检索结果-南通市图书馆

作者：缪银萍华东师范大学

学位级别：硕士

近年来,在土壤、水等环境中被频繁检出的抗生素,加剧了各环境介质中抗生素抗性细菌（Antibiotic resistance bacteria,ARB）和抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes,ARGs）的产生与传播,严重威胁人类健康和生态系统安全。然而,... 详细信息

近年来,在土壤、水等环境中被频繁检出的抗生素,加剧了各环境介质中抗生素抗性细菌（Antibiotic resistance bacteria,ARB）和抗生素抗性基因（Antibiotic resistance genes,ARGs）的产生与传播,严重威胁人类健康和生态系统安全。然而,目前抗生素及ARGs在土壤剖面和地下水中的分布迁移规律尚未明确,多种污染物复合污染对ARGs扩散传播的影响还认知有限。因此,本研究以污染类型多样的上海桃浦工业园区土壤柱和地下水为研究对象,运用超高效液相色谱-串联质谱仪定量分析了土壤-地下水中抗生素的污染特征;采用宏基因组测序技术和高通量荧光定量pcr方法探究了土壤柱和地下水中ARGs的种类丰度和微生物群落结构,综合分析了抗生素、微生物和ARGs的分布迁移规律及环境影响因子;应用共现网络分析,确定了潜在的抗生素抗性细菌。主要取得以下研究成果:（1）上海市桃浦工业园区土壤柱和地下水中20种抗生素的浓度分别为0.7-113.6 ng g和24.1-1161.1 ng L,氟喹诺酮类抗生素和磺胺类抗生素分别为土壤柱和地下水中的主要抗生素。这可能是氟喹诺酮类抗生素有更多极性/离子型的官能基团且容易被土壤强烈吸附而较少迁移至地下水,因此在土壤中占比更高。磺胺类抗生素因具有较少的离子型官能团而不易被土壤吸附和较高的水溶性而在地下水中有更高的占比。垂向分布上,总抗生素、氟喹诺酮类抗生素和四环素类抗生素含量变化符合指数衰减模型,大体呈现出随土壤深度的增加而降低的趋势,其中四环素类抗生素可能比磺胺类抗生素有更强的迁移能力。土壤中抗生素的分布迁移主要受人为因素（人为扰动和污染治理）、抗生素自身性质、土壤理化性质（pH和总有机碳含量）、多环芳烃（苊烯,苊和苯并[b]荧蒽）和重金属（锌和镍）的影响。地下水中抗生素赋存的主要影响因子则包括地下水理化性质（溶解有机碳含量、盐度、溶解氧含量和电导率）和多环芳烃(苊、荧蒽、芘、苯并[a]蒽、（艹屈）、苯并[b]荧蒽、苯并[k]荧蒽、茚并[1,2,3-cd]芘和总多环芳烃浓度)。（2）工业园区土壤柱中主要的细菌门类为变形菌门、绿弯菌门和放线菌门,地下水中的主要门类细菌与之相似,为变形菌门、拟杆菌门和放线菌门。垂向上看,土壤剖面各土层门类细菌群落的组成相似,但相对丰度变化大,变化范围与方向因细菌类别而异。不同环境介质中微生物群落的主要影响因素存在差异:土壤粘粒含量是影响土壤柱中微生物群落变化的最主要因素,而污染物则是本研究区域地下水中微生物群落结构的最主要影响因素,可能是地下水中更高浓度的抗生素和多环芳烃污染水平所致。（3）工业园区土壤柱和地下水中分别共检出属于21类ARGs的1183和1139个ARG亚型,多药类抗性基因和mac B分别为土壤柱和地下水中分布最广泛的ARGs和ARG亚型,外排泵耐药机制是ARGs在土壤柱和地下水中的最主要耐药机制。垂向分布上,土壤柱中ARGs的丰度呈现出随土壤深度的增加而升高的趋势,但不同ARGs的丰度峰值出现的土层存在差异。21类ARGs在土壤柱和地下水中的组成和相对丰度高度相似,多药类,大环内酯类,糖肽类,四环素类和肽类抗性基因在两种介质中均占比较高。研究结果表明土壤和地下水中的ARGs可能互相交换和迁移。（4）冗余分析（RDA）、方差分解分析（VPA）和结构方程模型（SEM）的结果均表明:在土壤柱中,微生物群落的变化是影响ARGs分布和传播的最主要因素,土壤理化性质和可移动基因元件（Mobile genetic elements,MGEs）也是影响土壤柱中ARGs分布的主要因素,同时污染物对其的影响也不能忽视;地下水中,包括抗生素和多环芳烃的污染物是ARGs分布的最主要的影响因素,其次为微生物群落,同时MGEs及地下水理化参数对于地下水中ARGs的分布传播也应引起重视。通过相关性网络分析,确定变形菌门和绿弯菌门是本研究土壤柱中主要的ARB,变形菌门和拟杆菌门是地下水中主要的ARB,且7类微生物菌属为土壤柱和地下水中共有的潜在宿主菌,表明ARB在土壤-地下水中的垂直迁移可能是造成地下水中ARGs污染的重要途径。以上结果说明控制ARGs污染时,需要综合考虑区域污染情况,通过治理对ARGs的传播扩散具有选择性压力的抗生素、PAHs等污染物而从根本上解决ARGs污染问题。

