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利用biolog技术分析蓝莓园土壤微生物群落的碳代谢特征

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中国林副特产 2017年第2期 13-16页

作者：焦奎宝吴立仁杜汉军刘文东阎聪黑龙江省农业科学院浆果研究所黑龙江绥棱152200

采用biolog技术分析绥棱和伊春2处蓝莓园中3个蓝莓品种‘美登’、‘北陆’、‘笃斯’以及清耕(对照)土壤微生物群落的碳代谢特征。结果表明:栽植蓝莓提高了土壤微生物群落碳代谢的强度和多样性。3个品种之间比较,‘笃斯’显著(P0.05)。... 详细信息

采用biolog技术分析绥棱和伊春2处蓝莓园中3个蓝莓品种‘美登’、‘北陆’、‘笃斯’以及清耕(对照)土壤微生物群落的碳代谢特征。结果表明:栽植蓝莓提高了土壤微生物群落碳代谢的强度和多样性。3个品种之间比较,‘笃斯’显著(P0.05)。主成分分析(耦合分析强度和多样性)结果表明,‘笃斯’土壤微生物碳代谢特征与另外两个蓝莓品种‘美登’和‘北陆’之间的差异较大,而后两者之间的差异较小。另外,取样地点(不同蓝莓园)对土壤微生物碳代谢特征也有一定的影响。研究的结果可为制定蓝莓园土壤管理措施提供一定的理论依据和新的思路。

关键词：蓝莓土壤微生物碳代谢特征 biolog技术土壤管理

基于biolog技术倒置/常规A^2/O工艺不同碳源类型条件下微生物群落代谢活性的差异

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城市环境与城市生态 2014年第4期27卷 22-26页

作者：刘长青李梅华曲燕慧康兴生毕学军青岛理工大学青岛市新型环保技术重点实验室青岛266033 山东省环境保护科学研究设计院济南250014

基于分别运行倒置/常规A2/O工艺的试验系统,研究不同碳源类型条件下两系统微生物群落代谢活性的差异。实验结果表明,不论在何种进水碳源类型条件下,倒置A2/O工艺系统微生物基于biolog所计算的AWCD(平均色度)值均高于常规A2/O工艺,分别提... 详细信息

基于分别运行倒置/常规A2/O工艺的试验系统,研究不同碳源类型条件下两系统微生物群落代谢活性的差异。实验结果表明,不论在何种进水碳源类型条件下,倒置A2/O工艺系统微生物基于biolog所计算的AWCD(平均色度)值均高于常规A2/O工艺,分别提高15.22%和9.16%,倒置A2/O工艺微生物对碳源的代谢能力以及其代谢活性均高于常规A2/O工艺;进水中挥发性脂肪酸所占比例对工艺微生物群落代谢活性有着显著影响,该比例从60%提高到100%时,倒置A2/O系统和常规A2/O系统AWCD平均值分别提高39%和32%,说明挥发性脂肪酸所占比例越高,对应的微生物群落代谢活性越强;不同工艺的微生物群落结构对进水条件变化的适应程度不同,倒置A2/O工艺系统和常规A2/O工艺系统中的显阳性碳源种类分别减少了2种和4种,说明倒置A2/O工艺系统微生物在进水条件变化时群落结构变化的程度小于常规A2/O工艺。

关键词：微生物群落 biolog技术倒置A2 O工艺常规A2 O工艺代谢活性代谢能力

一种基于biolog代谢指纹分析的油气微生物勘探新方法

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微生物学报 2012年第4期52卷 505-511页

作者：廖先燕张涛曾军孙建胡雯娄恺新疆大学生命科学与技术学院乌鲁木齐830046 新疆农业科学院微生物应用研究所乌鲁木齐830091

【目的】建立基于土壤微生物群落生理功能代谢的油气微生物勘探新方法。【方法】采集新疆玛北油气藏区浅层地表土壤样品45份,非油气藏区样品25份,利用biolog微平板,测定微生物群落代谢活性,采用判别分析模型判断油气藏区微生物异常。【... 详细信息

【目的】建立基于土壤微生物群落生理功能代谢的油气微生物勘探新方法。【方法】采集新疆玛北油气藏区浅层地表土壤样品45份,非油气藏区样品25份,利用biolog微平板,测定微生物群落代谢活性,采用判别分析模型判断油气藏区微生物异常。【结果】从95种碳源中,筛选到10种能够体现油气藏区与非油气藏区土壤微生物群落结构差异的典型碳源,利用判别函数对试验及对照区进行回判,油气藏区判别正确率为97.8%,非油藏区判别正确率为100%,总判别正确率为98.6%。【结论】biolog技术能高效准确的用于油气藏初步勘测。

