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青鱼生长QTL紧密连锁分子标记与生长性状的关联分析

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水生生物学报 2024年

作者：杨琳郭加民王元浩周思扬李家乐徐晓雁沈玉帮上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室

本研究对前期建立的青鱼(Mylopharyngodon piceus)家系高密度遗传连锁图谱及体长QTL的定位结果进行深入分析,在10号连锁群上识别到与体长相关的QTL区域,存在2个与体长强烈相关的紧密连锁SNP位点。本研究利用特异性标记判定青鱼遗传性别,... 详细信息

本研究对前期建立的青鱼(Mylopharyngodon piceus)家系高密度遗传连锁图谱及体长QTL的定位结果进行深入分析,在10号连锁群上识别到与体长相关的QTL区域,存在2个与体长强烈相关的紧密连锁SNP位点。本研究利用特异性标记判定青鱼遗传性别,对SNP位点侧翼序列PCR扩增子进行sanger测序。得到准确的SNP位点基因型信息后,本研究对紧密连锁SNP位点不同基因型与邗江青鱼群体生长性状进行了细致的关联分析。结果表明,在563尾邗江青鱼群体中,雌鱼290尾,雄鱼273尾,雌雄比约为1.06﹕1。遗传分析显示,SNP7957G>C和SNP9802T>A有效等位基因数(Ne)分别为1.754和1.399,观测杂合度(Ho)分别为0.384和0.266,期望杂合度(He)分别为0.430和0.285,多态信息含量分别(PIC)为0.508和0.378。相比雄鱼,雌鱼生长速度更快,但是变异系数更高,说明雌鱼生长性状离散程度更大。SNP7957G>C和SNP9802T>A不同基因型在群体体长性状中存在显著差异。SNP7957G>C位点的GG基因型在雄鱼体长性状中具有显著优势(PC和SNP9802T>A单标记其他基因型与生长性状之间存在差异,但未达到统计学差异。在SNP位点不同基因型构建的二倍型中,雌雄个体表现出一定的生长差异,D8(GGTA)在生长方面具有显著优势(P青鱼新品种提供分子标记,为未来青鱼遗传改良和分子标记辅助育种策略提供科学依据。

关键词： SNP 生长性状关联分析青鱼

青鱼生长相关SNP标记在不同地理群体中的验证

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上海海洋大学学报 2022年第5期31卷 1089-1096页

作者：郭加民徐晓雁李家乐沈玉帮上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306 上海海洋大学水产动物遗传育种中心上海市协同创新中心上海201306

单核苷酸多态性分子标记(single nucleotide polymorphism,SNP)是目前常用的分子标记辅助育种的工具之一。本研究在前期构建的青鱼(Mylopharyngodon piceus)高密度连锁图谱和QTL定位结果的基础上,利用体质量QTL区间中的2个SNP标记在3个... 详细信息

单核苷酸多态性分子标记(single nucleotide polymorphism,SNP)是目前常用的分子标记辅助育种的工具之一。本研究在前期构建的青鱼(Mylopharyngodon piceus)高密度连锁图谱和QTL定位结果的基础上,利用体质量QTL区间中的2个SNP标记在3个青鱼群体中进行验证,目的是为了检测通过QTL定位得到的SNP是否存在并能应用于其他地理群体,利用对分子标记的侧翼序列进行基因型组成分析、遗传多样性分析及中性检验等方法,对3个群体的2个SNP侧翼序列进行分析。遗传多样性结果显示,snp8107的扩展片段的单倍型多样性(H)在邗江群体、湘江群体和石首群体中分别为0.782、0.515和0.497;各位点的观测杂合度(H)为0.067~0.533,平均为0.239;期望杂合度(H)为0.127~0.506,平均为0.306;多态信息含量(PIC)为0.117~0.374,平均为0.246。中性检验显示3个群体在历史上可能发生过瓶颈效应导致稀有等位基因丢失的现象,结合遗传多样性结果推测,邗江群体在经历瓶颈效应后保留下来的稀有等位基因更多,最终得出结论邗江群体是适合进行遗传改良的最优群体。

