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巴马香猪断奶过渡期肠道微生物的变化

中国畜牧杂志 2023年第2期59卷 164-171页

作者：刘笑笑田威龙路玉洁程锋綦文晶陈奎蓉李月月吕冬玲梁靓高九昱奉玲丽朱思燃梁晶兰干球广西大学动物科学技术学院广西南宁530004

肠道微生物对猪的健康和生长具有重要作用,了解断奶期间微生物群落组成和功能的变化对猪生产具有重要意义。本研究收集了广西巴马香猪断奶前3 d(B3)、断奶后24 h(A0)、断奶后3 d(A3)和断奶后7 d(A7)共4个时间阶段的直肠拭子,通过Illumin... 详细信息

肠道微生物对猪的健康和生长具有重要作用,了解断奶期间微生物群落组成和功能的变化对猪生产具有重要意义。本研究收集了广西巴马香猪断奶前3 d(B3)、断奶后24 h(A0)、断奶后3 d(A3)和断奶后7 d(A7)共4个时间阶段的直肠拭子,通过Illumina Miseq平台对16s rrna基因V3-V4区域进行测序,分析巴马香猪断奶过渡期肠道微生物组成、结构和功能的改变。结果表明:随着仔猪年龄的增长,断奶后Alpha多样性逐渐增加;断奶应激导致巴马香猪断奶过渡期的肠道微生物的组成发生变化,在门水平,厚壁菌门(Firmicutes)和放线菌门(Actinobacteria)是断奶过渡期所有组的优势菌门,拟杆菌门(Bacteroidetes)和变形菌门(Proteobacteria)在断奶过渡期其丰度发生了显著变化(Ps)和梭杆菌属(Fusobacterium)等是断奶前的特征菌属,断奶后其优势被普氏菌属(Prevotella)、瘤胃球菌属(Ruminococcus)和密螺旋体属(Treponema)等菌属替代。KEGG功能预测发现,巴马香猪断奶前肠道微生物主要参与脂类代谢,断奶后肠道微生物主要参与免疫性疾病、其他氨基酸的代谢和其他次生代谢产物的生物合成等代谢途径。

关键词：巴马香猪断奶肠道微生物 16s rrna测序

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冷应激对雏鸡盲肠微生物的影响

中国畜牧杂志 2023年第11期59卷 298-303页

作者：高丽丽马晓春青岛农业大学草业学院山东青岛266109 遵义医科大学基础医学院贵州遵义563000 山东畜牧兽医职业学院动物医学院山东潍坊261061 中国农业科学院上海兽医研究所上海200241

为探讨冷应激对雏鸡盲肠微生物菌群结构和多样性的影响,本试验选用健康状况良好的7日龄白来航蛋雏鸡60只,随机分为2组,每组3个重复,每个重复10只。对照组30℃饲养,冷应激组先将雏鸡置于15℃环境中4 h,随后将温度设置为20℃与30℃交替进... 详细信息

为探讨冷应激对雏鸡盲肠微生物菌群结构和多样性的影响,本试验选用健康状况良好的7日龄白来航蛋雏鸡60只,随机分为2组,每组3个重复,每个重复10只。对照组30℃饲养,冷应激组先将雏鸡置于15℃环境中4 h,随后将温度设置为20℃与30℃交替进行,间隔12 h,连续3 d。采用Illumina Miseq测序技术对雏鸡盲肠内容物的微生物进行16s rrna V3-V4区测序,并对群落结构和多样性进行比较分析;同时采集盲肠组织进行病理学观察。结果显示:冷应激组的Chao、Ace指数低于对照组(Pshannon、simpson指数无显著差异。Beta多样性分析显示对照组和冷应激组肠道微生物群落差异显著。盲肠菌群结构分析显示冷应激后雏鸡盲肠中乳杆菌属(Lactobacillus)细菌的比例由36.84%下降至18.91%,而unclassified_f_Lachnospiraceae及Blautia细菌占比增加,分别从对照组中的23.54%和13.55%增加至29.05%和23.96%。另外,雏鸡冷应激后盲肠绒毛长度明显变短(P<0.0001)。这些结果表明冷应激导致雏鸡盲肠中微生物的组成和比例发生了明显的变化,尤其是乳杆菌属细菌。

关键词：冷应激盲肠微生物雏鸡 16s rrna测序

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鸡源地衣芽孢杆菌的分离鉴定及全基因组分析

吉林农业大学学报 2022年第5期44卷 613-623页

作者：李铭晗赵权吉林农业大学动物医学院长春130118

通过细菌形态学、生理生化特征和16s rrna测序等方法,鉴定从蛋鸡粪便中分离出的地衣芽孢杆菌菌株。以体外法对分离株Bacillus licheniformis LH96进行益生效果评价,发现其在14 h达到稳定期,具有良好的耐热能力,在pH 2.5~5.0、0.1%~0.3%... 详细信息

