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ABCA8通过调控Wnt/β-catenin通路抑制结直肠癌细胞增殖、迁移和侵袭

现代肿瘤医学 2024年第10期32卷 1781-1786页

作者：彭肃阳乐彬单汉国南华大学衡阳医学院附属第二医院胃肠外科湖南衡阳421001

目的:研究atp结合盒亚家族a成员8(ABCA8)对结直肠癌(CRC)细胞增殖、迁移与侵袭的影响,并阐明其作用机制。方法:采用生物信息学分析ABCA8在CRC组织中的表达情况;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测临床CRC癌组织和CRC细胞系中ABCA8 mRN... 详细信息

目的:研究atp结合盒亚家族a成员8(ABCA8)对结直肠癌(CRC)细胞增殖、迁移与侵袭的影响,并阐明其作用机制。方法:采用生物信息学分析ABCA8在CRC组织中的表达情况;采用实时荧光定量PCR(RT-qPCR)法检测临床CRC癌组织和CRC细胞系中ABCA8 mRNA表达水平。采用ABCA8基因过表达慢病毒感染SW480细胞,再将细胞分为对照(Blank)组、空载(Vector)组、ABCA8过表达(Oe-ABCA8)组、Vector+HLY78组和Oe-ABCA8+HLY78组,其中Wnt/β-catenin信号通路激动剂HLY78干预浓度为10μmol/L。CCK-8法检测各组细胞增殖活性;Transwell实验检测各组细胞迁移与侵袭细胞数量;Western blot法检测各组细胞中ABCA8、β-catenin、c-Myc和金属基质蛋白酶9(MMP-9)蛋白表达水平。结果:ABCA8在CRC癌组织和CRC细胞系SW480、SW620、 HCT116和HT-29中均呈低表达水平。与Blank组比较,Oe-ABCA8组SW480细胞增殖活性显著降低(P8表达显著升高(P0.05)。与Vector组比较,Vector+HLY78组SW480细胞增殖活性显著升高(P8组比较,Oe-ABCA8+HLY78组SW480细胞增殖活性显著升高(P8在CRC组织和细胞系中低表达,过表达ABCA8可抑制CRC细胞系SW480的增殖、迁移与侵袭,其作用机制可能与抑制Wnt/β-catenin信号传导有关。

关键词：结直肠癌 atp结合盒亚家族a成员8 细胞增殖细胞迁移细胞侵袭 Wnt/β-catenin信号通路

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ABCA8在结直肠癌中的生物信息学分析及验证

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右江民族医学院学报 2023年第4期45卷 594-601页

作者：台维龙黄天赋曹宇生梁浩源黄许森右江民族医学院研究生学院广西百色533000 右江民族医学院附属医院心胸血管外科广西百色533000 右江民族医学院附属医院胃肠外科广西百色533000

目的研究atp结合盒亚家族a成员8(ABCA8)在结直肠癌中的作用。方法下载癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中的结直肠癌数据,利用limma R包研究ABCA8在TCGA数据集中的表达情况。随即利用结直肠癌的临床生存状态数据研... 详细信息

目的研究atp结合盒亚家族a成员8(ABCA8)在结直肠癌中的作用。方法下载癌症基因组图谱数据库(The Cancer Genome Atlas,TCGA)中的结直肠癌数据,利用limma R包研究ABCA8在TCGA数据集中的表达情况。随即利用结直肠癌的临床生存状态数据研究该基因是否和结直肠癌的生存预后相关。利用基因相关性分析研究ABCA8在结直肠癌中和其他基因之间是否具有相关性。利用R包estimate包和CIBERSORT R包得到结直肠癌中每个样本的肿瘤微环境打分以及运行肿瘤免疫浸润分析,并且对ABCA8基因表达量高低的两个分组之间进行免疫细胞以及肿瘤微环境的表达进行分析。利用免疫检查点相关基因分析ABCA8和其之间的关联。采用Western Blot验证收集的结直肠癌患者癌、癌旁以及正常组织中的ABCA8的表达情况,并且同时验证人类蛋白图谱数据库(The Human Protein Atlas,HPA)中ABCA8基因在结直肠癌以及正常肠道组织中的表达水平变化。结果通过差异分析发现ABCA8在结直肠癌中低表达。通过相关性分析一共得到了多个与ABCA8密切相关的基因。通过肿瘤微环境评分发现依据ABCA8表达水平不同分成的高、低表达两组中,基质评分,免疫评分和肿瘤微环境评分均有差异。利用生物信息学分析还发现ABCA8基因和免疫细胞以及免疫检查点相关基因之间具有明显的关联。通过Western Blot和HPA数据库中发现正常肠组织中ABCA8的表达水平高于结直肠癌组织。结论ABCA8在结直肠癌和正常肠道组织中具有明显差异,可以作为一种新的诊断生物标志物。

关键词： atp结合盒亚家族a成员8 结直肠癌生物信息学癌症基因组图谱数据库

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