检索结果-南通市图书馆

戊型肝炎病毒摩洛哥株非编码区基因序列鉴定及基因型分型

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华微生物学和免疫学杂志 2004年第10期24卷 828-833页

作者：陈国兵孟继鸿东南大学基础医学院病原生物学与免疫学系南京210009

目的　检测戊型肝炎病毒 (HEV)摩洛哥株非编码区 (UTR)序列 ,探讨HEV非编码区序列能否作为其基因型分型的依据。方法　使用基于RNA连接酶的cDNA末端快速扩增法 (RLM RACE)扩增HEV摩洛哥株 5′和 3′端片段并测序。所得序列使用LASERGENE... 详细信息

目的　检测戊型肝炎病毒 (HEV)摩洛哥株非编码区 (UTR)序列 ,探讨HEV非编码区序列能否作为其基因型分型的依据。方法　使用基于RNA连接酶的cDNA末端快速扩增法 (RLM RACE)扩增HEV摩洛哥株 5′和 3′端片段并测序。所得序列使用LASERGENE和PHYLIP软件包与其他 2 9株HEV序列比较。结果　只有基于甲基化帽子结构的RLM RACE扩增出了 5′端片段。HEV摩洛哥株 5′端UTR有 2 6个核苷酸 ,3′端polyA之前有 6 5个核苷酸。基于 3′端UTR序列的进化树与基于全基因序列的进化树不全相同。HEV 3′端至少需要 10 0个左右核苷酸长的序列才可进行HEV基因型分型。结论　HEV摩洛哥株 5′端有甲基化帽子结构。HEV 3′端UTR序列不能完全代替全基因组序列进行基因型分型。部分序列替代全基因组进行基因型分型时需要考虑其部位和长度因素。

关键词： HEV 分型戊型肝炎病毒基因型非编码区基因序列核苷酸 RACE cDNA末端快速扩增进化树

麻疹病毒CC-47株非编码区核苷酸序列测定与比较

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华实验和临床病毒学杂志 2001年第4期15卷 327-331页

作者：胡孔新林崇哲王晓芳李川孟祥芝李德新中国预防医学科学院病毒学研究所出血热病毒研究室北京100052 长春生物制品研究所

目的　测定麻疹病毒疫苗株长 47(CC 47)的非编码区核苷酸序列 ,并和其他麻疹病毒比较 ,为利用疫苗株病毒进一步研究奠定基础。方法　用RT PCR分段扩增并克隆麻疹病毒CC 47株基因组全序列 ,用基因特异引物测定非编码区的核苷酸序列。结果... 详细信息

目的　测定麻疹病毒疫苗株长 47(CC 47)的非编码区核苷酸序列 ,并和其他麻疹病毒比较 ,为利用疫苗株病毒进一步研究奠定基础。方法　用RT PCR分段扩增并克隆麻疹病毒CC 47株基因组全序列 ,用基因特异引物测定非编码区的核苷酸序列。结果　CC 47疫苗株非编码区在基因组上为 7个不连续的片段 ,总计 1791个核苷酸。与其他野毒株及Edmonston衍生 5株疫苗株非编码区序列比较发现 ,CC 47疫苗株具有与Edmonston疫苗株系列相同的 4个特征性的核苷酸替代位点 ,分别位于基因组 3′末端第 2 6位 (U→A)、42位 (U→G)和M F基因间隔区FmRNA 5′非翻译区的 4978位(A→G)、5 34 9位 (A→G) ,这些位点的改变可能会影响病毒mRNA的合成、加工和翻译效率以及基因组的复制和包装。结论　不同基因型麻疹病毒具有同样的位点改变可能与病毒在半许可细胞中适应或减毒有关。

关键词：麻疹病毒非编码区核苷酸序列

非编码区单核苷酸多态性与眼部疾病关系的研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

眼科新进展 2016年第4期36卷 380-385页

作者：戎晗顾珊珊张国伟康丽华管怀进南通大学附属医院眼科江苏省南通市226001

单核苷酸多态性与眼部疾病的发生、发展和预后有关联。MicroRNA是一类长为18~25 nt的小分子非编码RNA,它们通过与靶mRNA的3’UTR区结合来调控基因表达。过去大量遗传关联研究发现,一些基因编码区的单核苷酸多态性与眼部疾病的易感性相关... 详细信息

单核苷酸多态性与眼部疾病的发生、发展和预后有关联。MicroRNA是一类长为18~25 nt的小分子非编码RNA,它们通过与靶mRNA的3’UTR区结合来调控基因表达。过去大量遗传关联研究发现,一些基因编码区的单核苷酸多态性与眼部疾病的易感性相关,但是很少涉及到一些基因非编码区如3’端非翻译区miRNA靶结合位点的遗传关联研究。本文就此研究进展作一简要综述。

关键词：单核苷酸多态性非编码区小分子RNA 眼部疾病

非编码区单核苷酸多态性与噪声性听力损失关系研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国职业医学 2022年第3期49卷 337-342页

