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蜜橘CcHY5的克隆及其对果实转色功能的研究

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园艺学报 2024年第5期51卷 939-955页

作者：邓淑芳刘倩刘玲陈鸥王文军曾凯芳邓丽莉西南大学食品科学学院重庆400715 西南大学食品贮藏与物流研究中心重庆400715

蜜橘果实在25℃贮藏可加速转色,而在32℃则抑制转色。以这两个温度下贮藏的蜜橘果皮为材料,挖掘到对叶绿素代谢具有显著影响的关键转录因子CcHY5。对CcHY5的结构特征进行了分析,并利用农杆菌EHA105介导的瞬时过表达体系,分别在烟草叶片... 详细信息

蜜橘果实在25℃贮藏可加速转色,而在32℃则抑制转色。以这两个温度下贮藏的蜜橘果皮为材料,挖掘到对叶绿素代谢具有显著影响的关键转录因子CcHY5。对CcHY5的结构特征进行了分析,并利用农杆菌EHA105介导的瞬时过表达体系,分别在烟草叶片和蜜橘果实上对该转录因子基因功能进行了深入研究。结果显示,CcHY5全长为507 bp,编码168个氨基酸,与拟南芥AtHY5同源性较高,其启动子区域具有光响应元件、脱落酸响应元件及生长素响应元件等各类响应元件,亚细胞定位于细胞核,具有转录激活活性。烟草叶片瞬时过表达CcHY5后出现了明显黄化现象,且在25℃下黄化速度较32℃更快。蜜橘果皮瞬时过表达CcHY5后在注射孔附近发生了明显转色,而阴性对照依然保持绿色,与阴性对照相比,不同温度下果皮中CcHY5均显著上调表达,但32℃下表达量较25℃显著降低。瞬时过表达后的烟草叶片和蜜橘果皮中叶绿素及其代谢产物(叶绿素a、叶绿素b、脱镁叶绿酸甲酯a、脱镁叶绿酸甲酯b及脱镁叶绿素a)含量显著降低,而蜜橘果皮中类胡萝卜素及其代谢产物含量与阴性对照无显著差异。瞬时过表达后的蜜橘果皮中叶绿素循环基因CcCHL1、CcCHL2和CcCHL3的表达受到不同程度抑制,叶绿素降解代谢基因CcNYC和CcRCCR的表达显著上调。综上,适宜温度(25℃)下CcHY5可能通过促进蜜橘果皮中叶绿素降解,加速其转色进程。

关键词：蜜橘 HY5转录因子叶绿素功能转色贮藏温度

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香菇菌丝后熟转色的转录组分析

菌物学报 2022年第2期41卷 260-273页

作者：储婷尚俊军管婉杨瑞恒鲍大鹏唐利华上海海洋大学食品学院上海201306 国家食用菌工程技术研究中心农业部南方食用菌资源利用重点实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403

香菇是世界第二大栽培食用菌,其菌丝后熟转色是其特有的栽培过程,并对其产量和品质至关重要。为了进一步了解香菇后熟转色形成的机制,本研究利用Illumina二代高通量测序平台,对初始未转色菌丝(LE118)、光照下转色菌丝(LE313C)、黑暗下... 详细信息

香菇是世界第二大栽培食用菌,其菌丝后熟转色是其特有的栽培过程,并对其产量和品质至关重要。为了进一步了解香菇后熟转色形成的机制,本研究利用Illumina二代高通量测序平台,对初始未转色菌丝(LE118)、光照下转色菌丝(LE313C)、黑暗下未转色菌丝(LE313W)进行转录组测序,以香菇单核体W1-26基因组为参考基因组进行转录组有参分析,共鉴定出2215个差异表达基因,LE313C比LE118、LE313C比LE313W、LE313W比LE118中分别有1216、1507、1054个基因差异表达。GO富集分析表明,差异表达基因显著富集碳水化合物代谢过程、氧化还原酶活性、水解酶活性、过氧化物酶活性等。KEGG分析发现芳香族化合物的降解在LE313C比LE313W中被显著富集。在LE313C比LE118即香菇菌丝后熟转色发育过程中,筛选出关键差异表达基因包括糖苷酶、疏水蛋白、P450、漆酶、谷氨酸脱氢酶等,表明这些差异基因在香菇菌丝的后熟转色中可能行使重要的生物功能。本研究为进一步研究香菇菌丝后熟及转色形成的机理提供了重要依据。

