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complicated target recognition by archaeal box c/d guide rnas

Science china(Life Sciences) 2024年第4期67卷 631-644页

作者： Jiayin Wang Songlin Wu Keqiong Ye Key Laboratory of rna Science and Engineering CAS Center for Excellence in BiomacromoleculesInstitute of BiophysicsChinese Academy of SciencesBeijing 100101China University of chinese Academy of Sciences Beijing 100049China

Box c/d rnas guide the site-specific formation of 2′-O-methylated nucleotides(Nm)of rnas in eukaryotes and *** c/d rnas have been profiled in several archaea,their targets have not been experimentally ***,we mapped Nm in r rnas,t rnas,and abundant small rnas(s rnas)and profiled c/d rnas in the crenarchaeon Sulfolobus *** targets of c/d rnas were assigned by analysis of base-pairing interactions,in vitro modification assays,and gene deletion experiments,revealing a complicated landscape of c/d rna-target interactions.c/d rnas widely use dual antisense elements to target adjacent sites in r rnas,enhancing modification at weakly bound *** consecutive sites can be guided with the same antisense element upstream of box d or d′,a phenomenon known as doublespecificity that is exclusive to internal box d′in eukaryotic c/d *** c/d rnas guide modification at a single non-canonical *** study reveals the global landscape of rna-guided 2′-O-methylation in an archaeon and unexpected targeting rules employed by c/d rna.

关键词： c/d rna 2′-O-methylation archaea guide rna rna modification

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