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cxcr1基因在正常和患临床型乳房炎绵羊乳腺中的表达及功能预测分析

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中国兽医学报 2019年第12期39卷 2429-2434,2440页

作者：李旺平马友记王建军严秉莲许开云赵咏中武威市畜牧兽医科学研究院甘肃武威733300 甘肃省肉羊繁育生物技术工程实验室甘肃民勤733300

cxcr1基因作为G蛋白偶联受体之一,可与其配体IL-8特异性结合,在炎症反应、肿瘤发生及转移等方面发挥关键调控作用。研究以正常和患临床型乳房炎绵羊(Ovis aries)(共6只,各3只)的乳腺组织作为研究对象,首先采用HE染色法比较观察其组织形... 详细信息

cxcr1基因作为G蛋白偶联受体之一,可与其配体IL-8特异性结合,在炎症反应、肿瘤发生及转移等方面发挥关键调控作用。研究以正常和患临床型乳房炎绵羊(Ovis aries)(共6只,各3只)的乳腺组织作为研究对象,首先采用HE染色法比较观察其组织形态学差异,随后采用荧光定量PCR(qRT-PCR)检测cxcr1mRNA的相对表达量,并通过相关生物信息学分析软件对cxcr1基因的靶向miRNAs、涉及到的通路及调控网络等进行预测。HE染色结果显示,与正常乳腺组织(对照组)相比,在患临床型乳房炎乳腺组织(试验组)中结缔组织大量增生,腺泡数量变少且发生萎缩,上皮细胞脱落、腔内有大量炎性细胞浸润。qRT-PCR结果显示,试验组中cxcr1mRNA的表达量较对照组极显著上调(Pcxcr1基因主要涉及趋化因子-受体相互作用、趋化作用等过程。靶向预测调控绵羊cxcr1基因的miRNAs结果显示,其表达可能受到miR-541-3p、miR-1193-3p等的调控。结果表明,在绵羊临床型乳房炎发生发展过程中,cxcr1基因可能在相关miRNAs的作用下表达上调,进而通过与其配体IL-8结合,趋化炎性细胞向绵羊乳腺感染部位迁移以发挥相应的作用。本研究为进一步深入探究cxcr1基因在绵羊临床型乳房炎发生发展过程中的分子机制提供了参考资料。

关键词： cxcr1基因绵羊乳房炎 IL-8 miR-541-3p miR-1193-3p

中国荷斯坦牛cxcr1基因遗传多态性与体细胞评分的关联分析

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中国农业科学 2010年第18期43卷 3848-3856页

作者：陈仁金杨章平毛永江陈莹常玲玲吴海涛施雪奎周里根王建勇尹召华梁祥焕扬州大学动物科学与技术学院上海光明荷斯坦牧业有限公司扬州大学实验农牧场

【目的】研究中国荷斯坦奶牛cxcr1基因的多态性及其与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛cxcr1基因... 详细信息

【目的】研究中国荷斯坦奶牛cxcr1基因的多态性及其与体细胞评分(Somaticcellscore,SCS)的关系,寻找与中国荷斯坦牛SCS相关的分子遗传标记,加快抗病育种进程。【方法】采用PCR-SSCP技术对来自30个公牛家系的610头中国荷斯坦牛cxcr1基因进行多态性检测,利用最小二乘均数法对CRCR1基因的多态位点与SCS进行相关分析,利用PHASE软件对4个多态位点进行单倍型分析。【结果】检测到4个SNPs,在5侧翼区发现了3个SNPs(-1830(A/G)、-1768(T/A)、-344(T/C)),在编码区783(C/A)位点为新发现的SNP。-1830(A/G)位点AA基因型个体SCS极显著低于AG基因型个体(P1),-1768(T/A)位点TT基因型个体SCS极显著低于TA基因型个体(P1),-344(T/C)位点TT基因型个体SCS极显著低于TC、CC个体(P1)。783(C/A)位点基因型个体的SCS差异不显著。单倍型Haplo2(ATTA)纯合基因型的SCS极显著低于Haplo1(ATCA)、Haplo3(GACA)和Haplo4(GATA)单倍型纯合基因型(P1)。【结论】-1830(A/G)位点AA基因型、-1768(T/A)位点TT基因型和-344(T/C)位点TT基因型以及单倍型Haplo2(ATTA)纯合体对中国荷斯坦牛的SCS具有较大的遗传效应,可作为分子标记应用于奶牛乳房炎抗性的筛选。

