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abcc3在肾透明细胞癌中的表达及临床意义的生物信息学分析

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齐齐哈尔医学院学报 2022年第7期43卷 601-605页

作者：赵长明毕经旺王蕊姚翠翠山东省第二人民医院血液肿瘤科山东济南250001

目的通过生物信息学方法探讨abcc3基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义。方法对oncomine数据库及CCLE数据库中abcc3基因表达进行二次分析,利用Kaplan-meire plotter数据库分析无进展生存期及总生存期。结果在oncomine数据库中,涉及AB... 详细信息

目的通过生物信息学方法探讨abcc3基因在肾透明细胞癌中的表达及预后意义。方法对oncomine数据库及CCLE数据库中abcc3基因表达进行二次分析,利用Kaplan-meire plotter数据库分析无进展生存期及总生存期。结果在oncomine数据库中,涉及abcc3的研究共计426项,其中差异表达的共计34项(28项研究高表达,6项研究低表达);肾透明细胞癌相关研究5项,共计162个样本,肾透明细胞癌组织中abcc3表达较正常肾组织明显升高(P=1.42E-8);CCLE数据分析结果显示,与多种癌细胞系相比,肾透明细胞癌细胞系中abcc3的mRNA表达水平均排名第一,Kaplan-meire plotter数据库分析结果显示肾透明细胞癌患者OS与abcc3表达水平有关(HR=1.68,95%CI:1.22-2.31,P=0.0012),但低表达患者组的RFS未见明显差异(HR=0.27,95%CI:0.06-1.19,P=0.063)。结论通过oncomine数据库及CCLE数据库分析发现肾透明细胞癌中abcc3基因表达升高,高表达患者总生存率(OS)明显缩短,因此,检测abcc3表达及抑制该基因表达有望成为肾透明细胞癌诊疗的方向。

关键词：肾透明细胞癌 abcc3 生物信息学预后

脑胶质瘤abcc3、PEBP4及Anxa7的表达及与病理特征和预后的关系

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分子诊断与治疗杂志 2022年第3期14卷 434-438页

作者：赵树鹏马继伟王向阳胡朝帅梁甲宁葛立可赵新利新乡医学院第一附属医院神经外科河南新乡453000

目的研究脑胶质瘤ATP结合盒转运蛋白3(abcc3)、磷脂酰乙醇胺结合蛋白4(PEBP4)及膜联蛋白7(Anxa7)的表达与病理特征、预后的关系。方法收集2016年5月至2018年6月于新乡医学院第一附属医院行肿瘤切除术的88例脑胶质瘤患者的胶质瘤组织... 详细信息

目的研究脑胶质瘤ATP结合盒转运蛋白3(abcc3)、磷脂酰乙醇胺结合蛋白4(PEBP4)及膜联蛋白7(Anxa7)的表达与病理特征、预后的关系。方法收集2016年5月至2018年6月于新乡医学院第一附属医院行肿瘤切除术的88例脑胶质瘤患者的胶质瘤组织作为实验组,同时收集瘤旁组织(距离肿瘤5 cm处)作为对照组;根据预后分为生存组(n=51)及死亡组(n=37)。对比各组间abcc3、PEBP4及Anxa7表达情况;分析脑胶质瘤中abcc3、PEBP4及Anxa7的表达与病理特征、预后的关系。结果实验组abcc3、PEBP4阳性率及Anxa7阴性率较对照组高,差异有统计学意义(Pabcc3、PEBP4阳性及Anxa7阴性患者的分化程度、远处转移、TNM分期高于abcc3、PEBP4阴性及Anxa7阳性患者,差异具有统计学意义(Pabcc3、PEBP4阳性率及Anxa7阴性率较生存组高,差异有统计学意义(Pabcc3、PEBP4、Anxa7为影响脑胶质瘤预后的独立危险因素(Pabcc3、PEBP4阳性表达高,Anxa7阴性表达高,三者可作为脑胶质瘤患者病情预后有效评估指标。

关键词：脑胶质瘤 abcc3 PEBP4 Anxa7

miR-591靶向abcc3对肺癌细胞吉西他滨耐药性的影响

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中国免疫学杂志 2021年第17期37卷 2115-2120页

作者：林辉雄林海锋逯妍王小泉王闻通琼海市人民医院肿瘤内科琼海571400 海南医学院第二附属医院肿瘤内科海口570311

目的:探究miRNA-591靶向abcc3对肺癌细胞吉西他滨耐药性的影响。方法:采用低浓度递增法构建肺癌吉西他滨耐药细胞A549/GR,CCK-8检测细胞增殖,qRT-PCR和Western blot检测miR-591和abcc3 mRNA、蛋白表达。TargetScan预测和双荧光素酶报告... 详细信息

