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血清长链非编码rna表达水平与克罗恩病发生发展关系的探讨

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血清长链非编码RNA表达水平与克罗恩病发生发展关系的探讨

作者：芮琪杰安徽医科大学

学位级别：硕士

背景克罗恩病（Crohn’s disease,CD）是一种消化道慢性炎症性疾病,其发生发展的潜在的分子机制目前尚不清楚。本研究的目的是探索在克罗恩病中存在差异表达的长链非编码rna（long non-coding rnas,lnc rnas）及其可能影响克罗恩病发生... 详细信息

背景克罗恩病（Crohn’s disease,CD）是一种消化道慢性炎症性疾病,其发生发展的潜在的分子机制目前尚不清楚。本研究的目的是探索在克罗恩病中存在差异表达的长链非编码rna（long non-coding rnas,lnc rnas）及其可能影响克罗恩病发生发展的机制,并在克罗恩病患者外周血清中验证其是否表达及测定其表达水平。方法从基因表达综合（Gene Expression Omnibus,GEO）数据库中获得GSE67106和GSE83448的表达矩阵数据。在R中用betaqn包将数据标准化后,使用limma包鉴定差异表达的lnc rnas（differentially expressed lnc rnas,DELs）和差异表达的m rnas（differentially expressed messenger rnas,DEGs）。使用注释、可视化和集成发现数据库（database for the annotation,visualization and integrated discovery,DAVID）6.7和基因集富集分析（Gene Set Enrichment Analysis,GSEA）3.0分析基因本体论（Gene Ontology,GO）和京都基因和基因组百科全书（Kyoto Encyclopedia of genes and genomes,KEGG）途径。Lnc rnas-m rnas的共表达通过加权基因共表达网络分析（weighted gene co-expression network analysis,WGCNA）实现,并预测了与这些DELs和DEGs相关联的mi rnas（micro rnas,mi rnas）,最终建立了竞争性内源性rna（competing endogenous rna,ce rna）网络。结果在CD组和正常对照组样本之间共鉴定出42个DELs和551个DEGs。这些差异表达的m rna被富集到视黄醇代谢、肾素血管紧张素系统和成熟相关信号通路等途径中。通过WGCNA构建了lnc rna-m rna共表达网络,其中CDKN2B-AS（anril）、CTC-210G5.1.1、RP11-467L20.10.1、RP11-325F22.5.1和RP11-59E19.1.1为枢纽DELs。并与mi rna一起构建了ce rna网络,功能分析表明细胞刷状缘及质膜、脂蛋白的合成和转运及血管紧张素的成熟、代谢和血压的调控都参与了CD的进展。最终我们在临床标本中成功验证了一个lnc rna anril。然而,lnc rna anril参与CD发生发展的确切机制有待进一步探索。结论本研究表明lnc rna anril对CD的发生发展可以起到一定的预测作用,并可能成为一个潜在的新的治疗靶点。

关键词：克罗恩病基因共表达网络分析长链非编码RNA ANRIL

沉默lncrna anril对Ox-LDL诱导人脐静脉内皮细胞凋亡相关蛋白的影响

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中国病理生理杂志 2023年第3期39卷 528-533页

作者：高奋薛拴勤朱洁李虹温雯陈丽君李姚娜杨慧宇山西医科大学第二医院心内科山西太原030001

目的:探讨沉默长链非编码rna(lncrna)细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义rna(anril对氧化型低密度脂蛋白(Ox-LDL)诱导人脐静脉内皮细胞(HUVECs)凋亡相关蛋白的影响。方法:培养HUVECs,设置空白对照(control)组和不同浓度(25 mg/L、50 m... 详细信息

目的:探讨沉默长链非编码rna(lncrna)细胞周期蛋白依赖性激酶抑制剂2B反义rna(anril对氧化型低密度脂蛋白(Ox-LDL)诱导人脐静脉内皮细胞(HUVECs)凋亡相关蛋白的影响。方法:培养HUVECs,设置空白对照(control)组和不同浓度(25 mg/L、50 mg/L、100 mg/L)Ox-LDL诱导组,用RT-qPCR检测anril的表达量。采用小干扰rna(sirna)技术沉默anril基因表达,将sianril(anril基因沉默组)和siNC(沉默对照组)转入细胞内,培养24 h,再选择最佳Ox-LDL浓度(100 mg/L)干预24 h进行实验。用RT-qPCR检测转染anril干扰片段后人脐静脉内皮细胞中anril表达情况,Western blot检测BAX和BCL-2的相对表达量。结果:Ox-LDL干预组anril表达量较control组显著增高(Panril的表达越高(Panril干扰片段后,与control组相比较,Ox-LDL组、Ox-LDL+siNC组和Ox-LDL+sianril组anril的表达水平显著上调(Panril组anril的表达水平显著下调(Panril表达未见明显差异;与Ox-LDL+siNC组相比,Ox-LDL+sianril组anril的表达水平显著下降(Panril组BAX上调,BCL-2下调(Panril组BAX下调,BCL-2上调(Panril组BCL-2上调,BAX下调(Panril的表达量,使内皮细胞功能障碍,导致动脉粥样硬化的发生。沉默lncrna anril使BAX下调,BCL-2上调,减轻Ox-LDL诱导的HUVECs凋亡,抑制AS的进程。

