检索结果-南通市图书馆

作者：缪丹云广州医科大学

学位级别：硕士

研究背景急性呼吸道感染(Acute respiratory tract infections,ARTI)在各年龄段人群均为常见疾病,症状轻者可表现为扁桃体炎,较严重者可致支气管炎、肺炎,预后不良者,可因重症肺炎及其并发症导致死亡。准确地检测呼吸道感染的病原体,对... 详细信息

研究背景急性呼吸道感染(Acute respiratory tract infections,ARTI)在各年龄段人群均为常见疾病,症状轻者可表现为扁桃体炎,较严重者可致支气管炎、肺炎,预后不良者,可因重症肺炎及其并发症导致死亡。准确地检测呼吸道感染的病原体,对于临床合理诊断治疗具有重要意义。病原体的检出受样本类型的影响,鼻拭子(Nasal swab,NS)被认为是检测上呼吸道病毒的首选标本,肺泡灌洗液(Bronchoalveolar lavage,BALF)的检测用来明确急性下呼吸道感染(Acute lower respiratory tract infection,ALRTI)的主要病原体。由于NS标本采样方便无创,而BALF的采集需进行侵入性的支气管灌洗,所以国内外一些对ALRTI儿童的研究中,常采集NS标本来检测病原体。但目前ALRTI患儿的NS标本与BALF中检出病原体的一致性尚未明确,NS标本是否能达到BALF标本的诊断效果还没有系统性研究。甲型流感病毒(Influenza A virus,IAV)作为一种急性呼吸道感染常见病原体,在每年流行季节都能导致大量儿童及成年人感染,IAV每年在全球范围内约导致300,000-500,000人死亡。甲型H1N1流感自2009年4月在墨西哥暴发后,随即在全球引起了21世纪首次流感大流行,目前疫苗接种是预防H1N1流感的最佳策略,疫苗效力取决于疫苗株与当季流行株抗原决定簇处的差异大小。中国地区分别在2014年和2016年有两次H1N1病毒流行高峰。我们需对流感病毒中积累的抗原变异进行检测,评估疫苗株效力,及时发现保护作用不强的疫苗株。2013年3月,一种新型甲型H7N9禽流感病毒在中国出现并导致人类严重疾病,前4次的爆发均由低致病性H7N9禽流感病毒引起,2016年9月开始的第五波H7N9禽流感流行期间出现多个碱性氨基酸插入病毒切割位点(Hemagglutin cleavage site,HACS),使H7N9病毒由低致病性禽流感变异为高致病性禽流感,低致病性和新出现的高致病性H7N9病毒在全国范围内共流通,导致人和禽类感染。我们收集2例H7N9禽流感感染患者标本,对其HACS处序列进行分析。研究目的1.评估鼻拭子标本在儿童急性下呼吸道感染病原体中的诊断价值;2.分析2014-2017年广州市甲型H1N1流行性感冒病毒抗原决定簇的氨基酸变异,并对疫苗效力进行评估;3.对2例2017年广州地区H7N9禽流感患者体内病毒的HA基因切割位点进行分析,为疫情的评估及防控提供基础信息。研究方法1.收集2016-2018年60例急性下呼吸道感染儿童同一时间的鼻拭子(NS)和肺泡灌洗液(BALF)标本,以基于巢式多重荧光定量PCR方法的Filmarray呼吸道病原体检测平台和实验室自建qPCR体系检测18种常见呼吸道病原体,并将NS检出病原体结果与BALF结果比较分析。2.选取2014-2017年,广州医科大学附属第一医院检验科检测H1N1病毒阳性(qPCR法)的鼻拭子标本42例,经病毒核酸提取和RT-PCR扩增获得H1N1病毒的HA1基因片段并测序,对HA1基因序列进行进化分析和抗原决定簇氨基酸位点变异分析,并以P模型对疫苗株的效力进行评估。3.收集2017年在广州医科大学附属第一医院就诊的2位H7N9病毒感染患者的痰标本,第一位患者收集其首次出现症状后第19天、第26的痰标本;第二位患者收取其首次出现症状后第9天、第16天的痰标本。对所收集到的痰标本进行核酸提取并逆转录,以半巢式PCR扩增H7N9病毒的切割位点处片段,将扩增产物测序,对测序结果显示有混合序列的产物进行TA克隆,随机选取克隆成功菌落再次测序。以RNAfold Web Server软件分析切割位点处点突变对病毒RNA二级结构的影响。研究结果1.同时取上下呼吸道标本的60例患儿标本中,两种检测方法均显示病原体检出率在NS及BALF中未见统计学差异(P>0.05);并且RV,RSV,IFB,OC43和IFA在NS、BALF中的检出有极高的一致性(Kappa≥0.75)。Filmarray检测结果中,83.3%(50/60)的NS标本和86.7%(52/60)的BALF标本检出至少一种病原体。68.3%(41/60)的NS中检出的病原体可包含BALF中所检出的病原体,其中50%(30/60)例结果完全相同。qPCR法的检测结果显示,83.3%(50/60)的NS标本和76.7%(46/60)的BALF标本检出至少一种病原体。68.3%(41/60)的NS中检出的病原体可包含BALF中所检出的病原体,完全一致的有53.3%(32/60)。2.2014-2016年广州地区H1N1病毒流行株与同年疫苗株A/California/07/2