关键词：土壤微生物群落油气勘探 biolog技术

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基于牡丹根际土壤微生物的中药材道地性研究

药学学报 2016年第8期51卷 1325-1333页

作者：郑艳刘炜黄军祥侯宇荣安徽师范大学生命科学学院中药资源研究所安徽芜湖241000 安徽省中药日化产品工程技术研究中心安徽芜湖241000

采用biolog ECO微平板和454焦磷酸测序技术,研究牡丹皮五产区不同生长发育时期药用牡丹根际土壤微生物的整体活性和真菌的多样性,旨在探讨中药材道地性与土壤微生物的相关性。结果表明五产区牡丹4个生长时期根际土壤的平均颜色变化率值... 详细信息

采用biolog ECO微平板和454焦磷酸测序技术,研究牡丹皮五产区不同生长发育时期药用牡丹根际土壤微生物的整体活性和真菌的多样性,旨在探讨中药材道地性与土壤微生物的相关性。结果表明五产区牡丹4个生长时期根际土壤的平均颜色变化率值呈升高趋势。按相似性97%分类标准可将测序获得的272 463条优质序列分为9 703个可操作分类单元;排除12%-58%未名真菌,五产区药用牡丹根际土壤检出真菌5门、22纲、70目、139科、266属,可分为Blastocladiales、Chytridiomycota、Dikarya、Glomeromycetes四大支系。其中Leptosphaeria等24属真菌在各产区均有分布,Curvularia等6属仅分布于道地产区;Guehomyces、Exophiala、Fusarium为道地产区优势属,Leptosphaeria、Cryptococcus、Exophiala、Fusarium、Ceratobasidium为非道地产区优势属。PCo A分析表明铜陵和南陵产区4个时期以及菏泽产区的萌芽期、果期真菌组成较为接近。Heatmap显示铜陵和南陵产区根际土壤真菌群落结构系统发育相似,亳州、菏泽和洛阳三产区的相似。总体而言,牡丹道地产区微生物整体活性高于非道地产区,根际土壤真菌在各产区大多呈现特异性分布,不仅种群组成多样、潜在新菌种丰富,而且道地产区真菌系统发育相似性较高。

关键词：牡丹根际微生物 biolog技术 454焦磷酸测序中药材道地性

马铃薯健株与黄萎病株根际土壤真菌群落结构及其对碳源利用特征

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中国农业科学 2021年第2期54卷 296-309页

作者：赵卫松郭庆港苏振贺王培培董丽红胡卿鹿秀云张晓云李社增马平河北省农林科学院植物保护研究所/河北省农业有害生物综合防治工程技术研究中心/农业农村部华北北部作物有害生物综合治理重点实验室

【目的】通过研究马铃薯健康植株与黄萎病株的根际土壤真菌群落结构与功能多样性的差异,明确土壤真菌群落结构与黄萎病发生之间的关系,为最终从微生物生态学的角度解释马铃薯黄萎病的发生原因及其生态防控提供理论依据。【方法】以河北... 详细信息