关键词：青鱼 SNP 遗传多样性中性检验

青鱼ST251型高致病性嗜水气单胞菌的毒力及药物敏感性

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大连海洋大学学报 2023年第4期38卷 573-583页

作者：王玲玲侯天牧李华明项维袁汉文雷连成张付贤长江大学动物科学学院湖北荆州434023 湿地生态与农业利用教育部工程研究中心湖北荆州434023 涝渍灾害与湿地农业湖北省重点实验室湖北荆州434023 吉林大学动物医学学院吉林长春130062

为确定引起湖北省荆州市某养殖场青鱼(Mylopharyngodon piceus)出血病的病原和致病性,采用传统病原分离方法,从患病青鱼(体质量为1.0~1.5 kg)中分离到一株优势菌QAB5,对其形态特征、生理生化特性、16S rRNA基因序列、多序列位点分型(ML... 详细信息

为确定引起湖北省荆州市某养殖场青鱼(Mylopharyngodon piceus)出血病的病原和致病性,采用传统病原分离方法,从患病青鱼(体质量为1.0~1.5 kg)中分离到一株优势菌QAB5,对其形态特征、生理生化特性、16S rRNA基因序列、多序列位点分型(MLST)和胞外酶活性进行分析,并进行毒力基因检测、人工感染试验、生物被膜形成能力测定和药敏试验。结果表明:经生理生化分析和分子鉴定,分离菌株QAB5为嗜水气单胞菌(Aeromonas hydrophila),且有较强的致病性,为ST251型,含有溶血活性、蛋白酶活性和脂肪酶活性,毒力基因型为aer+hly+ahp+ast+alt+act+;用菌株QAB5人工感染健康青鱼,患病青鱼出现反应迟钝、腹部出血、肛门红肿、肠道出血等与自然发病青鱼相似的症状;测定菌株QAB5的半致死浓度(LD 50)为4.4×106 CFU/mL,为高致病性的强毒株;菌株QAB5对卡那霉素、氯霉素等13种抗生素敏感,对氨苄西林、利福平等4种抗生素耐药;中药全蝎、乌梅和丁香对菌株QAB5有明显的体外抑制效果。研究表明,分离菌株QAB5为一株ST251型嗜水气单胞菌强毒株,是引起本次青鱼出血病的病原菌,推荐使用环丙沙星、四环素等高敏感抗菌药物,并结合生物被膜清除剂进行小剂量精准施治。

关键词：青鱼嗜水气单胞菌致病性毒力基因药物敏感性中药

饲料中不同脂肪源对青鱼生长性能、血清生化指标及肌肉品质的影响

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动物营养学报 2022年第7期34卷 4657-4673页

作者：陈艳婷贾小巍钱鹏丞张辰吴成龙叶金云湖州师范学院生命科学学院浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室湖州313000

本试验旨在研究饲料中不同脂肪源对青鱼生长性能、血清生化指标及肌肉品质的影响。选择540尾初始体重为(5.25±0.25)g的青鱼幼鱼,随机分为6组,每组3个重复,每个重复30尾。以鱼油(FO)、猪油(PL)、菜籽油(RO)、玉米油(CO)、花生油(PO)、豆... 详细信息

本试验旨在研究饲料中不同脂肪源对青鱼生长性能、血清生化指标及肌肉品质的影响。选择540尾初始体重为(5.25±0.25)g的青鱼幼鱼,随机分为6组,每组3个重复,每个重复30尾。以鱼油(FO)、猪油(PL)、菜籽油(RO)、玉米油(CO)、花生油(PO)、豆油(SO)为脂肪源,配制6种等氮等能的试验饲料。各组分别投喂6种不同脂肪源的试验饲料,养殖周期为180 d。结果表明:1)各组之间增重率(WGR)、特定生长率(SGR)无显著差异(P>0.05)。FO组、RO组和SO组肥满度(CF)和脏体比(VSI)显著高于PL组、CO组和PO组(P青鱼肌肉抗氧化能力,并且RO、FO还可改善青鱼肌肉质地、气味、滋味。与FO相比,摄食以PL、PO、SO为脂肪源的饲料会降低青鱼肌肉抗氧化能力、质地、气味和滋味。

