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南宁市静脉注射吸毒人群HIV-1基因亚型及耐药性分析

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中国热带医学 2019年第2期19卷 136-140页

作者：王亮覃巍巍南宁市疾病预防控制中心广西南宁530023

目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV-1流行基因亚型及其耐药性,为辖区艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法收集2017年南宁市静脉注射吸毒人员HIV感染者血浆样本总共68份,提取病毒核糖核酸(RNA),通过巢式PCR对HIV pol基因片段... 详细信息

目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV-1流行基因亚型及其耐药性,为辖区艾滋病防治策略制定提供科学依据。方法收集2017年南宁市静脉注射吸毒人员HIV感染者血浆样本总共68份,提取病毒核糖核酸(RNA),通过巢式PCR对HIV pol基因片段进行扩增测序,构建系统进化树进行基因分型,并将序列提交至美国斯坦福大学HIV耐药数据库分析,利用pol基因测序结果分析HIV-1亚型和耐药性情况。结果 68份血浆样本中巢式PCR成功扩增基因片段62份,系统进化分析显示检出3种HIV-1重组基因亚型,CRF_01-AE亚型占72.6%(45/62)、CRF_07-BC亚型占12.9%(8/62)、CRF_08-BC亚型占14.5%(9/62),CRF01_AE型为主要流行亚型。χ~2检验分析显示在性别、年龄、民族、婚姻4个人口学特征中62份样本HIV-1亚型组成差异无统计学意义(P>0.05)。62份样本中3例CRF_08-BC亚型发现T69S耐药突变,1例CRF_01-AE亚型发现L210W突变,1例CRF_07-BC亚型发现A71V突变。结论南宁市IDUs人群HIV-1感染者中至少存在3种HIV-1基因亚型流行,CRF_01-AE重组型为优势流行株,研究中出现的耐药突变位点为低度耐药突变位点,应密切监视其流行趋势。

关键词：静脉注射吸毒人群人免疫缺陷病毒1型基因分型耐药位点

重庆市静脉注射吸毒人群艾滋病疫情的SIR模型

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重庆市静脉注射吸毒人群艾滋病疫情的SIR模型

作者：马迪辉第三军医大学

学位级别：硕士

研究目的描述重庆市艾滋病高危人群的HIV/AIDS流行现况,评价重庆市针对静脉注射吸毒人群的艾滋病疫情采取的干预措施效果,建立SIR模型模拟并预测重庆市静脉注射吸毒人群艾滋病疫情趋势。研究方法采用SIR模型模拟重庆市静脉注射吸毒人群... 详细信息