关键词：超高效液相色谱-串联质谱仪宏基因组学高通量荧光定量pcr 抗生素抗生素抗性基因

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茅洲河流域民用井中耐药基因的分布特征与健康风险

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环境科学 2020年第7期41卷 3222-3230页

作者：吴黛灵邹海燕何璐茜高方舟应光国何良英华南师范大学环境研究院广东省化学品污染与环境安全重点实验室环境理论化学教育部重点实验室广州510006 华南师范大学环境学院广州510006

抗生素的大量使用促进了抗生素耐药基因的产生与传播.地下水是重要的供水途径之一,然而地下水中耐药基因的分布特征与健康风险尚不清楚.采用高通量荧光定量pcr技术(high-throughput qpcr),分析了深圳茅洲河流域11口民用井中耐药基因的... 详细信息

抗生素的大量使用促进了抗生素耐药基因的产生与传播.地下水是重要的供水途径之一,然而地下水中耐药基因的分布特征与健康风险尚不清楚.采用高通量荧光定量pcr技术(high-throughput qpcr),分析了深圳茅洲河流域11口民用井中耐药基因的分布特征和多样性.结果表明, 11口民用井中共检出141种抗生素耐药基因和8种可移动遗传元件,其中磺胺类、多重耐药类和氨基糖苷类耐药基因的丰度最高.此外,民用井井水中也检出了临床重要的耐药基因,如超广谱β-内酰胺酶基因(blaSHV、blaTEM、blaCTX和blaOXA-1),万古霉素类基因(vanB和vanC-03)等.通过对耐药基因进行均一化计算,发现在民用井W7、 W8和W10的井水中,平均每个细菌携带有至少一个耐药基因,而W11井水中甚至每个细菌平均携带有4个耐药基因.磺胺类、多重耐药类、氨基糖苷类、β-内酰胺类以及氯霉素类耐药基因的丰度与可移动遗传元件的丰度均呈显著正相关(P<0.01),表明民用井中可移动遗传元件可能促进了耐药基因在井水中的扩散.

关键词：地下水民用井抗生素耐药基因(ARGs) 可移动元件(MGEs) 高通量荧光定量pcr

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四川省稻田土壤的抗生素抗性基因多样性研究

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农业环境科学学报 2020年第6期39卷 1249-1258页

作者：何燕朱冬王东刘燕彭超黄丽萍彭正松路璐西南野生动植物保护重点实验室/西华师范大学生命科学学院四川南充637002 西华师范大学环境科学与工程学院四川南充637009 中国科学院生态环境研究中心北京100085 西昌学院农业科学学院四川西昌615000

为了全面明晰四川省稻田土壤中抗生素抗性基因的丰度和多样性,及其与环境因子的相关性,对7个不同地区的稻田土壤采用高通量荧光定量pcr技术,对283种抗生素抗性基因和12种可移动遗传元件遗传标记引物进行检测,揭示抗性基因的污染状况及... 详细信息