关键词：香菇转色转录组基因差异表达

新郁葡萄在渭南地区的表现及周年管理技术要点

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果农之友 2024年第6期 20-22页

作者：王金锋王录俊樊晓锋李蕊朱盼盼渭南葡萄研究所陕西渭南714000

新郁是由新疆维吾尔自治区葡萄瓜果研究所以红地球实生苗为母本、里扎马特为父本杂交育成的大粒红色葡萄品种(图1),欧亚种,中熟品种。该品种生长势较强,萌芽力和成枝力中等,易成花,较丰产,果粒易日灼,抗寒性差,多雨年份转色至成熟期有... 详细信息

新郁是由新疆维吾尔自治区葡萄瓜果研究所以红地球实生苗为母本、里扎马特为父本杂交育成的大粒红色葡萄品种(图1),欧亚种,中熟品种。该品种生长势较强,萌芽力和成枝力中等,易成花,较丰产,果粒易日灼,抗寒性差,多雨年份转色至成熟期有轻微裂果[1],宜采用设施栽培。

关键词：中熟品种设施栽培成枝力萌芽力欧亚种日灼生长势转色

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利用转录组分析光照对金耳子实体转色的影响

食用菌学报 2023年第6期30卷 12-27页

作者：沈真辉罗祥英赵仙伟李梦杰曹瑶杨林雷陆青青李荣春云南菌视界生物科技有限公司云南省级(珍稀食用菌)企业工程技术中心昆明市级(食用菌)企业工程技术中心云南昆明650200 云南农业大学食用菌研究所云南昆明650201

以生长在黑暗、白光、蓝光下的金耳(Naematelia aurantialba)子实体为材料,利用转录组分析光照对金耳子实体转色的影响。差异表达基因分析结果表明:白光诱导的转色子实体与黑暗处理的未转色子实体相比,差异表达基因总数为1 797个(1 308... 详细信息

以生长在黑暗、白光、蓝光下的金耳(Naematelia aurantialba)子实体为材料,利用转录组分析光照对金耳子实体转色的影响。差异表达基因分析结果表明:白光诱导的转色子实体与黑暗处理的未转色子实体相比,差异表达基因总数为1 797个(1 308个上调,489个下调);蓝光诱导的转色子实体与黑暗处理的未转色子实体相比,差异表达基因总数为1 617个(1 056个上调,561个下调);蓝光诱导的转色子实体和白光诱导的转色子实体相比,差异表达基因总数为152个(74个上调,78个下调)。GO功能富集分析表明:与黑暗处理未转色子实体相比,蓝光或白光诱导的转色子实体中大部分差异表达基因上调,且主要富集在翻译、肽类代谢、核糖体结构成分、结构分子活性等过程;蓝光和白光诱导的子实体中,差异表达基因主要富集在呼吸调控、跨膜运输及膜组分等相关过程。KEGG代谢途径富集分析表明:参与核糖体、氨基酸生物合成及2-氧羧酸代谢等途径的相关基因在子实体转色过程中大部分上调表达。根据KEGG代谢途径富集分析,筛选到9条与类胡萝卜素生物合成、核黄素代谢等相关的色素代谢途径及差异表达基因。从蓝光和黑暗比较组中的类胡萝卜生物合成途径、核黄素代谢及其与色素合成相关的上游代谢途径中筛选出9个上调差异表达基因进行qRT-PCR验证,结果显示9个基因表达趋势与转录组结果一致。研究结果可为金耳子实体转色机制解析、关键功能基因挖掘及栽培过程中的光照调控提供参考。

关键词：金耳转录组光质转色差异表达基因 GO功能荧光定量PCR

基于广泛靶向代谢组学的‘品丽珠’葡萄转色中果皮差异代谢物分析

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中外葡萄与葡萄酒 2023年第5期 20-26页

作者：丁亭亭苏东平杜宜龙陈景辉赵红军孙磊王鹏飞山东省葡萄研究院山东济南250100 烟台科技学院山东烟台265600 蓬莱国宾葡萄酒庄有限公司山东烟台265600 中粮长城葡萄酒(蓬莱)有限公司/山东省酿酒葡萄与葡萄酒技术创新中心山东烟台265600 北京市农林科学院林业果树研究所北京100093 农业农村部华东都市农业重点实验室山东济南250100

