检索结果-南通市图书馆

Effect of Protein Dimerization on Ion Conductivity of Gramicidin A Channel Studied Using Polarizable force Field

Chinese Journal of Chemical Physics 2021年第4期34卷 471-479,I0003页

作者： Jun-ben Weng Chen-yi Liao Yan Li Ding-lin Zhang Guo-hui Li An-hui Wang Laboratory of Molecular Modeling and Design State Key Laboratory of Molecular Reaction DynamicsDalian Institute of Chemical PhysicsChinese Academy of SciencesDalian 116023China University of Chinese Academy of Sciences Beijing 101408China State Key Laboratory of Fine Chemicals School of ChemistryDalian University of TechnologyDalian 116024China

In studies of ion channel systems,due to the huge computational cost of polarizable force elds,classical force elds remain the most widely used for a long *** this work,we used the amoeba polarizable atomic multipole force eld in enhanced sampling simula-tions of single-channel gramicidin A(gA)and double-channel gA systems and investigated its reliability in characterizing ion-transport properties of the gA ion channel under *** inuence of gA dimerization on the permeation of potassium and sodium ions through the channel was described in terms of conductance,di usion coeffcient,and free energy pro *** from the polarizable force eld simulations show that the conductance of potassium and sodium ions passing through the single-and double-channel agrees well with experimental *** data analysis reveals that the molecular mechanism of protein dimerization a ects the ion-transport properties of gA channels,i.e.,protein dimer-ization accelerates the permeation of potassium and sodium ions passing through the double-channel by adjusting the environment around gA protein(the distribution of phospholipid head groups,ions outside the channel,and bulk water),rather than directly adjusting the conformation of gA protein.

关键词： Dimerization Conductance Gramicidin A amoeba force eld Umbrella sampling

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：