检索结果-南通市图书馆

五种真蝽(Pentatoma Olivier) mtDNA-coii基因序列分析及系统发育关系初探(半翅目:蝽科)

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

Entomotaxonomia 2005年第2期27卷 90-96页

作者：卜云郑哲民郭昆陕西师范大学动物研究所陕西西安710062

测定并比较分析了真蝽属(Pentatoma)5种昆虫:褐真蝽***、斜纹真蝽***、红足真蝽***、日本真蝽***和金绿真蝽***以及益蝽亚科2种外群种类(并蝽Pinthaeushumeralis和蠋蝽Armacustos)mtDNA-coii基因部分序列,依据分子数据建立了该5种昆虫... 详细信息

测定并比较分析了真蝽属(Pentatoma)5种昆虫:褐真蝽***、斜纹真蝽***、红足真蝽***、日本真蝽***和金绿真蝽***以及益蝽亚科2种外群种类(并蝽Pinthaeushumeralis和蠋蝽Armacustos)mtDNA-coii基因部分序列,依据分子数据建立了该5种昆虫的系统发育关系。结果显示,5种真蝽coii基因A+T平均含量(73%)高于弹尾目、缨尾目和直翅目昆虫,低于双翅目、鳞翅目及膜翅目昆虫,而与缨翅目的蓟马和半翅目的突角长蝽Oncopeltusfasciatus非常接近。系统发育结果显示,红足真蝽与日本真蝽亲缘关系最近,形成一个姊妹群,斜纹真蝽与金绿真蝽亲缘关系较近,也形成一个姊妹群,褐真蝽为较早分化的种类。

关键词：真蝽 mtDNA coii 基因序列分析系统发育半翅目蝽科

基于coii全基因序列对蜻科部分昆虫的分子系统发育分析(蜻蜓目:差翅亚目)

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

宁夏大学学报（自然科学版） 2009年第4期30卷 370-374页

作者：查岭生张大治郑哲民淮北煤炭师范学院生命科学学院安徽淮北235000 宁夏大学生命科学学院宁夏银川750021 陕西师范大学动物研究所陕西西安710062

通过设计蜻蜓目coii全基因的非特异性引物,获得蜻科5亚科15属21种蜻蜓的21条coii基因全序列.采用Clustal X(1.8),MEGA 2.1,Phylip 3.6以及MrBayes 3.0等生物学软件对其进行分子系统学研究,结果显示,①蜻科coii的A+T含量非常低(69%),这... 详细信息

通过设计蜻蜓目coii全基因的非特异性引物,获得蜻科5亚科15属21种蜻蜓的21条coii基因全序列.采用Clustal X(1.8),MEGA 2.1,Phylip 3.6以及MrBayes 3.0等生物学软件对其进行分子系统学研究,结果显示,①蜻科coii的A+T含量非常低(69%),这与蜻蜓目是一比较原始类群的观点相一致;②蜻科coii全序列均含有2个半胱氨酸,这一点有别于其他类群;③各属内的种类基本聚在一起,大黄赤蜻与红蜻近缘而远离赤蜻属,褐蜻属与赤蜻属近缘,曲缘蜻亚科与赤蜻亚科近缘;④斜痣蜻亚科的进化速度相对较慢,蜻亚科与赤蜻亚科的进化速度稍快.

关键词：蜻科 coii 系统发育蜻蜓目

基于16SrDNA和coii基因序列的蝗总科部分种类分子系统学研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基于16SrDNA和COII基因序列的蝗总科部分种类分子系统学研究

作者：张轶平东北师范大学

学位级别：硕士

蝗总科昆虫是直翅目的重要组成部分,也在食物链中扮演着多种角色,对维持生态系统稳定有不可替代的作用。蝗总科昆虫对农业、牧业和林业的发展有巨大影响,与人类生活息息相关,所以对蝗总科的研究意义重大。在蝗总科的研究中,系统学一直... 详细信息