关键词：氧化型低密度脂蛋白人脐静脉内皮细胞长链非编码RNA ANRIL 细胞凋亡

青藤碱通过anril/miR-626轴减轻MPP^+诱导的SK-N-SH细胞损伤

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中国病理生理杂志 2020年第8期36卷 1404-1412页

作者：霍颖浩王进殷立新河北医科大学第二医院神经内科河北石家庄050000 河北医科大学第二医院药学部河北石家庄050000

目的:探讨青藤碱(SN)对1-甲基-4-苯基吡啶离子(MPP^+)诱导的人神经母细胞瘤SK-N-SH细胞损伤的影响及作用机制,为探讨帕金森病的发病机制寻找线索。方法:用SN干预经MPP^+诱导的SK-N-SH细胞,采用ELISA法检测细胞培养上清液中丙二醛(MDA)... 详细信息

目的:探讨青藤碱(SN)对1-甲基-4-苯基吡啶离子(MPP^+)诱导的人神经母细胞瘤SK-N-SH细胞损伤的影响及作用机制,为探讨帕金森病的发病机制寻找线索。方法:用SN干预经MPP^+诱导的SK-N-SH细胞,采用ELISA法检测细胞培养上清液中丙二醛(MDA)和谷胱甘肽(GSH)的水平,流式细胞术检测细胞凋亡,Western blot检测细胞中Bcl-2和Bax蛋白的水平,RT-qPCR检测细胞中长链非编码RNA ANRIL和微小rna-626(miR-626)的水平。双萤光素酶报告基因实验验证anril和miR-626的调控关系。转染anril小干扰rna至SK-N-SH细胞,用上述相同方法观察抑制anril表达对MPP^+诱导的SK-N-SH细胞凋亡、Bax和Bcl-2蛋白表达及细胞培养上清液中MDA和GSH水平的影响。结果:MPP^+处理后,SK-N-SH细胞的凋亡率、Bax蛋白水平和anril表达水平升高(Panril表达后,MPP^+诱导的SK-N-SH细胞凋亡率、Bax蛋白水平和anril表达水平降低(Panril/miR-626通路减轻MPP^+诱导的SK-N-SH细胞损伤。

关键词：帕金森病青藤碱长链非编码RNA ANRIL 微小rna-626 氧化应激细胞凋亡

miR-199a-5p介导的lncrna anril通过调节HIF-1α促进多发性骨髓瘤的恶性增殖

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国际检验医学杂志 2022年第19期43卷 2357-2363页

作者：苏静绵阳市中心医院血液内科四川绵阳621000

目的探讨长链非编码rna(lncrna)anril在多发性骨髓瘤(MM)中的生物学功能及其可能的作用机制。方法采集MM患者与健康志愿者血浆,采用qRT-PCR检测lncrna anril、微小rna(miR)-199a-5p和低氧诱导因子-1α(HIF-1α)的相对表达水平。分析ln... 详细信息

目的探讨长链非编码rna(lncrna)anril在多发性骨髓瘤(MM)中的生物学功能及其可能的作用机制。方法采集MM患者与健康志愿者血浆,采用qRT-PCR检测lncrna anril、微小rna(miR)-199a-5p和低氧诱导因子-1α(HIF-1α)的相对表达水平。分析lncrna anril、miR-199a-5p和HIF-1α之间的靶向作用关系,进一步分析lncrna anril与miR-199a-5p表达及miR-199a-5p和HIF-1α表达的调控关系。敲减lncrna anril、miR-199a-5p和HIF-1α的mrna水平后,或者上调lncrna anril、miR-199a-5p和HIF-1α表达后,采用CCK-8测定U266细胞增殖活力,流式细胞术测定细胞凋亡率,Western blot检测Bax、Bcl-2、caspase3和caspase9蛋白表达。结果与健康志愿者相比,MM患者血浆lncrna anril和HIF-1α表达上调。miR-199a-5p在MM患者血浆中表达下调。此外,lncrna anril可与miR-199a-5p相互作用。HIF-1α被证实是miR-199a-5p的一个靶点。lncrna anril表达与HIF-1α表达呈正向调控,miR-199a-5p表达与HIF-1α表达呈负向调控。下调lncrna anril、HIF-1α或过表达miR-199a-5p可显著抑制细胞增殖,促进细胞凋亡。过表达lncrna anril通过调控miR-199a-5p促进U266细胞增殖。结论 miR-199a-5p介导的lncrna anril通过调节HIF-1α促进MM的恶性增殖。