为了全面明晰四川省稻田土壤中抗生素抗性基因的丰度和多样性,及其与环境因子的相关性,对7个不同地区的稻田土壤采用高通量荧光定量pcr技术,对283种抗生素抗性基因和12种可移动遗传元件遗传标记引物进行检测,揭示抗性基因的污染状况及空间分布规律。结果表明,7个稻田土中共检出166种不同的抗生素抗性基因和9种可移动遗传元件,每个土壤分别检出56~84种抗生素抗性基因。7个稻田土的抗生素抗性基因组成各异,且都存在其独有的抗生素抗性基因。不同稻田土的抗生素抗性基因的相对和绝对丰度均不同,抗生素抗性基因的绝对丰度范围为9.55×10^8~2.83×10^10 copies·g^-1(干质量),相对丰度为0.012±0.006 copies·cell^-1。7个稻田土的抗生素抗性基因和可移动遗传元件的丰度都呈极显著正相关(P<0.01),说明抗生素抗性基因的水平转移可能促进抗生素抗性基因的迁移和富集,加剧了农田土壤的抗生素抗性基因污染。总体相对丰度较高的抗生素抗性基因类型为多重耐药类(49.26%)、大环内脂类-林可酰胺类-链阳性菌素B类(11.30%)和β-内酰胺类(10.87%)。冗余分析表明土壤肥力重要指标总氮与7个稻田土中的抗生素抗性基因多样性极显著相关(P<0.01)。四川不同地区的稻田土抗生素抗性基因分布规律各异,农业耕种活动可能影响土壤抗生素抗性基因的多样性。

关键词：稻田土抗生素抗性基因高通量荧光定量pcr

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青海湖候鸟与其栖息地生态因子细菌耐药性调查及关联性研究

青海湖候鸟与其栖息地生态因子细菌耐药性调查及关联性研究

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中国畜牧兽医学会兽医药理毒理学分会第十三次全国会员代表大会暨第十七次学术研讨会

作者：朱婷婷何冰孙坚华南农业大学

候鸟在全球范围内迁徙,对生态系统具有重要的作用。随着人类活动的扩大和全球化进程的推进,候鸟与人类以及其他动物之间的接触机会也越来越多。这种接触可能导致耐药细菌的传播风险增加,因此了解候鸟源细菌的耐药性以及其与栖息地生态... 详细信息

候鸟在全球范围内迁徙,对生态系统具有重要的作用。随着人类活动的扩大和全球化进程的推进,候鸟与人类以及其他动物之间的接触机会也越来越多。这种接触可能导致耐药细菌的传播风险增加,因此了解候鸟源细菌的耐药性以及其与栖息地生态因子的关联性对于揭示传染病传播机制、保护公共卫生和维持生态平衡至关重要。本研究的目标是分析候鸟粪便样本以及与其栖息地相关的放牧牛羊、土壤和水体样本中的微生物群落结构和耐药基因分布情况。结合宏基因组学与高通量荧光定量pcr的优势,对不同类型样本的微生物群落结构和耐药基因进行综合分析,以探究各类样本中耐药基因与菌群结构的关联性,以及不同来源样品之间耐药基因的相关性,为候鸟源耐药基因的溯源和传播提供理论指导。随机采集青海湖旁斑头雁候鸟、牛群与羊群的粪便、土壤和青海湖水,提取基因组,利用宏基因组学与高通量荧光定量pcr技术,结合Spearman相关性分析、Network分析和主成分分析等方法分析各类样本耐药基因与菌群结构进行分析,以揭示他们之间的关联性。宏基因组测序结果显示候鸟体内的耐药基因多样性高于各类生态因子,包括临床常见的14种耐药基因种类,多重耐药类耐药基因特别是与外排泵相关基因在各类样本均有较高的丰度;利用高通量荧光定量pcr技术对各样本耐药基因分布及丰度情况进行探究,发现候鸟样本中常见耐药基因种类丰富度高于各生态因子样本,与牛羊及水土环境均有着极显著的相关性。结合常见耐药基因与菌群结构进行关联性分析,发现addA5、armA、bcrB、bla、bla、bla、bla、drfA12、tetC、tetM、tetX3、vanA耐药基因在各个样本中存在共有相关菌（Spearman's r>0.7,P高通量荧光定量pcr技术较为全面立体地描述了候鸟及其栖息地各生态因子耐药性情况及候鸟与各生态因子间的关联性。候鸟作为野生动物的一员,其携带有包括临床重要耐药基因在内的多种耐药基因,虽丰度较低但仍具有传播风险,并且候鸟栖息地各生态因子对候鸟的菌群及耐药基因均有一定的影响。