目的:探究miRNA-591靶向abcc3对肺癌细胞吉西他滨耐药性的影响。方法:采用低浓度递增法构建肺癌吉西他滨耐药细胞A549/GR,CCK-8检测细胞增殖,qRT-PCR和Western blot检测miR-591和abcc3 mRNA、蛋白表达。TargetScan预测和双荧光素酶报告实验分析miR-591与abcc3的靶向关系。A549/GR细胞中转染miR-591或si-abcc3,并给予吉西他滨处理,或共转染miR-591和pcDNA-abcc3,并给予吉西他滨处理。CCK-8和流式细胞术检测细胞增殖与凋亡,Western blot检测abcc3、细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、p21、B细胞淋巴瘤/白血病-2(Bcl-2)、Bcl-2相关X蛋白(Bax)蛋白表达。结果:与A549细胞相比,0.01、0.1、1、2、5、10μmol/L吉西他滨显著降低A549/GR细胞增殖抑制率。A549/GR细胞中miR-591表达明显减少,abcc3 mRNA和蛋白表达显著增加(Pabcc3表达。miR-591过表达联合吉西他滨显著提高A549/GR细胞抑制率、凋亡率、p21、Bax蛋白表达,显著降低CyclinD1、Bcl-2蛋白水平(Pabcc3表达联合吉西他滨作用相同。abcc3过表达逆转miR-591过表达对吉西他滨作用的A549/GR细胞增殖、凋亡、CyclinD1、p21、Bcl-2、Bax蛋白表达的影响。结论:miR-591过表达通过靶向调控abcc3表达,降低肺癌细胞对吉西他滨的耐药性。

关键词： miR-591 abcc3 肺癌吉西他滨耐药性凋亡

大数据下肺腺癌BIRC5，abcc3，CDC20，ASPM新网络构建及分析验证

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大数据下肺腺癌BIRC5，ABCC3，CDC20，ASPM新网络构建及分析验证

作者：史季韬北京邮电大学

学位级别：硕士

本论文原创重构了肺腺癌GSE7670库高表达显著性的BIRC5,abcc3,CDC20,ASPM新分子和知识网络,分析提出和验证了新假说,整合基因表达差异显著性分析方法SAM、基于线性规划和分解过程的基因重构网络构建算法GRNInfer、Kappa统计和模糊启发... 详细信息

本论文原创重构了肺腺癌GSE7670库高表达显著性的BIRC5,abcc3,CDC20,ASPM新分子和知识网络,分析提出和验证了新假说,整合基因表达差异显著性分析方法SAM、基于线性规划和分解过程的基因重构网络构建算法GRNInfer、Kappa统计和模糊启发式聚类分析的DAVID方法。相较肺腺癌正常肺邻近组织,肺腺癌中分子网络的激活分子数减抑制分子数净正向结果:BIRC5网络的肺腺癌发生发展为7,微管细胞骨架为6,核为1;abcc3网络在肺腺癌的转运蛋白活性和膜组分为3;CDC20网络在肺腺癌的蛋白分解为1,细胞周期调节为2;APSM网络在肺腺癌的细胞内膜细胞器为5,有丝分裂为3。相较肺腺癌正常邻近组织,肺腺癌中分子网络的激活分子数减抑制分子数的净负向结果:BIRC5网络在肺腺癌的细胞质为-5,选择性剪接为-6;abcc3网络在肺腺癌糖蛋白为-9;CDC20网络在肺腺癌的蛋白结合为-1,序列变异为-3。我们提出BIRC5网络增强肺腺癌核内微管相关的发生发展和抑制细胞质剪接变异体;abcc3网络增强肺腺癌膜转运蛋白活性和抑制胞外糖蛋白;CDC20网络增强肺腺癌蛋白分解相关的细胞周期调节和抑制蛋白结合的序列变异;ASPM网络增强肺腺癌基于膜细胞器的有丝分裂。并通过BIRC5、abcc3、CDC20、ASPM的激活和抑制知识网络相互正向和反向验证我们的假说。为我国肺腺癌的整合诊断和治疗奠定基础并开辟新途径。

