检索结果-南通市图书馆

逆转录转座子LINE-1介导配子和胚胎发育异常的研究进展

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

中华生殖与避孕杂志 2023年第7期43卷 757-762页

作者：平昀鹭赵小萱冯晓玲黑龙江中医药大学研究生院哈尔滨150040 黑龙江中医药大学附属第一医院妇科二科哈尔滨150040

长散布核元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)是人类基因组中唯一自主转座的非末端重复序列逆转录转座子,能够复制并粘贴到基因组的新位点。为了确保进化成功,可遗传的新LINE-1插入物在携带遗传信息的生殖细胞和胚胎干... 详细信息

长散布核元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)是人类基因组中唯一自主转座的非末端重复序列逆转录转座子,能够复制并粘贴到基因组的新位点。为了确保进化成功,可遗传的新LINE-1插入物在携带遗传信息的生殖细胞和胚胎干细胞中积累。然而,早期胚胎发育中LINE-1抑制的减少可能会导致反转座子插入引起基因组突变,LINE-1 mRNA和蛋白质表达增加可能通过诱导胎儿卵母细胞消耗、DNA损伤与免疫炎症反应间接造成早期胚胎损伤乃至妊娠丢失。本文总结并分析了近年来关于LINE-1表观调控在配子发生及早期胚胎发育过程中的作用及其诱发早期自然流产的研究进展。

关键词：胚胎发育配子发生逆转录转座子长散布核元件-1 早期自然流产

基于茶树Ty3-gypsy逆转录转座子序列的IRAP分子标记开发及利用

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

分子植物育种 2022年第3期20卷 902-918页

作者：陈立佼蒋奇呈李红叶刘琨毅张正艳刘明丽赵明王苗云南农业大学龙润普洱茶学院昆明650201 云南农业大学云南省有机茶产业智能工程研究中心昆明650201 云南农业大学云南省高校智能有机茶园建设重点实验室昆明650201 云南农业大学西南中药材种质创新与利用国家地方联合工程研究中心昆明650201 云南省生态环境科学研究院土壤环境保护研究中心昆明650034

IRAP分子标记被广泛运用于植物物种间的鉴定及遗传多样性研究。为探究IRAP分子标记在茶树种质资源研究中的可行性,本研究采用通用引物成功扩增茶树Ty3-gypsy类型逆转录转座子逆转录酶序列,通过多态性及单倍型分析,评价其适于开发分子标... 详细信息

IRAP分子标记被广泛运用于植物物种间的鉴定及遗传多样性研究。为探究IRAP分子标记在茶树种质资源研究中的可行性,本研究采用通用引物成功扩增茶树Ty3-gypsy类型逆转录转座子逆转录酶序列,通过多态性及单倍型分析,评价其适于开发分子标记。基于相对保守区域设计并筛选的3对引物,采集自云南12个地区的65个不同类型的茶树种质资源材料通过PCR扩增获得带型稳定、多态性好、条带清晰的IRAP-PCR指纹图谱,其中筛选的26个IRAP标记在供试样本中具有100%多态性,可以有效区分茶树种质资源的采集地,也可对不同茶树类型的鉴定提供参考。本研究基于Ty3-gypsy逆转录转座子逆转录酶序列开发的IRAP分子标记可为茶树物种关系研究提供新的思路。

