阵列技术对Crem、ACT、Kif17b和SPAG8基因的17个SNPs位点进行了基因型分型。选取30例生精阻滞患者及30例正常精子发生的睾丸组织，运用q-RT-PCR的方法检测Crem基因的在两组的mRNA表达水平，T检验进行数据统计，PCrem基因共检测4个SNP位点（rs4934540，rs2295415，rs11592356，rs1148247），其中rs4934540位点C等位基因频率（24.7%VS34.4%，P=4.9*10-5，OR=0.624,95%CI=(0.497-0.784)，rs2295415位点的G等位基因频率（18.0%VS24.2%，P=0.003，OR=0.686,95%CI=(0.532-0.885)，rs11592356位点G等位基因频率（6.9%VS10%，P=0.036，OR=0.672,95%CI=(0.461-0.978)均在NOA组显著低于正常生育组，提示该位点的变异可能对正常精子的发生具有保护作用，进一步的单体型分析提示TATG（rs493454, rs2295415, rs11592356and rs1148247）单体型的比例在NOA组显著高于正常生育组（P=0.011，OR=1.317，95%CI=1.064-1.631）。而ACT基因9个标签SNP（srs2273621，rs9373985，rs2252816，rs9398152，rs9398148，rs4839688，rs17056756，rs3798292，rs9486705）、KIF17b3个SNP（rs631357，rs522496，rs2296225）、SPAG8基因1个SNP（rs3763631）基因型分布在实验组及对照组均未见差异。Crem基因在NOA（生精阻滞）组及正常精子发生中睾丸组织的表达用明显差异，Crem基因在NOA（生精阻滞）患者睾丸组织中低表达（P=0.00001）。结论Crem基因多态

关键词：不育症非梗阻性无精子症（NOA） ETV5 HORMA 单核苷酸多态性(SNP) 男性不育非梗阻性无精子症单核苷酸多态性 Crem

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1,2-二氯乙烷通过Crem/CREB信号通路介导雄性NIH小鼠生殖毒性（英文）

1,2-二氯乙烷通过CREM/CREB信号通路介导雄性NIH小鼠生殖毒性（英...

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2017环境与公共健康学术会议暨中国环境科学学会环境医...

作者： Yating Zhang Guoliang Li Yizhou Zhong Manqi Huang Jiejiao Wu Jiewei Zheng Zhenlie Huang Department of Toxicology Guangdong Provincial Hospital for Occupational Disease Prevention and Treatment Faculty of Preventive Medicine School of Public HealthGuangdong Pharmaceutical University Faculty of Preventive Medicine School of Public HealthSun Yat-sen University

1,2-Dichloroethane(1,2-DCE) is a widely used chlorinated organic toxicant,but little is known about the reproductive disorders induced by its excessive exposure.To reveal 1,2-DCE-induced male reproductive toxicity and to elucidate the underlying mechanisms,we exposed male NIH Swiss mice to 1,2-DCE by inhalation at 0,100,350,and 700 mg/m for 6 h/day,for 1 and 4 weeks.Our findings showed a significant decrease in body weight with increased testis/body weight ratio,reduced sperm concentration and induced malformation of spermatozoa,and vacuolar degeneration of germ cells in the seminiferous tubules of testes in mice exposed to 1,2-DCE.Cyclic adenosine monophosphate(cAMP)-response element binding protein(CREB) and cAMP-response element modulator(Crem)were significantly inhibited by 1,2-DCE.This is consistent with the declines in the transducer of regulated CREB activity 1(TORC1) and activator of Crem in testis(ACT),which results in the decrease in lactate dehydrogenase C(LDH-C) and testis-specific kinase 1(TESK1) in the testes.Moreover,the activation of p53 and Bax with the inhibition of Bcl-2 might be the reason for the upregulation of caspase-3 in the apoptosis,as detected by TUNEL assay in the testes induced by1,2-DCE.Finally,elevated testosterone levels were found along with increased levels of gonadotropin-releasing hormone,cAMP,luteinizing hormone(LH) and LH receptors in the testes.These findings suggest that 1,2-DCE inhibits Crem/CREB signaling cascade and subsequently induces apoptosis associated with p53 activation and mitochondrial dysfunction.This also results in induced malformation of spermatozoa,reduced sperm concentration and pathological impairment of the testes.