关键词：宏基因组高通量荧光定量pcr 细菌耐药性

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环境抗生素抗性基因研究进展

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生物多样性 2013年第4期21卷 481-487页

作者：苏建强黄福义朱永官中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室福建厦门361021

抗生素耐药性及其在全球范围内的传播已成为国际关注的热点。本文结合最新文献,综述了抗生素抗性基因在环境中的来源、传播、分布以及新型抗性基因的发现等方面的研究进展。环境中抗生素抗性基因的来源主要是环境中细菌的内在抗性基因... 详细信息

抗生素耐药性及其在全球范围内的传播已成为国际关注的热点。本文结合最新文献,综述了抗生素抗性基因在环境中的来源、传播、分布以及新型抗性基因的发现等方面的研究进展。环境中抗生素抗性基因的来源主要是环境中细菌的内在抗性基因及随人或动物粪便排到体外的抗性细菌。功能宏基因组学技术的应用极大地丰富了人们对抗生素抗性组学的认知,并已从环境中筛选到多种新型抗性基因。近年来,由于抗生素在医疗以及养殖业中的大量使用,增加了抗性基因在环境中的丰度和多样性,加速了抗性基因在环境中的传播,在多种环境介质(如养殖水域、污水处理厂、河流、沉积物和土壤等)均检测到多种高丰度的抗生素抗性基因。我们建议今后在以下方面开展深入研究:(1)抗性基因传播和扩散的机制;(2)新型抗性基因筛选和抗性机制;(3)抗生素和抗性基因环境风险评估体系等。

关键词：抗生素抗性基因抗性组学高通量荧光定量pcr

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基于高通量定量pcr研究城市化小流域微生物污染特征

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生态毒理学报 2017年第5期12卷 141-152页

作者：庄芳芳苏建强陈辉煌朱永官中国科学院城市环境研究所城市环境与健康重点实验室厦门361021 中国科学院大学北京100049

水体微生物污染(包括致病菌、病毒、寄生虫)会引起多种传染病和寄生虫病,对生产生活用水安全和人体健康造成重要威胁。本研究应用基于Taq Man探针的高通量荧光定量pcr技术对厦门市后溪流域冬季微生物污染进行检测,包含了5种粪便污染源(... 详细信息

水体微生物污染(包括致病菌、病毒、寄生虫)会引起多种传染病和寄生虫病,对生产生活用水安全和人体健康造成重要威胁。本研究应用基于Taq Man探针的高通量荧光定量pcr技术对厦门市后溪流域冬季微生物污染进行检测,包含了5种粪便污染源(人源、反刍动物源、猪源、家禽源、狗源)微生物源示踪分子标记物与12种病原微生物。结果表明,该流域在上游及水库5个位点没有粪便污染,仅在其中一个水库位点检测出棘阿米巴,微生物污染极小;中下游检测出人类、反刍动物、猪、家禽、狗粪便污染,并且检测出产气荚膜梭菌、肠聚集性大肠杆菌、肠毒素型大肠杆菌、幽门螺杆菌、霍乱弧菌、副溶血弧菌、棘阿米巴、克雷伯氏肺炎杆菌等病原菌,其中流经旧城区居民生活生产区水样微生物污染严重,下游新城区微生物污染较小。这些结果暗示着城市人类活动是流域微生物污染主要来源,应从污染源头加强微生物污染控制。

关键词：流域微生物污染微生物源示踪病原微生物高通量荧光定量pcr

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抗生素抗性基因在养殖废水中的分布与去除

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环境化学 2017年第11期36卷 2311-2318页

