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长链非编码RNA asb16-as1调控miR-670-3p/ATXN7L3轴影响胃癌细胞增殖、迁移和侵袭

世界华人消化杂志 2020年第15期28卷 673-682页

作者：罗俊张晓苹郑园园马阿火绍兴市人民医院消化内科浙江省绍兴市312000

背景多种长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)在胃癌(gastric cancer,GC)进展中被证实发挥抑癌或促癌作用.但lncRNAs数量众多,仍有多种lncRNAs在GC进展中的作用并不明确.因此,筛选具有影响GC细胞增殖、迁移和侵袭的lncRNAs对GC... 详细信息

背景多种长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNAs)在胃癌(gastric cancer,GC)进展中被证实发挥抑癌或促癌作用.但lncRNAs数量众多,仍有多种lncRNAs在GC进展中的作用并不明确.因此,筛选具有影响GC细胞增殖、迁移和侵袭的lncRNAs对GC防治十分必要.目的探讨LncRNA asb16-as1调控miR-670-3p/ATXN7L3轴对GC细胞增殖、迁移和侵袭的影响.方法实时荧光定量PCR(real-time quantitative PCR,RTqPCR)和western blot检测人胃黏膜细胞GES-1、GC细胞HGC-27、AGS、NUGC-4中asb16-as1、miR-670-3p和ATXN7L3的表达水平.将HGC-27细胞分为si-NC、si-asb16-as1、miR-NC、miR-670-3p、si-ATXN7L3、si-asb16-as1+anti-miR-NC、si-asb16-as1+anti-miR-670-3p、si-asb16-as1+pcDNA-NC、si-asb16-as1+pcDNA-ATXN7L3组.采用细胞计数试剂盒、transwell实验分别测定细胞活力、迁移侵袭能力;双荧光素酶报告实验、RT-qPCR、western blot确定asb16-as1与miR-670-3p、miR-670-3p与ATXN7L3之间的相互作用.结果GC细胞中asb16-as1、ATXN7L3呈高表达,miR-670-3p呈低表达(Pasb16-as1表达,或过表达miR-670-3p,或抑制ATXN7L3表达后,HGC-27细胞增殖活力、迁移和侵袭能力均显著降低(Pasb16-as1靶向负调控miR-670-3p表达.miR-670-3p靶向负调控ATXN7L3表达.抑制miR-670-3p表达部分逆转抑制asb16-as1对HGC-27细胞增殖、迁移和侵袭的影响(Pasb16-as1对HGC-27细胞增殖、迁移和侵袭的影响(Pasb16-as1通过调控miR-670-3p/ATXN7L3轴抑制GC细胞增殖、迁移和侵袭.

关键词： asb16-as1 miR-670-3p ATXN7L3 胃癌细胞增殖迁移和侵袭

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LncRNA asb16-as1对胶质瘤生物学行为的影响

LncRNA ASB16-AS1对胶质瘤生物学行为的影响

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作者：张德龙皖南医学院

学位级别：硕士

目的:学习R语言生物信息技术。通过生物信息技术筛选备选lncRNA。利用实验技术探究备选LncRNA在样本组织中是否存在差异表达。以及这些LncRNA表达量是否与WHO(World Health Organization)分级相关。对组织中确实存在差异表达的基因做细... 详细信息