作者：陈育全刘移民广州市职业病防治院职业病科广东广州510620

噪声性听力损失(NIHL)是一种严重危害劳动者健康的听力障碍,其是环境与遗传因素共同作用的复杂疾病。单核苷酸多态性(SNP)是最常见的可遗传变异,其与NIHL的发生发展有关联。微小RNA(miRNA)是一种非编码单链小分子RNA,其在耳蜗中大量表达... 详细信息

噪声性听力损失(NIHL)是一种严重危害劳动者健康的听力障碍,其是环境与遗传因素共同作用的复杂疾病。单核苷酸多态性(SNP)是最常见的可遗传变异,其与NIHL的发生发展有关联。微小RNA(miRNA)是一种非编码单链小分子RNA,其在耳蜗中大量表达,通过与靶信使RNA(mRNA)的3′-非翻译区结合来对基因进行调控的。miRNA的SNP是最常见的可遗传变异;非编码区SNP可通过导致miRNA募集异常,参与基因表达调控与表型产生的过程,进而影响NIHL的发生发展。NIHL的遗传易感基因包括氧化应激类基因、单基因耳聋基因和热休克蛋白基因等,其非编码区SNP与NIHL易感性存在相关性。miRNA SNP已被证实参与NIHL的发生发展,但不同miRNA SNP与NIHL的相关性存在差异。非编码区SNP通过影响miRNA的表达和功能,进而影响NIHL的易感性。

关键词：噪声听力损失非编码区单核苷酸多态性微小RNA 基因相关性研究进展

肠道病毒71型3′非编码区序列分析及重组病毒的构建

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华实验和临床病毒学杂志 2019年第1期33卷 83-88页

作者：董祯王莉鸿刘子薇陈锐陶泽新赵丽王志玉温红玲山东大学公共卫生学院微生物检验学系感染性疾病防控重点实验室(山东省“十三五”高校重点实验室) 济南250012 山东省疾病预防控制中心山东省传染病预防控制重点实验室济南250012

目的对EV-A71的3′UTR核苷酸序列进行分析,并利用反向遗传学技术构建3′UTR置换的重组病毒,为研究3′UTR功能及其对毒力的影响奠定基础。方法提取分离病毒的RNA,对3′UTR核苷酸序列进行测定并分析。以SDLY107株全长感染性克隆为骨架,将S... 详细信息

目的对EV-A71的3′UTR核苷酸序列进行分析,并利用反向遗传学技术构建3′UTR置换的重组病毒,为研究3′UTR功能及其对毒力的影响奠定基础。方法提取分离病毒的RNA,对3′UTR核苷酸序列进行测定并分析。以SDLY107株全长感染性克隆为骨架,将SDLY1株的3′UTR替换到其相应部分,拯救重组病毒并鉴定。结果序列分析表明,9个EV-A71临床分离株的3′UTR核苷酸同源性为94%~100%,个别位点突变可能影响病毒的致病性。经PCR测序鉴定重组病毒的3′UTR成功替换,转染后出现典型的致细胞病变效应,可稳定传代并具有感染性。结论EV-A713′UTR可能与致病性有关。成功拯救重组EV-A71 SDLY107(1-3′UTR)株,为进一步研究3′UTR对其毒力的影响提供了基础。

关键词：肠道病毒71型非编码区重组病毒

结直肠癌患者瘤内线粒体DNA非编码区突变异质性研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华肿瘤防治杂志 2019年第7期26卷 473-478页

作者：张惠锋王华伟谢振荣任莉徐玉刘为军王昆华云南省第一人民医院昆明理工大学附属医院临床药学科云南昆明650000 昆明医科大学第一附属医院生殖科云南昆明650000 昆明医科大学第一附属医院科教部云南昆明650000 云南省第一人民医院昆明理工大学附属医院妇产科云南昆明650000 昆明医科大学第一附属医院普外科云南昆明650000 云南省第一人民医院昆明理工大学附属医院肛肠科云南昆明650000

目的线粒体DNA非编码区是调控线粒体DNA复制和转录的重要区域,由于其自身的结构特点,具有较高的突变速率,本研究旨在探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)瘤内不同空间位置线粒体DNA非编码区的突变异质性情况。方法收集2013-08-01-2014-... 详细信息

目的线粒体DNA非编码区是调控线粒体DNA复制和转录的重要区域,由于其自身的结构特点,具有较高的突变速率,本研究旨在探讨结直肠癌(colorectal cancer,CRC)瘤内不同空间位置线粒体DNA非编码区的突变异质性情况。方法收集2013-08-01-2014-10-31云南省第一人民医院普外科手术治疗的26例CRC患者瘤内不同空间位置的78例肿瘤组织和26例癌旁正常组织。采用HE染色法,显微镜下确定肿瘤组织的类型;直接测序法对线粒体DNA非编码区进行测序,比较CRC瘤内不同空间位置的线粒体DNA非编码区的突变情况。结果有10例CRC患者mtDNA D-loop区发生了突变,突变率为45.5%。突变位点分别为HVSI的16114、16166、16248、16278、16304、16362及16390位点,其中309点位点突变最多,有2例同时在HVSⅠ、Ⅱ和Ⅲ有突变,其余患者均只发生了一个位点突变。有9例存在瘤内mtDNA非编码区突变的异质性。结论 CRC患者mtDNA非编码区的突变存在瘤内异质性。