作者：庄榆佳赵忆苏建强耿春女上海应用技术大学生态技术与工程学院上海201418 中国科学院城市环境研究所厦门361021

畜禽养殖场作为抗生素抗性基因的一个热点区,其产生的废水中存在大量的抗生素抗性基因,直接排放将会污染接受的水体.本研究以微生物固化曝气技术为核心,构建了一个包含沉淀池、一级处理池、二级处理池和氧化塘的养殖废水处理系统.采用... 详细信息

畜禽养殖场作为抗生素抗性基因的一个热点区,其产生的废水中存在大量的抗生素抗性基因,直接排放将会污染接受的水体.本研究以微生物固化曝气技术为核心,构建了一个包含沉淀池、一级处理池、二级处理池和氧化塘的养殖废水处理系统.采用高通量荧光定量pcr技术,探究各种抗性基因在进水、各处理池和出水中的种类、多样性和丰度的变化以及可能的影响因素.研究发现:(1)微生物固化曝气技术能有效降低养殖废水中抗性基因的种类和多样性;(2)该技术也能有效去除养殖废水中抗性基因的绝对丰度,去除率高达93.6%;(3)养殖废水出水中抗性基因绝对丰度仍高于自然水体,其直接排放仍有抗性基因污染风险;(4)畜禽养殖废水中TN和土霉素的含量与许多抗生素抗性基因总丰度存在正相关性.通过对TN和土霉素的去除或者控制使用,可以有效降低养殖废水中的抗性基因.

关键词：微生物固化曝气技术高通量荧光定量pcr 抗性基因多样性和丰度养殖废水抗生素

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4种网络交易的粪肥中抗生素抗性基因多样性分析和传播风险评估

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安全与环境工程 2021年第5期28卷 220-229页

作者：刘燕朱冬何燕杨宇帆彭超钱永明王东唐赟路璐西华师范大学环境科学与工程学院四川南充637009 中国科学院生态环境研究中心北京100085 西华师范大学生命科学学院四川南充637002 西华师范大学法学院四川南充637002

为探究网络交易的粪肥是否成为抗性基因的传播载体,采用高通量荧光定量pcr技术对网上购买的4种粪肥(牛粪肥、鸡粪肥、羊粪肥和鸡羊混合肥)中抗生素抗性基因的多样性和丰度进行了比较分析,并对其潜在的传播风险进行了评估。结果表明:4种... 详细信息

为探究网络交易的粪肥是否成为抗性基因的传播载体,采用高通量荧光定量pcr技术对网上购买的4种粪肥(牛粪肥、鸡粪肥、羊粪肥和鸡羊混合肥)中抗生素抗性基因的多样性和丰度进行了比较分析,并对其潜在的传播风险进行了评估。结果表明:4种网络交易的粪肥中共检测出165种抗生素抗性基因和10种可移动遗传元件,检测到抗性基因的个数表现为:羊粪肥(130种)>鸡粪肥(98种)>鸡羊混合肥=牛粪肥(89种);4种网络交易的粪肥中抗生素抗性基因的绝对丰度为7.18×10^(7)~3.99×10^(11)copies/g(干重),相对拷贝数为0.013~0.727copies/bacterialcell,抗生素抗性基因的丰度均表现为羊粪肥>鸡羊混合肥>鸡粪肥>牛粪肥;4种网络交易的粪肥主导的抗生素抗性基因主要是氨基糖苷类、多重耐药类和磺胺类抗性基因,而不同粪肥中抗生素抗性基因多样性的差异显著,且都具有其独有的抗性基因;4种网络交易的粪肥中都检测到intI-1LC和tnpA-04等4种可移动遗传元件,且总抗性基因的相对拷贝数与总可移动遗传元件的相对拷贝数呈极显著相关(p<0.01),表明抗生素抗性基因的水平转移可能加剧其迁移和传播的风险。综上,网络交易的粪肥可能是抗生素抗性基因迁移和传播的潜在载体,该研究对健全我国网络交易中粪肥的微生物安全标准具有重要的参考价值。

关键词：粪肥网络交易高通量荧光定量pcr 抗生素抗性基因可移动遗传元件多样性和丰度传播风险评估

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典型人工系统中抗生素及抗生素抗性基因去除研究

典型人工系统中抗生素及抗生素抗性基因去除研究

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作者：庄榆佳上海应用技术大学

学位级别：硕士

养殖场和污水处理厂是新型环境污染物抗生素抗性基因的两大热点区域,研究去除技术具有非常重要的现实意义。本论文研究了微生物固化曝气技术对养殖废水中常规污染物、抗生素和抗性基因的去除;同时研究了石灰稳定处理和加热干燥等技术对... 详细信息