目的:学习R语言生物信息技术。通过生物信息技术筛选备选lncRNA。利用实验技术探究备选LncRNA在样本组织中是否存在差异表达。以及这些LncRNA表达量是否与WHO(World Health Organization)分级相关。对组织中确实存在差异表达的基因做细胞功能实验。验证敲减指定lncRNA是否会引起肿瘤细胞的增殖侵袭迁移功能发生改变。为胶质瘤的诊断和治疗确定可能分子标志物和治疗靶点。方法:应用TCGA数据库筛选差异基因。研发R语言代码,批量计算这些差异基因的ROC曲线(Receiver operating characteristic)。将ROC曲线下面积(area under the curve,AUC值)>0.85的基因筛选出来利用starbase提供的“ceRNA预测网络”构建这些差异基因的ceRNA网络。利用Cytoscope 3.6软件对这个ceRNA网络做分析,鉴定出基因内部连接度处于前10%的hub genes。在hub genes中随机选区4个研究较少的lncRNA做样本组织内的qPCR,判断是否存在差异表达,以及其表达量与WHO分级是否相关。最终我们选中asb16-as1进行功能实验。选用siRNA技术对asb16-as1进行敲减。功能实验U87和U251在生长因子刺激下孵育出的胶质瘤干细胞样细胞(glioblastoma stem-like cells)——U87GS和U251GS,每个细胞系设三个组别:NC组(Negative control,转染NC siRNA),siRNA-1组(转染asb16-as1 siRNA-1),siRNA-2组(转染asb16-as1 siRNA-2)。功能实验使用了RTCA(Real-time cellular analysis)技术用于检测细胞在敲减增殖、侵袭、迁移能力的改变。使用流式细胞周期技术检测细胞周期有无阻滞。结果:差异分析一共鉴定出178个差异lncRNA,且他们的ROC曲线下面积>0.85。根据这些基因的symbol和starbase v2.0提供的ceRNA预测网络数据,共计鉴定出1650条预测ceRNA关系。并不是所有差异基因都能在starbase v2.0找到预测关系。共计只有72个lncRNA被包括在输出ceRNA中。差异基因的ceRNA网络共计417个节点。前10%连接度的hub gene共计42个。去除其中非lncRNA和报道比较多的lncRNA。我们保留了HOXA-AS2、HOTAIRM1、asb16-as1、LINC00339做临床样本的qPCR验证。结果提示只有asb16-as1在我院临床样本中存在显著差异表达且和胶质瘤分期分级正相关(正常组1.01±0.84,低等级胶质瘤4.34±2.69,高等级胶质瘤11.29±6.33,但因素方差分析Pasb16-as1的表达量与胶质瘤诊断正相关,ROC分析显示其曲线下面积达到0.94。在TCGA数据库中asb16-as1在肿瘤组织中较正常组织显著上调(正常组1.36±0.70,肿瘤组4.03±1.67,t检验Pasb6-as1的表达量无明显差异(复发组3.59±1.92,原发组4.07±1.65,t检验P>0.05)。siRNA敲减后qPCR检测得知本实验所使用siRNA-1、siRNA-2能有效敲减asb16-as1,抑制效率达到50%左右。RTCA增殖、侵袭、迁移实验结果证实肿瘤细胞在asb16-as1敲减后增殖侵袭迁移能力显著减弱(Pasb16-as1 siRNA组U87GS和U251GS G2/M期发生显著上升(U87GS NC19.3±4.2,si 30.9±5.5;U251GS NC 18.3±3.2,si 27.9±4.6,Pasb16-as1的表达量在胶质瘤组织中较正常组织显著上调,并且其表达量随着胶质瘤等级的增加而增加。asb16-as1参与胶质瘤进展,在胶质瘤U87,U251细胞系中敲减asb16-as1能显著影响胶质瘤的增殖侵袭迁移能力。asb16-as1是潜在的生物学标志物和药物靶点。

关键词： asb16-as1 胶质瘤增殖侵袭迁移 lncRNA 生物信息

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LncRNA asb16-as1促进胶质瘤细胞的增殖、侵袭和迁移

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右江民族医学院学报 2018年第6期40卷 520-525页

作者：张德龙周黄贵刘俊刘杰毛捷皖南医学院第一附属医院/弋矶山医院神经外科安徽芜湖241000

目的探讨lncRNA asb16-as1在不同WHO分级胶质瘤标本中的表达量变化,以及在胶质瘤细胞系LN382U87MG中验证lncRNA asb16-as1对增殖、迁移、侵袭功能的影响。方法使用qRT-PCR技术检测lncRNA asb16-as1在临床肿瘤样本中表达量,分析lncRNA AS... 详细信息

目的探讨lncRNA asb16-as1在不同WHO分级胶质瘤标本中的表达量变化,以及在胶质瘤细胞系LN382U87MG中验证lncRNA asb16-as1对增殖、迁移、侵袭功能的影响。方法使用qRT-PCR技术检测lncRNA asb16-as1在临床肿瘤样本中表达量,分析lncRNA asb16-as1是否存在差异表达以及与肿瘤分期分级有无相关性。在LN382、U87MG细胞系上使用siRNA抑制lncRNA asb16-as1的表达,检验NC组(转染negative siRNA)和silence组(转染lncRNA asb16-as1siRNA)在实时细胞分析(Real-time cell analysis,RTCA)增殖实验、划痕试验和Transwell实验上有无肿瘤功能改变。结果肿瘤组织分期分级越高lncRNA asb16-as1表达量越高。在两个细胞系上进行的划痕试验结果显示,silence组愈合速度慢于NC组(P1)。RTCA增殖曲线显示silence组增殖速度慢于NC组(P1)。Transwell侵袭、迁移试验接种12h后穿透到底面的细胞silence组少于NC组(P 1)。结论肿瘤组织分期分级越高lncRNA asb16-as1表达量越高。lncRNA asb16-as1在胶质瘤中起到促进肿瘤增殖、侵袭、迁移作用。

