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应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成

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环境科学 2008年第4期29卷 1082-1091页

作者：刘敏朱开玲李洪波张涛肖天中国科学院海洋研究所海洋生态与环境科学重点实验室国家海洋局第二海洋研究所卫星海洋环境动力学国家重点实验室杭州310012

利用PCR-DGGE技术对2个季节（2006-04和2006-10）的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近（约17条）,多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条... 详细信息

利用PCR-DGGE技术对2个季节（2006-04和2006-10）的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近（约17条）,多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少（约12条）,其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群：变形细菌门（Proteobacteria）和拟杆菌门（Bacteroides）.在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ-和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体（海水温度为7-12℃）的细菌群落组成和10月份（冷水团存在期）冷水团内部水体（海水温度低于10℃）的细菌群落组成相同（都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides）,与10月份冷水团外部水体（海水温度大于19℃）的（包括γ-Proteobacteria和Bacteroides）不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同（都是γ-Proteobacteria）,而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性.

关键词：细菌群落组成 16srdna序列分析 PCR-DGGE 黄海冷水团

交替假单胞菌(Pseudoalteromonas sp.)DY3菌株产内切葡聚糖酶的性质研究及基因克隆

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生物工程学报 2004年第2期20卷 233-237页

作者：熊鹏钧文建军国家海洋局第三海洋研究所海洋生物工程重点实验室厦门361005

从深海样品ES0 10 9中分离到一株具有高内切葡聚糖酶活力的细菌DY3 ,16srdna序列分析表明该菌与交替假单胞菌属 (Pseudoalteromonassp .)的Pseudoalteromonascitrea和Pseudoalteromonaselyakovii的同源性为 99%。PCR扩增DY3的内切葡聚糖酶基因celX全长 14 79bp ,编码一个 492AA的蛋白质。酶的氨基酸序列分析表明CelX与Pseudoalteromonashaloplanktis的内切葡聚糖酶CelG有 95%的相似性 ,包括一个糖基水解酶家族 5的催化结构域 ,一个连接序列和位于C端的的CBM5结构域。对酶性质的初步研究发现 ,CelX的最适温度为 40℃ ,酶的最适pH在 6～

关键词：交替假单胞菌 DY3菌株 16srdna序列分析内切葡聚糖酶基因纤维素酶克隆

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产甾体皂甙华重楼内生菌的筛选与鉴定

微生物学报 2005年第5期45卷 776-779页

作者：赵明贺声蓉陈小静黄春萍王一丁四川师范大学生命科学学院成都610068

从华重楼(Paris ***)的地下块茎中分离筛选得到2株可能产生甾体皂甙的内生菌(SS01和SS02),薄层层析检测菌株SS01、SS02的发酵产物分别有3条和2条层析带与重楼总皂甙的层析带迁移率相当。形态和生理生化特征初步表明SS01和SS02分属于肠... 详细信息

从华重楼(Paris ***)的地下块茎中分离筛选得到2株可能产生甾体皂甙的内生菌(SS01和SS02),薄层层析检测菌株SS01、SS02的发酵产物分别有3条和2条层析带与重楼总皂甙的层析带迁移率相当。形态和生理生化特征初步表明SS01和SS02分属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和芽孢杆菌属(Bacillussp.)细菌。扩增、测序得到SS01和SS02的部分16S rDNA序列,GenBank接收号分别为AY842143和AY842144。用Blastn调出与菌株16srdna同源的序列,用Clustal W进行多重序列对比,用软件Phylip按Neighbor-Joining方法构建16srdna系统发育树。菌株SS01和SS02分别与Cedecea davisae DSM4568、Paenibacillus daejeonensis处于同一分支,相似性分别为98.9%和97.7%,将它们鉴定为Cedecea davisae SS01和Paenibacillus daejeonensis SS02。

关键词：华重楼内生菌甾体皂甙 16srdna序列分析

甘肃省定西市马铃薯疮痂病新病原Streptomycesgalilaeus的分离、鉴定及生物学特性研究

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植物保护 2018年第5期44卷 206-211页

作者：崔凌霄杨成德魏立娟薛莉张俊莲甘肃农业大学植物保护学院甘肃省农作物病虫害生物防治工程实验室兰州730070 甘肃省作物遗传改良与种质创新重点实验室兰州730070