关键词：肺腺癌 abcc3 ASPM BIRC5 CDC20

四种昆虫abcc2和abcc3基因的重组表达及功能分析

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四种昆虫ABCC2和ABCC3基因的重组表达及功能分析

作者：何飞华中师范大学

学位级别：硕士

苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)是目前产量多、使用广泛的微生物农药之一,具有较好的经济价值,其产生的伴孢晶体毒素可以直接作用于害虫,还可以将其毒素基因作为转基因农作物的靶标基因,因此该微生物资源有非常大的应用价... 详细信息

苏云金芽孢杆菌(Bacillus thuringiensis,Bt)是目前产量多、使用广泛的微生物农药之一,具有较好的经济价值,其产生的伴孢晶体毒素可以直接作用于害虫,还可以将其毒素基因作为转基因农作物的靶标基因,因此该微生物资源有非常大的应用价值。在BT毒素杀虫过程中,发挥杀虫作用的关键步骤是毒素与受体的识别与结合,因此BT毒素受体的研究对探索BT毒素的杀虫机理具有重要的意义。目前,在昆虫中肠中发现的受体主要有四类:碱性磷酸酶(ALP),氨肽酶N(APN),钙粘蛋白(Cadherin)和糖脂类。近年来,一些鳞翅目昆虫ABC家族的多种蛋白被报道可以作为BT毒素的受体并且可能与BT毒素的抗性相关,目前有关斜纹夜蛾、棉铃虫、红铃虫和粘虫abcc蛋白的报道尚少,在离体细胞水平尚未证实能否介导细胞对Bt毒素的毒力。本实验中,首先在细胞水平用RNAi技术沉默了Slabcc3基因的表达,发现SIabcc3基因被沉默后,TH细胞对Cry1Ac毒素的敏感性显著下降(pabcc3-GFP真核表达质粒分别导入到TH细胞和TnH5细胞中,超表达后,发现这两种不同的昆虫细胞对Cry1Ac毒素的敏感性都显著增强(pabcc3蛋白介导的Cry1Ac毒素的毒力比棉铃虫HaCadherin蛋白更强;真核表达质粒pIE2-EGFP-N1-S1abcc3-GFP 和 pIE2-EGFP-N1-HaCadherin-mCherry,在 TnH5 细胞中共表达,细胞对Cry1Ac毒素的敏感性显著增强(pabcc3蛋白可以作为BT毒素的受体,并且与棉铃虫HaCadherin受体蛋白一起作用时对毒素具有显著协同作用。此外,本研究还证明棉铃虫abcc2、红铃虫abcc2以及粘虫的abcc2和abcc3蛋白都定位在细胞质中和细胞膜上;并且这几种蛋白均能介导Cry1Ac毒素对昆虫细胞的毒力,提示在多种鳞翅目昆虫中,abcc2和abcc3蛋白都可以作为BT毒素的受体,即鳞翅目昆虫的abcc2和abcc3蛋白作为BT毒素的潜在受体具有普遍性。

关键词： abcc3 abcc2 RNAi Cry1Ac 毒素 BT 毒素受体

外周血中abcc3浓度与CYP2C19基因型对PCI术后氯吡格雷抗血小板效应的影响

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湖南师范大学学报（医学版） 2021年第2期18卷 130-133页

作者：王晶晶郭晓波谢娟阮芙蓉西安交通大学医学院附属西安市中心医院药剂科西安710003 西安交通大学医学院附属西安市中心医院血液科西安710003

目的:探究外周血中abcc3浓度与CYP2C19基因型对PCI术后氯吡格雷抗血小板效应的影响。方法:纳入在本院进行PCI手术的冠心病患者103例,术后采用氯吡格雷进行抗血小板治疗,利用外周血提取DNA进行CYP2C19基因型分型,同时利用ELISA法测定外... 详细信息

目的:探究外周血中abcc3浓度与CYP2C19基因型对PCI术后氯吡格雷抗血小板效应的影响。方法:纳入在本院进行PCI手术的冠心病患者103例,术后采用氯吡格雷进行抗血小板治疗,利用外周血提取DNA进行CYP2C19基因型分型,同时利用ELISA法测定外周血中abcc3的水平,观察术后血小板聚集率及达标率。分析CYP2C19基因型与abcc3水平的相关性,及对氯吡格雷抗血小板效应的影响。结果:本研究PCI术后患者CYP2C19基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡。不同代谢型CYP2C19患者的abcc3水平有较大差异,快代谢型患者的abcc3水平较中、慢代谢型患者显著降低,且快代谢型患者的抗血小板效应(血小板聚集率及达标率)均优于中慢型代谢型患者。同时,发现abcc3水平与血小板聚集率具有显著的相关性。结论:CYP2C19基因型与PCI治疗后氯吡格雷抗血小板临床疗效有关,且外周血abcc3水平与氯吡格雷抗血小板疗效相关性更优,可以为临床治疗提供参考。