蝗总科昆虫是直翅目的重要组成部分,也在食物链中扮演着多种角色,对维持生态系统稳定有不可替代的作用。蝗总科昆虫对农业、牧业和林业的发展有巨大影响,与人类生活息息相关,所以对蝗总科的研究意义重大。在蝗总科的研究中,系统学一直是研究的热点。传统分类学主要以形态为依据,已经不能满足现代研究的要求。本研究采用酚-氯抽提、PCR扩增和DNA测序等手段,辅助以Bio Lign、MEGA5.05、PAUP4.0、Mr Bayes3.1.2等软件,对剑角蝗科、斑翅蝗科、槌角蝗科和斑腿蝗科16种蝗虫的16Sr DNA和coii基因,进行序列组成分析、碱基替换分析、密码子使用分析、氨基酸组成分析、遗传距离分析和碱基替换饱和度分析,并最后以短额负蝗为外群,采用ML、MP、NJ、BI法,分别对16Sr DNA基因、coii基因和两个基因联合构建系统发育树,进行分子系统学研究。通过研究分析,得到以下主要结论:(1)蝗总科线粒体基因具有明显A+T偏向性,其中16Sr DNA基因A+T含量为71.2%,coii基因A+T含量为71.8%。(2)16Sr DNA基因保守性为66.5%,coii基因保守性为53.2%。16Sr DNA基因比coii基因更保守。同时,基因中的第三位点的变异容易被保留下来,所以第三位点变异率更高。(3)coii基因中出现频率较高的密码子为AUU(21.3)、UUA(17)和ACA(12.1),而CUG、UCG和GCG没有出现,密码子出现频率的差异可能与线粒体内相应种类t RNA含量有关。含量较高的氨基酸为异亮氨酸(11.57)、亮氨酸(11.49)和丝氨酸(9.72)。(4)16种蝗虫的16Sr DNA基因的非矫正遗传距离在0.006-0.151之间。16种蝗虫的coii基因的非矫正遗传距离范围在0.007-0.236之间。(5)通过建立遗传距离与R值、TS、TV的关系,证明该两个基因的碱基替换没有达到饱和。(6)在系统发育关系上,剑角蝗科、斑翅蝗科、槌角蝗科和斑腿蝗科互为单系群。红翅皱膝蝗与鼓翅皱膝蝗亲缘关系较近,但不是一个物种(支持率95)。黄胫小车蝗并没有和亚洲小车蝗形成姊妹群,而是与轮纹异痂蝗亲缘关系更近。本论文通过测定16种蝗虫的16Sr DNA和coii基因序列,对其进行系统发育分析,为蝗虫的系统分类提供了分子依据。后续工作中将增加蝗虫种类,加大扩增片段长度,以获得更可靠的系统发育信号。

关键词：蝗总科系统学 16SrDNA coii

日本鬼鲉同工酶组织差异、基于Cytb，coii的系统发育分析及微卫星多态性标记筛选

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

日本鬼鲉同工酶组织差异、基于Cytb，COII的系统发育分析及微卫星...

作者：董徐辉宁波大学

学位级别：硕士

日本鬼鲉是一种有较高经济价值的的鱼类。本文从日本鬼鲉不同组织同工酶差异,基于Cyt b,coii基因序列的系统发育地位分析和多态性微卫星引物的筛选等三方面进行了研究。采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳技术,对象山港野生日本鬼鲉的9种组织... 详细信息

