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应用预防医学 2007年第4期13卷 193-196页

作者：杨益超黎学铭赵同领李树林许洪波吴钦华商少明谢祖英区方奇黄铿凌麦富珍广西壮族自治区疾病预防控制中心广西医科大学

目的比较分析广西人体扇棘单睾吸虫、扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8srrna序列及二级结构,探讨他们的进化关系。方法提取广西扇棘单睾吸虫DNA,PCR扩增并测定5.8srDNA序列;登录GenBank获取扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8srDNA序列。应用... 详细信息

目的比较分析广西人体扇棘单睾吸虫、扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8srrna序列及二级结构,探讨他们的进化关系。方法提取广西扇棘单睾吸虫DNA,PCR扩增并测定5.8srDNA序列;登录GenBank获取扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫5.8srDNA序列。应用相关软件将5.8srDNA基因转换成5.8srrna。采用Zuker算法,构建5.8srrna分子二级结构;计算3种吸虫间的遗传距离和同源性,分析5.8srrna序列及其二级结构特征。结果广西人体扇棘单睾吸虫与扇棘单睾吸虫5.8srrna分子序列比较显示第81、83、84、129和143位共5个碱基发生变异,这些突变碱基均位于5.8srrna分子二级结构未配对碱基区,未引起5.8srrna二级结构的明显变化;与钩棘单睾吸虫比较,显示第13、27、49、66、99、152、157位共7个碱基发生变异,其中3个碱基发生在配对区,4个替代发生在未配对区,碱基变异引起两种吸虫5.8srrna二级结构的明显不同;广西扇棘单睾吸虫与扇棘单睾吸虫和钩棘单睾吸虫的遗传距离分别为0.031和0.044,同源性分别为96.9%和95.6%。结论广西人体扇棘单睾吸虫5.8srrna序列与扇棘单睾吸虫高度同源,二级结构无明显不同,与钩棘单睾吸虫同源性较低,二级结构明显不同。

关键词：扇棘单睾吸虫 5.8s rrna 二级结构

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Phylogenetic relationships within the genus Aspidisca(Protozoa,Ciliophora,Euplotida) revealed by ITs1-5.8s-ITs2 region sequences

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Chinese Journal of Oceanology and Limnology 2011年第2期29卷 277-283页

作者：黄洁伊珍珍苗苗 AL-RAsHEID KhaledA.s 宋微波 Laboratory of Protozoology Institute of Evolution and Marine Biodiversity Ocean University of China Qingdao 266003 China Laboratory of Protozoology Key Laboratory of Ecology and Environmental Science in Guangdong Higher Education South Chtna Normal University Guangzhou 510631 China Zoology Department King Saud University Riyadh 11451 Saudi Arabia

Abstract The internal transcribed spacer regions （ITs1 and ITs2） and 5.8s rrna genes were sequenced in six populations of four Aspidisca species, namely A. leptaspis, A. orthopogon, A. rnagna and A. aculeata. Phylogenetic trees were constructed by means of Bayesian inference （BI）, Maximum Parsimony （MP）, Neighbor-Joining （NJ）, and Maximum Likelihood （ML） to assess the inter- and intra-species relationships within the genus Aspidisca. All trees show similar topologies with stable supports and indicate that：（1） four well known groups, i.e., Oligotrichia, stichotrichia, Choreotrichia and Hypotrichia, are distinctly outlined within the class spirotrichea, and all are monophyletic other than Hypotrichia; （2） members of Aspidisca can be distinguished well, based on the ***-ITs2 region sequences, and A. leptaspis and A. magna shared a closer relationship than other species; （3） Aspidisca and Euplotes branch early in the subclass Hypotrichia. To compare the phylogenetic relationships based on different genes, ssU rrna trees were also constructed with nearly the same species inclusion, which revealed different topologies of inter-species, inter-genera and inter-subclasses.