以‘品丽珠’葡萄转色前约4周(S1)、转色前约1周(S2)、转色前期(S3)果皮为试材,通过广泛靶向代谢组学分析葡萄果皮代谢物组分及变化。结果表明,S1果皮的代谢组成分有394种,S2果皮的代谢组成分有401种,S3果皮的代谢组成分有397种,3个取... 详细信息

以‘品丽珠’葡萄转色前约4周(S1)、转色前约1周(S2)、转色前期(S3)果皮为试材,通过广泛靶向代谢组学分析葡萄果皮代谢物组分及变化。结果表明,S1果皮的代谢组成分有394种,S2果皮的代谢组成分有401种,S3果皮的代谢组成分有397种,3个取样期果皮中共检测出29类416种代谢物,其中373种为三者共有;转色过程中3个比较组果皮差异代谢物分别为32个(S1 vs S2)、195个(S1 vs S3)和186个(S2 vs S3),其中共有差异代谢物20个。通过KEGG富集分析显示,S1 vs S2差异代谢物主要涉及类黄酮的生物合成、次生代谢物的生物合成、二苯乙烯、二芳基庚酸类和姜酚合成、半胱氨酸和蛋氨酸代谢和异黄酮的生物合成等通路;S1 vs S3差异代谢物主要涉及代谢途径、次生代谢物、花青素和氨基酸的生物合成等通路;S2 vs S3差异代谢物主要涉及代谢途径、异黄酮、花青素和氨基酸的生物合成等通路。

关键词：品丽珠转色果皮差异代谢物广泛靶向代谢组学分析

反式-2-己烯醛（E2H）对番茄转色期质体转化的调控作用

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反式-2-己烯醛（E2H）对番茄转色期质体转化的调控作用

作者：刘晶晶江西农业大学

学位级别：硕士

番茄中富含维生素C、碳水化合物和类胡萝卜素等营养物质,深受广大消费者的喜爱。番茄果实的色泽一方面标志着番茄果实的成熟,另一方面是重要的外观品质指标,直接影响着番茄的商品价值。番茄转色过程中会发生复杂的生理变化,包括叶绿体... 详细信息

