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arid1a基因突变体的构建及其在肝癌细胞中的过表达鉴定

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中华实验和临床病毒学杂志 2017年第4期31卷 343-347页

作者：肖花廖启成汪海燕刘威龙吴驰黄健刘嘉林深圳市第三人民医院 518112 赣南医学院赣州341000

目的构建人类染色体重塑复合物SWI/SNF（Switch/Sucrose NonFermentable）中重要组份arid1a（A-T rich interaction domain）的突变过表达载体,并检测野生型arid1a基因及突变型arid1a基因在肝癌细胞株HepG2中的表达情况.方法采用overlap PCR技术构建在野生型质粒pcDNA6-arid1a基础上构建结构域缺失突变体pcDNA6-arid1a/△arid以及pcDNA6-arid1a/△DUF3518;利用脂质体转染技术将野生型质粒以及构建的突变型质粒转染到肝癌细胞HepG2中进行过表达;通过Real-time PCR以及Western blot技术对野生型及突变型arid1a在肝癌细胞中的表达情况进行鉴定.结果经双酶切后SDS-PAGE分析以及测序验证,成功构建了真核表达载体pcDNA6-arid1a的突变型质粒pcDNA6-arid1a/△arid以及pcDNA6-arid1a/△ DUF3518;通过Real-time PCR以及Western blot的方法验证,arid1a及arid1 A/△arid在肝癌细胞株HepG2中成功过表达,而arid1a/△ DUF3518蛋白可能降解.结论成功构建arid1a功能域缺失型突变体,并在肝癌细胞株HepG2中稳定过表达arid1a及arid1a/△arid;arid1a/△ DUF3518蛋白的缺失暗示DUF3518结构域可能起着稳定蛋白结构的功能.

关键词： arid1a基因功能域缺失突变过表达肝肿瘤细胞培养

潜在类别模型在arid1a基因低频变异与原发性肝癌遗传关联中的应用

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中华肿瘤杂志 2021年第7期43卷 801-805页

作者：皮路程林欣琪刘晴刘桂炎刘丽郜艳晖广东药科大学公共卫生学院统计学教研室广州510310

目的应用潜在类别模型分析arid1a基因低频变异与原发性肝癌的关系。方法根据基因的不同功能区域将arid1a基因低频变异进行合并,应用潜在类别模型分析合并后的arid1a基因低频变异得到分类潜变量,采用logistic回归分析arid1a基因低频变异... 详细信息

目的应用潜在类别模型分析arid1a基因低频变异与原发性肝癌的关系。方法根据基因的不同功能区域将arid1a基因低频变异进行合并,应用潜在类别模型分析合并后的arid1a基因低频变异得到分类潜变量,采用logistic回归分析arid1a基因低频变异与肝癌发生之间的关系。结果潜在类别模型将arid1a基因低频变异人群分为3类,类别1主要为基因未突变人群,占比94.2%(2452/2603);类别2主要为基因转录调控功能区突变人群,占比4.8%(124/2603);类别3主要为基因外显子突变人群,占比1.0%(27/2603)。以类别1人群作为参照,转录调控功能区基因突变可降低肝癌的发生风险(OR为0.601,95%CI为0.364-0.992,P=0.046)。结论潜在类别模型可识别肝癌相关基因低频变异,潜在类别模型可推广应用于更多复杂疾病相关低频变异的遗传关联研究。

关键词：肝肿瘤 arid1a基因潜在类别模型低频变异

miRNA-9调控arid1a基因影响上皮性卵巢癌细胞顺铂耐药的研究

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miRNA-9调控ARID1A基因影响上皮性卵巢癌细胞顺铂耐药的研究

作者：张文健广州医科大学

学位级别：硕士

研究目的:卵巢癌是女性生殖系统肿瘤中致死率最高的肿瘤,晚期卵巢癌患者5年生存率仅有约30%[1]。卵巢癌治疗以手术及紫杉醇和铂类为基础的化疗药为主,但卵巢癌患者常出现对顺铂或者以顺铂为基础的联合化疗药耐药,这是导致晚期患者5年生... 详细信息