关键词：中国荷斯坦牛 cxcr1基因 PCR-SSCP 多态性单倍型体细胞评分

中国荷斯坦牛cxcr1基因编码区的遗传多态性

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西北农林科技大学学报：自然科学版 2009年第6期37卷 47-52页

作者：官久强王洪梅王长法李秋玲仲跻峰侯明海帅素容四川农业大学动物科技学院四川雅安625014 山东省农业科学院奶牛研究中心山东济南250100

【目的】研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1基因(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,cxcr1)编码区的遗传多态性。【方法】采用巢式PCR、DNA测序和创造酶切位点法,对中国荷斯坦牛cxcr1基因编码区下游区域的单核苷酸多态位点(Single nucleotid... 详细信息

【目的】研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1基因(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,cxcr1)编码区的遗传多态性。【方法】采用巢式PCR、DNA测序和创造酶切位点法,对中国荷斯坦牛cxcr1基因编码区下游区域的单核苷酸多态位点(Single nucleotide polymorphisms,SNPs)进行筛查,并对筛查到的SNPs进行群体遗传多态性分析。【结果】发现了819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个SNPs,其中995(A/G)和1008(C/T)为首次报道的多态位点,995(A/G)位点导致第332位的Arg突变为His。cxcr1基因819(A/G)、995(A/G)和1008(C/T)3个位点在中国荷斯坦牛群体的优势等位基因分别为G、G和C,其等位基因频率分别为0.634 0,0.733 0和0.706 4。经χ2适合性检验,荷斯坦牛在3个位点均未达到Hardy-Weinberg平衡状态(Pcxcr1基因编码区的遗传多态性比较丰富。

关键词：中国荷斯坦牛 cxcr1基因遗传多态性优势等位基因

澳系进口荷斯坦奶牛cxcr1基因遗传多态性与泌乳性状及体细胞评分的关联性分析

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中国兽医学报 2014年第1期34卷 159-164页

作者：张美荣廖想想陈丹毛永江刘坤陈亮王杏龙杨章平杨利国扬州大学动物科学与技术学院江苏扬州225009 华中农业大学动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室湖北武汉430070 上海牛奶集团海丰奶牛场有限公司江苏大丰2241001

采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对以海丰奶牛场588头澳系进口荷斯坦牛牛趋化因子受体1(Chemokine receptor 1,cxcr1)基因的遗传多态性进行分析;采用混合动物模型分析cxcr1基因2个突变位点与测定日产奶量、乳脂率、乳... 详细信息

采用聚合酶链式反应-单链构象多态性(PCR-SSCP)技术对以海丰奶牛场588头澳系进口荷斯坦牛牛趋化因子受体1(Chemokine receptor 1,cxcr1)基因的遗传多态性进行分析;采用混合动物模型分析cxcr1基因2个突变位点与测定日产奶量、乳脂率、乳蛋白率、305d产奶量、305d乳脂量、305d乳蛋白量及体细胞评分7个性状的相关性,寻找可用于生产实际的分子标记。结果显示,cxcr1基因5′侧翼区-1830位点发生了A→G的突变,检测到AA、AG和GG 3种基因型,频率分别为0.684、0.289和0.027,等位基因A和G的频率分别为0.828和0.172;GG基因型奶牛的日产奶量、SCS和305d产奶量均极显著高于AA基因型(P基因型奶牛(P基因型,基因型频率分别为0.886和0.114,等位基因A和C的频率分别为0.943和0.057。AA型的个体的日产奶量、305d脂肪产量和305d蛋白产量极显著高于AC型个体,而其乳脂率、乳蛋白率和SCS却极显著低于AC型个体(Pcxcr1基因遗传突变对澳系进口荷斯坦牛泌乳性状和乳房炎抗性有较大的遗传效应,可用于澳系进口荷斯坦牛的分子标记辅助选择。

