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非常见缺失型alpha-地中海贫血筛查方法的建立

非常见缺失型alpha-地中海贫血筛查方法的建立

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作者：吕姗右江民族医学院

学位级别：硕士

目的:地中海贫血(Thalassemia)(以下简称“地贫”)严重危害健康,是出生缺陷的主要病因之一。我国两广地区是地贫发病率和基因携带率最严重的地区。虽然地贫防治“广西模式”取得较好成效,得到包括农工党中央主席陈竺等领导的高度肯定。... 详细信息

目的:地中海贫血(Thalassemia)(以下简称“地贫”)严重危害健康,是出生缺陷的主要病因之一。我国两广地区是地贫发病率和基因携带率最严重的地区。虽然地贫防治“广西模式”取得较好成效,得到包括农工党中央主席陈竺等领导的高度肯定。但目前人群地贫基因携带率仍然较高,且有重症地贫患儿出生。可能原因之一是目前的地贫检测方法可能存在不足,不能有效检测全部静止型和非常见型的α-地中海贫血基因。本研究欲建立一种高通量、高灵敏度的方法,为大规模筛查常见和非常见的缺失型α-地中海贫血基因提供技术支撑,为地贫高发区防控地贫,降低地贫患儿出生率做出应有的贡献。方法:建立三重Tap Man实时荧光定量PCR检测体系,同步检测HBA、HBZ和内参基因,结合2相对定量分析的原理,相对定量HBA及HBZ的基因拷贝数,根据缺失型α-地中海贫血分子机制中α珠蛋白基因和看家基因的拷贝数比例差异,从而检测HBA及HBZ基因缺失或基因叠加,快速诊断α地中海贫血基因拷贝数。通过不断调整检测体系的引物、探针及反应液浓度和优化检测模板量、DNA聚合酶组份及循环数,最终确定缺失型α-地中海贫血三重Tap Man实时荧光定量PCR检测体系。为了探讨其临床应用的可行性,我们以本研究建立的方法对已知基因型的临床本进行检测,根据检测结果进行方法的优化。然后,对未知基因型的临床待测标本进行,并与“金标准”Gap-PCR技术进行比对,评估本检测体系的准确率和灵敏度。结果:(1)本研究建立并验证了缺失型α-地中海贫血三重荧光定量PCR检测方法。其中,HBA基因拷贝数测定的判断标准是:判定值2=1,表示样本HBA拷贝数正常;判定值2≤0.75,表示HBA拷贝数低于正常值,即阳性值为0-0.89,阴性值为0.9-1.1。HBZ基因拷贝数测定的判断标准是:判定值2=1,表示样本HBZ拷贝数正常;判定值2≤0.5,表示拷贝数低于正常。(2)用建立的实验方法对500例临床待测样本进行α-地中海贫血基因型的检测,结果显示4个HBA基因拷贝的有422例,3个拷贝的有33例,2个拷贝的有43例,1个拷贝的有2例。其中,我们通过检测拷贝数的缺失探索出了临床常规筛查不能发现的非常见地中海贫血基因型:泰国缺失型地中海贫血基因型。(3)通过Gap-PCR验证,本检测方法的准确率为99.60%,灵敏度为100%。临床常规检测技术准确率为98.60%,灵敏度为93.42%。本研究建立的方法检出率高于临床常规检测方法,差异有统计学意义;本检测方法与临床常规检测方法相比,准确率和灵敏度更高,有效降低了漏诊率。结论:本研究建立了基于珠蛋白基因拷贝数相对定量技术的缺失型α-地中海贫血的检测方法,能有效检出静止型、轻型、非常见型α地中海贫血;检测方法准确率高,灵敏度好。可用于常见、非常见及未知的地中海基因型的探索,为临床及现场地中海贫血基因筛查提供参考方案,有助于减少或避免出生缺陷,实现优生优育。

关键词： α-地中海贫血非常见型缺失型基因突变三重TapMan实时荧光定量PCR

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