研究目的:卵巢癌是女性生殖系统肿瘤中致死率最高的肿瘤,晚期卵巢癌患者5年生存率仅有约30%[1]。卵巢癌治疗以手术及紫杉醇和铂类为基础的化疗药为主,但卵巢癌患者常出现对顺铂或者以顺铂为基础的联合化疗药耐药,这是导致晚期患者5年生存率低的一个重要原因。arid1a基因编码的arid1a蛋白是SWI/SNF染色质重塑复合物的一个亚基,最近研究认为arid1a基因也是一个抑癌基因并在多种肿瘤中发生突变,与顺铂耐药相关但在不同肿瘤中的作用不同[2-4]。因此,探索arid1a基因在卵巢癌顺铂耐药中的作用及arid1a基因受哪些因素的调控具有重要的临床意义。本文研究miRNA-9是否调控上皮性卵巢癌arid1a基因表达以及miRNA-9/arid1a轴在上皮性卵巢癌耐顺铂中的作用。研究方法:1.使用结晶紫染色实验验证A2780FC及C30、A2780sigma及A2780cis两对上皮性卵巢癌细胞的顺铂耐药性;*** blot检测上述两对细胞株检测BRCA1以及arid1a的蛋白表达情况;3.使用TargetScan(***)软件预测调节arid1a的miRNAs;制作microarray并检测耐顺铂的上皮性卵巢癌细胞中miRNAs的表达情况,以及使用Real-time PCR验证两对上皮性卵巢癌细胞(A2780FC敏感株及C30耐药株、A2780sigma敏感株及A2780cis耐药株)中的miR-9的表达情况;4.在A2780FC以及A2780sigma中构建高表达miR-9的稳定细胞株,western blot检测构建的细胞株arid1a蛋白的表达情况,4结晶紫染色实验检测经顺铂梯度浓度处理后细胞的耐药变化;5.体外瞬时转染实验:使用lipofectamine3000试剂瞬时转染C30及A2780cis,降低2株细胞的miR-9表达,Real-time PCR验证miR-9的降低水平,western blot检测arid1a蛋白的表达情况,结晶紫染色实验检测经顺铂梯度浓度处理后细胞的耐药变化;*** blot检测瞬时转染miR-9-antisense后的Cleaved-capase3蛋白表达情况。研究结果:***-9在耐顺铂细胞株(C30和A2780cis)中高表达(***Parid1a蛋白表达水平明显高于对顺铂耐受的细胞株(C30和A2780cis);3.在对顺铂敏感的细胞株(A2780FC及A2780sigma)中过表达miR-9,arid1a蛋白的表达下降不明显,细胞的耐药无明显变化;4.瞬时转染mir-9-antisense后,C30和A2780cis的arid1a蛋白表达下调,与对照组相比IC50无明显变化,但细胞数绝对值减少,Cleaved-capase3蛋白表达升高。研究结论:***-9在耐顺铂细胞株(C30和A2780cis)中高表达(***Parid1a蛋白表达水平低于顺铂敏感的细胞株(A2780FC及A2780sigma),瞬时转染miR-9-antisense后,C30和A2780cis的arid1a蛋白表达下调,提示miR-9可能通过调节arid1a蛋白的表达,参与上皮性卵巢癌顺铂耐药的发生;2.瞬时转染miR-9-antisense后,C30和A2780cis与对照组相比,IC50无明显变化,但细胞数绝对值减少,Cleaved-capase3蛋白表达升高,提示miR-9在耐药株中可能通过抑制细胞凋亡从而导致顺铂耐药的发生。

关键词： miRNA-9 arid1a基因上皮性卵巢癌顺铂耐药

染色质重塑基因arid1a在妇科肿瘤中的研究进展

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疑难病杂志 2015年第1期14卷 104-107页

作者：艾方方刘巍谭文华哈尔滨医科大学附属第二医院妇产科 150086

在真核细胞中,遗传信息储存于染色质,这是一种由DNA、组蛋白及非组蛋白通过高度浓缩机制而形成的复杂结构,但在DNA复制、修复、重组及转录等过程中需动态变化以促使相关因子与DNA结合,这种作用称为染色质重塑。而染色质重塑包括DNA复制... 详细信息

在真核细胞中,遗传信息储存于染色质,这是一种由DNA、组蛋白及非组蛋白通过高度浓缩机制而形成的复杂结构,但在DNA复制、修复、重组及转录等过程中需动态变化以促使相关因子与DNA结合,这种作用称为染色质重塑。而染色质重塑包括DNA复制、转录、修复、甲基化和重组,对于细胞核活动至关重要,染色质重塑复合物的分子基因型改变是癌症发病的一个新机制。

关键词： arid1a基因染色质重塑肿瘤抑制因子子宫内膜异位症卵巢癌

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子宫内膜异位症恶变研究进展

中国实用妇科与产科杂志 2017年第12期33卷 1300-1303页

作者：陈曦徐丛剑复旦大学附属妇产科医院上海200011

子宫内膜异位症（EMs）是育龄妇女最常见的疾病之一。该病有多种临床表现,近年来发病率占育龄妇女的15%,有明显升高的趋势。EMs虽然在组织学上属于良性病变,但却具有增生、浸润、转移及复发等恶性行为,并且有一定比例发生组织学改变,转... 详细信息

