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Deterministic epidemic models overestimate the basic reproduction number of observed outbreaks

Infectious Disease Modelling 2024年第3期9卷 680-688页

作者： Wajid Ali Christopher E.Overton Robert R.Wilkinson Kieran J.Sharkey Department of Mathematical Sciences University of LiverpoolPeach StreetLiverpoolL697ZXEnglandUnited Kingdom Department of Applied Mathematics Liverpool John Moores UniversityByrom StreetLiverpoolL35UXEnglandUnited Kingdom

The basic reproduction number,R_(0),is a well-known quantifier of epidemic ***,a class of existing methods for estimating R_(0)from incidence data early in the epidemic can lead to an over-estimation of this *** particular,when fitting deterministic models to estimate the rate of spread,we do not account for the stochastic nature of epidemics and that,given the same system,some outbreaks may lead to epidemics and some may ***,an observed epidemic that we wish to control is a major *** amounts to implicit selection for major outbreaks which leads to the over-estimation *** formally characterised the split between major and minor outbreaks by using Otsu's method which provides us with a working *** show that by conditioning a‘deterministic’model on major outbreaks,we can more reliably estimate the basic reproduction number from an observed epidemic trajectory.

关键词： Estimating R_(0) Simple birth-death process Major outbreak conditioned epidemic Stochastic fade-out

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