研究目的描述重庆市艾滋病高危人群的HIV/AIDS流行现况,评价重庆市针对静脉注射吸毒人群的艾滋病疫情采取的干预措施效果,建立SIR模型模拟并预测重庆市静脉注射吸毒人群艾滋病疫情趋势。研究方法采用SIR模型模拟重庆市静脉注射吸毒人群的艾滋病流行情况。在模型中加入种群动力学因素、针具交换因素、美沙酮维持治疗因素和抗病毒治疗因素,分析各干预因素对疫情的影响。模型中的相关参数提取自2007-2012年重庆市艾滋病防治工作年报,某些参数采用蒙特卡罗模拟方法和文献研究进行估计。以模型中的基本再生数0R为评价艾滋病疫情发展趋势的主要指标。主要应用软件包括:SIR模型的公式推导以Wolfram Mathematica 9软件实现,蒙特卡罗模拟编程通过R软件实现,数据的整理分析以Excel2010和SPSS19.0实现。研究结果2006-2012年重庆市艾滋病感染的主要途径为异性性途径、同性性途径和静脉注射吸毒。2006-2012年,重庆市静脉注射吸毒者的HIV年平均感染率为8.42%(95%CI:7.82%.03%)。通过SIR模型模拟重庆市静脉注射吸毒人群的艾滋病传播特征,研究中有以下结果:在未开展针具交换、美沙酮维持治疗和抗病毒治疗时,基本再生数0R为2.05;当针具交换覆盖率为0时,HIV阳性的静脉注射吸毒人群的美沙酮维持治疗覆盖率由0上升至0.05,基本再生数0R减小0.5;当HIV阳性的静脉注射吸毒人群的坚持抗病毒治疗率从0上升至0.05,基本再生数0R下降0.5;而当HIV阳性的静脉注射吸毒人群的美沙酮维持治疗覆盖率和坚持抗病毒治疗率为0时,针具交换覆盖率由0上升至0.2,基本再生数0R减少幅度小于0.5。结合实际情况和模型模拟,最佳的干预措施策略是美沙酮维持治疗覆盖率为0.105且抗病毒治疗覆盖率为0.05时,基本再生数0R小于1。模型模拟的静脉注射吸毒人群的HIV感染率与实际的拟合,相关系数为0.77(p人群的HIV/AIDS流行现况,建立了SIR模型模拟并预测重庆市静脉注射吸毒人群的艾滋病疫情趋势。在模型中加入重庆市针对IDUs的HIV疫情采取的干预措施(针具交换项目、美沙酮维持治疗项目和抗病毒治疗项目)后,通过模型模拟可知不同的干预项目和干预力度对疫情的影响大小。通过模型模拟情况与现实可行性,本研究提出了最佳可实现的干预措施策略。本研究的sir模型的模拟数据与实际数据的拟合度高,这表明sir模型对艾滋病传播规律的分析有良好的效果,相比其他艾滋病疫情模型,sir模型能直接体现各行为因素和干预因素对疫情的影响,且模型中有基本再生数来预测艾滋病疫情的发展趋势。

关键词：艾滋病静脉注射吸毒人群流行病学 SIR模型

德宏州1992-2010年静脉注射吸毒人群艾滋病哨点监测

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中国艾滋病性病 2013年第9期19卷 673-674,678页

作者：项丽芬高洁段松叶润华杨跃诚杨世江王继宝龚渝蓉卓龙冉何纳德宏傣族景颇族自治州疾病预防控制中心云南芒市678400 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室上海200032

目的了解云南省德宏州静脉吸毒人群艾滋病(HIV/AIDS)流行特点和变化趋势,为艾滋病综合防治和科学干预提供依据。方法依照云南省HIV/AIDS哨点监测方案,对德宏州1992-2010年静脉吸毒人群实施哨点监测。结果 1992-2010年,艾滋病哨点累计检... 详细信息

目的了解云南省德宏州静脉吸毒人群艾滋病(HIV/AIDS)流行特点和变化趋势,为艾滋病综合防治和科学干预提供依据。方法依照云南省HIV/AIDS哨点监测方案,对德宏州1992-2010年静脉吸毒人群实施哨点监测。结果 1992-2010年,艾滋病哨点累计检测静脉注射吸毒者4 534人,其中HIV抗体阳性1 802人,HIV阳性率为39.7%。男性HIV抗体阳性率为40.3%(1 749/4 345),女性为28.0%(53/189)。艾滋病哨点监测的静脉吸毒人群中HIV抗体阳性率总体水平高,自2008起似呈下降趋势。结论德宏州静脉注射吸毒人群HIV感染率高,艾滋病防控形势依然严峻。

关键词：静脉注射吸毒人群艾滋病病毒哨点监测

云南省德宏傣族景颇族自治州静脉注射吸毒者HIV新发感染情况的队列研究

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中华预防医学杂志 2016年第11期50卷 966-970页

作者：杨跃诚靳子义唐仁海李林叶润华曹艳芬杨世江姚仕堂段松何纳云南省德宏傣族景颇族自治州疾病预防控制中心艾滋病性病防制科芒市678400 复旦大学公共卫生学院流行病学教研室公共卫生安全教育部重点实验室

目的分析云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）静脉注射毒品者HIV新发感染情况。方法采集2010年以来德宏州所有戒毒所内戒毒人员的指纹，纳入首次HIV检测为阴性、中国籍的静脉注射吸毒者共1413名；同时，对2004-2009年历史监测人群进... 详细信息