关键词：鼻拭子标本 H1N1流感病毒疫苗效力 H7N9流感病毒切割位点

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用血清学和PCR研究麻风感染的流行病学

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中国麻风皮肤病杂志 1995年第1期11卷 55-56页

作者： Beers SM 安平

在印尼两个毗邻的村庄,麻风流行率为10.0‰的高流行区,在当地健康人中采集1015份血清和1228份鼻拭子标本。当时该地的病人用DDS单疗,大都不规则。用乳胶颗粒凝集试验(MLPA)和间接ELISA检测血清抗PGL-I及LAM抗体,用PCR检测鼻拭子标本中... 详细信息

在印尼两个毗邻的村庄,麻风流行率为10.0‰的高流行区,在当地健康人中采集1015份血清和1228份鼻拭子标本。当时该地的病人用DDS单疗,大都不规则。用乳胶颗粒凝集试验(MLPA)和间接ELISA检测血清抗PGL-I及LAM抗体,用PCR检测鼻拭子标本中的麻风菌。结果MLPA阳性率为32％,IgM-PGL阳性率30.8％,IgG-PGL阳性率为6.7％,IgG-LAM阳性率11.6％。IgM-PGL和MLPR的阳性率在年青组中较高。家内接触者和非家内接触者,各种抗体阳性率均无不同。鼻拭子标本做PCR,证明7.8％的人呈阳性,PCR和血清抗体的结果无关联。作者认为这不足怪,因鼻粘膜查见麻风菌不一定发生感染,此外即使有麻风菌感染,如在少

关键词：麻风菌鼻粘膜血清麻风杆菌 PCR 鼻拭子标本

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咽拭子、鼻拭子、痰液中SARS-CoV-2核酸检测结果一致性及检出率分析

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传染病信息 2020年第4期33卷 307-311页

作者：牛卫东段江洋蒋诗苑孙丽梅胡乃月周鹏赵瑞臻郑州市疾病预防控制中心微生物检验所 450007

目的通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-Co... 详细信息

目的通过对不同类型标本严重急性呼吸综合征冠状病毒2(severe acute respiratory syndrome coronavirus 2,SARS-CoV-2)核酸检测结果的一致性及检出率分析,明确检测结果较优的标本类型。方法回顾分析郑州市疾病预防控制中心自开展SARS-CoV-2核酸检测以来所有同时采集自同一被检者的不同种类的标本核酸检测结果,利用McNemarχ~2检验分析不同标本病毒核酸阳性检出率的统计学差异;用kappa检验分析不同标本核酸检测结果的一致性。结果本研究共有61例被检者同时进行2种及以上标本的核酸检测,其中检测咽拭子标本158人次,痰液标本144人次,鼻拭子标本35人次;ORF1a/b基因和N基因同时检出率最高的为痰液标本(71.5%),其次是鼻拭子标本(34.3%),咽拭子标本检出率最低(29.1%)。同时进行痰液标本和咽拭子标本检测的有144人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为75.0%、33.3%,N基因检出率分别为89.6%、42.4%,差异均有统计学意义(P均标本病毒核酸阳性检出率明显高于咽拭子标本;同时进行痰液标本和鼻拭子标本检测的有22人次,2者ORF1a/b基因检出率分别为63.6%、27.3%,N基因检出率分别为81.8%、40.9%,差异均有统计学差异(P均标本病毒核酸阳性检出率亦高于鼻拭子标本;同时进行鼻拭子标本和咽拭子标本检测的有35人次,鼻拭子标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本,2者ORF1a/b基因检出率分别为40.0%、25.7%,N基因检出率分别为51.4%、34.3%,但差异均无统计学意义(P均>0.05),一致性检验结果则表明2者一致性差(k均标本病毒核酸阳性检出率高于咽拭子标本和鼻拭子标本,在人群筛查中3种标本检测结果可互相补充验证以减少漏诊。

关键词：核酸检测痰液标本咽拭子标本鼻拭子标本

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