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基于全基因组测序平均核苷酸一致性的生胞梭菌(Clostridium sporogenes)鉴定

食品与发酵工业 2022年第19期48卷 44-49页

作者：曹艳花冯会粉程坤刘波都海渤谢九艳辛迪姚粟中国食品发酵工业研究院有限公司中国工业微生物菌种保藏管理中心北京100015

基于全基因组测序通过平均核苷酸一致性鉴定生胞梭菌(Clostridium sporogenes)CICC 10385(=cmcc 64941)至种水平。通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 10385的基础信息,并采用BGISEQ-500基因测序仪进行全基因组测序分析全基因组平均... 详细信息

基于全基因组测序通过平均核苷酸一致性鉴定生胞梭菌(Clostridium sporogenes)CICC 10385(=cmcc 64941)至种水平。通过形态学和生理生化特征分析获得CICC 10385的基础信息,并采用BGISEQ-500基因测序仪进行全基因组测序分析全基因组平均核苷酸一致性。结果显示,菌株CICC 10385的基因组大小为4252276 bp,含有58个contigs,基因组(G+C)mol%为27.9%。该菌16S rRNA基因序列与生胞梭菌(***)、肉毒梭菌(***)、孔氏梭菌(***)和***最为相似,平均核苷酸一致性(average nucleotide identity,ANI)分析显示,该菌与生胞梭菌(***)DSM 795~T(GCA_001020205.1)ANI值为99.39%,与梭菌属其余菌种ANI值均低于95%,可将CICC 10385鉴定为生胞梭菌(***)。基于全基因组测序的ANI分析是一种准确有效的菌种鉴定方法,为该菌及梭菌属(Clostridium sp.)相关菌种鉴定研究提供了理论依据,为该菌的生物学功能研究奠定了基础。

关键词：生胞梭菌 CICC 10385 cmcc 64941 全基因组测序平均核苷酸一致性

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