对甘肃省定西市安定区的马铃薯疮痂病病原进行了分离、鉴定和生物学特性研究。结果表明,菌株5T-1具有较强致病性,菌落表面呈灰色,有金属光泽,平均直径为4.68mm,可产生黄褐色素,孢子圆形或圆柱形,孢子丝松散,革兰氏染色呈阳性。5T-1的16S... 详细信息

对甘肃省定西市安定区的马铃薯疮痂病病原进行了分离、鉴定和生物学特性研究。结果表明,菌株5T-1具有较强致病性,菌落表面呈灰色,有金属光泽,平均直径为4.68mm,可产生黄褐色素,孢子圆形或圆柱形,孢子丝松散,革兰氏染色呈阳性。5T-1的16srdna序列与加利利链霉菌Streptomyces galilaeus菌株的相似度为99%,结合形态特征将菌株5T-1鉴定为Streptomyces galilaeus,为甘肃省新报道病原菌。菌株5T-1生长最适温度为30℃,最适光照条件为全黑暗,最适pH为8.5,最佳碳源和氮源分别为肌醇和天冬氨酸。该研究结果为甘肃省马铃薯疮痂病诊断和综合防治提供了依据。

关键词：马铃薯疮痂病病原 16srdna序列分析鉴定生物学特性

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厦门地区近海温泉嗜热菌的分离、鉴定

台湾海峡 2007年第1期26卷 61-70页

作者：杨波陈新华国家海洋局第三海洋研究所海洋生物遗传资源重点实验室福建厦门361005

嗜热菌是一类特殊的极端环境微生物.本文所用的实验样品采集于厦门地区两个近海温泉的4个不同位点,通过16srdna序列分析对所分离到的312株细菌进行了归类总结,鉴定出嗜热栖热菌、嗜热脂肪泥土芽孢杆菌、嗜高温纤维分解菌、泥土芽孢杆菌... 详细信息

嗜热菌是一类特殊的极端环境微生物.本文所用的实验样品采集于厦门地区两个近海温泉的4个不同位点,通过16srdna序列分析对所分离到的312株细菌进行了归类总结,鉴定出嗜热栖热菌、嗜热脂肪泥土芽孢杆菌、嗜高温纤维分解菌、泥土芽孢杆菌属、水生栖热菌、假单胞菌属、木糖氧化无色杆菌、uncultured sheep mite bacte-rium、uncultured gamma proteobacterium等9种嗜热菌株,其中嗜高温纤维分解菌和嗜热栖热菌是主要的可培养优势菌群.其生长温度均在60-85℃,中性pH值.从而得出厦门地区近海温泉样品中的微生物生长类群信息,并发现了某些可能的新菌群,有助于了解该地区近海温泉特有环境下的可培养的微生物群落类型.

关键词：嗜热菌 16srdna序列分析分离鉴定

鲐鱼中产组胺菌的分离筛选与生物学特性初步研究

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食品工业科技 2012年第9期33卷 190-193页

作者：杨健吴祖芳周秀锦翁佩芳李微微应用海洋生物技术教育部重点实验室宁波大学生命科学与生物工程学院浙江宁波315211 舟山出入境检验检疫局浙江舟山316100

利用产组胺菌鉴别培养基,对鲐鱼内脏中产组胺菌进行初步筛选,结合高效液相色谱分析方法对分离菌株的产组胺能力进行了确认;并通过菌株的生理生化、形态和16srdna基因序列分析对分离得到的菌株进行鉴定;研究了温度和pH对菌株生长和产组... 详细信息

利用产组胺菌鉴别培养基,对鲐鱼内脏中产组胺菌进行初步筛选,结合高效液相色谱分析方法对分离菌株的产组胺能力进行了确认;并通过菌株的生理生化、形态和16srdna基因序列分析对分离得到的菌株进行鉴定;研究了温度和pH对菌株生长和产组胺的影响。结果表明,从鲐鱼中初步分离的4株菌(T4、T5、T6和T9)在组胺发酵培养基中能够产生164.1～466.1μg/100mL组胺;经生理生化特性及16srdna序列测定为相同菌种,对其中T4菌株进行进化树分析,发现菌株T4与产粘液变形杆菌相似性最高。T4菌株生长和产组胺的最适温度均为20℃,最适pH均为7。