关键词：茶树逆转录转座子 IRAP分子标记逆转录酶遗传多样性

利用两类不同CRISPR：Cas12a和Cas13a对逆转录转座子的干预研究

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

利用两类不同CRISPR：Cas12a和Cas13a对逆转录转座子的干预研究

作者：张牛冰河南大学

学位级别：硕士

近年来,CRISPR已成为对抗外源逆转录病毒病原体和器官移植中灭活内源性逆转录病毒的重要且有前途的工具。CRISPR-Cas系统（clustered regularly interspaced short palindromic repeat-CRISPR-associated systems）是细菌及古生菌产生和进化的抵御外来遗传物质入侵的适应性免疫系统,通过形成cr RNA（CRISPR RNA）-效应蛋白复合物,识别并破坏特定的外源序列,比如噬菌体病毒和外源DNA,某些情况下为RNA。基于该系统的特性,现已开发出一系列高效的基因编辑工具,被广泛应用于对各宿主基因组进行编辑。CRISPR-Cas12a蛋白,属于CRISPR核酸内切酶家族的2类V型蛋白,缺乏HNH结构域,具有单个Ruv C核酸酶结构域和一个推定的Nuc结构域,分别负责两条DNA链的切割。Cas12a蛋白同时具有DNA和RNA核酸酶活性,可实现对多个基因的同时编辑,常在细菌、植物和哺乳动物细胞中调节异源DNA编辑。2类VI型CRISPR-Cas13效应蛋白,具有特异地靶向和切割单链RNA而不是双链DNA底物的独特能力。Cas13a蛋白含有两个高等真核生物和原核生物核苷酸结合（HEPN）结构域,其二元效应复合物在cr RNA引导下,作用于与原间隔序列互补的单链RNA。Cas13a-cr RNA复合物与靶标RNA结合后被激活,随后可在宿主细胞中切割非特异性的其它单链RNA,抑制宿主细胞的生长速率。目前一项研究发现,激活的Cas13a通过诱导被感染细胞的细胞生长停滞,为细菌宿主提供了一种“被动保护”机制,以此防御DNA噬菌体的侵染。这表明Cas13a除具有靶向和裂解RNA病毒的能力外,还可以使细菌细胞抵御DNA入侵者。总的来说,Cas12a和Cas13a效应子提供了一些独特的分子特征和CRISPR作用的新机制,使其实现了跨“中心法则”的基因操作,但目前尚未有利用二者干扰逆转录病毒进行的评估。逆转录转座子是由RNA介导转座的转座子元件,通过转录合成m RNA,再反转录合成新的DNA元件整合到基因组中以完成转座。Tf1是一种来自裂殖酵母（Schizosaccharomyces pombe）的逆转录转座子,编码一个长的多聚蛋白,其侧翼为385个碱基的长末端重复序列（LTRs）。LTR逆转录转座子和逆转录病毒在基因组结构、复制机制和生命周期等方面有许多共同的特征,二者都通过逆转录进行复制,并通过整合到宿主基因组中进行繁殖,在真核细胞中完成复制和跳跃。因此,LTR逆转录转座子可以作为研究逆转录病毒的一个有效模型。本研究首先在裂殖酵母菌株内开发了CRISPR-Cas12a基因编辑工具,构建了靶向酵母内源基因的基因编辑系统,并测试了不同亚种Cas12a蛋白的编辑效率;比较筛选出在裂殖酵母细胞内编辑效率较高Cas12a蛋白--新凶手弗朗西斯菌（Francisella novicida）来源的Fn Cas12a效应蛋白进行后续实验。然后通过将裂殖酵母中LTR逆转录转座子Tf1改造为模型系统,利用CRISPR-Cas12a和CRISPR-Cas13a蛋白分别干扰逆转座子Tf1的转座活动,并对两种不同的干扰机制进行了评估。研究表明Fn Cas12a蛋白对Tf1转座过程的DNA阶段进行靶向干扰,表现出强烈的抑制作用,但仍残留少许转座活性;我们猜测这些残留的转座活性可能是Tf1复制过程中RNA/c DNA中间产物在病毒样颗粒（virus-like particles,VLPs）中受到保护而持续存在的结果。因此,我们进一步构建了能使cr RNA长期存在的新菌株体,再次利用Fn Cas12a干扰逆转座,结果完全消除Tf1残留的转座活性。另一方面,我们发现将CRISPR-Cas13a靶向Tf1 RNA中间体也可以显著抑制Tf1的转座。但与细菌宿主不同,Tf1转录本对Cas13a的持续激活不会导致裂殖酵母细胞生长停滞,这表明病毒激活的Cas13a在真核细胞中触发的作用可能不同。综上,本研究深入了解了新型CRISPR机制在对抗逆转录病毒病原体中的作用,并为开发治疗逆转录病毒相关疾病的新策略建立了系统参数。