关键词：结直肠癌线粒体DNA 非编码区异质性

依赖于5′端非编码区高级结构的真核生物mRNA翻译调控

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国生物化学与分子生物学报 2007年第11期23卷 881-887页

作者：余光创秦宜德伯晓晨王升启军事医学科学院放射与辐射医学研究所北京100850 安徽医科大学基础医学院合肥230032

翻译水平的调控是真核基因表达调控的重要环节.近年来的研究表明,许多真核基因的翻译依赖于RNA5′端非编码区的结构元件.一些小结构元件,如铁离子反应元件,具有1个茎环结构,由铁离子介导控制转铁蛋白的翻译.核糖开关通过结合特定代谢分... 详细信息

翻译水平的调控是真核基因表达调控的重要环节.近年来的研究表明,许多真核基因的翻译依赖于RNA5′端非编码区的结构元件.一些小结构元件,如铁离子反应元件,具有1个茎环结构,由铁离子介导控制转铁蛋白的翻译.核糖开关通过结合特定代谢分子在2种结构状态下切换,调控可变剪接和翻译起始.另1个高度结构化的mRNA元件是内部核糖体进入位点,通过富集核糖体和起始因子促进基因的表达.本文综述了依赖于小结构元件、内部核糖体进入位点和核糖开关的真核基因翻译起始调控相应的研究成果和研究方法.对于研究的前景以及可能存在的挑战也作出阐述.

关键词：非编码区翻译调控核糖开关内部核糖体进入位点

黄瓜绿斑驳花叶病毒辽宁分离物外壳蛋白基因与3′非编码区的序列分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国病毒学 2006年第5期21卷 516-518页

作者：陈红运白静朱水芳赵文军李明福中国检验检疫科学研究院动植物检疫研究所北京100029 沈阳农业大学植物保护学院辽宁沈阳110161

The coat protein gene and its 3′ noncoding region of a watermelon isolate of Cucumber green mottle mosaic virus (CGMMV-LN) in Liaoning, China was determined and compared with other isolates. The gene encoding the coat protein of CGMMV-LN comprises of 486 nucleotides and encodes a putative protein of 161 amino acids. Sequence comparisons showed that the coat protein of this isolate was identical to that of seven CGMMV isolates infecting cucurbits in Europe and Asia. The 3′ noncoding region of CGMMV-LN consists of 176 nucleotides, which is same as that of CGMMV-KOM, CGMMV-KW and CGMMV–SH.

关键词：外壳蛋白基因烟草花叶病毒非编码区序列分析黄瓜亚基因组RNA 分离物病毒基因组

型内非编码区嵌合口蹄疫病毒的拯救及生物学特性分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中国兽医科学 2013年第11期43卷 1101-1108页

作者：韩成昊李平花白兴文包慧芳卢曾军孙普曹轶梅刘在新中国农业科学院兰州兽医研究所家畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室甘肃兰州730046 中国农业科学院兰州兽医研究所畜疫病病原生物学国家重点实验室农业部畜禽病毒学重点开放实验室国家口蹄疫参考实验室甘肃兰州730046

为探寻口蹄疫病毒(FMDV)非编码区对病毒生命周期乃至生物学特性的影响,以O/HN/93现用疫苗株的感染性克隆为骨架,利用融合PCR分别构建了含持续感染毒株O/CHN/Mya98/33-P 3′非编码区、5′非编码区及3′非编码区和5′非编码区嵌合的3株全... 详细信息

为探寻口蹄疫病毒(FMDV)非编码区对病毒生命周期乃至生物学特性的影响,以O/HN/93现用疫苗株的感染性克隆为骨架,利用融合PCR分别构建了含持续感染毒株O/CHN/Mya98/33-P 3′非编码区、5′非编码区及3′非编码区和5′非编码区嵌合的3株全长cDNA克隆。3个全长克隆经线性化后分别在脂质体介导下转染表达T7RNA聚合酶的BHK-21细胞,转染后第60小时均出现明显的致细胞病变效应。对收获的病毒分别用RT-PCR、间接免疫荧光分析,结果表明成功拯救到3个嵌合的FMDV。拯救的病毒对乳鼠致病力和细胞感染力的比较分析结果显示,发现分别替换两端非编码区会导致病毒细胞感染力和乳鼠致病力下降,而同时替换非编码区的病毒则无明显变化。这些嵌合病毒的成功拯救为进一步阐述非编码区的功能奠定了基础。

关键词：型内嵌合非编码区口蹄疫病毒生物学特性