关键词： abcc3 氯吡格雷 CYP2C19 抗血小板

天然抗abcc3 IgG抗体对口腔鳞癌细胞增殖的影响

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北京口腔医学 2019年第2期27卷 67-71页

作者：刘秀黄志成董蕊何子毅孟庆勇胡颖首都医科大学口腔医学院口腔医学研究所北京100050 吉林省肿瘤医院放射科广东省东莞市中心血站广东医科大学护理学院

目的探讨天然抗abcc3 IgG抗体对口腔鳞癌细胞CAL27和SCC15的影响。方法采用ELISA方法筛查富含天然抗abcc3 IgG抗体的阳性血浆为实验组,低含天然抗abcc3 IgG抗体的阴性血浆为对照组。采用qRT-PCR检测abcc3基因的mRNA表达水平。CCK-8实验... 详细信息

目的探讨天然抗abcc3 IgG抗体对口腔鳞癌细胞CAL27和SCC15的影响。方法采用ELISA方法筛查富含天然抗abcc3 IgG抗体的阳性血浆为实验组,低含天然抗abcc3 IgG抗体的阴性血浆为对照组。采用qRT-PCR检测abcc3基因的mRNA表达水平。CCK-8实验和流式细胞术检测天然抗abcc3 IgG抗体对CAL27和SCC15细胞的增殖、凋亡和细胞周期的影响。结果在CAL27和SCC15细胞中均有abcc3基因的表达。与阴性对照血浆相比较,富含abcc3 IgG抗体的阳性血浆可以明显抑制CAL27细胞的增殖(Pabcc3 IgG抗体对口腔鳞癌细胞的增殖有抑制作用,可能成为治疗口腔鳞癌的一种有前景的新药物。

关键词：天然抗体 abcc3 口腔鳞癌

血液中循环肿瘤抗体abcc3在乳腺癌早期诊断中的意义

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中国实验诊断学 2019年第8期23卷 1368-1369页

作者：郝芳时崔春国计国义吉林大学中日联谊医院吉林长春130033

有证据显示多重耐药(MDR)的发生可能和三磷酸腺苷结合转运蛋白(ABC)的过表达相关,目前已知有49个基因参与编码了ABC[1]。这些ABC转运蛋白可以分为7个亚组,其中abcc1-3和ABCG2等蛋白的表达被证实可能和多种恶性肿瘤的治疗失败呈相关性[2... 详细信息

有证据显示多重耐药(MDR)的发生可能和三磷酸腺苷结合转运蛋白(ABC)的过表达相关,目前已知有49个基因参与编码了ABC[1]。这些ABC转运蛋白可以分为7个亚组,其中abcc1-3和ABCG2等蛋白的表达被证实可能和多种恶性肿瘤的治疗失败呈相关性[2]。值得注意的是,这些ABC转运蛋白的过表达会通过肿瘤相关抗原的呈递在患者血液中表现出相关抗体表达的依赖性。

关键词：乳腺癌早期诊断循环抗体乳腺癌患者肿瘤抗体 abcc3

经皮冠状动脉介入治疗术后患者CYP2C19基因多态性与血浆abcc3水平的相关性研究

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贵州医药 2019年第3期43卷 385-386页

作者：胡蓉王彦程君高明喜李真真上海市第一人民医院宝山分院药剂科上海200940 上海市第一人民医院宝山分院心内科上海200940

目的评价经皮冠状动脉介入治疗(PCI)术后患者CYP2C19基因多态性与血浆abcc3水平的相关性。方法选取PCI术后患者149例,根据其CYP2C19基因型分为快代谢型(CYP2C19*1/*1)、中等代谢型(CYP2C19*1/*2、CYP2C19*1/*3)和慢代谢型(CYP2C19*2/*2、CYP2C19*2/*3、CYP2C19*3/*3)3组,比较3组abcc3水平。结果快代谢组53例(35.57%);中代谢组75例(50.34%);慢代谢组21例(14.09%)。快代谢型、中等代谢型和慢代谢型3组之间abcc3水平差异无统计学意义(P>0.05)。结论 PCI术后患者CYP2C19基因多态性与血浆abcc3水平无显著相关性,但abcc3水平在快代谢型、中等代谢型和慢代谢型3组中呈下降趋势。

关键词：经皮冠状动脉介入治疗(PCI) 基因多态性 CYP2C19 abcc3