通过细菌形态学、生理生化特征和16s rrna测序等方法,鉴定从蛋鸡粪便中分离出的地衣芽孢杆菌菌株。以体外法对分离株Bacillus licheniformis LH96进行益生效果评价,发现其在14 h达到稳定期,具有良好的耐热能力,在pH 2.5~5.0、0.1%~0.3%胆盐浓度和模拟人工胃肠液等条件下,均有着良好的耐受性。B.licheniformis LH96具有产多种短链脂肪酸的能力,其中产乙酸的能力最强。耐抗生素试验结果显示,菌株对阿奇霉素、克林霉素和红霉素具有耐药性。同时,通过基因组装得到了B.licheniformis LH96的全基因组信息,菌株基因组大小为4187148 bp,G+C含量为46.18%,包含了4263个蛋白质编码序列。菌株中存在大量与碳水化合物代谢有关的基因,以及糖苷水解酶、多糖裂解酶和碳水化合物酯酶等,这些代谢途径中的酶可以帮助分解鸡不能消化的淀粉、纤维素、果胶等营养物质。研究结果为进一步阐明其益生菌特性的功能机制提供了遗传学基础。

关键词：地衣芽孢杆菌 16s rrna测序全基因组测序

湿热证大肠癌患者肠道菌群对AOM/Dss小鼠肠癌发生的影响

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中华中医药杂志 2022年第5期37卷 2842-2846页

作者：周晔禄赵玲贾茹饶希午侯新新岑戎张怡冯媛媛刘宁宁周利红王炎李琦上海中医药大学附属曙光医院上海201203 上海中医药大学中西医结合研究院上海201203

目的:探讨湿热证大肠癌患者肠道菌群结构特点及其对肠癌发生的影响。方法:通过16s rrna测序分析湿热证和无明显证候大肠癌患者肠道菌群特征,并将其粪菌提取液对伪无菌小鼠进行粪菌移植,同时通过AOM/Dss诱导小鼠肠癌发生。观察小鼠的体... 详细信息

目的:探讨湿热证大肠癌患者肠道菌群结构特点及其对肠癌发生的影响。方法:通过16s rrna测序分析湿热证和无明显证候大肠癌患者肠道菌群特征,并将其粪菌提取液对伪无菌小鼠进行粪菌移植,同时通过AOM/Dss诱导小鼠肠癌发生。观察小鼠的体质量、成瘤数,比较各组细胞因子表达水平。结果:与无明显证型大肠癌患者比较,湿热证大肠癌患者具有显著不同的微生物群落结构,其中致病菌(如大肠杆菌属、别样杆菌属、肠球菌属、Intestinibacter菌属、嗜胆菌属等)的丰度明显增高,此外以大肠杆菌为代表的产LPs病原菌明显富集(Pss小鼠模型进行粪菌移植后,相较于无明显证型粪菌移植小鼠,湿热证粪菌移植小鼠体质量明显减轻(Ps合成细菌增多为主要特点的肠道菌群结构,其肠道菌通过粪菌移植后可促进AOM/Dss小鼠肠癌发生。

关键词：湿热证大肠癌肠道菌群粪菌移植 16s rrna测序脂多糖致病菌大肠杆菌

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结直肠癌发生与肠道菌群的相关性研究

现代预防医学 2023年第13期50卷 2479-2484页

作者：魏瑶瑶蒲芳芳何夏梦蒙婷廖欣怡郭鉴葵庄文胡雯四川大学华西公共卫生学院/华西第四医院四川大学华西医院临床营养科四川大学华西医院临床药学部(药剂科)

目的探索结直肠癌发生与肠道菌群的相关性。方法分别收集在四川地区长期生活的33例结直肠癌患者（结直肠癌组）和33例健康人群（对照组）的粪便，采用16s rrna测序分析比较两组人群粪便肠道菌群差异。结果结直肠癌组患者shannon指数... 详细信息

目的探索结直肠癌发生与肠道菌群的相关性。方法分别收集在四川地区长期生活的33例结直肠癌患者（结直肠癌组）和33例健康人群（对照组）的粪便，采用16s rrna测序分析比较两组人群粪便肠道菌群差异。结果结直肠癌组患者shannon指数较健康人低（Pserved species指数和simpson指数均无统计学差异（P>0.05）。在门水平上结直肠癌组患者厚壁菌门（P<0.001）、放线菌门（P<0.01）降低，梭杆菌门（P<0.01）、疣状菌门（P<0.01）升高。在属水平上结直肠癌组患者毛螺菌属、瘤胃球菌、粪球菌、霍氏真杆菌等相对丰度降低（P<0.01或0.05）,UBA1819、毛螺菌科UCG.010、副拟杆菌属、另枝菌属等相对丰度升高（P<0.01或0.05）。属水平肠道菌群与血红蛋白的相关性分析显示，结直肠癌组患者多尔菌属与血红蛋白呈负相关。结论四川地区结直肠癌患者肠道菌群多样性减少，呈现有益菌较少、有害菌增多的特征，其发生可能与副拟杆菌属、另枝菌属、颤螺科UCG.002等有关。此外，多尔菌属可能会促进结直肠癌患者贫血的发生。