关键词： CRISPR-Cas12a CRISPR-Cas13a 逆转录转座子逆转录病毒基因编辑

N^(6)-腺苷甲基化修饰及其对LINE-1的调控机制

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

遗传 2024年第3期46卷 209-218页

作者：张傲岑山李晓宇中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所免疫生物学室北京100050

长散布元件-1(long interspersed elements-1,LINE-1)是现今在人类基因组中唯一具有自主转座能力的转座子,其转座会引起细胞基因组结构和功能的改变,是导致多种严重疾病的重要因素。在转座过程中,LINE-1 mRNA是转座中间体的核心,宿主细... 详细信息

长散布元件-1(long interspersed elements-1,LINE-1)是现今在人类基因组中唯一具有自主转座能力的转座子,其转座会引起细胞基因组结构和功能的改变,是导致多种严重疾病的重要因素。在转座过程中,LINE-1 mRNA是转座中间体的核心,宿主细胞对其进行相关修饰直接影响转座。N^(6)-腺苷甲基化修饰(m^(6)A)是真核细胞RNA上最丰富且动态可逆的表观遗传修饰。目前发现m^(6)A修饰也存在于LINE-1 mRNA上,参与LINE-1整个生命周期的调控,影响其转座和基因组中LINE-1相邻基因的表达,进而影响基因组稳定性、细胞自我更新与分化潜能,在人类发育和疾病中具有重要作用。本文介绍了LINE-1 m^(6)A修饰的位置、功能以及相关机制,并总结了LINE-1的m^(6)A修饰对其转座调控的研究进展,以期为相关疾病发生发展的机制研究和治疗提供新的思路。

关键词： m^(6)A修饰逆转录转座子 LINE-1 基因组基因组稳定性

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

SLFN14抗LINE-1分子机制研究

遗传 2020年第7期42卷 669-679页

作者：毛洋丁寄葳陈淑敏岑山李晓宇中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所免疫生物学室北京100050

长散在核重复序列1 (long interspersed nuclear element-1, LINE-1)是迄今为止发现的人体基因组中唯一具有自主转座活性的逆转录转座子,其转座常引起宿主基因组不稳定,从而导致包括癌症在内的各种严重基因疾病的发生。宿主因子在宿主抗... 详细信息

长散在核重复序列1 (long interspersed nuclear element-1, LINE-1)是迄今为止发现的人体基因组中唯一具有自主转座活性的逆转录转座子,其转座常引起宿主基因组不稳定,从而导致包括癌症在内的各种严重基因疾病的发生。宿主因子在宿主抗LINE-1转座中发挥着重要作用。宿主因子SLFN14作为免疫系统重要组成员,具有抗病毒活性。本实验室研究发现SLFN14对于LINE-1的转座具有抑制作用。为进一步探究其具体的作用机制,通过对LINE-1复制周期中的转录、翻译、逆转录、整合环节进行实验分析,证实SLFN14能够通过影响LINE-1 mRNA转录过程及其半衰期,降低LINE-1 mRNA的水平,从而影响LINE-1蛋白及cDNA表达水平,最终导致LINE-1复制受阻。同时,通过对SLFN14活性中心的定位,本研究还发现SLFN14的抗LINE-1活性与其核糖核酸内切酶结构域和核糖体结合结构域密切相关。上述研究结果展示了SLFN14调控LINE-1复制的机制,进一步完善了宿主因子调控网络,为控制因LINE-1复制引起的基因组不稳定提供了新思路。