目的分析云南省德宏傣族景颇族自治州（德宏州）静脉注射毒品者HIV新发感染情况。方法采集2010年以来德宏州所有戒毒所内戒毒人员的指纹，纳入首次HIV检测为阴性、中国籍的静脉注射吸毒者共1413名；同时，对2004-2009年历史监测人群进行指纹补录采集，将指纹与历史监测数据进行匹配后，纳入首次HIV检测为阴性、中国籍、采集过指纹的静脉注射吸毒者作为队列的基线数据，共1830名。截至2015年12月31日，纳入队列的研究对象共3243名，其中随访对象为2546名（78．5％），失访对象697名（21．5％）。采用问卷调查的形式对研究对象进行调查，问卷内容包含艾滋病相关知识、吸毒行为、性行为和既往HIV检测史等。并抽取每名研究对象3—5ml静脉血进行HIV检测。基于Poisson分布方法，计算历年HIV新发感染率及95％凹。结果2546名随访对象的观察总人时为13907．1人年，新发HIV感染者226例，HIV新发感染率为1．6／100人年（95％CI：1．4／100人年．1．9／100人年）。2004-2009年平均HIV新发感染率均为2．6／100人年（95％CI：2．2／100人年～3．1／100人年），2010-2015年历年HIV新发感染率分别为1．6／100人年（95％CI：1．0／100人年～2．3／100人年）、1．7／100人年（95％CI：1．1／100人年，2．4／100人年）、1．2／100人年（95％CI：0．8／100人年-1．9／100人年）、0．6／100人年（95％CI：0．3／100人年．1．1／100人年）、0．2／100人年（95％CI：0．0／100人年-0．7／100人年）、0．5／100人年（95％CI：0．1／100人年，1．4／100人年）。结论云南省德宏州静脉注射吸毒者HIV新发感染率仍处于较高水平，但呈现逐年下降趋势。

关键词：吸毒人群 HIV 指纹识别静脉注射吸毒人群队列研究

哨点监测、BED、阴性队列评估玉溪市2007-2010年IDU人群HIV-1感染态势对比分析

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中华疾病控制杂志 2012年第4期16卷 360-362页

作者：高良敏赵金仙郭春园陈良鲁建波李孝安玉溪市疾病预防控制中心云南玉溪653100

目的为避免评估方法单一性带来的局限,笔者等采用3种方法对玉溪市2007-2010年静脉注射吸毒人群(intravenous drug users,IDUs)艾滋病病毒感染态势进行评估,为艾滋病防治策略的调整提供科学依据。方法采用哨点监测、BED-CEIA、阴性队列3... 详细信息

目的为避免评估方法单一性带来的局限,笔者等采用3种方法对玉溪市2007-2010年静脉注射吸毒人群(intravenous drug users,IDUs)艾滋病病毒感染态势进行评估,为艾滋病防治策略的调整提供科学依据。方法采用哨点监测、BED-CEIA、阴性队列3种方法分析2007-2010年IDUs HIV-1感染态势,指标分别为感染率、新近感染率和发病率。结果 3种方法获得的4年感染率结果分别为,哨点监测:10.28%、15.35%、15.03%、13.40%;BED-CEIA(新近感染率):3.27/100人年、1.16/100人年、1.74/100人年、1.44/100人年;阴性队列(新近感染率):0.00/100人年、0.54/100人年、1.21/100人年、1.01/100人年,结果显示IDUs近4年HIV-1感染处于较低水平。结论玉溪市IDUs HIV-1感染处于较低水平。3种评估方法各有优缺点,结合哨点监测开展队列研究,同时引入简便、经济实用的监测技术是基层开展HIV-1发病评估的重要途径。

关键词：静脉注射吸毒人群 HIV 流行病学研究

甘肃省近年流行HIV-1基因型特点及中国吸毒人群HIV-1流行和基因型Meta分析

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甘肃省近年流行HIV-1基因型特点及中国吸毒人群HIV-1流行和基因型...

