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中国动物传染病学报 2017年第6期25卷 64-69页

作者：戴振清胡序明王芳陈世豪贾崇信豆春峰耿拓宇崔恒宓扬州大学表观遗传学及表观基因组学研究所扬州225009 扬州大学动物科学和技术学院扬州225009

已知鸡基因组中含有禽内源性反转录病毒alve1序列,而alve1在鸡基因组中的上游和下游区域位置在参考基因组中并未成功鉴定。本研究成功鉴定出alve1所在鸡基因组中的上、下游序列,并通过提取CEF细胞和DF-1细胞基因组反过来验证了alve1的... 详细信息

已知鸡基因组中含有禽内源性反转录病毒alve1序列,而alve1在鸡基因组中的上游和下游区域位置在参考基因组中并未成功鉴定。本研究成功鉴定出alve1所在鸡基因组中的上、下游序列,并通过提取CEF细胞和DF-1细胞基因组反过来验证了alve1的位置信息。与参考基因组不同的是,我们发现alve1序列包含3'LTR序列,在鸡1号染色体上的插入位置为chr1:65,995,534~65,993,540。本研究不仅提供了alve1在鸡基因组中的完整信息,也为进一步研究alve1的功能奠定了基础。

关键词：禽内源性反转录病毒 alve1 鉴定

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miR-155体外特异性靶向鸡内源性反转录病毒alve1 env转录物的研究

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畜牧与兽医 2016年第5期48卷 7-11页

作者：朱文奇胡序明陈世豪刘洋洋孙振耿拓宇宋成义高波崔恒宓扬州大学表观遗传学及表观基因组学研究所江苏扬州225009 扬州大学动物科学技术学院江苏扬州225009

通过生物信息学方法,发现了鸡内源性反转录病毒禽白血病E1(alve1)的env转录物存在gga-miR-155作用位点(AGCATTA),并在体外验证其靶位点的活性。将鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组中扩增的alve1 env转录物构建至荧光素酶报告载体pmir GLO,获... 详细信息

通过生物信息学方法,发现了鸡内源性反转录病毒禽白血病E1(alve1)的env转录物存在gga-miR-155作用位点(AGCATTA),并在体外验证其靶位点的活性。将鸡胚成纤维细胞(CEF)基因组中扩增的alve1 env转录物构建至荧光素酶报告载体pmir GLO,获得重组质粒pmirGLO-alve1-ENV-WT(野生型),并利用重叠PCR将其miR-155作用位点AGCATTA突变为ATTCAAA,然后构建重组质粒pmir GLO-alve1-ENV-MU(突变型),同时将gga-miR-155前体序列构建至pc DNA3.1载体,获得重组质粒pc DNA3.1-gga-miR-155,将这些质粒共转染至DF-1细胞中,48 h后收集细胞并检测荧光素酶活性。结果发现:野生组能显著下调pmir GLO-alve1-ENV-WT荧光素酶活性,而对照组无显著改变;对照组和突变组均未能改变pmir GLO-alve1-ENV-MU荧光素酶活性。本研究证实gga-miR-155可直接靶向alve1 env转录物,为鸡内源性反转录病毒的调控机制提供了新的启示。

关键词： miR-155 靶位点鸡内源性反转录病毒 alve1 env

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蛋氨酸对鸡内源性反转录病毒alve1表达的影响及其相关调控机制研究

蛋氨酸对鸡内源性反转录病毒ALVE1表达的影响及其相关调控机制研究

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作者：朱文奇扬州大学

学位级别：硕士

内源性反转录病毒(Endogenous ***)作为基因组成分,其生物学功能正在被逐渐认识。近年来的研究表明在哺乳动物中内源性反转录病毒的表达受营养因素和表遗传的调控,而内源性反转录病毒可通过调控先天免疫相关的转录因子来参与先天免疫反... 详细信息

内源性反转录病毒(Endogenous ***)作为基因组成分,其生物学功能正在被逐渐认识。近年来的研究表明在哺乳动物中内源性反转录病毒的表达受营养因素和表遗传的调控,而内源性反转录病毒可通过调控先天免疫相关的转录因子来参与先天免疫反应。然而,有关家禽的ERV研究还相当有限。比如,家禽营养因子是否调节ERV的表达,ERV是否受表遗传调控,营养因子是否通过调控ERV来影响动物的先天免疫反应等。本研究将围绕这些问题进行研究,试图阐明营养因子对鸡ERV表达的影响及相关机制。主要研究结果如下:1、鸡内源性反转录病毒alve1基因序列及其表达分析:利用链特异性引物,以鸡巨噬细胞HD11基因组为模板进行alve1全长序列PCR分段扩增,测序结果表明克隆测序的alve1基因序列与NCBI公布的alve1序列同源性达到99%,但多个位点存在核苷酸多态性。利用荧光定量PCR检测alve1在CEF细胞和HD11细胞的转录表达以及alve1 env基因在2日龄和35日龄SPF鸡不同组织(脑、法氏囊、胸腺、脾脏、心脏、肝脏、肾脏、肺脏和皮肤)中的表达量,结果显示:env基因在免疫细胞HD11中的表达量显著高于非免疫细胞CEF(Palve1可能参与鸡早期免疫器官的形成及早期先天免疫反应。不过,该推测还有待进一步研究加以验证。2、营养因子对alve1表达的影响在培养基中分别用蛋氨酸和维生素C处理鸡细胞,然后用qPCR检测alve1和先天免疫基因的表达量。结果表明,蛋氨酸激活了鸡内源性反转录病毒LTR序列的转录,并伴有先天免疫相关基因表达的显著上长升(Palve1的转录表达没有显著影响(P>0.05)。3、alve1区CpG到的甲基化分析生物信息学预测发现alve1基因存在两个CpG甲基化岛,且alve1 env转录物存在miR-155作用位点。DNA甲基化酶抑制剂AZA处理HD11细胞后,焦磷酸测序的结果表明:alve1 CpG岛的DNA甲基化水平降低,且伴有alve1基因和先天免疫相关基因的表达激活。再者,利用Overlap PCR以及荧光素酶报告系统,研究证实miR-155可靶向env的转录物。以上结果表明:alve1的表达受表观遗传学机制的调控,且alve1的表达激活可能参与先天免疫反应。另外,通过脂质体转染alve1 env基因,使其过表达近40倍,但并未对所测先天免疫基因的表达产生显著影响,这可能是反义RNA表达激活的缺失所致。综上所述,鸡内源性反转录病毒alve1 env基因在鸡免疫细胞以及免疫器官中高表达,特别是鸡的早期生长阶段。alve1的转录表达受到蛋氨酸、miR-155以及DNA甲基化的调控。营养因子-蛋氨酸可能通过诱导alve1的表达来激活先天免疫基因的表达,影响动物的免疫反应。这些研究结果可能对推动内源性反转录病毒的表观遗传学研究具有重要意义。

关键词：鸡内源性反转录病毒 alve1 蛋氨酸维生素C DNA甲基化酶抑制剂先天免疫 miR-155

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