番茄中富含维生素C、碳水化合物和类胡萝卜素等营养物质,深受广大消费者的喜爱。番茄果实的色泽一方面标志着番茄果实的成熟,另一方面是重要的外观品质指标,直接影响着番茄的商品价值。番茄转色过程中会发生复杂的生理变化,包括叶绿体转变为有色体,类胡萝卜素大量积累,膜质结构变化和脂肪酸组分发生改变等。目前,对于番茄转色过程中质体转化的生理调节机制尚不清楚。我们推测E2H可能是一种重要的细胞调节因子,加速番茄由叶绿体向有色体的转化进程,改变了番茄膜脂结构,抑制番茄类胡萝卜素的积累,从而抑制番茄转色。普通小球藻在结构和功能上与番茄质体相似,因此选择普通小球藻模拟番茄质体结构。本文拟以普通小球藻模拟番茄质体和直接以番茄质体为研究对象,对它们的色素、超微结构、脂肪酸组分、脂肪酸和色素相关基因和番茄中与质体转化相关挥发性物质进行分析,探究E2H对番茄转色期质体转化的调控作用,以期证明上述推论,为番茄质体转化调控机制提供理论基础。主要研究结果如下:1.E2H对小球藻色素合成和积累的影响并不是直接作用于色素,而是通过重构内膜结构,影响内膜色素含量,使小球藻由绿转黄,抑制小球藻的生长。E2H处理后,小球藻色素含量显著低于对照组,而在6h,低浓度E2H处理组叶黄素含量显著低于高浓度处理组。低浓度E2H处理后小球藻内膜系统变得松散、无规则,部分内膜结构出现分离、断层等现象,但未影响小球藻色素合成;高浓度E2H处理后小球藻核区及内膜系统崩塌、溶解,整个细胞呈死亡状态。低浓度E2H处理主要降低了十六碳二烯酸(C16:1)和亚油酸(C18:2n6c)的含量,分别降低了36.1%和22.8%;高浓度E2H处理后棕榈酸(16:0)、十六碳三烯酸(C16:3)、亚麻酸(C18:3n3)和二十碳五烯酸(C20:5n3)的含量降低。低浓度E2H处理后,脂肪酸生物合成相关基因acc D相对表达量在6h较对照组提高了2.5倍,高浓度E2H处理后提高了1倍,之后总体上相对表达量下降。psa A和psb E相对表达量变化趋势与acc D相似。pet A、pet B、pet D和pet G四种与色素相关基因相对表达量较对照组均显著下降。以上结果表明,E2H通过影响小球藻内膜系统,进而影响色素含量,抑制小球藻的生长。2.E2H影响番茄质体内膜结构,使番茄色素合成、转运和储存受阻,抑制了番茄转色。E2H处理抑制番茄质体叶绿素含量下降和番茄红素的增加,高浓度E2H处理效果更加明显。低浓度E2H处理后,番茄质体内膜系统模糊看不出纹理,色泽分布不均,透射电镜可观察到管状结构和质体小球等结构,叶绿体转变为有色体。高浓度E2H处理后,质体已被完全破坏,色素沉积物散落在视野内。E2H处理后番茄质体结构性脂肪酸豆蔻酸(C14:0)、棕榈酸(C16:0)和硬脂酸(C18:0)以及油酸(C18:1n9c)等含量均显著低于对照组,而亚油酸(C18:2n6c)和亚麻酸(C18:3n3)含量显著高于对照组。E2H处理后,acc D、psa A和psb B相对表达量总体下降。低浓度E2H处理后,6h时色素相关基因pet G和ccs A相对表达量分别下调37.3%和38.7%;高浓度E2H处理后,6h时色素相关基因pet G和ccs A相对表达量分别下调29.3%和42.7%。以上结果显示,E2H对番茄质体膜脂结构产生影响,,进而影响番茄质体色素变化,抑制了番茄转色。3.E2H通过调控番茄质体内膜系统,抑制番茄转色,进而对脂肪酸和色素衍生挥发性物质造成影响。低浓度E2H处理后,脂肪酸衍生挥发性物质内源(E)-2-己烯醛、(E)-2-己烯-1-醇和正己醛含量显著低于6h对照组,而(E)-2-戊烯醛和1-戊烯-3-酮含量则显著上升,与脂肪酸衍生挥发性物质形成相关基因HPL相对表达量显著低于6h对照组,脂肪酸分解相关基因LOXC相对表达量显著增加,番茄转色关键基因OR相对表达量显著下调。低浓度E2H处理后,番茄红素分解直接产物6-甲基-5-庚烯-2-酮含量显著低于6h对照组,位于番茄红素上游基因PSY和PDS相对表达量也显著低于6h对照组。低浓度E2H处理后,(E)-2-乙酸含量较6h对照组增加了27.3倍。以上结果表明,E2H处理可诱发番茄细胞保护机制,它通过调控番茄质体内膜系统,抑制番茄转色,进而对脂肪酸和色素衍生挥发性物质产生影响。

关键词：番茄质体转色反式-2-己烯醛调控作用

香菇菌丝转色过程中黑色素积累及合成途径的研究

同方学位论文库评论

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香菇菌丝转色过程中黑色素积累及合成途径的研究

中国菌物学会2023年学术年会

作者：杜金茹王守现严冬高琪范阳阳余知和刘宇北京市农林科学院植物保护研究所北京市食用菌工程技术研究中心长江大学生命科学学院

香菇菌丝转色是决定栽培香菇产量和品质的关键因素之一,弄清菌丝转色过程中黑色素主要合成途径、关键基因功能和细胞定位,对于解析香菇菌丝转色机理具有重要意义。本研究基于全基因组比对分析黑色素主要合成途径,发现香菇缺少庚烯酮水... 详细信息

