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林麝（Moschus berezovskii）人工驯养调研及其香腺组织转录组测序分析

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林麝（Moschus berezovskii）人工驯养调研及其香腺组织转录组测...

作者：张进西北农林科技大学

学位级别：硕士

野生林麝是国家一级保护动物,主要分布在陕西、四川等省市的山区中。雄性林麝香腺分泌的麝香为四大动物香料之首,也是一种名贵的中药材,具有很高的药用价值和经济价值。由于其栖息地遭到破坏,加上滥捕滥杀,野生林麝数量和麝香产量急剧... 详细信息

野生林麝是国家一级保护动物,主要分布在陕西、四川等省市的山区中。雄性林麝香腺分泌的麝香为四大动物香料之首,也是一种名贵的中药材,具有很高的药用价值和经济价值。由于其栖息地遭到破坏,加上滥捕滥杀,野生林麝数量和麝香产量急剧下降。为保护野生林麝资源和提高麝香产量,早在上世纪50年代我国便展开了林麝的人工驯养和科学研究,且取得了一定的成果。但相关资料仍不系统、不规范,一些基础研究不深入,特别是其泌香机制仍不够清楚。因此,需进一步探究林麝的人工驯养技术和泌香机制。本研究以陕西省某林麝养殖场为对象,调查了该林麝养殖场2018—2019年的人工驯养情况,分析了林麝人工驯养过程中的实际生产问题。利用高通量测序、生信分析、RT-q PCR验证、HE染色和免疫组化等方法,探究了4月龄雄性林麝香腺组织中雄激素合成相关基因的表达情况。主要研究结果如下:（1）调查发现,当前林麝的人工养殖具有鲜明的特点。其驯养方式主要是“圈舍-运动场”圈养模式;圈养林麝的日粮由粗饲料和精料补充料组成,其不同发育阶段对饲料配比要求不同,但需注意粗饲料的品质;人工驯养林麝外伤引起的化脓性疾病较常见,胃肠炎和一些寄生虫引起的消化道疾病偶发,幼龄林麝容易感染支原体肺炎;繁殖管理方面,配种林麝公母比为1:2,可保证双胎率超过80%,繁殖率达180%以上;雄性林麝的麝香分泌量与年龄有关,3～8岁是其泌香盛期,平均泌香量为11.84～18.74 g。（2）4月龄雄性林麝未性成熟,通过HE染色发现睾丸曲细精管发育未完全,管腔中没有圆形精子、延长型精子和成熟精子;香腺为典型的腺体组织,由很多腺管组成,腺细胞附着在腺管管腔基底部。4月龄林麝香腺组织转录组测序分析显示,在香腺中共注释到33308个基因。与睾丸组织相比,共发现7018个差异表达基因,其中3581个基因表达上调,3437个基因表达下调。差异表达基因GO和KEGG富集分析显示,类固醇激素合成信号通路显著性富集了15个差异表达基因,其中CYP11A1、CYP17A1、HSD3B基因涉及雄激素的合成过程。通过RT-q PCR和免疫组化分析,发现雄激素合成相关基因CYP11A1、CYP17A1、HSD3B在林麝香腺组织中表达,且雄激素合成关键限速酶CYP11A1在香腺组织中的表达丰度显著高于睾丸组织。调查结果表明,当前林麝人工驯养技术仍有待提高,本研究为林麝的标准化饲养提供了重要参考资料。此外,香腺中雄激素合成相关基因的表达,表明了香腺组织可能存在雄激素合成信号通路,推测香腺可能通过自身产生雄激素调控其发育,甚至影响成年雄麝的麝香产量和品质。

关键词：林麝人工驯养转录组测序分析雄激素合成相关基因泌香机制

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盐胁迫甘草愈伤组织转录组测序分析

盐胁迫甘草愈伤组织转录组测序分析

作者：潘笑河北大学

学位级别：硕士

植物在胁迫环境下会特异表达一些基因,调节植物生理生化特性以适应胁迫环境,有着非常复杂的分子调控机制。因此,选择在转录组水平上研究植物应对胁迫的表达模式,更有利于阐明植物抗逆调控的分子机制。本研究利用高通量测序技术Illumina2... 详细信息