关键词：结直肠癌肠道菌群 16s rrna测序

长期相对高、低温环境温度对肉鸡十二指肠微生物多样性的影响

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家畜生态学报 2022年第7期43卷 29-36页

作者：沈丽艳杨玉婷李星高欢赵智勇潘洪彬云南农业大学动物科学技术学院云南省动物营养与饲料重点实验室云南昆明650201 云南省畜牧兽医科学院云南昆明650201

为探讨长期相对高、低温环境温度对肉鸡十二指肠微生物多样性的影响,选取300只1日龄艾维茵肉仔鸡,随机均分为3组:高温组(HD组)、对照组(CD组)和低温组(LD组),各组温度随日龄平行递减0.5℃,至42 d时,HD、CD、LD组分别降至22℃、19℃、16... 详细信息

为探讨长期相对高、低温环境温度对肉鸡十二指肠微生物多样性的影响,选取300只1日龄艾维茵肉仔鸡,随机均分为3组:高温组(HD组)、对照组(CD组)和低温组(LD组),各组温度随日龄平行递减0.5℃,至42 d时,HD、CD、LD组分别降至22℃、19℃、16℃,各组随机选取12只肉鸡屠宰,采集十二指肠食糜,进行16s rrna测序。结果表明:与CD组相比,HD组shannon指数显著增加,LD组的shannon、simpson指数显著增加(Pstipes的丰度显著降低(Psiella、Faecalibacterium、Clostridium XlVa、Brevundimonas的丰度显著增加(Psm信号通路在CD组显著富集;Lipid metabolism等3个信号通路在HD组显著富集;Amino acid metabolism等8个信号通路在LD组显著富集。HD组Lactobacillus与Lipid metabolism信号通路呈负相关;LD组富集的信号通路与Bacteroides、Fcalibacterium、ClostridiumXIVa呈正相关。表明长期相对高温和低温通过增加肉鸡十二指肠菌群的多样性来提高对环境的抗逆能力。

关键词：肉鸡温度十二指肠 16s rrna测序微生物多样性

育肥猪粪便菌群结构及其与生长速度的相关性分析

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中国畜牧兽医 2022年第3期49卷 924-931页

作者：姜长津陈云潘鹏丞陈宝剑关志惠卢慧林谢炳坤覃兆鲜广西大学动物科学技术学院南宁530004 广西壮族自治区畜牧研究所广西家畜遗传改良重点实验室南宁530001

【目的】研究育肥猪的生长速度与粪便微生物之间的作用关系,寻找与猪生长速度相关的微生物菌群。【方法】选取50头出生重相近的仔猪,在相同饲养环境中进行饲养管理,生病猪及时转出试验组,125日龄时按体重由高到低排序,把体重最高和最低... 详细信息

【目的】研究育肥猪的生长速度与粪便微生物之间的作用关系,寻找与猪生长速度相关的微生物菌群。【方法】选取50头出生重相近的仔猪,在相同饲养环境中进行饲养管理,生病猪及时转出试验组,125日龄时按体重由高到低排序,把体重最高和最低的4头猪分别分为体重高(51.30 kg±2.57 kg,HW)、低(36.90 kg±2.50 kg,LW)组,通过16s rrna测序,对125日龄生长育肥猪的粪便微生物区系多样性、群落组成及与生长速度的关联性进行分析。【结果】Alpha多样性分析显示,两组间均无显著差异(P>0.05)。主成分分析结果显示,HW和LW组中能够明显区分菌群结构。粪便微生物结构组成分析表明,HW和LW组的优势菌门均为厚壁菌门、拟杆菌门和螺旋体门,优势菌属为密螺旋体属、乳杆菌属、链球菌属和未被培养菌属Muribaculaceae菌。LW组中拟杆菌门丰度极显著高于HW组(P16个特有菌门,LW组检测到1个特有菌门和24个特有菌属。将肠道菌群与生长速度进行相关性分析,共发现10个菌门,18个属与体重(BW)和平均日增重(ADG)呈正相关,7个菌门和12个属与BW和ADG呈负相关。【结论】相同日龄不同生长速度的猪粪便微生物的区系结构存在显著差异,差异菌群可能对猪的生长速度起到了一定的调控作用,本研究结果为研发益生菌和提高猪生长速度提供了参考依据。