作者：姜宇兰州大学

学位级别：硕士

目的:人类免疫缺陷性病毒(Human Immunodeficiency Virus,HIV)是导致艾滋病(Acquired Immune Deficiency Syndrome,AIDS)的病原体,分为HIV-1和HIV-2两种类型,其中HIV-1是引起全球艾滋病流行的主要类型。本研究基于甘肃省临床样本对甘肃省近年流行HIV-1病毒株特点、耐药基因型进行研究,分析流行病学相关数据,为甘肃省HIV的精准诊断、预防策略和治疗提供参考。方法:选取2016年1月-2018年5月甘肃省疾病预防控制中心(GS-CDC)留存的HIV-1确证试验阳性且病毒载量≥1000(拷贝数/ml)的血浆114例,用巢式RT-PCR的方法,进行HIV-1基因分型研究。用琼脂糖凝胶电泳验证阳性的PCR产物,送华大基因公司测序,测序结果通过美国Los Alamos国家实验室HIV核酸序列库的HIV-BLAST工具,依据同源性对gag、pol、env三个基因区域的基因型进行鉴定。鉴定结果用系统树分析做进一步证实。序列的比对、同源性分析应用Clustal X 1.83软件,使用Mega 4.1软件利用]NNeighbor-j oining法构建系统进化树。不同标准参考序列从美国Los Alamos网站上的HIV databases中下载(https://***/content/index)。利用Mega 4.1软件中的distance程序中的Kimura双参数方法计算序列间的基因离散率,即基因距离分析。通过前期分型前期研究发现,甘肃省中有CRF551B和CRF65px流行重组型各3例。在前期分型研究基础上,选择HIV-1基因型CRF551B和CRF65px阳性共6例;选择gag、pol和env基因均阳性样本10例,gag和env阳性样本3例,合计19份样本,进行HIV-1近乎全长基因序列(NFLG)分析,利用SimPlot软件做进一步分析;选取2018年3月到5月甘肃省疾病预防控制中心留存的HIV-1确证试验阳性且患者未曾服药病毒载量≥1000(拷贝数/ml)的血浆27例,进行甘肃省近年HIV/AIDS耐药基因型特征研究。结果:用巢式RT-PCR检测114例HIV-1阳性血浆样本,结果分别检测到HIV-lgag基因39例、pol基因24例,env基因57例,gag,pol,env三种结构基因中至少有一种检出的有68例,三者均检出10例,三者均未检出46例。在至少有一种基因表达的68例样本测序比对结果显示,甘肃省近年HIV-1基因型有B亚型、C亚型,CRF07C、CRF01E、CRF08C,其中以CRF07C和CRF01E重组型为主,分别占41.18%和27.94%。此外发现有新传入甘肃省的CRF551B、CRF65px各3例。同时,分析样本库的人口学和地理学信息特点显示,甘肃省HIV阳性人群以男性为主,占85.29%(58/68);年龄集中在20-50岁青壮年,占82.3 5%(56/68);甘肃省HIV-1基因型分布具有显著的地域特征,HIV阳性地区有地域优势病毒株,临夏市以CRF01E为主,占37.0%(10/27),定西市为CRF07C,占58.8%(10/17)。在甘肃省HIV-1近乎全长基因序列(NFLG)分析过程中,成功扩增并拼接出6例样本的基因序列。这6例样本有3例为甘肃省未曾报道新传入的流行毒株CRF551B,通过NFLG与各自的参考株比较,其重组模式相同和重组断点相似。选择的27例HIV阳性未曾服药的样本,对pol基因逆转录酶编码(RT)区的耐药基因序列分析结果显示,BC重组型13例,CRF01E 10例,4份样本不能确定基因型。将pol基因逆转录酶区序列提交斯坦福大学HIV耐药数据库进行耐药突变分析,在甘肃省27例HIV-1感染人群中发现有耐药相关突变发生情况8例(8/27),并发现有针对蛋白酶抑制剂的耐药毒株的传播。结论:甘肃省近年HIV-1流行以CRF07C和CRF01E流行重组型为主,与全国HIV-1的主要流行的基因型相似;发现甘肃省有CRF551B、CRF65px基因型的流行和耐药基因型传播;各基因型分布具有显著的地域特征,本研究补充了甘肃省近年HIV-1流行和基因型信息。目的:中国早期HIV的传播主要是通过静脉注射吸毒人群(IDUs)。目前,HIV在中国的传播逐渐由高危人群转向普通人群,以性途径传播为主。早期通过静脉注射吸毒途径传播的HIV基因型可能是影响我国HIV流行基因型的主要因素。对静脉注射吸毒人群感染的HIV基因型进行全面分析,可以为中国HIV的分子流行和传播类型提供综合证据。因此,我们对静脉注射吸毒人群的HIV流行和基因型进行Meta分析。方法:检索数据库:PubMed,Web of Science