【目的】通过研究马铃薯健康植株与黄萎病株的根际土壤真菌群落结构与功能多样性的差异,明确土壤真菌群落结构与黄萎病发生之间的关系,为最终从微生物生态学的角度解释马铃薯黄萎病的发生原因及其生态防控提供理论依据。【方法】以河北省坝上地区马铃薯健株与黄萎病株的根际土壤为研究对象,分别利用实时荧光定量PCR(real-time PCR)和高通量测序(Illumina MiSeq)技术检测根际土壤中大丽轮枝菌(Verticillium dahliae)ITS基因拷贝数量并分析真菌群落结构变化,结合冗余分析(RDA)明确真菌群落结构与土壤养分的相关性。同时利用biolog-ECO平板法比较健株与黄萎病株根际土壤微生物对碳源的利用能力。【结果】马铃薯黄萎病的发生与土壤中大丽轮枝菌ITS基因拷贝数量存在相关性,在病株根际土壤中病原菌数量高,而在健株根际土壤中未检测到病原菌。高通量测序分析表明,病株根际土壤真菌多样性指数低于健康植株,但多样性差异不显著。在群落组成的门水平上,与健株根际土壤相比,病株根际土壤中的子囊菌门(Ascomycota)和丝孢菌门(Mortierellomycota)相对丰度上升幅度分别为20.68%和16.16%,而担子菌门(Basidiomycota)的相对丰度下降51.43%。在属水平上,病株根际土壤中轮枝菌属(Verticillium)、青霉属(Penicillium)、维希尼克氏酵母属(Vishniacozyma)、红酵母属(Rhodotorula)和芽枝霉属(Cladosporium)的相对丰度呈上升趋势,增加倍数分别为71.96、3.62、6.11、15.38和6.24倍,而小不整球壳属(Plectosphaerella)、Guehomyces、葡萄穗霉属(Stachybotrys)、赤霉属(Gibberella)、曲霉属(Aspergillus)菌群的相对丰度下降幅度分别为45.10%、61.41%、96.87%、45.85%和44.39%。真菌群落组成与土壤养分的冗余分析(RDA)表明,健株根际土壤优势群落的相对丰度(如小不整球壳属、Guehomyces、葡萄穗霉属、赤霉属、曲霉属)与硝态氮、有机质和pH呈正相关,而黄萎病株根际土壤优势群落的相对丰度(如轮枝菌属、链格孢属、刺盘孢属、被孢霉属、腐质霉属、青霉属、维希尼克氏酵母属、红酵母属和芽枝霉属)与无机磷和速效磷呈正相关。不同根际土壤的AWCD值表明,病株根际土壤微生物对碳源的利用能力高于健株。进一步分析发现,与健株相比,病株土壤微生物对羧酸类碳源的利用能力显著提高,而对氨基酸类、胺类、碳水化合物类、聚合物类和双亲化合物类碳源利用能力差异不显著。【结论】病株的根际土壤真菌多样性降低和群落结构改变是马铃薯黄萎病发生的重要特征,其中轮枝菌属菌群的相对丰度显著提高是最主要特征,并且真菌群落结构受土壤养分影响。同时,病株根际土壤微生物对羧酸类碳源利用能力显著提高。

关键词：马铃薯黄萎病大丽轮枝菌根际土壤真菌群落结构高通量测序土壤养分 biolog技术

外源磺胺二甲嘧啶对施用粪肥的菜地土壤中微生物群落多样性的影响

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华南农业大学学报 2018年第6期39卷 24-31页

作者：王美张文娟郑粤琪陈思远孙永学华南农业大学兽医学院/国家兽药安全评价(环境评估)实验室/广东省兽药研制与安全评价重点实验室广东广州510642

【目的】明确磺胺二甲嘧啶(SM2)随粪便施入土壤对土壤微生物群落造成的影响,为合理进行养殖场周围土壤环境质量评估和施肥管理提供参考依据。【方法】收集养殖场附近未经抗生素污染的粪便和土壤,构建粪便–土壤模型,设置不同SM2添加剂... 详细信息

【目的】明确磺胺二甲嘧啶(SM2)随粪便施入土壤对土壤微生物群落造成的影响,为合理进行养殖场周围土壤环境质量评估和施肥管理提供参考依据。【方法】收集养殖场附近未经抗生素污染的粪便和土壤,构建粪便–土壤模型,设置不同SM2添加剂量的处理,分别为对照组(0)、低剂量组(5μg·kg^(-1))、中剂量组(500μg·kg^(-1))和高剂量组(5 000μg·kg^(-1)),并分别于粪便和SM2施入1、7、14和50 d后采集土壤样品,采用biolog技术以及磷脂脂肪酸(Phospholipid fatty acid,PLFA)标记法对比分析不同处理组土壤微生物群落的碳源利用能力、菌群结构和功能多样性变化。【结果】SM2的施入提高了土壤微生物群落的总体碳源利用能力,中、高剂量组在施入50 d时对除酯类以外的其他碳源利用能力均强于对照组。低剂量组在施入7 d内对各类碳源利用能力增强,中、高剂量SM2的施入可能会影响土壤群落某些优势物种的繁殖和数量分配。随施入时间的延长,土壤微生物群落对不同剂量SM2反应不同,革兰阳性菌、革兰阴性菌以及真菌数量变化显著,放线菌变化不明显。【结论】SM2的施入将长期影响土壤微生物群落的结构与功能多样性。养殖场应及时处理动物排泄物以消除抗生素残留,减少粪肥对土壤环境造成的生态破坏。

