检索结果-南通市图书馆

安徽农业科学 2024年第2期52卷 87-92页

作者：问荣荣苏钰高泽芳徐梦宇何雯雯王步勇菏泽学院农业与生物工程学院山东菏泽274015

[目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因ltp的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsltp基因序列及其编... 详细信息

[目的]了解牡丹非特异性脂质转移蛋白基因ltp的基因特征及其编码蛋白的生物学特性,探索其生物功能。[方法]运用Blast、ORF-Finder、ProtParam、SignalP 4.1、ProtScale和TMHMM 2.0 Server等生物信息学软件,分析牡丹nsltp基因序列及其编码蛋白的基本理化性质、信号肽、磷酸化位点、保守结构域等,并运用DANMAN、MEGA软件进行多序列比对和系统发育树构建。[结果]牡丹nsltp基因(NCBI登录号为:JZ840269.1)序列全长为685 bp,开放阅读框长为354 bp,编码蛋白包含117个氨基酸,理论等电点为8.93,为不稳定性蛋白。牡丹nsltp蛋白为疏水性蛋白,含有信号肽但不含跨膜结构域,NetPho Server预测其含有8个丝氨酸和3个酪氨酸磷酸化位点及5个苏氨酸磷酸化位点。Psnsltp蛋白具有植物ltp蛋白典型结构,即4个α-螺旋,4对二硫键,1个可结合和容纳脂质分子的疏水结构。多序列比对及系统发育树分析显示,Psltp蛋白与绒毛烟草ltp蛋白(XP_009608993.1)的相识度62.7%,且进化树聚为同一小分支,遗传距离较近。[结论]通过对牡丹nsltp基因特性及蛋白结构研究,系统性研究了牡丹nsltp基因的生物信息学特性,为牡丹抗病抗逆功能基因的研究提供了依据,也为其他植物nsltp基因研究提供了参考。

关键词：牡丹非特异性脂质转移蛋白基因ltp 蛋白结构生物信息学

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