检索结果-南通市图书馆

作者：杨孝娟安徽医科大学

学位级别：硕士

目的:检测酰基辅酶A合成酶中链家族成员5(acyl-Co A synthetase medium-chain family member 5,acsm5)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及癌旁肝组织中的表达情况,探讨其与临床病理特征的关系及对肝癌预后的意义。方法:通过... 详细信息

目的:检测酰基辅酶A合成酶中链家族成员5(acyl-Co A synthetase medium-chain family member 5,acsm5)在肝细胞肝癌(hepatocellular carcinoma,HCC)及癌旁肝组织中的表达情况,探讨其与临床病理特征的关系及对肝癌预后的意义。方法:通过生物信息学方法筛选出与肝癌相关的潜在指标acsm5,分别从TIMER数据库、TCGA数据库、GEPIA数据库及Kaplan-Meier Plotter数据库检索acsm5,分析其在肝癌中的表达情况。通过TIMER数据库分析acsm5在不同肿瘤组织与癌旁组织中的表达情况,通过TCGA数据库分析371例肝癌样本与50例癌旁样本中acsm5基因的表达水平,通过GEPIA数据库分析369例肝癌样本和160例癌旁样本中acsm5基因的表达水平。利用Kaplan-Meier Plotter数据库和GEPIA数据库进一步评估acsm5表达情况与肝癌患者预后的关系。基于前期筛选分析,应用免疫组化En Vision两步法染色检测62例HCC及对应癌旁肝组织中acsm5的表达,采用χ2检验或Fisher精确概率检验分析acsm5表达情况与HCC患者临床病理特征间的关系,采用Kaplan-Meier预后生存分析评估acsm5表达水平与HCC患者预后的关系,运用单因素及多因素COX回归分析评估HCC患者预后的影响因素。结果:(1)分析TIMER数据库中acsm5在不同肿瘤组织与癌旁组织中的表达,结果显示:相较于癌旁组织,acsm5在乳腺癌、肝癌、肺腺癌等肿瘤组织中低表达,差异有统计学意义(Pacsm5基因表达水平,结果均显示acsm5在癌旁组织中的表达水平高于肝癌组织,差异有统计学意义(P5)。比较GEPIA数据库及Kaplan-Meier Plotter数据库中acsm5低表达组和高表达组患者的总生存期,结果显示高表达组预后更好,差异有统计学意义(P=0.024,P=0.013)。(2)免疫组化结果:acsm5蛋白主要定位于细胞质;62例HCC组织中acsm5低表达45例(72.58%),高表达17例(27.42%);62例癌旁肝组织中acsm5低表达3例(4.84%),高表达59例(95.16%);与癌旁肝组织相比,acsm5在HCC组织中的表达水平降低,差异有统计学意义(χ2=59.961,Pacsm5表达水平与HCC患者临床病理特征的关系,结果显示:acsm5表达水平高低与肿瘤分化程度及AFP水平显著相关,差异均具有统计学意义(P=0.001,P=0.024);与患者年龄、性别、病灶数目、肿瘤直径、是否合并肝硬化、有无卫星灶及有无脉管癌栓无明显相关,差异无统计学意义(P>0.05)。(4)Kaplan-Meier预后生存分析结果显示ASCM5低表达组患者总生存期(Overall Survival,OS)及无瘤生存期(Disease Free Survival,DFS)较高表达组短,差异有统计学意义(P5)。此外,与多个病灶组相比,单个病灶组HCC患者预后更好,差异有统计学意义(P5)COX回归分析提示病灶数目及脉管癌栓是HCC患者预后不良的因素,acsm5低表达是HCC患者预后不良的因素。结论:(1)acsm5在肝癌组织中低表达,在癌旁肝组织中高表达,且acsm5表达水平与肿瘤分化程度及AFP水平密切相关,提示acsm5为HCC的潜在分子标志物。(2)acsm5高表达组HCC患者预后优于低表达组,acsm5表达水平可能是HCC患者生存的独立性影响因素。

关键词：肝细胞肝癌 acsm5 免疫组织化学

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acsm5在肺腺癌中的临床意义以及与免疫浸润相关性的研究

ACSM5在肺腺癌中的临床意义以及与免疫浸润相关性的研究

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作者：贺思静大连医科大学

学位级别：硕士

目的探索acsm5(Acyl-coenzyme A synthetase Medium Chain Family Member 5,酰辅酶A合成酶中链家族5)在肺腺癌中的临床意义以及与免疫浸润的相关性。方法本研究通过分析TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)数据库,探究acsm5... 详细信息