关键词：青鱼脂肪源生长性能血清生化指标肌肉品质

青鱼-鲢、鳙生态池塘浮游生物群落结构特征及其与环境因子的关系

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水产科学 2022年第4期41卷 517-526页

作者：龚进玲李学梅何勇凤杨德国朱永久中国水产科学研究院长江水产研究所农业农村部淡水生物多样性保护重点实验室湖北武汉430223

为探究青鱼-鲢、鳙生态养殖池塘中浮游生物群落结构特征及其与环境因子的关系,于2015年4-10月对3口青鱼养殖池塘的浮游生物及水质理化性质进行监测。结果显示,在青鱼-鲢、鳙生态养殖池塘中共检出浮游植物112种,其中绿藻门(47种)、裸藻门... 详细信息

为探究青鱼-鲢、鳙生态养殖池塘中浮游生物群落结构特征及其与环境因子的关系,于2015年4-10月对3口青鱼养殖池塘的浮游生物及水质理化性质进行监测。结果显示,在青鱼-鲢、鳙生态养殖池塘中共检出浮游植物112种,其中绿藻门(47种)、裸藻门(30种)和硅藻门(17种)为优势门类,优势种有扭曲小环藻、普通小球藻和被甲栅藻,浮游植物平均密度和生物量分别为3.24×10^(7)个/L和32.10mg/L。共检出浮游动物96种,其中原生动物42种、轮虫40种、枝角类9种、桡足类5种,优势种有裂痕龟纹轮虫、针簇多肢轮虫和暗小异尾轮虫等,浮游动物平均密度和生物量分别为6.08×10^(4)个/L和5.20mg/L。不同月份浮游植物和浮游动物的多样性指数中,香农-维纳多样性指数分别为1.8~2.5和2.9~4.5、物种丰富度指数分别为2.5~4.9和1.2~4.1、物种均匀度指数分别为0.51~0.69和1.5~2.8。此外,通过Pearson相关性分析和冗余分析对浮游生物群落与水体理化因子之间的关系进行分析,影响青鱼-鲢、鳙生态养殖池塘中浮游生物群落结构的主要环境因子为pH、水温、透明度和溶解氧。因此,在实际生产中可通过调控水质来控制养殖水体中浮游生物群落结构的组成和数量。同时,在高温缺氧的天气应加强水质管理。

关键词：青鱼浮游生物群落结构池塘养殖环境因子

发酵植物蛋白复配替代豆粕对青鱼生长、免疫、抗氧化及肠道菌群结构的影响

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动物营养学报 2023年第4期35卷 2478-2489页

作者：陈倪慧杨霞孙珊珊雷西汀邵仙萍吴成龙叶金云湖州师范学院生命科学学院水生动物繁殖与营养国家地方联合工程实验室浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室湖州313000

本试验研究发酵植物蛋白复配替代豆粕对青鱼生长、免疫、抗氧化及肠道菌群结构的影响。以不同比例(1∶1和2∶1)发酵棉籽粕和发酵菜籽粕分别替代基础饲料中0(对照组)、50%、75%的豆粕,配制5种等氮等能试验饲料,饲喂初始体重(6.04±0.18)... 详细信息