关键词：澳系进口荷斯坦牛 cxcr1基因泌乳性状遗传多态性 PCR—SSCP SCS

中国荷斯坦牛cxcr1基因第二外显子新SNPs与乳腺炎的关联分析

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畜牧兽医学报 2011年第8期42卷 1063-1070页

作者：周雷王洪梅王长法柳楠侯明海李秋玲仲跻峰山东省农业科学院奶牛研究中心济南250100 青岛农业大学动物科技学院青岛266109

通过研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,cxcr1)基因多态性与乳腺炎间的相关性,找到对乳腺炎性状有显著影响的基因型和单倍型组合,为从遗传角度上解决奶牛乳腺炎问题提供参考。采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-P... 详细信息

通过研究中国荷斯坦牛趋化因子受体1(Chemokine(C-X-C motif)receptor1,cxcr1)基因多态性与乳腺炎间的相关性,找到对乳腺炎性状有显著影响的基因型和单倍型组合,为从遗传角度上解决奶牛乳腺炎问题提供参考。采用巢氏PCR、DNA测序和CRS-PCR-RFLP方法,对中国荷斯坦牛的cxcr1外显子2进行遗传多态性研究,分别利用SHEsis软件和PHASE软件进行配对连锁不平衡分析和单倍型分析。结果表明,找到了4个新SNPs,分别为291(C/T)、333(C/T)、337(A/G)和365(C/T)。各SNPs与中国荷斯坦牛体细胞评分(SCS)和产奶量的关联分析表明:337(A/G)和365(C/T)位点的等位基因G、C均为低SCS、高产奶量的优秀等位基因;另外,H3 H7(CCCTGGCC)单倍型杂合个体为低SCS、高产奶量的优秀单倍型组合。cxcr1基因的单倍型H3 H7(CCCTGGCC)在SCS和产奶量方面是优良的单倍型,可作为选择抗乳腺炎的分子标记。

关键词：中国荷斯坦牛 cxcr1基因乳腺炎抗性单倍型

中国荷斯坦牛cxcr1基因SNPs与白血病易感性的关联分析

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农业生物技术学报 2017年第10期25卷 1637-1642页

作者：王梦琦邢世宇倪炜杨奕张慧敏李明勋王成明杨章平毛永江扬州大学动物科学与技术学院扬州大学兽医学院

牛白血病是由牛白血病病毒(Bovine leukemia virus,BLV)引起的牛(Bos taurus)、绵羊(Ovis aries)等动物的慢性肿瘤性疾病,是影响养牛业发展的重要传染病之一。为探索牛趋化因子受体1(chemokine(CX-C motif)receptor 1,cxcr1)基因编码区(... 详细信息