目的探索acsm5(Acyl-coenzyme A synthetase Medium Chain Family Member 5,酰辅酶A合成酶中链家族5)在肺腺癌中的临床意义以及与免疫浸润的相关性。方法本研究通过分析TCGA(The Cancer Genome Atlas,癌症基因组图谱)数据库,探究acsm5在肺腺癌组织中的表达水平,以及与生存预后和临床病理参数之间的相关性,初步认定acsm5是肺腺癌发展和演变的关键基因。接着使用GSEA(Gene Set Enrichment Analysis,基因富集分析)软件分析与acsm5相关潜在的分子通路。用UALCN(The University of Alabama Cancer Database,阿拉巴马大学癌症数据库)数据库分析LUAD组织中acsm5相关蛋白编码基因的正、负表达。通过使用STRING和Gene MANIA数据库,我们调查了在LUAD组织中与acsm5相关的蛋白质编码基因。我们还通过使用CIBERSORT和TCGA数据库确定了acsm5与28种肿瘤浸润免疫细胞之间的相关性。通过TIMER算法,我们对acsm5与免疫细胞标记物进行相关性分析,同时利用“GSVA”(版本1.40.1)和“gsease”(版本1.54 4.0)R包,对acsm5与免疫细胞功能进行相关性分析。在使用肺腺癌在线数据库做初步分析后,使用临床样本验证上述结果,蛋白免疫印迹实验和免疫组化实验用于验证acsm5的表达与生存预后、临床病理参数以及免疫检查点PD-1、PD-L1之间的相关性。结果在TCGA数据库中,acsm5在BLCA(Bladder Urothelial Carcinoma,膀胱尿路上皮癌)、BRCA(Breast Invasive Carcinoma,乳腺浸润性癌)、CHOL(Cholangiocarcinoma,胆管癌)等18种癌症中显著低表达,同时通过IHC和WB实验证明,在肺腺癌组织中acsm5的表达也明显低于癌旁肺组织。预后分析表明在肺腺癌中相较于acsm5低表达的患者,高表达的患者具有更好的预后生存。接着探究acsm5与肺腺癌临床因素的相关性,箱型图的结果表明acsm5的表达和临床病理分级密切相关,且随着病理分级和T分期的不断升高,acsm5的表达也在不断降低。单因素结果表明分级(HR=1.65,Pacsm5表达(HR=0.11,Pacsm5可以作为肺腺癌患者预后的独立危险因素。利用UALCAN数据库分析LUAD组织中与acsm5相关的基因,结果显示与acsm5呈正相关的前10个蛋白质编码基因依次为:DPEP2、KCNJ5、DNASE2B、FDG2、IRF8、CHIT1、CD37、MS4A7、AMICA1和CD300LF。与acsm5负相关的10个蛋白编码基因依次为:PAICS、ALDH18A1、HDGF、CKAP4、UBE2V2、PYCR1、FAM136A、TUBA1C、BZW2和PPP1R14B。接着我们通过GSEA软件进行KEGG通路分析以确定肺腺癌进展中和acsm5表达相关的生物学通路,结果表明acsm5的高表达可能和肠道免疫网络中Ig A的生产、细胞黏附分子、B细胞受体信号通路、自然杀伤细胞介导的细胞毒性、T细胞受体信号通路和VEGF信号通路呈正相关,而acsm5的高表达可能和RNA降解、细胞周期、磷酸戊糖途径、蛋白质外排和柠檬酸循环呈负相关。通过CIBERSORT和TCGA数据库,发现acsm5的表达与24种类型的免疫细胞显著相关。接着使用TIMER数据库进一步探讨LUAD组织预后和免疫细胞浸润水平与acsm5表达之间的关系,结果是acsm5表达水平与CD4+T细胞(r=0.311,P=1.49e-12)、B细胞(r=0.181,P=5.11e-05)和嗜中性粒细胞(r=0.24,P=6.52e-08)的浸润水平呈正相关,且B细胞、树突状细胞的浸润水平和acsm5表达情况是与LUAD累积存活率相关的因素。通过“GSVA”(版本1.40.1)和“gsease”(版本1.54 4.0)R包分析可知acsm5的高表达与LUAD组织中的PD-1、PD-L1、CTLA4、CD86、LAG3、TIM-3和TIGIT免疫检查点相关。对免疫组化芯片的结果进行分析,可知随着T分期升高acsm5表达逐渐降低,且acsm5表达与预后呈正相关,通过多因素COX分析可知acsm5可作为肺腺癌患者独立的预后因素,这与之前的结果一致。另外acsm5+细胞浸润的高丰度与肿瘤内PD-L1+和PD-1+的高丰度相关。结论***5在

关键词： acsm5 肺腺癌生物标志物预后免疫检查点

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基于数据挖掘分析acsm5在肺腺癌中的表达和临床意义

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中文科技期刊数据库（全文版）医药卫生 2023年第4期 36-38页

