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雌核生殖棕点石斑鱼遗传图谱构建及生长性状QTL定位

雌核生殖棕点石斑鱼遗传图谱构建及生长性状QTL定位

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作者：张维炜海南大学

学位级别：硕士

棕点石斑鱼（Epinephelus fuscoguttatus）是石斑鱼新品种——虎龙杂交斑（品种登记号:GS-02-004-2016）的母本,在石斑鱼种业资源中占有重要的地位。当前,棕点石斑鱼繁殖周期较长,不利于对其进行遗传改良。人工雌核生殖技术和分子标记... 详细信息

棕点石斑鱼（Epinephelus fuscoguttatus）是石斑鱼新品种——虎龙杂交斑（品种登记号:GS-02-004-2016）的母本,在石斑鱼种业资源中占有重要的地位。当前,棕点石斑鱼繁殖周期较长,不利于对其进行遗传改良。人工雌核生殖技术和分子标记辅助（MAS）育种是对繁殖周期长的鱼类较为高效的良种培育手段之一。集成人工雌核生殖诱导技术、MAS育种技术与表型选择将有助于促进棕点石斑鱼遗传改良。本论文首先基于雌核生殖棕点石斑鱼家系,分析形态学性状与体质量的关系。随后,采用GBS技术挖掘SNPs,构建了雌核生殖棕点石斑鱼高密度遗传连锁图谱。最终,针对与生长相关的数量性状位点（QTL）进行定位分析。研究结果可为棕点石斑鱼良种选育和MAS育种奠定理论基础,同时,也为虎龙杂交斑优质苗种规模化提供基础资料。本论文的研究结果如下:（1）雌核生殖棕点石斑鱼形态学性状与体质量的相关性分析通过相关分析、通径分析及多元回归分析的方法,分析该家系石斑鱼形态性状与体质量关系。结果表明,所测性状除眼径外,其他各性状间两两相关均达到极显著水平（P雌核生殖棕点石斑鱼选育当以体长为主要选择性状,体高、尾柄高和头长为辅助选择性状。（2）雌核生殖棕点石斑鱼高密度遗传图谱的构建以164尾雌核生殖棕点石斑鱼F子代和母本为作图群体,子代采用GBS测序技术挖掘SNP标记,母本使用全基因组重测序挖掘SNP标记。利用分布于24 LGs（与棕点石斑鱼染色体数一致）的19301个SNP标记构建了雌核生殖棕点石斑鱼高密度遗传图谱,总遗传长度为2343.72 c M,平均遗传长度为97.655 c M,平均遗传距离为0.12 c M。结果为单亲本的雌核生殖家系构建遗传图谱提供了参考,也为数量性状位点（QTL）定位提供了重要的工具。（3）雌核生殖棕点石斑鱼生长相关性状的QTL定位在表型数据评价和所构建遗传连锁图谱的基础上,选取6个与生长相关的性状进行QTL定位。在5个LGs（LG3、LG5、LG8、LG11和LG16）上共检测到29个与生长性状相关的QTLs（包括17全基因组显著相关的QTLs）。LG3、LG8和LG16上存在多个生长相关性状共享的QTL位点,并确定了几个重要的生长相关候选基因:raptor、pcyt2、exosc1、adcy3、eys和adgrb3。这些生长相关候选基因功能主要是参加调节细胞周期、细胞增殖、能量代谢和细胞内信号传导。

关键词：雌核生殖棕点石斑鱼遗传连锁图谱生长性状数量性状位点(QTL) 相关系数通径分析多元回归分析

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