日本鬼鲉是一种有较高经济价值的的鱼类。本文从日本鬼鲉不同组织同工酶差异,基于Cyt b,coii基因序列的系统发育地位分析和多态性微卫星引物的筛选等三方面进行了研究。采用垂直聚丙烯酰胺平板电泳技术,对象山港野生日本鬼鲉的9种组织器官的8种同工酶进行研究,并分析了其酶谱表型。结果表明,琥珀酸脱氢酶在所有组织中均存在,组织间差异较小;乳酸脱氢酶、苹果酸脱氢酶、苹果酸酶、酯酶、醇脱氢酶、过氧化物酶、超氧化物歧化酶则具有明显的组织特异性,且这些酶在表型、分布和活性上均表现出高度的组织特异性。根据鲉行目鱼类cyt b和COⅡ上下游保守序列各自设计引物,对日本鬼鲉的线粒体DNA进行PCR扩增,克隆并测定了cyt b和COⅡ因的全序列, COⅡ基因为691 bp和cyt b为1141 bp。从GenBank下载鲉形目28种鱼类的cytb部分或全序列和10种鱼类的COⅡ部分或全序列,然后进行比对分析,用NJ法和ML法构建分子系统发育树。系统发育树结果显示:线粒体cytb和COⅡ基因序列构建的分子系统树,和传统分类方法的结果基本一致;毒鲉科的日本鬼鲉和鲉科的关系最近;在飞角鱼科(Dactylopteridae)是否属于鲉形目还是单独成飞角鱼目的问题上,本研究比较支持飞角鱼科(Dactylopteridae)独立归成飞角鱼目(Dactylopteriformes)。鲉形目的COⅡ与昆虫类的COⅡ不同,鲉形目的COⅡ基因比cyt b基因保守,即COⅡ基因比cyt b基因进化慢。COⅡ基因进化树相应的节点上数值稍微较高。用磁珠富集法构建的日本鬼鲉基因组微卫星文库中共有近1000个单菌落。随机挑选352个克隆用载体引物进行第二次筛选,获得阳性候选克隆262个并随机选择了174个克隆进行测序。测序结果表明,156个克隆含有明显(重复次数大于5次)的微卫星重复单元,共含有181个微卫星结构域。两碱基重复次数大于12或三碱基重复次数大于8的克隆共67个。所获得含微卫星的序列总长度范围是152-854bp,平均长度在330 bp左右。其中两碱基重复单元出现的次数最多,占所有分离的微卫星数目的79.0%,三碱基重复单元出现的次数居次,10.5%,此外还发现一碱基重复,四碱基重复,五碱基重复等多种重复类型,共占分离微卫星数目的10.5%,在获得的181个微卫星位点中,完美型微卫星序列共有98个,占54.1%;非完美型的66个,占36.5%;复合型的17个,占9.4%。对两碱基复次数大于12或三碱基重复次数大于8的克隆的67个克隆,用Primer premier 5.0引物设计软件设计65对引物,并随机挑选32个合成。用32对引物在厦门日本鬼鲉群28个个体进行PCR扩增,筛选出25对有效扩增的微卫星引物,其中19对微卫星引物在此群体有高度多态性。每个位点等位基因个数(A)在4-14之间,观察杂合度在0.500–0.892之间,期望杂合度0.521–0.914之间。有两个位点(J004, IJ014)严重偏离Hardy-Weinberg平衡。本文首次报道了日本鬼鲉微卫星DNA标记的多态性筛选,在毒鲉科鱼类中也尚属第一次。

关键词：日本鬼鲉同工酶组织特异性表达 Cyt b coii 系统发育微卫星多态性

基于Cyt b和coii基因序列的网翅蝗科(直翅目:蝗总科)部分种类的分子系统学研究

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

基于Cyt b和COII基因序列的网翅蝗科(直翅目:蝗总科)部分种类的分...

广东省稻区越冬代大螟种群动态监测及遗传多态性差异分析

2012年中国西部动物学首届学术研讨会

作者：王延峰王文强郑哲民黄原杨亮延安大学生命科学学院陕西师范大学动物研究所

本研究采用PCR产物直接测序法测定了2亚科31种网翅蝗科昆虫及1种癞蝗(外群)的线粒体基因Cyt b和coii全序列,使用MEGA V2.1进行序列组成分析,对线粒体基因Cyt b、coii数据集按照蛋白质基因密码子第一、二、三位点划分子集,并组成联合数据... 详细信息

本研究采用PCR产物直接测序法测定了2亚科31种网翅蝗科昆虫及1种癞蝗(外群)的线粒体基因Cyt b和coii全序列,使用MEGA V2.1进行序列组成分析,对线粒体基因Cyt b、coii数据集按照蛋白质基因密码子第一、二、三位点划分子集,并组成联合数据集coii&Cyt b,对各数据集其子集进行了数据探索研究。在PAUP中应用NJ法、MP法、ML法以及在Mrbayes V3.0中应用贝叶斯系统发育推论(BI)法进行系统发育关系重建,结果表明所研究的网翅蝗科部分种类的系统发育关系基本与中国的传统形态学分类体系没有差别,竹蝗亚科为较早分化出来的类群,其次为网翅蝗亚科;竹蝗新种和黄脊雷篦蝗聚为一支和其它竹蝗属类群形成姊妹群,因此建议雷篾蝗属并入竹蝗属;隆额网翅蝗和宽翅曲背蝗聚为另一支,故建议曲背蝗属并入网翅蝗属。雏蝗属的四个亚属中黑翅亚属、曲隆亚属和直隆亚属这三个亚属的单系性均得到稳健的支持,黑翅亚属升级为属可以成立,曲隆亚属和直隆亚属的亚属地位明确,它们是姊妹群。然而短翅亚属的单系性在各种分析中皆得不到支持,它很可能是多系起源。

关键词：网翅蝗科 Cyt b coii 分子进化系统学

来源： cnki会议评论

在线全文

cnki会议

学校读者我要写书评

暂无评论

植物保护学报 2023年第5期50卷 1120-1129页

作者：吴阳刚袁龙宇黄德超李燕芳肖汉祥张振飞广东省农业科学院植物保护研究所农业农村部华南果蔬绿色防控重点实验室广东省植物保护新技术重点实验室广州510640 华中农业大学植物科学技术学院武汉430070 广东省有害生物预警防控中心广州510640