牛白血病是由牛白血病病毒(Bovine leukemia virus,BLV)引起的牛(Bos taurus)、绵羊(Ovis aries)等动物的慢性肿瘤性疾病,是影响养牛业发展的重要传染病之一。为探索牛趋化因子受体1(chemokine(CX-C motif)receptor 1,cxcr1)基因编码区(coding sequence,CDS)SNPs与牛白血病易感性之间的关系,本研究用荧光共振能量转移-定量多聚酶链式反应(fluorescence resonance energy transfer-quantitative polymerase chain reaction,FRET-qPCR)对某大型奶牛场866头中国荷斯坦牛牛白血病感染情况进行检测,同时用飞行时间质谱法(matrix-assisted laser desorption/ionization time of flight mass spectrometry,MALDI-TOF-MS)对cxcr1基因编码区cxcr1-c.642 A>G、cxcr1-c.816C>A、cxcr1-c.980A>G和cxcr1-c.1068G>A 4个SNPs位点进行检测,采用Logistic回归分析cxcr1 SNPs基因型与牛白血病易感性之间的关系,结果表明:在866头奶牛中,患白血病的牛为42头,阳性率为4.85%;cxcr1-c.642 A>G、cxcr1-c.816C>A、cxcr1-c.980A>G和cxcr1-c.1068G>A 4个SNPs位点优势基因型分别为GG、CC、AA和GG型,频率分别为0.580、0.466、0.60和0.658。cxcr1-c.980 A>G位点对牛患白血病的相对风险影响达到显著水平(P=0.016)。cxcr1-c.980 A>G位点GG型基因患白血病的概率为AA型基因的5.04倍。而cxcr1-c.642 A>G、cxcr1-c.816C>A、cxcr1-c.1068G>A和cxcr1单倍型对牛白血病易感性无显著影响(P>0.05)。cxcr1c.980A>G位点可作为奶牛白血病抗病育种的分子标记之一,筛选cxcr1-c.980A>G位点AA型个体有助于降低奶牛对牛白血病的易感性并提高生产效率。

关键词：荷斯坦牛牛白血病 cxcr1基因关联分析单核苷酸多态性

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山羊cxcr1基因的克隆及组织表达谱研究

黑龙江畜牧兽医 2019年第19期 19-24,29,177页

作者：徐涛王利魏勇西南民族大学青藏高原研究院成都610041 西南民族大学生命科学与技术学院成都610041 四川畜牧科学研究院成都610041

为了探究山羊C-X-C趋化因子受体1(C-X-C motif chemokine receptor 1,cxcr1)基因的特点,试验以金堂黑山羊脾脏cDNA为模板克隆了cxcr1基因,借助生物信息学软件及在线软件分析序列,并采用实时荧光定量PCR方法检测cxcr1基因在金堂黑山羊脾... 详细信息

为了探究山羊C-X-C趋化因子受体1(C-X-C motif chemokine receptor 1,cxcr1)基因的特点,试验以金堂黑山羊脾脏cDNA为模板克隆了cxcr1基因,借助生物信息学软件及在线软件分析序列,并采用实时荧光定量PCR方法检测cxcr1基因在金堂黑山羊脾脏、肺脏、肌肉、心脏和肠的5个组织中的相对表达量。结果表明:克隆得到的cxcr1基因序列全长为1 140 bp,完整CDS编码区长1 107 bp,共编码368个氨基酸;所得氨基酸序列与牛进行比对,两者同源性为96.8%;编码蛋白为带正电荷、具有疏水性的稳定蛋白;有7个跨膜结构和32个磷酸化位点,无信号肽;二级结构中α-螺旋比例最高,为54.35%;获得的三级结构模型与人的cxcr1蛋白(PDB:2lnl.1.A)同源性最高,为81.49%;氨基酸比对结果与系统进化树结果相近,金堂黑山羊与牛的亲缘关系最近;cxcr1基因主要表达于肌肉和心脏。说明cxcr1基因可能在山羊肌肉发育相关的信号通路中发挥作用。

关键词： cxcr1基因 PCR扩增金堂黑山羊克隆生物信息学分析组织表达

奶牛cxcr1基因SNPs多态与白血病易感性的关联分析

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奶牛CXCR1基因SNPs多态与白血病易感性的关联分析

作者：邢世宇扬州大学

学位级别：硕士

牛白血病是由牛白血病病毒(BLV)引起的牛、绵羊等动物的慢性肿瘤性疾病,其特征是淋巴样细胞恶性增生和高死亡率。牛白血病分布十分广泛,存在于世界各个养牛国家,在某些牛群中血清阳性率甚至达到60%,是影响养牛业发展的重要传染病之一。... 详细信息

