检索结果-南通市图书馆

The direct targets of cbfs:In cold stress response and beyond

Journal of Integrative Plant Biology 2021年第11期63卷 1874-1887页

作者： Yue Song Xiaoyan Zhang Minze Li Hao Yang Diyi Fu Jian Lv Yanglin Ding Zhizhong Gong Yiting Shi Shuhua Yang State Key Laboratory of Plant Physiology and Biochemistry College of Biological SciencesChina Agricultural UniversityBeijing 100193China

Cold acclimation in Arabidopsis thaliana triggers a significant transcriptional reprogramming altering the expression patterns of thousands of cold-responsive(COR) genes. Essential to this process is the C-repeat binding factor(cbf)-dependent pathway, involving the activity of AP2/ERF(APETALA2/ethylene-responsive factor)-type cbf transcription factors required for plant cold acclimation. In this study, we performed chromatin immunoprecipitation assays followed by deep sequencing(ChIP-seq) to determine the genomewide binding sites of the cbf transcription factors. Cold-induced cbf proteins specifically bind to the conserved C-repeat(CRT)/dehydrationresponsive elements(CRT/DRE;G/ACCGAC) of their target genes. A Gene Ontology enrichment analysis showed that 1,012 genes are targeted by all three cbfs. Combined with a transcriptional analysis of the cbf1,2,3 triple mutant, we define 146 cbf regulons as direct cbf targets. In addition, the cbf-target genes are significantly enriched in functions associated with hormone, light,and circadian rhythm signaling, suggesting that the cbfs act as key integrators of endogenous and external environmental cues. Our findings not only define the genome-wide binding patterns of the cbfs during the early cold response, but also provide insights into the role of the cbfs in regulating multiple biological processes of plants.

关键词： Arabidopsis cbf target genes ChIP-seq cold acclimation

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：