关键词：鲐鱼产组胺菌生理生化特性 16srdna序列分析

红树内生细菌RS261菌株防治辣椒疫病的初步研究

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植物病理学报 2009年第3期39卷 333-336页

作者：柳凤欧雄常何红胡汉桥张小媛广东海洋大学农学院湛江524088

The endophytic Bacillus amyloliquefaciens strain RS261 is a biological agent isolated from the leaf of Rhizophora *** efficacy of RS261 strain on control of capsicum phytophthora blight caused by Phytophthora capsici was studied by seed socking,root drenching and fruit *** results showed that good biocontrol efficacy was *** indicated that biocontrol with endophytic bacteria was an atternative and potential methed to control the capsicum seedlings and fruits phytophthora blight.

关键词：突变菌株辣椒疫病内生细菌防治效果 16srdna序列分析红树解淀粉芽孢杆菌辣椒疫霉

1例冷藏猪脑中2种致病菌的分离及系统发育分析

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现代预防医学 2011年第8期38卷 1508-1510页

作者：高建新傅松哲龙慧南昌市疾病预防控制中心

[目的]为了解生肉类食品的安全性,针对火锅城食用生肉类食品中的单核细胞增生性李斯特菌及金黄色葡萄球菌进行检测。[方法]按照GB4789.30-2008、GB4789.10-2008对相关菌株进行检测。[结果]从1例火锅食用冷藏猪脑中同时分离出2种致病菌,... 详细信息

[目的]为了解生肉类食品的安全性,针对火锅城食用生肉类食品中的单核细胞增生性李斯特菌及金黄色葡萄球菌进行检测。[方法]按照GB4789.30-2008、GB4789.10-2008对相关菌株进行检测。[结果]从1例火锅食用冷藏猪脑中同时分离出2种致病菌,单核细胞增生性李斯特菌(简称100105A)及金黄色葡萄球菌(简称100105B)。并对菌株100105A、100105B其形态特征、生理生化鉴定以及对菌株100105A进行了16S rDNA序列进行了分析,确定了其系统发育关系,并研究了100105A菌株在10℃,4℃,-10℃低温下的生长情况。该菌株在10℃,4℃,乃至-10℃下,显示出较强的繁殖能力。[结论]冰箱冷藏保存,对食品安全性也存在一定风险。

关键词：冷藏猪脑单核细胞增生性李斯特菌金黄色葡萄球菌生化特性及鉴定 16srdna序列分析低温生长模式

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反硝化除磷系统的驯化及反硝化聚磷菌的筛选

安徽农业科学 2011年第18期39卷 11040-11042+11060页

作者：刘艳萍朴哲李玉敏马帅陈德莹扬州大学环境科学与工程学院

利用城市河道底泥,通过厌氧/缺氧/好氧(A2O)工艺驯化反硝化除磷系统,采用BTB培养基、异染粒及PHB(聚β-羟基丁酸)染色等方法,从反硝化除磷系统中分离筛选出反硝化聚磷菌,并通过16S rDNA序列测定分析其遗传背景。在该试验条件下,反硝化... 详细信息

利用城市河道底泥,通过厌氧/缺氧/好氧(A2O)工艺驯化反硝化除磷系统,采用BTB培养基、异染粒及PHB(聚β-羟基丁酸)染色等方法,从反硝化除磷系统中分离筛选出反硝化聚磷菌,并通过16S rDNA序列测定分析其遗传背景。在该试验条件下,反硝化除磷系统的氮磷的去除率超过80%。从反硝化除磷系统中分离筛选出DPB-A511、DPB-A9和DPB-A10 3株反硝化聚磷菌,其氮、磷去除率均超过50%。这3株菌中DPB-A511、DPB-A9分别与Dechloromonas aromatica、Candidatus accumulibacter phosphatis的相似性均达到97%,DPB-A10与Bacillus pumilus的相似性达到99%。

关键词：反硝化除磷系统反硝化聚磷菌筛选 16srdna序列分析