为制订行之有效的大螟Sesamia inferens区域综合防治策略,2018—2022年对广东省珠三角稻区、粤东稻区、粤西稻区和粤北稻区9个市的越冬代大螟进行调查和采样,于室内对样品进行DNA提取、扩增和序列分析,采用线粒体COI、coii等分子标记技... 详细信息

为制订行之有效的大螟Sesamia inferens区域综合防治策略,2018—2022年对广东省珠三角稻区、粤东稻区、粤西稻区和粤北稻区9个市的越冬代大螟进行调查和采样,于室内对样品进行DNA提取、扩增和序列分析,采用线粒体COI、coii等分子标记技术对越冬代大螟进行单倍型分析、系统发育树分析和遗传多态性分析。结果显示,2018—2022年广东省稻区越冬代大螟虫量很高,粤东稻区和珠三角稻区平均虫量均大于大发生量。在越冬代大螟幼虫线粒体COI基因样本中共检测出20个单倍型,89个多态位点,总群体单倍型多样度为0.840,固定系数为0.473,基因流为0.56,总群体的Tajima’s D值为-1.965,Fu’s Fs值为-2.454。在越冬代大螟幼虫线粒体coii基因样本中共检测出19个单倍型,372个多态位点,总群体单倍型多样度为0.790,固定系数为0.816,基因流为0.11,总群体的Tajima’s D值为3.224,Fu’s Fs值为54.260。表明广东省不同稻区越冬代大螟种群间的遗传多态性较高,亲缘关系近,但存在着遗传分化现象,种群间遗传分化现象主要原因为遗传漂变,种群未经历明显扩张。

关键词：越冬代大螟虫量监测地理种群遗传分化 COI coii 基因流

中国南方双斑长跗萤叶甲地理种群遗传结构及Wolbachia感染

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

昆虫学报 2021年第6期64卷 730-742页

作者：李菁张小飞徐玲玲申圆圆李肖肖王振营西安文理学院生物与环境工程学院西安710065 西安市农业技术推广中心西安710061 中国农业科学院植物保护研究所北京100193

【目的】双斑长跗萤叶甲Monolepta hieroglyphica为多食性害虫,可取食为害多种农作物。本研究旨在探究中国南方地区分布的双斑长跗萤叶甲地理种群的遗传多样性、遗传结构及种群间的遗传分化程度与基因流水平,探究共生菌Wolbachia在中国... 详细信息

【目的】双斑长跗萤叶甲Monolepta hieroglyphica为多食性害虫,可取食为害多种农作物。本研究旨在探究中国南方地区分布的双斑长跗萤叶甲地理种群的遗传多样性、遗传结构及种群间的遗传分化程度与基因流水平,探究共生菌Wolbachia在中国南方双斑长跗萤叶甲地理种群中的多样性和感染情况。【方法】以线粒体coii基因作为分子标记,对中国南方双斑长跗萤叶甲14个地理种群403头个体的coii基因片段进行PCR扩增及测序,分析单倍型多样性(Hd)、种群间遗传分化指数(Fst)和基因流(Nm),并进行分子方差分析(AMOVA)以及Tajima’s D和Fu’s Fs中性检验,构建单倍型中介网络关系图及系统发育树。PCR扩增Wolbachia的wsp基因,对供试种群进行Wolbachia感染率检测,并利用获得的wsp基因序列进行Wolbachia株系区分和系统发育分析。【结果】在供试的双斑长跗萤叶甲403头个体中共检测到23种coii基因单倍型,在系统进化上分成两大分支。总种群Hd为0.748,各种群的Hd在0.394~0.782间。中性检验结果表明种群在进化上遵循中性模型,在较近的历史时期内没有经历明显的群体扩张事件。总种群的Fst为0.2481,Nm为0.76,AMOVA结果表明种群间的遗传分化主要来自种群内部,占方差比率的73.75%。种群间的遗传距离与地理距离间无显著相关性(R=0.2898,P=0.0640)。14个地理种群的Wolbachia感染率在92.59%~100%之间,平均感染率为97.60%;基于wsp基因序列,在检测的感染个体中共发现6种Wolbachia株系(wMhie1~wMhie6),均属于A大组,这6种株系与已知的代表性株系区别明显而在系统发生树中单独聚为一个分支。【结论】中国南方双斑长跗萤叶甲种群遗传多样性较高,多数种群间存在明显的遗传分化,种群间基因交流较低,遗传分化与地理隔离之间无显著相关性。Wolbachia在中国南方双斑长跗萤叶甲种群中具有很高的感染率及丰富的感染类群。