关键词：磺胺二甲嘧啶 biolog技术磷脂脂肪酸标记土壤微生物群落多样性碳源利用

油松、虎榛子不同林型土壤微生物功能多样性研究

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干旱区资源与环境 2010年第10期24卷 133-137页

作者：齐雅静白淑兰闫伟邵东华韩胜利内蒙古农业大学林学院呼和浩特010019 内蒙古鄂尔多斯林业研究所鄂尔多斯017000

研究应用biolog技术,对油松、虎榛子不同林型根际土和根围土微生物功能多样性进行了测试,目的是了解油松、虎榛子不同林型中微生物功能多样性变化规律,最终探明在自然森林生态系统中虎榛子的存在对油松的促生作用机理。结果表明:虎榛子... 详细信息

研究应用biolog技术,对油松、虎榛子不同林型根际土和根围土微生物功能多样性进行了测试,目的是了解油松、虎榛子不同林型中微生物功能多样性变化规律,最终探明在自然森林生态系统中虎榛子的存在对油松的促生作用机理。结果表明:虎榛子纯林根际土的AWCD值增长的最快;微生物群落多样性指数和群落主成分分析都显示混交林根际土中的微生物最为稳定;主成分分析显示,起不同生态作用的主要为糖类,其次是羧酸类、氨基酸类和多聚类化合物。

关键词：根际土根围土 biolog技术

施用微生物菌剂对参后地土壤微生物功能多样性的影响

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吉林农业大学学报 2015年第3期37卷 317-322页

作者：马锋敏杨利民肖春萍杨颂吉林农业大学中药材学院长春130118

应用biolog技术研究了施用4种微生物菌剂对参后地土壤微生物群落代谢能力的影响。结果表明:哈茨木霉菌剂和益生元菌剂处理的微生物群落碳源利用率、Shannon指数、丰富度指数高于其他组和对照组;主成分分析结果表明:不同处理土壤微生物... 详细信息

应用biolog技术研究了施用4种微生物菌剂对参后地土壤微生物群落代谢能力的影响。结果表明:哈茨木霉菌剂和益生元菌剂处理的微生物群落碳源利用率、Shannon指数、丰富度指数高于其他组和对照组;主成分分析结果表明:不同处理土壤微生物群落在碳源的利用上存在较大的差异,起分异作用的主要是氨基酸类和糖类碳源。益生元菌剂、哈茨木霉菌剂使土壤微生物对碳源的利用模式发生明显变化,益生元菌剂400 g/m2和哈茨木霉菌剂5 g/m2、8 g/m2对参后地土壤微生物具有较强的改良作用。

关键词：生物菌剂人参 biolog技术功能多样性

三七根腐病株根际土壤真菌群落组成与碳源利用特征研究

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菌物学报 2015年第1期34卷 65-74页

作者：吴照祥郝志鹏陈永亮曾燕郭兰萍黄璐琦王勇陈保冬中国科学院生态环境研究中心城市与区域生态国家重点实验室北京100085 中国药材公司北京100097 道地药材国家重点实验培训基地中国中医科学院北京100700 文山学院文山三七研究院云南文山663000

根腐病是药用植物三七Panax notoginseng的多发性病害,而土壤真菌群落组成与根腐病的发生存在一定的联系。利用末端限制性酶切片段长度多态性分析和biolog技术研究了云南文山三七种植园健康和发病三七植株根际土壤真菌群落结构和碳源利... 详细信息

根腐病是药用植物三七Panax notoginseng的多发性病害,而土壤真菌群落组成与根腐病的发生存在一定的联系。利用末端限制性酶切片段长度多态性分析和biolog技术研究了云南文山三七种植园健康和发病三七植株根际土壤真菌群落结构和碳源利用特征,结果表明健康和发病植株的根际土壤真菌多样性和代谢活性差异不显著,但是真菌群落组成存在差异。健康和发病植株根际土壤都以小茎点霉Phoma exigua及镰孢菌属Fusarium真菌为主要种群,而健康植株根际土壤中火丝菌属Pyronema和被孢霉属Mortierella等真菌类群的相对丰度显著高于发病植株根际土壤,尖孢镰孢菌F.ox‐ysporum和刺座霉属的Volutella colletotrichoides的相对丰度则显著低于发病植株。

关键词：三七根腐病真菌群落末端限制性酶切片段长度多态性分析(T‐RFLP) biolog技术