养殖场和污水处理厂是新型环境污染物抗生素抗性基因的两大热点区域,研究去除技术具有非常重要的现实意义。本论文研究了微生物固化曝气技术对养殖废水中常规污染物、抗生素和抗性基因的去除;同时研究了石灰稳定处理和加热干燥等技术对污泥中抗生素抗性基因的多样性和丰度的影响。主要研究结果如下:(1)微生物固化曝气技术能有效去除常规污染物,除TP外,COD和NH-N的出水浓度均能达到《畜禽养殖业污染物排放标准》(GB 18596-2001);(2)微生物固化曝气技术对抗生素的去除效果依抗生素的种类而变,对4种四环素类抗生素的去除率高达85%以上;对大环内酯类中的阿奇霉素的去除率为62.8%;对大环内酯类中的罗红霉素和氟喹诺酮类抗生素则基本无效;(3)微生物固化曝气技术能有效降低养殖废水中抗性基因的种类和多样性;同时也能有效去除养殖废水中的抗生素抗性基因,去除率高达93.60%;然而养殖废水出水中抗性基因绝对丰度仍高于自然水体,其直接排放仍有抗性基因污染风险;此外,畜禽养殖废水中TN和土霉素的含量与许多抗生素抗性基因总丰度存在正相关性。(4)石灰处理和高温加热干燥处理能有效抑制污泥中抗性基因的增长,而低温加热干燥或者室温干燥则会促进抗性基因的增长。

关键词：高通量荧光定量pcr 微生物固化曝气技术污泥处理处置常规污染物抗生素

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青海湖候鸟与其栖息地生态因子细菌耐药性调查及关联性研究

青海湖候鸟与其栖息地生态因子细菌耐药性调查及关联性研究

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作者：何冰华南农业大学

学位级别：硕士

为对候鸟源细菌进行耐药性调查及探究其与栖息地生态因子的关联性,本研究采集2019年青海湖候鸟栖息地候鸟粪便及各生态因子样本(牛羊粪便、土壤及水体样本),结合宏基因组学、高通量荧光定量pcr技术及传统分菌检测技术优势,对各类样本的... 详细信息

为对候鸟源细菌进行耐药性调查及探究其与栖息地生态因子的关联性,本研究采集2019年青海湖候鸟栖息地候鸟粪便及各生态因子样本(牛羊粪便、土壤及水体样本),结合宏基因组学、高通量荧光定量pcr技术及传统分菌检测技术优势,对各类样本的微生物群落结构及耐药基因分布情况进行分析。并通过Spearman相关性分析、Network分析和主成分分析等方法分析各类样本耐药基因与菌群结构的关联性以及不同来源样品间耐药基因的关联性,为候鸟耐药基因的溯源与传播提供理论指导。宏基因组测序结果揭示了候鸟及各生态因子的微生物群落结构及耐药组。结果显示,候鸟肠道菌群结构与牛羊及水土环境菌群结构具有较大差异,且候鸟样本中的菌群多样性较低于牛羊样本,极显著低于环境样本(P高通量荧光定量pcr(HT-qpcr)检测。结果显示候鸟样本中常见耐药基因种类丰富度高于各生态因子样本,检出包括bla 、bla 、bla 等宏基因组测序未注释到的耐药基因。候鸟样本常见耐药基因总丰度水平极显著低于土壤及牛粪样本(P0.6,P0.3,P0.7,Ppcr及分菌检测技术,较为全面立体地描述了候鸟及其栖息地各生态因子耐药性情况及候鸟与各生态因子间的关联性。候鸟作为野生动物的一员,其携带有包括临床重要耐药基因在内的多种耐药基因,虽丰度较低但仍具有传播风险,并且候鸟栖息地各生态因子对候鸟的菌群及耐药基因均有一定的影响。

关键词：候鸟宏基因组高通量荧光定量pcr 细菌耐药性菌群结构关联性

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