关键词： HIV/AIDS 基因型全长基因系统进化耐药基因甘肃省 HIV-1 艾滋病静脉注射吸毒人群 Meta分析中国

楚雄州(2011～2016)年吸毒哨点资料分析

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皮肤病与性病 2019年第3期41卷 354-357页

作者：朱强张晓冰龚晓洁李蕊邹雅琴杨晓煜云南省楚雄彝族自治州疾病预防控制中心

目的了解云南省楚雄州静脉吸毒人群艾滋病(HIV/AIDS)流行特点和变化趋势,为实施有效的干预措施和防治对策提依据。方法分析楚雄州(2011~2016)年吸毒人群艾滋病哨点连续监测资料。结果共调查2428人,其中HIV抗体阳性252人,HIV阳性率为1... 详细信息

目的了解云南省楚雄州静脉吸毒人群艾滋病(HIV/AIDS)流行特点和变化趋势,为实施有效的干预措施和防治对策提依据。方法分析楚雄州(2011~2016)年吸毒人群艾滋病哨点连续监测资料。结果共调查2428人,其中HIV抗体阳性252人,HIV阳性率为10.38%。男性HIV抗体阳性率为11.32%(151/2217),女性为0.47%(1/211)。艾滋病哨点监测的静脉吸毒人群中HIV抗体阳性率保持较高水平,少数民族检出率较高,该人群艾滋病知识知晓率达95.22%。结论楚雄州静脉注射吸毒人群HIV感染率仍高,少数民族检出率较高。艾滋病防控形势依然严峻,需要加强针对性干预措施。

关键词：静脉注射吸毒人群艾滋病病毒哨点监测

南宁市102例HIV/HCV共感染者HCV基因型特征分析

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中国热带医学 2017年第6期17卷 573-576页

作者：王亮刘海燕栾苑黄秋芳潘海西南宁市疾病预防控制中心广西南宁530023

目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV/HCV共感染者HCV基因亚型流行情况。方法收集2012—2014年间南宁市静脉注射吸毒人员HIV/HCV共感染者血浆样本总共108份,设计特异性引物,通过巢式PCR对HCV NS5B区域长339 bp的片段进行扩增并测... 详细信息

目的了解南宁市静脉注射吸毒人群(IDUs)中HIV/HCV共感染者HCV基因亚型流行情况。方法收集2012—2014年间南宁市静脉注射吸毒人员HIV/HCV共感染者血浆样本总共108份,设计特异性引物,通过巢式PCR对HCV NS5B区域长339 bp的片段进行扩增并测序,构建系统进化树对HCV进行基因分型。结果 108份血浆样本中巢式PCR成功扩增基因片段102份,系统进化分析显示检出4种HCV基因型含6种基因亚型,各基因亚型所占样本比例为6a 34.31%(35/102)、3b 33.33%(34/102)、1a 20.59%(21/102)、1b 6.87%(7/102)、3a 3.92%(4/102)和2a 0.98%(1/102)。在不同人口学特征时102份样本HCV基因型组成差异无统计学意义(P>0.05)。结论南宁市IDUs人群HIV/HCV共感染者中至少存在6种HCV基因亚型流行,6a、3b和1a为主要流行亚型。

关键词：静脉注射吸毒人群丙型肝炎病毒艾滋病病毒共感染基因分型