牛白血病是由牛白血病病毒(BLV)引起的牛、绵羊等动物的慢性肿瘤性疾病,其特征是淋巴样细胞恶性增生和高死亡率。牛白血病分布十分广泛,存在于世界各个养牛国家,在某些牛群中血清阳性率甚至达到60%,是影响养牛业发展的重要传染病之一。目前国外对牛白血病的研究较多,通过前人不断研究已证明免疫系统在该病的发生及发病过程中起着重要作用。同时,cxcr1基因在奶牛炎症和肿瘤的发生、增殖、生长等方面发挥重要的调控作用。因此,本研究通过对某大型奶牛场886头中国荷斯坦牛血样进行采集,用BLV FRET-qPCR对牛白血病感染情况进行检测,同时收集采样牛只生产性能测定记录,采用多因素方差法分析白血病在不同产犊季节、测定季节、胎次和泌乳阶段对奶牛泌乳性能(日产奶量、乳脂率、乳蛋白率、体细胞评分、总固体、尿素氮)的影响。同时,用直接测序法对奶牛cxcr1基因编码区(CDS)突变进行检测,筛选出642G>A、816C>A、980G>A和1068G>A 4个SNP位点,再采用飞行时间质谱法对筛查出的突变位点进行SNP分型检测,采用Logistic回归分析cxcr1 SNPs基因型和单倍型与牛白血病的感染之间的关系,以期为牛白血病抗性的分子标记辅助育种提供参考依据,研究主要结果如下:1.在886头奶牛中,患有牛白血病的牛为48头,阳性检出率为5.4%。2.白血病对不同产犊季节、泌乳阶段、胎次及测定季节奶牛泌乳性能的影响都达到了极显著水平(P1)。春季测定阳性牛乳脂率、SCS显著低于阴性牛;泌乳中期阳性牛SCS显著低于阴性牛,泌乳末期阴性牛乳脂率显著高于阳性牛;三胎阴性牛尿素氮含量显著高于阳性牛;夏、冬季节产犊的阴性牛SCS显著高于阳性牛。***1基因CDS区共发现13个SNP位点,经连锁分析分为4个连锁群。从4个连锁群中各选择1个SNP位点进行后续分析,分别是:642G>A、816C>A、980G>A和1068G>A4个SNP位点,利用飞行质谱法对大样本中国荷斯坦牛进行检测。cxcr1-642、cxcr1-816、cxcr1-980和cxcr1-1068 4个SNP位点优势基因型分别为GG、CC、GG和GG型,频率分别为0.58、0.466、0.60和0.658,优势基因分别为G、C、G和G,基因频率是0.76、0.69、0.78和0.81。4个SNP位点共有8种单倍型,其中单倍型GAAG频率最高(0.819),而单倍型GCAG频率最低(0.033)。cxcr1 980G>A位点和单倍型GCAG对牛患白血病的相对风险影响显著(P=0.016)。980G>A位点AA型基因的发生概率为GG型基因的5.04倍,cxcr1单倍型GCAG患牛白血病的风险是GAGG的1.97倍。

关键词：荷斯坦牛牛白血病 cxcr1基因关联分析单核苷酸多态性

奶牛乳腺细胞cxcr1基因在三种菌落刺激下的表达变化研究

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中国奶牛 2017年第6期 27-30页

作者：王珍珍陈仁金杨章平毛永江冀德君徐州医科大学徐州212004 扬州大学动科学院扬州225009

本研究旨在探索在不同菌落刺激下奶牛乳腺上皮细胞中cxcr1基因的表达变化。运用SYBR Green实时荧光定量PCR技术对cxcr1基因mRNA水平进行测定。结果发现cxcr1基因在细胞水平上对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌刺激较敏感,各个时段表... 详细信息

本研究旨在探索在不同菌落刺激下奶牛乳腺上皮细胞中cxcr1基因的表达变化。运用SYBR Green实时荧光定量PCR技术对cxcr1基因mRNA水平进行测定。结果发现cxcr1基因在细胞水平上对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌、链球菌刺激较敏感,各个时段表达差异达显示水平。本研究为今后进一步研究cxcr1基因的表达机理以及奶牛乳房炎的防治奠定了基础。

关键词： cxcr1基因实时定量PCR 奶牛乳腺上皮细胞