作者：汤恺成刘昱含汪永惠郭尧陈全刚徐州医科大学生命科学学院江苏徐州221000

探索中链酰基辅酶A合成酶5(Acyl-CoA Synthetase Medium Chain Family Member 5,acsm5)在肺腺癌中的表达和临床意义。方法通过GEPIA2在线工具分析TCGA数据库中acsm5 mRNA在肺腺癌和正常肺组织中的表达情况,并进一步分析acsm5基因表达... 详细信息

探索中链酰基辅酶A合成酶5(Acyl-CoA Synthetase Medium Chain Family Member 5,acsm5)在肺腺癌中的表达和临床意义。方法通过GEPIA2在线工具分析TCGA数据库中acsm5 mRNA在肺腺癌和正常肺组织中的表达情况,并进一步分析acsm5基因表达与肺腺癌预后之间的关系,用Kaplan-Meier Plotter数据库加以验证。借助UALCAN数据库探讨了acsm5和肺腺癌临床病理特征的联系。利用TIMER2.0数据库分析acsm5表达量与CD8+ T细胞、B细胞及髓源性抑制细胞在肺腺癌肿瘤微环境中的浸润水平的关系。结果 acsm5 mRNA在肺腺癌组织中的表达水平均明显低于正常肺组织。acsm5低表达与肺腺癌不良预后有关。TCGA数据库中,acsm5 mRNA高表达组肺腺癌患者的OS明显长于低表达组,并在Kaplan-MeierPlotter数据库中得到了进一步验证。acsm5表达量和CD8+ T细胞和B细胞的浸润水平显著正相关,而与髓源性抑制细胞的浸润水平呈负相关。结论基于肿瘤基因数据库信息挖掘,acsm5在肺腺癌组织中呈低表达,acsm5的低表达与肺腺癌的不良预后相关,可能是肺腺癌的潜在分子标志物。

关键词： acsm5 肺腺癌临床分析

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Genomic characterization and risk stratification of esophageal squamous dysplasia

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Medical Review 2024年第3期4卷 244-256页

作者： Qingjie Min Min Zhang Dongmei Lin Weimin Zhang Xianfeng Li Lianmei Zhao Huajing Teng Tao He Wei Sun Jiawen Fan Xiying Yu Jie Chen Jinting Li Xiaohan Gao Bin Dong Rui Liu Xuefeng Liu Yongmei Song Yongping Cui Shih-Hsin Lu Ruiqiang Li Mingzhou Guo Yan Wang Qimin Zhan Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing) Laboratory of Molecular OncologyPeking University Cancer Hospital&InstituteBeijingChina Novogene Co.Ltd BeijingChina Department of Pathology Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital&InstituteBeijingChina Department of Gastroenterology Daping HospitalArmy Medical University(Third Military Medical University)ChongqingChina Research Center The Fourth Hospital of Hebei Medical UniversityShijiazhuangHebeiChina Department of Radiation Oncology Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing)Peking University Cancer Hospital&InstituteBeijingChina Department of Gastroenterology&Hepatology Chinese PLA General HospitalBeijingChina Department of Etiology and Carcinogenesis and State Key Laboratory of Molecular Oncology National Cancer Center/National Clinical Research Center for Cancer/Cancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijingChina State Key Laboratory of Molecular Oncology Cancer Institute and Cancer HospitalChinese Academy of Medical Sciences and Peking Union Medical CollegeBeijingChina Key Laboratory of Carcinogenesis and Translational Research(Ministry of Education/Beijing) Central LaboratoryPeking University Cancer Hospital&InstituteBeijingChina Institute of Cancer Stem Cell Dalian Medical UniversityDalianLiaoningChina Shenzhen Peking University-The Hong Kong University of Science and Technology(PKU-HKUST)Medical Center Peking University Shenzhen HospitalShenzhenGuangdongChina

Objectives:The majority of esophageal squamous dysplasia(ESD)patients progress slowly,while a subset of patients can undergo recurrence rapidly or progress to invasive cancer even after proper ***,the molecular mechanisms underlying these clinical observations are still largely ***:By sequencing the genomic data of 160 clinical samples from 49 tumor-free ESD patients and 88 esophageal squamous cell carcinoma(ESCC)patients,we demonstrated lower somatic mutation and copy number alteration(CNA)burden in ESD compared with ***:Cross-species screening and functional assays identified acsm5 as a novel driver gene for ESD ***,we revealed that miR-4292 promoted ESD progression and could serve as a non-invasive diagnostic marker for ***:These findings largely expanded our understanding of ESD genetics and tumorigenesis,which possessed promising significance for improving early diagnosis,reducing overtreatment,and identifying high-risk ESD patients.

关键词： esophageal squamous dysplasia genomic alteration acsm5 early diagnosis miR-4292

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