关键词：转座逆转录转座子 LINE-1 SLFN14 5’-UTR内部启动子区

灵长类动物限制性因子SAMHD1的生物学功能分析

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

吉林大学学报（医学版） 2019年第3期45卷 484-490,I0001页

作者：李爽郭浩然魏伟吉林大学第一医院转化医学研究院艾滋病与病毒研究所

目的:探讨不同灵长类动物限制因子不育-α-基序结构域和组氨酸/天冬氨酸残基双联体结构域包涵蛋白1 (SAMHD1)的抗病毒、抑制逆转录转座子LINE-1和减弱干扰素(IFN)产生信号通路等作用,为灵长类动物SAMHD1的研究提供依据。方法:构建稳定... 详细信息

目的:探讨不同灵长类动物限制因子不育-α-基序结构域和组氨酸/天冬氨酸残基双联体结构域包涵蛋白1 (SAMHD1)的抗病毒、抑制逆转录转座子LINE-1和减弱干扰素(IFN)产生信号通路等作用,为灵长类动物SAMHD1的研究提供依据。方法:构建稳定表达不同灵长类动物SAMHD1蛋白的U937细胞系,以空载体构建的细胞作为阴性对照组,以稳定表达不同灵长类动物SAMHD1蛋白的U937细胞系为实验组。经佛波酯(PMA)刺激分化成巨噬样细胞后,流式细胞术分析各组HIV-1病毒感染率。以单独转染SAMHD1表达质粒的HEK293T细胞为对照组,共同转染SAMHD1与HIV-2/SIV Vpx表达质粒的细胞为实验组,转染后48h收获细胞,采用Western blotting法检测SAMHD1蛋白表达水平,免疫荧光检测法观察不同SAMHD1蛋白的细胞内定位。以单独转染LINE-1-GFP报告质粒的HEK293T细胞作为对照组,以共同转染LINE-1-GFP与SAMHD1表达质粒的细胞为实验组,采用流式细胞术检测GFP阳性细胞率,代表SAMHD1对LINE-1转座子的活性。以单独转染IFN-luc报告质粒的HEK293T细胞为对照组,共同转染IFN-luc和SAMHD1表达质粒的细胞为实验组,采用化学发光仪检测HEK293T细胞中荧光素酶的表达水平。结果:与阴性对照组比较,灵长类动物SAMHD1稳定表达的实验组HIV-1病毒感染率明显降低(P转座子活性降低(P逆转录转座子LINE-1以及拮抗天然免疫系统产生IFN的作用。

关键词：灵长类动物限制因子不育-α-基序结构域和组氨酸/天冬氨酸残基双联体结构域包涵蛋白1 逆转录病毒逆转录转座子 Vpx

野大豆种群转座子和转录因子的多样性和分子适应

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

植物生态学报 2007年第5期31卷 952-959页

作者：胡志昂姜国强邓馨王洪新中国科学院植物研究所北京100093

对环境变化的适应机理一直是进化生物学和生态学长期争论的核心课题。根据适应逆境的生态学和分子生理的最新进展,设想逆境诱导转座子的转座,影响转录因子的表达,随即改变一系列抗性基因的表达水平,抗性种群快速适应形成;由此可能建立... 详细信息