子宫内膜异位症（EMs）是育龄妇女最常见的疾病之一。该病有多种临床表现,近年来发病率占育龄妇女的15%,有明显升高的趋势。EMs虽然在组织学上属于良性病变,但却具有增生、浸润、转移及复发等恶性行为,并且有一定比例发生组织学改变,转变为癌瘤[1]。1925年,Sampson首次报道恶性肿瘤与异位子宫内膜并存于同一病变,认为EMs可以发生恶变。目前研究认为,EMs的恶变率约为0.7%~1%,其中80%发生在卵巢,

关键词：子宫内膜异位症恶变达那唑 arid1a基因

过表达arid1a对胶质母细胞瘤细胞侵袭的影响

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中国医师杂志 2021年第12期23卷 1791-1794页

作者：刘渊渊曾瑜中南大学湘雅医院神经外科长沙410008

目的探讨AT丰富结合域1A(arid1a)在胶质母细胞瘤侵袭中的作用及机制。方法体外培养人胶质瘤细胞U87,用Lipofectamin脂质体法将重组pCDNA3.1(+)-arid1a转染至U87细胞为arid1a过表达组,转染空质粒至U87细胞为vector组,未作处理的为空白对... 详细信息

目的探讨AT丰富结合域1A(arid1a)在胶质母细胞瘤侵袭中的作用及机制。方法体外培养人胶质瘤细胞U87,用Lipofectamin脂质体法将重组pCDNA3.1(+)-arid1a转染至U87细胞为arid1a过表达组,转染空质粒至U87细胞为vector组,未作处理的为空白对照组,qRT-PCR和Western blot验证其转染效率。采用Transwell侵袭实验检测细胞的侵袭能力;Western blot技术检测c-myc、MMP-2、MMP-9表达的变化。结果转染arid1a真核表达质粒48 h后,arid1a过表达组、vector组、空白对照组的细胞侵袭能力分别为(42.2±11.5)%、(98.6±4.8)%、(100.0±5.1)%,arid1a过表达组与另外两组相比,差异有统计学意义(P1);arid1a过表达组c-myc、MMP-2、MMP-9蛋白的表达均低于vector组和空白对照组(P1)。结论arid1a可以通过抑制MMP-2/MMP-9表达来抑制胶质母细胞瘤的侵袭,可以作为潜在的胶质瘤治疗靶点。

关键词：胶质母细胞瘤细胞侵袭 arid1a基因基质金属蛋白酶2 基质金属蛋白酶9

arid1a及雄激素受体在子宫内膜增生病变组织中的表达及意义

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ARID1A及雄激素受体在子宫内膜增生病变组织中的表达及意义

作者：要秀娥山西医科大学

学位级别：硕士

目的:研究AT丰富结构结构域1A（AT rich interaction domain 1A,arid1a）arid1a基因、雄激素受体（AR）在子宫内膜增生症不同病变中的表达情况,同时分析其与雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）的相关性,探讨arid1a、AR在子宫内膜增生... 详细信息

目的:研究AT丰富结构结构域1A（AT rich interaction domain 1A,arid1a）arid1a基因、雄激素受体（AR）在子宫内膜增生症不同病变中的表达情况,同时分析其与雌激素受体（ER）、孕激素受体（PR）的相关性,探讨arid1a、AR在子宫内膜增生症发生发展中的作用,旨在了解子宫内膜增生症的病因和发病机制,探索子宫内膜增生症防治的新的思路,为预防和降低子宫内膜癌的发生奠定理论依据。方法:选取2013年1月至2016年6月山西省妇幼保健院病理科132例子宫内膜增生症组织标本（包括单纯型增生40例,复杂型增生40例,不典型增生52例）,选取同期增殖期子宫内膜组织28例作为对照组,所有标本均经过病理学证实,3个月内未接受激素治疗。釆用免疫组织化学方法（streptavidin peroxidase-biotin,SP）检测arid1a、ER、PR、AR在增殖期内膜、子宫内膜增生各级别病变组织中的表达。应用SPSS21.0进行统计分析,arid1a、ER、PR、AR蛋白表达率运用x2检验;arid1a、AR与ER、PR表达相关性用Spearman相关分析。结果:1、子宫内膜组织中广泛存在ER、PR、AR的表达,ER、PR在增殖期子宫内膜、单纯型增生、复杂型增生、不典型增生各组间差异无统计学意义（P=0.143,P=0.496）;AR在不典型增生组阳性表达率最低,与其余各组间比较,差异具有统计学意义（P=0.018）,增殖期内膜组,单纯型增生组、复杂型增生组,各组间比较,差异无统计学意义（P＞0.05）2、arid1a基因在子宫内膜腺上皮和间质细胞核中广泛表达,随着病变的发展,arid1a基因表达的缺失率逐渐增加,在不典型子宫内膜组中,arid1a表达缺失率为19.2%,与其余组间比较,差异有统计学意义（x2=11.58,P=0.004）,（P＞0.05）3、子宫内膜增生组织中arid1a与ER、PR、AR之间无明显的相关性（rs=-0.066,P=0.455;rs=0.001,P=0.987;rs=0.114,P=0.191）;AR与ER、PR的表达呈正相关性（rs=0.176,P=0.043;rs=0.195,P=0.025）。结论:1、arid1a基因突变和表达缺失是子宫内膜增生恶变过程中的一个早期事件。2、雄激素及其受体可能参与了子宫内膜增生症的发生发展。3、对于AR阳性的部分子宫内膜增生患者,联合降低雄激素治疗,有可能成为子宫内膜增生症治疗的一个新的策略。