关键词：长链非编码RNA ANRIL 微小rna-199a-5p 低氧诱导因子-1α 多发性骨髓瘤增殖

血清Lncrna anril水平对溃疡性结肠炎的诊断价值分析

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中国普外基础与临床杂志 2021年第11期28卷 1439-1444页

作者：王艳秋许丽丽江涛薛娟河南科技大学第一附属医院检验科河南洛阳471000 南通市妇幼保健医院遗传与生殖医学研究所江苏南通226000

目的探讨长链非编码RNA ANRIL(Lnc rna anril)在溃疡性结肠炎(UC)患者血清中的表达情况,并分析血清Lncrna anril水平对UC的诊断价值。方法回顾性收集2015年2月至2019年11月期间河南科技大学第一附属医院收治的143例UC患者,并选取同期河... 详细信息

目的探讨长链非编码RNA ANRIL(Lnc rna anril)在溃疡性结肠炎(UC)患者血清中的表达情况,并分析血清Lncrna anril水平对UC的诊断价值。方法回顾性收集2015年2月至2019年11月期间河南科技大学第一附属医院收治的143例UC患者,并选取同期河南科技大学第一附属医院的145例健康体检正常者为对照组。分析UC患者的血清Lncrna anril水平与PCT和IL-17水平的关系,并比较2组人群的血清Lncrna anril、PCT和IL-17水平,探索其对UC的诊断价值。结果143例UC患者的疾病程度:轻度41例、中度59例、重度43例;内镜分级:Ⅰ级38例、Ⅱ级65例、Ⅲ级40例。与对照组相比,UC组患者的血清Lncrna anril、PCT和IL-17水平均升高(Prna anril、PCT和IL-17水平均逐渐升高,不同疾病严重程度和内镜分级UC患者的血清Lncrna anril、PCT和IL-17水平两两比较差异均有统计学意义(Prna anril水平与PCT和IL-17水平均呈正相关(r=0.596,Prna anril水平诊断UC的曲线下面积(AUC)为0.851,截断值为1.29,此时灵敏度和特异度分别为75.5%及83.4%;血清Lncrna anril与PCT联合诊断UC的AUC为0.898,相应的灵敏度和特异度分别为81.8%和87.6%,诊断价值高于血清Lncrna anril单独诊断(Z=2.102、P=0.036)。结论UC患者的血清Lnc rna anril水平升高,具有一定的诊断价值,且联合PCT可更好地预测UC。

关键词：溃疡性结肠炎长链非编码RNA ANRIL 降钙素原诊断价值

血浆lncrna anril水平在高血压患者脑动脉硬化中的临床意义

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西部医学 2021年第6期33卷 906-909,913页

作者：王翀朱晓蕾黄嵘王晓云南京大学医学院附属鼓楼医院神经内科江苏南京210008

目的探讨血浆lncrna anril水平在高血压患者脑动脉硬化中的临床意义。方法选取2017年1月~2019年12月在我院就诊的218例高血压患者作为研究对象,将其中诊断为脑动脉硬化的89例患者设为高血压合并脑动脉硬化组(HBP/CAS),剩余129例患者设... 详细信息

目的探讨血浆lncrna anril水平在高血压患者脑动脉硬化中的临床意义。方法选取2017年1月~2019年12月在我院就诊的218例高血压患者作为研究对象,将其中诊断为脑动脉硬化的89例患者设为高血压合并脑动脉硬化组(HBP/CAS),剩余129例患者设为高血压组(HBP)。统计所有患者年龄、性别、体重指数(BMI)、腰围和臀围;生化仪检测血清甘油三酯(TG)、总胆固醇(TC)、低密度脂蛋白(LDL-C)、高密度脂蛋白(HDL-C)、血糖(GLU)及同型半胱氨酸(Hcy);RT-qPCR检测血浆lncrna anril水平;person法分析lncrna anril与各指标的相关性;多因素Logistic回归分析HBP/CAS的危险因素。结果HBP/CAS组和HBP组患者性别、BMI、腰臀比及血压均无差异(P>0.05);而相较于HBP组,HBP/CAS组患者年龄明显偏高(Prna anril水平明显升高(Prna anril与HBP/CAS的发生有关(Prna anril是引起HBP/CAS发生的独立危险因素(Prna anril与TC(r=0.7369,P0.05)。结论血浆lncrna anril水平升高是HBP患者发生CAS的独立危险因素,lncrna anril水平与TC和TG相关。

关键词：长链非编码RNA ANRIL 高血压脑动脉硬化总胆固醇甘油三酯