对环境变化的适应机理一直是进化生物学和生态学长期争论的核心课题。根据适应逆境的生态学和分子生理的最新进展,设想逆境诱导转座子的转座,影响转录因子的表达,随即改变一系列抗性基因的表达水平,抗性种群快速适应形成;由此可能建立一个统一的进化理论。从黄河入海口野生大豆(Glycine soja)盐渍种群植株DNA扩增到一段干旱应答元件结合蛋白基因(DREB)序列,称为GsDREB1。克隆了一个全长的类Gypsy逆转录转座子整合酶基因序列,称为GsINT。种群内各植株该序列有多个拷贝,植株间存在限制片段长度多态性。根据所得的这两个序列,设计并合成包括GsINT 5′上游保守序列的Gs-1等若干引物,试图检测野大豆基因组中GsDREB1的5′上游是否存在逆转录转座子整合酶序列。将GsDREB1标记为探针,Southern杂交表明用Gs-1为正向引物GmDR1为逆向引物所扩增的产物既是多拷贝而又与GsDREB1高度同源。这一对引物扩增和部分测序的结果暗示逆转录转座子有的插入DREB的5′上游,种群内外植株间显现两基因间隔长度的多样性。据此提出抗性种群形成即适应进化分子机理的下列假说。正常种群主要由非抗性普通植株组成。当环境发生变化处于逆境条件时,种群内植株转座频率大大增加。转座子非定向地插入基因组。多数突变中性,不影响表型。少数插入到转录因子的5′上游或其编码区,可促进或阻抑其表达,由此引发转录因子所控制的抗性基因网络表达的增加或减少,抗性相应增加或降低。总的结果是在短时间内就能积累包括高抗性植株在内的有各种抗性水平的个体;对逆境敏感的个体不断地被自然选择所淘汰,但逆境不断诱导其产生,少数植株有可能利用逆境减弱的较短时间完成发育得以生存下来。此假说可以解释逆境条件下的植物种群为什么能快速形成而有更高的遗传多样性;又为什么抗性种群在高抗性植株产生的同时有时存在敏感植株。逆境促进的转座改变转录因子基因表达可能是植物生理和形态快速进化的一般分子机理。

关键词：野大豆逆转录转座子转录因子逆境分子适应

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

piRNA抑制基因转座的分子机制

遗传 2018年第6期40卷 445-450页

作者：刘启鹏安妮岑山李晓宇中国医学科学院&北京协和医学院医药生物技术研究所免疫生物学室北京100050

转座子是一类可以在染色体上或不同染色体间自由移动的DNA。在高等生物中,处于活跃状态的转座子多为通过RNA中间体进行转座的逆转录转座子。由于逆转录转座子在细胞基因组中占有很高的比例,它的频繁转座能引起细胞基因组结构和功能的改... 详细信息

转座子是一类可以在染色体上或不同染色体间自由移动的DNA。在高等生物中,处于活跃状态的转座子多为通过RNA中间体进行转座的逆转录转座子。由于逆转录转座子在细胞基因组中占有很高的比例,它的频繁转座能引起细胞基因组结构和功能的改变,导致癌症等严重基因疾病的发生,因此宿主细胞在长期的进化中形成了多种自我保护机制用以控制逆转录转座子活性。属于非编码小RNA的piRNA以其独特的机制在转录及转录后水平控制逆转录转座子RNA中间体的产生,抑制了逆转录转座过程的发生。本文总结了近年来piRNA控制转座子转座相关分子机制的研究进展,以期为转座子及基因调控方面的研究工作提供一些参考。

关键词：转座子逆转录转座子非编码小干扰RNA piRNA

菠菜YY550 Copia全长的克隆及染色体定位

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

基因组学与应用生物学 2020年第12期39卷 5684-5688页

作者：李晓月孟自伟陶敏杰李书粉李宁高武军邓传良河南师范大学生命科学学院新乡453007

菠菜(Spinacia oleracea L.)是一种重要的雌雄异株植物,是研究植物性染色体演化的重要模式材料。逆转录转座子在植物性染色体演变过程中起着重要的作用,而有关其在菠菜性染色体演化中的作用未见报道。本研究以菠菜根尖为材料,制备中期... 详细信息

菠菜(Spinacia oleracea L.)是一种重要的雌雄异株植物,是研究植物性染色体演化的重要模式材料。逆转录转座子在植物性染色体演变过程中起着重要的作用,而有关其在菠菜性染色体演化中的作用未见报道。本研究以菠菜根尖为材料,制备中期分裂相的染色体制片,借助荧光原位杂交技术对逆转座子YY550 Copia在菠菜染色体上的定位进行探讨。结果显示,YY550 Copia逆转录转座子在染色体上呈点状分布,在染色体的长、短臂均有分布,荧光信号在性染色体与常染色体上未见到明显差异。本研究为探讨逆转录转座子在菠菜性染色体演化的作用提供了一定的理论依据。

关键词：菠菜逆转录转座子染色体定位荧光原位杂交