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Fine Mapping QTLs Affecting Milk Production Traits on bta6 in Chinese Holstein with SNP Markers

Journal of Integrative Agriculture 2013年第1期12卷 110-117页

作者： LIU Rui SUN Dong-xiao WANG Ya-chun YU Ying ZHANG Yi CHEN Hui-yong ZHANG Qin ZHANG Sheng-li ZHANG Yuan College of Animal Science and Technology/Key Laboratory of Animal Genetics and Breeding Ministry of Agriculture/National Engineering Laboratory of Animal Genetics/China Agricultural University Sichuan Animal Science Academy

Our previous studies demonstrated that the region around markers BMS470 and BMS1242 on bta6 showed a linkage to 305-d milk yield and composition traits in the Chinese Holstein population. We herein focused on such narrow region to fine map milk production QTLs with 15 SNPs across 25 Mb with each SNP in 1 Mb within most regions in a Chinese Holstein population with daughter design. 1 449 Holstein cows and 11 sires were genotyped for such SNPs by using TaqMan probe and RFLP assays. Multipoint linkage analysis across family revealed a QTL affecting milk yield between PPARGC1A C4075T and SLC34A2 T1713C. Meanwhile, within family analysis found three milk yield QTLs （two in CR T60984131G-CEP135 C501T and one in PDLIM5 A106C-OPN T3907, a fat yield QTLin UGDH T1670C-CR T60984131G region, and two protein yield QTLs in TBC1D1 G501C-UGDH T1670C and PPARGC1A C4075T-SLC34A2 T1713C, respectively. Associations between aforementioned significant SNP markers and milk production traits were further implemented. We found significant associations of PPARGC1A C4075T, SLC34A2 T1713C with milk yield （P0.05, P0.01, P0.01）, UGDH T1670C, and CR T60984131G with fat yield （P0.01, P0.01）, and PPARGC1A C4075T, SLC34A2 T1713C, UGDH T1670C and OPN T3907 with protein yield （P0.01, P0.01, P0.01, P0.01）. Our findings implied that QTLs affecting milk production traits on bta6 were pleictropism or multigenic effect and PPARGC1A and OPN may be the causal mutations behind milk production QTLs on bta6 in the Chinese Holstein population.

关键词： fine mapping milk production trait SNP bta6 Chinese Holstein

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定位影响中国荷斯坦奶牛产奶性状的位置候选基因

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第十五次全国动物遗传育种学术讨论会

作者：梅瑰张勤丁向东张哲农业生物技术国家重点实验室农业部畜禽遗传育种重点开放实验室中国农业大学动物科技学院广东省农业科学院畜牧研究所广东省动物育种与营养公共实验室

＜正＞引言20世纪以来,奶牛的生产水平大幅度提高,其中由于育种所实现的群体遗传改良起到很大作用。但传统的选择方法进展较慢,如果能找到影响奶牛产奶性状的主效基因,并应用于标记辅助选择,将大大加快遗传

关键词：奶牛 bta6 位置候选产奶性状关联分析

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