本试验研究发酵植物蛋白复配替代豆粕对青鱼生长、免疫、抗氧化及肠道菌群结构的影响。以不同比例(1∶1和2∶1)发酵棉籽粕和发酵菜籽粕分别替代基础饲料中0(对照组)、50%、75%的豆粕,配制5种等氮等能试验饲料,饲喂初始体重(6.04±0.18)g的青鱼,试验期8周。结果显示:各组之间生长性能、形体指标及体组成均无显著差异(P>0.05)。各组之间血清补体3、丙二醛、白蛋白含量以及溶菌酶活性均无显著差异(P>0.05)。50%替代组的血清补体4含量均显著高于其他各组(P0.05)。各组之间肠道α-淀粉酶和脂肪酶活性无显著差异(P>0.05),发酵棉籽粕和发酵菜籽粕以1∶1比例替代75%豆粕组的肠道胃蛋白酶活性显著高于对照组(P青鱼肠道微生物优势菌门为变形菌门(Proteobacteria)、厚壁菌门(Firmicutes)、梭杆菌门(Fusobacteria)和浮霉菌门(Planctomycetes);在属水平上,青鱼肠道微生物优势菌属为气单胞菌属(Aeromonas)、鲸杆菌属(Cetobacterium)、青枯菌属(Ralstonia)和邻单胞菌属(Plesiomonas)。各组之间肠道主要菌群的相对丰度均无显著差异(P>0.05)。综上所述,本试验条件下,高比例(75%)发酵植物蛋白替代豆粕没有造成青鱼肝胰腺的损伤以及肠道菌群结构的改变,甚至提高了血清部分免疫指标活性及肠道胃蛋白酶活性,且发酵棉籽粕和发酵菜籽粕的复配比例也不会对青鱼生长性能、形体指标、体组成、肝胰腺抗氧化指标和肠道菌群结构产生显著影响。

关键词：青鱼发酵植物蛋白豆粕免疫肠道菌群

富硒壶瓶碎米荠对青鱼幼鱼生长、生理生化、硒代谢、抗氧化及先天免疫的影响

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水生生物学报 2023年第3期47卷 523-534页

作者：张辰贾小巍钱鹏丞陈艳婷吴成龙叶金云湖州师范学院生命科学学院水生动物繁育与营养国家地方联合工程实验室湖州313000 湖州师范学院生命科学学院浙江省水生生物资源养护与开发技术研究重点实验室湖州师范学院生命科学学院湖州313000

为探究富硒壶瓶碎米荠(Cardamine hupingshanensis)对青鱼(Mylopharyngodon piceus)幼鱼生长、血清生理生化、肝脏硒代谢、抗氧化能力和先天免疫指标的影响,选取360尾初始体重为(5.51±0.02)g的青鱼幼鱼随机分配至4个实验组中,每组3个... 详细信息

为探究富硒壶瓶碎米荠(Cardamine hupingshanensis)对青鱼(Mylopharyngodon piceus)幼鱼生长、血清生理生化、肝脏硒代谢、抗氧化能力和先天免疫指标的影响,选取360尾初始体重为(5.51±0.02)g的青鱼幼鱼随机分配至4个实验组中,每组3个重复。在基础饲料中添加富硒壶瓶碎米荠的量为0、0.5、1.0和2.0 g/kg(硒的实际含量分别为0.04、0.43、0.75和1.57 mg/kg),同时添加矿物质混合物(无硒添加)和维生素混合物,配置成4种等氮等能的青鱼幼鱼试验饲料,养殖周期为60d。结果显示:饲料中添加0.5和1.0 g/kg富硒壶瓶碎米荠时,鱼体增重率(WG),特定生长率(SGR)较对照组和过量组(2.0 g/kg)显著升高,饲料系数(FCR)显著降低(P青鱼幼鱼生长,增加鱼体的蛋白沉积,促进机体硒代谢,提高肝脏抗氧化和先天免疫能力。

关键词：富硒壶瓶碎米荠生长硒代谢抗氧化能力先天免疫能力青鱼

青鱼和鲇肠道排泄物对养殖水体铜绿微囊藻休眠体复苏的影响及作用途径

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水产学报 2021年第4期45卷 563-577页

作者：邹万生王智宋齐生刘良国韩庆王文彬杨品红湖南文理学院水产高效健康生产湖南省协同创新中心洞庭湖生态经济区建设与发展湖南省协同创新中心动物学湖南省高校重点实验室湖南师范大学生命科学学院 Division of Plant Sciences University of Missouri Columbia