香菇菌丝转色是决定栽培香菇产量和品质的关键因素之一,弄清菌丝转色过程中黑色素主要合成途径、关键基因功能和细胞定位,对于解析香菇菌丝转色机理具有重要意义。本研究基于全基因组比对分析黑色素主要合成途径,发现香菇缺少庚烯酮水解酶基因、小柱孢酮脱水酶基因和对羟苯丙酮酸双加氧酶基因,推测香菇菌株不存在典型的DHN-黑色素和脓黑色素合成途径,但可以合成DOPA黑色素、GHB黑色素、PAP黑色素和儿茶酚黑色素。此外,酪氨酸酶、多聚酮合成酶和漆酶等黑色素合成相关基因与香菇栽培转色过程密切相关。前人通过转录组分析发现多聚酮合成酶在香菇菌丝转色过程中表达量上调,并且漆酶基因LeLcc1的超量表达也会使得香菇菌丝的转色速度加快,但是目前对于香菇菌丝转色过程中酪氨酸酶基因功能的研究并不透彻。我们对其进行生物信息学分析发现酪氨酸酶基因编码蛋白为稳定的亲水蛋白,含有2个与酪氨酸酶催化活性相关的铜离子结构域且定位在细胞质。为了更直观的了解黑色素的细胞定位,我们通过电子显微镜对香菇菌丝中黑色素进行了定位观察。结果表明香菇菌丝转色过程中,高电子密度物质(黑色素)依次在细胞质、细胞壁和细胞间质等部位大量积累,直至充满整个细胞,表明黑色素的积累位置和积累量与菌丝转色程度直接相关。同时,转色期细胞中自噬体和自噬性溶酶体的存在暗示细胞自噬参与了香菇菌丝转色的过程。该研究结果为香菇黑色素合成遗传基础、菌丝转色机理及影响因素研究提供了重要参考。

关键词：香菇转色黑色素细胞定位合成途径关键基因

来源： cnki会议评论

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cnki会议

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光诱导香菇菌丝转色阶段的转录因子表达分析

菌物学报 2016年第9期35卷 1106-1116页

作者：唐利华鲍大鹏万佳宁李燕王莹谭琦国家食用菌工程技术研究中心农业部应用真菌资源与利用重点开放实验室上海市农业遗传育种重点开放实验室上海市农业科学院食用菌研究所上海201403

转录因子在真菌环境响应及生理过程中发挥重要的调节作用。本文利用转录组测序(RNA-Seq)技术研究光诱导香菇菌丝转色过程中的转录因子表达变化。转录组测序结果表明,在光照条件下转色的菌丝(313C)与黑暗条件下未转色的菌丝(313W)相比,... 详细信息

转录因子在真菌环境响应及生理过程中发挥重要的调节作用。本文利用转录组测序(RNA-Seq)技术研究光诱导香菇菌丝转色过程中的转录因子表达变化。转录组测序结果表明,在光照条件下转色的菌丝(313C)与黑暗条件下未转色的菌丝(313W)相比,香菇菌丝中共有68个转录因子基因表达发生变化(48个转录因子上调表达,20个转录因子下调表达);转色的菌丝(313C)与初始未转色的菌丝(118)相比,香菇菌丝中有80个转录因子基因表达发生变化(49个转录因子上调表达,31个转录因子下调表达)。这些差异表达的转录因子包括WD40、MADS-box、MYB和GATA等家族。另外,样品的两两比较中差异表达的转录因子既存在部分重叠,也表现特异性。其中,313C/313W中有14个特异性差异表达转录因子,313C/118中有26个特异差异表达的转录因子。重叠的转录因子有64个,其中有39个表达水平上调,15个表达水平下调。采用实时荧光定量PCR对几个转录因子进行了表达检测,其中部分转录因子的表达趋势与转录组分析基本相同。这些数据为进一步研究香菇转色的转录调控奠定了一定的基础。

关键词：香菇转色光线转录因子高通量测序

秋延迟番茄果实膨大期常见问题及对应管理技术

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河南农业 2024年第1期 25-25页

作者：孙潇泌阳县农业技术推广站

番茄果实进入膨大期后,其植株对营养的需求愈加旺盛,植株负担加重,这导致其抗逆性下降,一些问题也随之而来,主要表现为早衰、死棵、叶部病害和青皮果等。对此,种植户要高度重视,采取有针对性的管理技术进行防治。一、养护根系防早衰保... 详细信息

番茄果实进入膨大期后,其植株对营养的需求愈加旺盛,植株负担加重,这导致其抗逆性下降,一些问题也随之而来,主要表现为早衰、死棵、叶部病害和青皮果等。对此,种植户要高度重视,采取有针对性的管理技术进行防治。一、养护根系防早衰保护地番茄进入膨果期后,黄叶现象较为常见,叶片黄化后,由于其制造有机营养的能力趋弱,植株就会早衰,进而影响果实的正常膨大和转色。

关键词：果实膨大期有机营养叶片黄化叶部病害番茄果实转色种植户早衰