关键词： marine ciliates Aspidisca phylogeny internal transcribed spacer 5.8s rrna

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几种石莼目大型海洋绿藻的系统发育分析

几种石莼目大型海洋绿藻的系统发育分析

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作者：张耀东苏州大学

学位级别：硕士

实验测得了孔石莼(Ulva pertusa),浒苔(Enteromorpha prolifera),格式礁膜的(Monostroma grevillei)rbcL基因;孔石莼(Ulva pertusa),浒苔(Enteromorpha prolifera),格式礁膜(Monostroma grevillei)5.8s rrna基因;孔石莼(Ulva pertusa),浒苔(Enteromorpha prolifera),宽礁膜(Monostrom latissimum)18s rrna基因;浒苔(Enteromorpha prolifera)格式礁膜(Monostroma grevillei )ITs基因。通过基因序列分析多种石莼目绿藻分子系统发育关系。序列数据经ClustalX1.8软件排序后,采用MEGA2.软件根据Kimura’s双因子法计算遗传距离,并应用邻接法(neighbour-jointing)和最大简约法(Maximum Parsimony)构建系统树,Bootstrap法(1000次重复)评估分支可信度。将5.8s rrna基因、18s rrna基因、ITs基因和rbcL组合起来,分析了多种大型绿藻的系统发育关系。系统地讨论了海藻DNA提取,建树方法的选择,石莼属和浒苔属的发育关系,缘管浒苔的分类地位,浒苔的分类地位,扁浒苔和肠浒苔的关系,礁膜、宽礁膜和格式礁膜三者之间的亲缘关系,袋礁膜、格氏礁膜和北极礁膜之间的亲缘关系。我们认为石莼属和浒苔属不是严格区分的,缘管浒苔和浒苔都应并入石莼属,条浒苔和肠浒苔是两个不同的种,格式礁膜和袋礁膜是同一个物种,袋礁膜和北极礁膜是不同的种。

关键词：石莼目 5.8s rrna 18s rrna rbcL ITs 系统发育

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广西人体扇棘单睾吸虫研究

广西人体扇棘单睾吸虫研究

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全国寄生虫学与热带医学学术研讨会

作者：杨益超黎学铭李树林许洪波吴钦华谭裕光商少明区方奇广西壮族自治区疾病预防控制中心

目的了解扇棘单睾吸虫在广西人群和淡水鱼中的感染情况;分析广西人体扇棘单睾吸虫(H.t-gx)5.8s rrna基因片段。方法在有吃生鱼类习惯的地区,采用Kato-Katz法检查居民粪便,选择部分吸虫卵阳性者驱虫并收集扇棘单睾吸虫成虫;采用消化法检... 详细信息

目的了解扇棘单睾吸虫在广西人群和淡水鱼中的感染情况;分析广西人体扇棘单睾吸虫(H.t-gx)5.8s rrna基因片段。方法在有吃生鱼类习惯的地区,采用Kato-Katz法检查居民粪便,选择部分吸虫卵阳性者驱虫并收集扇棘单睾吸虫成虫;采用消化法检查鱼类扇棘单睾吸虫囊蚴;PCR扩增并测序成虫5.8s rrna基因片段,与GenBank中以色列鱼内扇棘单睾吸虫囊蚴(H.t)和钩棘单睾吸虫囊蚴(H.p)相同片段进行同源性和遗传距离分析。结果在6个调查点调查了813人,发现吸虫卵阳性者454例,感染率55.84%,在阳性者选择168人进行驱虫,收集扇棘单睾吸虫成虫的73人,占驱虫人数的43.45%,其中马山调查点占到90.47%,而东罗点筛虫40人,没有找到扇棘单睾吸虫成虫。在流行区内收集和消化了鱼类40多种,有17种鱼发现了扇棘单睾吸虫囊蚴:鲢鱼,鲫鱼,花鱼骨,海南似鱼乔,鲤鱼,棒花鱼,餐,Culter recurviceps,达氏鲌,南方拟餐,马口鱼,条纹小鱼巴,线细鳊,*麦鲮,达氏鲌,蛇鮈,squalidus argentatus。其中,鲤鱼和鲫鱼为流行区人群最常生吃的鱼类。H.t-gx、H.t和H.p间5.8s rrna的同源性和遗传距离分析显示H.t-gx与H.t和H.p同源性分别为96.9%,95.6%,遗传距离分别为0.031和0.044。结论人群粪便检查吸虫卵阳性者中,半数以上为扇棘单睾吸虫感染,鲤鱼、鲫鱼等为主要的传播中间宿主,在对华支睾吸虫预防和治诊断中应该充分考虑这种现况。H.t-gx与H.t有较高的同源性。

关键词：扇棘单睾吸虫感染率 5.8s rrna

来源： cnki会议评论

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