检索结果-南通市图书馆

作者：赵真南华大学

学位级别：硕士

细胞间通讯是指一个细胞发出的信号通过介质传递到另一个细胞并产生相应的反应。细胞之间有多种通讯方式,包括:1.化学信号分子传递,包括内分泌（endocrine）、旁分泌（paracrine）、自分泌（autocrine）和化学突触（chemical synapse）... 详细信息

细胞间通讯是指一个细胞发出的信号通过介质传递到另一个细胞并产生相应的反应。细胞之间有多种通讯方式,包括:1.化学信号分子传递,包括内分泌（endocrine）、旁分泌（paracrine）、自分泌（autocrine）和化学突触（chemical synapse）;2.细胞之间通过相邻表面分子的结合进行通讯,细胞之间可以直接接触,信号分子与受体都是细胞的跨膜蛋白;3.细胞与细胞外基质的粘着以及实现代谢偶联或电偶联等。细胞通讯网络是多细胞生物生长发育、分化,以及各种组织器官的形成、维持和相关生理活动协调的功能基础,是生物体内相关组织和细胞实现其生物学特定功能的关键,细胞通讯网络模型的构建对人们理解生物体内不同组织的生理机制和不同疾病的致病机制有着重要的意义,而在过去,传统的RNA-seq测序技术只能获得一个样本总体的基因表达情况,不能获得细胞内特异性细胞亚群的基因异质性表达信息,但是近些年来伴随着单细胞测序技术的出现和发展,人们可以相对轻松的获得组织内不同亚型的细胞的基因异质性表达信息,这使得人们有机会去详细探究不同细胞之间的详细通讯状态,从而更好的理解生物体不同生物学功能的实现机制。所以,近些年来如何通过单细胞测序数据来建立细胞间相互联系的通讯网络成为了生物信息学领域的热点研究领域,但是这些研究大多局限于简单的细胞配体和受体之间的相互作用,没有关注到受体激活后细胞可能会引起的一系列生化反应,没有将细胞通讯和细胞生物功能的实现关联起来。因此,本研究从对单细胞测序数据中显著表达的配体和受体分析入手,通过对测序数据中显著表达的配体和受体基因数据与中显著表达的功能通路的关联分析,来构建一个可以简单易用的细胞间通讯网络分析的web分析平台,从而为科研人员提供一个更加简单易用,稳定可靠的实现细胞通讯网络分析以及与细胞通讯相关的功能通路分析的方法。首先,我们整合了来自CellPhoneDB[1]和Fantom[2]一共3,057对经过实验验证的配体受体关系对,用于细胞间通讯网络的构建。接下来我们收集了来自于MsigDB[3]和Go term的共4838条功能通路,用于后续的功能通路激活分析以及信号集识别分析。然后,我们使用Django（版本号1.11.20）框架来建立我们的分析平台,我们使用Python（版本号2.7）程序语言来开发我们的平台,我们使用Mysql（版本号14.14）来储存用户的相关数据,我们的分析平台会自动筛选出基因表达矩阵中显著表达的配体和受体,同时将不同细胞之间的通讯联系使用Circos和Echart以可视化的方法返回给用户,然后我们的分析平台会分析与配体受体相关的基因通路的激活情况,然后将与细胞通讯高度相关的激活通路反馈给用户。除此之外,我们的分析平台还支持用户相关计算数据的上传和存储,用户的计算数据和结果将会被持久的保存在服务器上。最后,我们以自身免疫性脑脊髓炎（Experimental Autoimmune Encephlomyelitis,EAE）疾病期间的细胞通讯分析为例,详细介绍了分析平台的使用方法,以及疾病中细胞间通讯分析详细的流程,我们使用细胞间通讯分析平台详细分析了 EAE不同疾病阶段的单细胞转录组数据,提取了神经炎症不同阶段中显著表达的细胞间配体受体相互作用关系,并用这些配体受体相互作用关系构建了神经炎症期间不同细胞簇群构成的细胞间通讯网络,并进一步揭示了随着疾病的发展,不同细胞通讯模式的变化是如何影响细胞的分化和代谢,以及如何调控相关功能通路的激活的,系统的阐述了细胞间通讯影响神经炎症疾病进展的相关机制。

关键词：细胞通讯配体受体通路激活通讯网络

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维奈克拉治疗急性髓系白血病的耐药机制及应对策略

引用

中南药学 2024年第5期22卷 1291-1299页

作者：滕喆杨新宇中南大学湘雅医院长沙410008

急性髓系白血病(AML)是一类克隆性造血干细胞恶性肿瘤,治疗手段有限,死亡率高,但是近些年涌现多种靶向药物有望改善这一困境。2018年经FDA批准的维奈克拉(Venetoclax)极大地提高了AML患者的应答率。Venetoclax是一种BH3模拟物,它特异性... 详细信息

急性髓系白血病(AML)是一类克隆性造血干细胞恶性肿瘤,治疗手段有限,死亡率高,但是近些年涌现多种靶向药物有望改善这一困境。2018年经FDA批准的维奈克拉(Venetoclax)极大地提高了AML患者的应答率。Venetoclax是一种BH3模拟物,它特异性地抑制抗凋亡蛋白BCL-2,进而杀伤肿瘤细胞。然而,随着Venetoclax在AML中的广泛应用,其耐药问题逐渐显现。具体的耐药机制主要表现在肿瘤细胞中靶点蛋白BCL-2下调及其他非BCL-2抗凋亡蛋白上调、BCL-2家族中促凋亡蛋白下调及非依赖BCL-2家族蛋白的其他耐药机制。本综述将系统地阐述AML中Venetoclax耐药的分子机制,并总结靶向这些耐药机制的相关治疗策略的新进展。

关键词：维奈克拉耐药 BCL-2蛋白家族氧化磷酸化通路激活线粒体

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