关键词：双斑长跗萤叶甲地理种群 coii 单倍型遗传结构 Wolbachia

Genetic variations of Chrysomya megacephala populations in Malaysia (Diptera: Calliphoridae)

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

Advances in Entomology 2014年第1期2卷 49-56页

作者： Yi Vern Chong Tock H. Chua Beng Kah Song School of Medicine Universiti Malaysia Sabah Kota Kinabalu Sabah Malaysi School of Science Monash University Bandar Sunway Selangor Malaysia

Samples of Chrysomya megacephala were collected from five sites in Malaysia, namely Penang, Selangor, Pahang, Johor, and Sabah. Molecular analysis was conducted using the cytochrome oxidase gene and ISSR-PCR to identify polymorphic markers for distinguishing the populations and to estimate the genetic relatedness among these populations. Two SNPs were detected at sequence position 952 (M1) and 1120 (M2), involving transitional substitutions with cytosine (C) being replaced with thymine (T) and guanine (G) replaced with adenine (A), but there was no amino acid variation. Penang and Selangor shared the same nucleotide T at the M1 position, while M2 variation was found in Pahang population only. The NJ tree based on the COI sequence showed two main groups with branch A comprised of Penang and Selangor populations while branch B consisted of Johor, Pahang and Sabah populations. ISSR analysis indicated that 18 scorable bands (size 200 to 1800 bp) were amplified with UBC808 and UBC835, 11 bands of which were polymorphic and the rest monomorphic. Sabah population was left out for further analysis due to small number of specimens. UPGMA dendrogram using ISSR data showed two branches, one consisted of Penang and Selangor populations, while the other consisted of Pahang and Johor individuals. The polymorphic loci (P) for Johor Baru were 5.56%, Penang 16.70%, Selangor and Pahang 22.2%. Nei’s H values are respectively 0.018, 0.060, 0.050 and 0.051. Similarly the Shannon index diversity values are respectively 0.028, 0.089, 0.085 and 0.087. The lowest genetic distance (0.0997) was between Penang and Selangor populations, while the highest (0.613) was observed between Penang and Pahang populations. AMOVA shows low genetic differentiation among individuals within populations and that 85.6% of total genetic variance was among individuals between populations. This was also indicated by FST statistic of 0.8562. The gene flow between populations was low with Nm of 0.042, and Mantel’s

关键词： Populations Genetics Chrysomya megacephala COI coii ISSR Malaysia

维普期刊数据库评论

在线全文

维普期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中华按蚊的分子鉴定标准

重庆师范大学学报（自然科学版） 2014年第4期31卷 40-44页

作者：杨飞龙李旭东闫振天陈斌重庆师范大学生命科学学院昆虫与分子生物学研究所重庆401331

中华按蚊(Anopheles sinensis)是重要的传疟媒介之一,广泛分布于中国和东南亚,它的形态特征和赫坎按蚊种团(Anopheles hyrcanus Group)其他蚊种十分近似,建立中华按蚊的分子鉴定标准十分重要。本研究从实验室中华按蚊品系的一个个体测... 详细信息

中华按蚊(Anopheles sinensis)是重要的传疟媒介之一,广泛分布于中国和东南亚,它的形态特征和赫坎按蚊种团(Anopheles hyrcanus Group)其他蚊种十分近似,建立中华按蚊的分子鉴定标准十分重要。本研究从实验室中华按蚊品系的一个个体测序了线粒体DNA COI和coii基因,以及核糖体DNA D2、D3和ITS2位点,测序片段长度分别为658、663、551、365、556 bp。这些序列和近缘蚊种对应序列分别用最大似然法构建系统发育树,结果表明中华按蚊的序列均聚合为同一支。将测序的中华按蚊coii序列和已知蚊种的对应序列比对发现其中的保守位点分别是第133位点C,321位点C,382位点C,435位点T,516位点A和651位点C,线粒体DNA COI和coii基因序列的碱基组成具有AT偏向性,分别占69.15%和74.96%。提交了5条序列到NCBI数据库,其中核糖体DNA D2位点序列是首次在中华按蚊中公开报道。

关键词：中华按蚊 COI coii D2位点 D3位点 ITS2位点分子鉴定标准