关键词： 1,2-dichloroethane apoptosis CREB Crem reproductive toxicity

来源： cnki会议评论

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夏季中国东部降水季节内振荡的区域模式模拟

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大气科学 2011年第6期35卷 1033-1045页

作者：赵崇博周天军李博王璐孙丹中国科学院大气物理研究所大气科学和地球流体力学数值模拟国家重点实验室北京100029 中国科学院研究生院北京100049

利用中国科学院大气物理研究所大气科学与地球流体力学国家重点实验室(LASG)发展的区域气候模式Crem,对中国东部夏季降水的季节内振荡(ISO)进行了模拟研究,通过与格点和卫星观测降水资料及NCEP2再分析资料的对比,评估了该模式的优缺点... 详细信息

利用中国科学院大气物理研究所大气科学与地球流体力学国家重点实验室(LASG)发展的区域气候模式Crem,对中国东部夏季降水的季节内振荡(ISO)进行了模拟研究,通过与格点和卫星观测降水资料及NCEP2再分析资料的对比,评估了该模式的优缺点。结果表明,该模式对东部季风区ISO具有较强的模拟能力。模式能够模拟出中国东部夏季降水气候态的季节内振荡(CISO)信号,并能较好地再现其纬向上西传和经向上北传的传播特征,尽管模拟的CISO强度分布与观测相比大值中心位置偏西北。此外,模式也能够合理地再现出降水瞬变的季节内振荡(TISO)的局地振荡特征以及高频振荡周期,但模拟的TISO强度较观测偏强,且在长江流域,模拟的TISO显著周期较短,其传播也表现出过强的东传。分析表明,上述偏差与夏季平均环流场以及ISO对应的辐散场和湿度场自身垂直结构的模拟偏差有关。NCEP2再分析资料的降水产品难以准确描述观测的CI-SO和TISO特征,Crem的模拟结果相对于再分析资料具有明显的"增值"。

关键词：区域气候模式 Crem 中国东部季节内振荡降水

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环磷酸腺苷反应元件调控因子在精索静脉曲张大鼠睾丸的表达及意义

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中国药物与临床 2017年第4期17卷 506-508页

作者：张芳徐菁山西医科大学附属人民医院中心实验室太原030012 山西医科大学病理教研室

目的观察环磷酸腺苷反应元件调控因子(Crem)在精索静脉曲张(VC)大鼠睾丸组织中的表达,探讨Crem在VC大鼠不育中的作用及意义。方法选择32只SD大鼠,采用随机数字表法分为对照组(16只)和VC模型组(16只)。通过左肾静脉结扎的方法,制备VC大... 详细信息

目的观察环磷酸腺苷反应元件调控因子(Crem)在精索静脉曲张(VC)大鼠睾丸组织中的表达,探讨Crem在VC大鼠不育中的作用及意义。方法选择32只SD大鼠,采用随机数字表法分为对照组(16只)和VC模型组(16只)。通过左肾静脉结扎的方法,制备VC大鼠模型,采用实时荧光定量聚合酶链反应(PCR)和蛋白质印迹法测定VC大鼠左侧睾丸组织中Crem m RNA和蛋白质水平的表达。结果与对照组相比,VC大鼠睾丸组织Crem m RNA和蛋白质水平均显著降低(PCrem在VC大鼠睾丸组织中表达降低,可能参与了VC大鼠睾丸生殖细胞凋亡的过程,在VC致不育中起重要作用。

关键词：精索静脉曲张 Crem 细胞凋亡大鼠睾丸

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