关键词：猪粪便微生物生长速度 16s rrna测序

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芍药甘草汤对急性肺损伤大鼠肠道菌群的影响

中国药房 2023年第17期34卷 2063-2068页

作者：张甘纯刘文宋信莉刘兴德舒万芬秦琴王洪鑫贵州中医药大学药学院贵阳550025 贵州医科大学药学院贵阳550025

目的研究芍药甘草汤(sGD)对急性肺损伤(ALI)大鼠的改善作用及对肠道菌群的影响。方法将60只大鼠按随机数字表法分为正常组(CON组,生理盐水)、模型组(MOD组,生理盐水)、阳性对照组(DEX组,5 mg/kg地塞米松)和芍药甘草汤低、中、高剂量组... 详细信息

目的研究芍药甘草汤(sGD)对急性肺损伤(ALI)大鼠的改善作用及对肠道菌群的影响。方法将60只大鼠按随机数字表法分为正常组(CON组,生理盐水)、模型组(MOD组,生理盐水)、阳性对照组(DEX组,5 mg/kg地塞米松)和芍药甘草汤低、中、高剂量组(sGD-L、sGD-M、sGD-H组,给药剂量以生药量计分别为5.8、11.6、23.2 g/kg),每组10只。各组大鼠每天灌胃1次,灌胃体积均为10 mL/kg,连续7 d。末次灌胃30 min后,CON组大鼠气道滴注等体积生理盐水,其余各组大鼠气道滴注脂多糖(5 mg/kg)建立ALI模型。造模12 h后,计算大鼠肺组织湿/干重比,检测大鼠肺泡灌洗液(BALF)中白细胞介素1β(IL-1β)、IL-6和肿瘤坏死因子α(TNF-α)含量,以苏木素-伊红染色后观察肺组织病理形态学变化。采用16s rrna测序技术分析大鼠粪便中菌群,并分析差异菌属与炎症因子的相关性。结果与MOD组比较,sGD各剂量组大鼠肺组织炎症细胞浸润均减少,肺泡隔增厚和肺泡水肿情况均有所改善;肺组织湿/干重比及BALF中IL-1β、IL-6、TNF-α水平均显著降低(PsGD(中剂量)可以改善ALI大鼠肠道菌群紊乱,恢复肠道菌群的多样性与丰富度,调节菌群结构,降低乳杆菌属、链球菌属和大肠埃氏菌属-志贺氏菌属的相对丰度,并增加厚壁菌属、毛螺菌属、瘤胃球菌属、梭状芽孢杆菌属、杜氏杆菌属和阿克曼菌属的相对丰度。相关性分析发现,乳杆菌属、链球菌属、大肠埃氏菌属-志贺氏菌属的相对丰度与炎症因子IL-1β、IL-6和TNF-α的水平呈显著正相关(PsGD可能通过减轻大鼠肺组织损伤和炎症反应、调节菌群结构来改善ALI。

关键词：芍药甘草汤急性肺损伤肠道菌群 16s rrna测序炎症反应

地衣芽孢杆菌对白羽肉鸡生长性能、免疫功能及肠道微生物的影响

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饲料研究 2023年第22期46卷 31-37页

作者：胡琴琴张庆华钟丽娟李莹杜天宁赵新海辽宁省微生物科学研究院辽宁朝阳122000

试验旨在研究日粮中添加地衣芽孢杆菌对白羽肉鸡生长性能、免疫功能及肠道微生物的影响。选取136只1日龄体重42 g左右的白羽肉鸡,随机分为2组,每组4个重复,每个重复17只肉鸡。对照组白羽肉鸡饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加250 mg... 详细信息

试验旨在研究日粮中添加地衣芽孢杆菌对白羽肉鸡生长性能、免疫功能及肠道微生物的影响。选取136只1日龄体重42 g左右的白羽肉鸡,随机分为2组,每组4个重复,每个重复17只肉鸡。对照组白羽肉鸡饲喂基础日粮,试验组在基础日粮中添加250 mg/kg的地衣芽孢杆菌制剂,试验期43 d。结果显示,43日龄时,与对照组相比,试验组白羽肉鸡的平均日增重(ADG)显著增加6.18%(Ps-torques)的相对占比增加。研究表明,地衣芽孢杆菌能够改善白羽肉鸡的生长性能,增强免疫功能,改善肠道结构,降低盲肠微生物多样性,增加盲肠有益菌属占比,保障肉鸡健康生长。

关键词：地衣芽孢杆菌白羽肉鸡免疫肠道形态结构肠道微生物 16s rrna测序