关键词：子宫内膜增生症 arid1a基因雌激素受体(ER) 孕激素受体(PR) 雄激素受体(AR)

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AT丰富结合域1A基因在恶性肿瘤中的作用

甘肃医药 2022年第3期41卷 205-207页

作者：夏红蕾马娟文兰州市妇幼保健院甘肃兰州730030

AT丰富结合域1A(arid1a)基因是染色质重塑复合物SWI/SNF的重要亚基,是一种抑癌基因,在多种肿瘤中存在突变或缺失,其突变或缺失可能与恶性肿瘤的增殖、侵袭、转移、高分期、不良预后等有关。对aridIA抑癌作用机制深入研究,能进一步了解... 详细信息

AT丰富结合域1A(arid1a)基因是染色质重塑复合物SWI/SNF的重要亚基,是一种抑癌基因,在多种肿瘤中存在突变或缺失,其突变或缺失可能与恶性肿瘤的增殖、侵袭、转移、高分期、不良预后等有关。对aridIA抑癌作用机制深入研究,能进一步了解癌症发生发展机制,有望为癌症患者提供治疗靶点。本文对近年来arid1a在恶性肿瘤中的表达、功能调节及其在肿瘤中的作用做一综述。

关键词： arid1a基因突变恶性肿瘤

arid1a在浸润性乳腺癌中的表达及临床意义

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甘肃科技 2022年第20期38卷 96-99页

作者：张郡夏红蕾杨沁惠兰州市妇幼保健院甘肃兰州730030

探讨arid1a基因在浸润性乳腺癌中的表达及与浸润性乳腺癌患者临床病理学特征之间的关系。收集兰州市妇幼保健院病理诊断为浸润性乳腺癌的患者101例,用免疫组织化学SP法定性检测arid1a基因在浸润性乳腺癌、乳腺纤维腺瘤、浸润性乳腺癌癌... 详细信息

探讨arid1a基因在浸润性乳腺癌中的表达及与浸润性乳腺癌患者临床病理学特征之间的关系。收集兰州市妇幼保健院病理诊断为浸润性乳腺癌的患者101例,用免疫组织化学SP法定性检测arid1a基因在浸润性乳腺癌、乳腺纤维腺瘤、浸润性乳腺癌癌旁正常组织中的表达情况,统计并分析arid1a基因在浸润性乳腺癌、乳腺良性病变及癌周正常乳腺组织中的表达及与乳腺癌患者临床病理参数间的关系。(1)arid1a在乳腺癌中的表达阳性率显著低于癌旁正常组织和纤维腺瘤,差异具有统计学意义(Parid1a在乳腺癌的表达与患者的年龄、肿瘤大小、组织学分级和TNM分期均无关系(P>0.05),而与患者是否发生淋巴结转移有关(Parid1a在正常乳腺组织、纤维腺瘤组织以及乳腺癌组织中的阳性表达依次减弱。结论:(1)arid1a在正常乳腺组织中呈阳性表达,在纤维腺瘤组织和乳腺癌组织中的表达逐渐减弱,提示arid1a是一种肿瘤抑制因子,从而抑制了乳腺癌的发生。(2)arid1a在乳腺癌组织中表达缺失,且其表达缺失与乳腺癌组织的侵袭、转移有关,提示arid1a是一种保护性因子,其突变或缺失可导致乳腺癌的发生,并与乳腺癌不良预后相关。(3)乳腺组织中arid1a基因检测有助于乳腺癌的早期诊断、预防和治疗。

关键词： arid1a基因浸润性乳腺癌免疫组化

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