关键词：神经胶质瘤长链非编码RNA asb16-as1

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lncRNA asb16-as1在结直肠癌组织中的表达及对结直肠癌细胞增殖的影响

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贵州医科大学学报 2019年第10期44卷 1167-1172页

作者：石峰唐青魏晓为阜宁县人民医院江苏盐城224000 南京医科大学附属南京医院肿瘤内科江苏南京210006

目的:探讨lncRNAasb16-as1在结直肠癌(CRC)中的表达及其对CRC细胞增殖的影响。方法:采用逆转录定量PCR(qRT-PCR)检测26对CRC及其配对癌旁组织、4株CRC细胞(HT-29、SW-480、SW-620及LOVO)中lncRNAasb16-as1的表达,选择2株lncRNAasb16-as1表达最高的CRC转染asb16-as1干扰片段作为干扰组,实验设置对照组(不转染)及阴性对照组(转染阴性对照干扰片段),采用CCK-8法检测转染0、24、48、72及96h时细胞的增殖情况,qRT-PCR法检测转染48h时细胞miR-185-5p表达;将含有asb16-as1野生型序列或突变序列的质粒与miR-185-5pmimic或阴性对照mimic共转染至293T细胞,转染24h后采用双荧光素酶法检测各组细胞的荧光强度,观察lncRNAasb16-as1对miR-185-5的调控作用。结果:qRT-PCR结果显示,lncRNAasb16-as1在CRC组织中的表达水平显著高于癌旁组织(P1),CRC细胞HT-29及LOVO中lncRNAasb16-as1的表达水平显著高于SW-480及SW-620(P1);与阴性对照组比较,转染asb16-as1干扰片段的HT-29和LOVO细胞中lncRNAasb16-as1的表达水平显著降低(P1);转染48h开始,干扰组HT-29和LOVO细胞的增殖水平显著低于阴性对照组(Pasb16-as1后细胞中miR-185-5p表达水平显著升高(Pasb16-as1和miR-185-5pmimic共转染,显著降低293T细胞中双荧光素酶的活性(Pasb16-as1上调有关。

关键词：长链非编码RNA asb16-as1 结直肠癌细胞增殖 miR-185-5p 转染双荧光素酶

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LncRNA asb16-as1调控前列腺癌细胞增殖转移的分子机制

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山东医药 2020年第13期60卷 29-33页

作者：郭宗华孔东波江波涛邹伟饶志刚赵克栋咸宁市中心医院湖北科技学院附属第一医院湖北咸宁437100

目的探讨长链非编码RNA asb16-as1(LncRNA asb16-as1)对前列腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响及其分子机制。方法体外培养前列腺癌细胞株LNCaP,分别将si-NC、si-asb16-as1、miR-NC、miR-760 mimics、si-asb16-as1+anti-miR-NC、si-asb16-as1+anti-miR-760转染至LNCaP细胞。采用MTT检测细胞增殖能力,Transwell小室实验检测细胞迁移及侵袭能力,双荧光素酶报告实验验证asb16-as1与miR-760的靶向关系,Western blotting法检测细胞周期蛋白1(CyclinD1)、基质金属蛋白酶-2(MMP-2)、基质金属蛋白酶-9(MMP-9)、p21蛋白水平。结果与转染si-NC、miR-NC相比,转染si-asb16-as1、miR-760 mimics后细胞增殖活力降低(P均asb16-as1能够靶向结合miR-760。与si-asb16-as1+anti-miR-NC组相比,si-asb16-as1+anti-miR-760组细胞增殖活力升高(P1、MMP-2、MMP-9蛋白水平升高(P均1蛋白水平降低(Pasb16-as1通过靶向干扰miR-760表达从而促进前列腺癌细胞增殖、迁移及侵袭。

关键词：前列腺肿瘤 LncRNA asb16-as1 miR-760 细胞增殖细胞迁移细胞侵袭

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