为探讨养殖水体底栖鱼类肠道排泄物对铜绿微囊藻休眠体复苏的影响,将青鱼和鲇肠道排泄物与铜绿微囊藻休眠体用野外养殖水域沉积物(底泥)混匀包埋,在10、15和20°C梯度温度下进行休眠体复苏实验。结果显示,铜绿微囊藻休眠体主要复苏期为... 详细信息

为探讨养殖水体底栖鱼类肠道排泄物对铜绿微囊藻休眠体复苏的影响,将青鱼和鲇肠道排泄物与铜绿微囊藻休眠体用野外养殖水域沉积物(底泥)混匀包埋,在10、15和20°C梯度温度下进行休眠体复苏实验。结果显示,铜绿微囊藻休眠体主要复苏期为第3～15天,在10和15°C条件下,青鱼排泄物组(MP)、鲇排泄物组(SA)和青鱼-鲇排泄物混合组(MP-SA)铜绿微囊藻休眠体复苏率均显著高于对照组(CK),且MP组也显著高于SA组和MP-SA组;在20°C条件下,MP组铜绿微囊藻休眠体复苏率显著高于SA组、MP-SA混合组和CK组,但SA组和MP-SA组与CK组复苏率并无显著性差异。实验过程中MP组沉积物中优势菌群以假单胞菌为主,SA组和MP-SA组优势菌群分别以芽孢杆菌和厚壁菌为主,第0～12天为菌群增殖期,且此期间沉积物-水体界面(SWI)实验MP组、SA组和MP-SA组溶解氧含量(DO)和氮磷比(N/P)均显著低于对照组。研究表明,青鱼和鲇肠道排泄物能促进铜绿微囊藻休眠体复苏,且这种促复苏效果在低温区间(10～15°C)更显著,可能是排泄物中菌群在生长增殖期降低了沉积物-水体界面N/P和DO的结果。研究结果对养殖水体底泥清淤和春季铜绿微囊藻水华防控具有一定的理论意义。

关键词：青鱼鲇铜绿微囊藻鱼类排泄物休眠体复苏溶解氧氮磷比

基于线粒体COⅠ基因的9个青鱼群体遗传变异分析

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水生生物学报 2022年第7期46卷 933-938页

作者：鲍生成包天杰王沈同徐晓雁代雅凡张家华李家乐沈玉帮上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室上海201306 上海海洋大学上海水产养殖工程技术研究中心上海201306

为掌握中国青鱼(Mylopharyngodon piceus)种质资源分布特征,揭示青鱼种质资源的遗传变异情况,研究通过对9个青鱼群体271个样本线粒体COⅠ区设计引物并进行PCR扩增,运用软件分析了群体内部遗传多样性和各群体之间的进化关系。分析结果表... 详细信息

为掌握中国青鱼(Mylopharyngodon piceus)种质资源分布特征,揭示青鱼种质资源的遗传变异情况,研究通过对9个青鱼群体271个样本线粒体COⅠ区设计引物并进行PCR扩增,运用软件分析了群体内部遗传多样性和各群体之间的进化关系。分析结果表明:长度为1003 bp的9个群体COⅠ基因区域序列GC含量低于AT含量,共检测到6个突变位点,7种单倍型,其中Hap4单倍型在9个群体中都有分布。AMOVA分子方差分析显示271个青鱼样本的变异90.33%来自群体内部,9.67%来自群体间。青鱼总体核苷酸多样性(π)偏低,在0.00109—0.00244。单倍型多样(H_(d))性较高,在0.403—0.847。遗传分化系数(F_(st))在–0.0033—0.23445,保持在低度至高度分化,主要集中在低度和中度分化。分析得到广东佛山群体可能经历过瓶颈效应,其余8个群体可能经历过快速的种群扩张事件。研究结果揭示了中国目前青鱼种质资源的遗传背景,可以为中国青鱼种质资源的保护和创新利用提供重要的参考依据。

关键词： COⅠ基因地理群体遗传多样性遗传分化青鱼