植物在胁迫环境下会特异表达一些基因,调节植物生理生化特性以适应胁迫环境,有着非常复杂的分子调控机制。因此,选择在转录组水平上研究植物应对胁迫的表达模式,更有利于阐明植物抗逆调控的分子机制。本研究利用高通量测序技术Illumina2000对胀果甘草的正常愈伤组织和用盐处理的愈伤组织进行转录组测序,全面分析甘草愈伤组织盐胁迫下差异表达的基因,揭示了甘草愈伤组织可能的耐盐途径及分子机理,对甘草抗盐基因挖掘和今后采用分子生物学手段培育甘草新品种具有重要意义。同时,选取甘草酸合成途径相关的羽扇豆醇合酶,黄酮合成途径关键酶查尔酮合酶和查尔酮异构酶为研究对象作了进一步研究。主要研究结果如下:1.甘草样品转录组测序得到46935469个Short read,对原始测序数据处理后进行拼接,产生了155072Transcript和93263Unigene。对产生的Unigene与NR、GO、KO、Swiss Prot、PFAM、KOG、NT数据库进行对比,注释的百分比分别为55.76%、42.61%、21.2%、41.98%、41.48%、15.09%、59.53%。鉴定了1913个差异表达的基因,其中上调基因为1109,下调基因804个。GO富集分析发现这些差异基因主要参与催化活性、氧化还原酶活动和氧化还原过程。KEGG代谢通路富集分析发现富集的前三位代谢通路分别是苯丙烷生物合成途径、苯丙氨酸代谢和类黄酮生物合成途径。2.通过对盐胁迫甘草愈伤组织转录组分析,推测在甘草愈伤组织中存在的耐盐调控网络图,SOS信号途径、MAPK信号途径、转录因子和激素代谢等中的相关基因相互作用共同调控目的基因的表达,维持细胞离子平衡、氧化还原平衡和渗透平衡,提高细胞盐耐受性。3.对植物表达载体pBI121进行改造,在多克隆位点中Xba I和BamH I之间插入氨苄抗性基因,得到p BI121-Ampr植物表达载体,为后续基因植物表达载体的构建和基因功能鉴定提供基础。4.本研究选取了310bp的羽扇豆醇合酶基因片段为目的基因,选取部分gus基因片段作为内含子,通过融合PCR的方式获得融合片段,并构建了克隆载体,同时构建了目的基因反义片段的克隆载体,测序结果正确。为后续构建RNAi表达载体奠定了基础。5.选取黄酮合成途径的关键酶查尔酮合酶和查尔酮异构酶作为研究对象,构建了查尔酮合酶基因和查尔酮异构酶基因的克隆载体,测序结果正确,为后续植物表达载体的构建及功能鉴定提供基础。

关键词：盐胁迫甘草愈伤组织转录组测序分析查尔酮合酶查尔酮异构酶羽扇豆醇合酶

应用转录组测序分析硝苯地平诱导的牙龈增生的机制研究

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应用转录组测序分析硝苯地平诱导的牙龈增生的机制研究

应用转录组测序分析硝苯地平诱导的牙龈增生的机制研究

2019年中华口腔医学会老年口腔医学专业委员会第十四次...

作者：琚燕琴黄丽娟王淑伟赵守亮复旦大学附属华山医院口腔科复旦大学上海医学院口腔系

目的:探讨硝苯地平诱导药物性牙龈增生发病的关键基因。方法:随机选取40-70岁的需要拔除智齿的正常患者、慢性牙周炎患者、服用硝苯地平未导致牙龈增生的患者及服用硝苯地平引起牙龈增生患者各3例,拍摄临床照片,观察其临床表现。分别对... 详细信息

目的:探讨硝苯地平诱导药物性牙龈增生发病的关键基因。方法:随机选取40-70岁的需要拔除智齿的正常患者、慢性牙周炎患者、服用硝苯地平未导致牙龈增生的患者及服用硝苯地平引起牙龈增生患者各3例,拍摄临床照片,观察其临床表现。分别对四组样本的牙龈成纤维细胞进行培养,用CCK8和Transwell法检测细胞增殖和迁移能力;进一步对四组患者来源的成纤维细胞进行RNAseq检测与分析。结果:硝苯地平诱导的药物性牙龈增生患者来源的成纤维细胞较其他组相比具有更高的增殖和迁移能力。通过蛋白-蛋白相互作用网络分析,本实验发现TGFB2、ITGA8、ITGA11、FGF5、PLA2GD、PLA2G2F、PTGS1、CSF1、LPAR1、CCL3、NKX3-1等参与了硝苯地平诱导的药物性牙龈增生的发病。这些因素可能与花生四烯酸代谢和PI3K/AKT信号通路有关。结论:通过对牙龈成纤维细胞的转录组测序分析发现了一些可能与硝苯地平引起的牙龈增生发病密切相关的差异基因。本研究为硝苯地平诱导的牙龈增生的分子机制研究提供了重要的实验基础。

关键词：转录组测序分析牙龈增生硝苯地平牙龈成纤维细胞

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应用转录组测序分析硝苯地平诱导的牙龈增生的机制研究

基于转录组学分析酸胁迫影响鼠伤寒沙门氏菌耐酸能力的机理

中华口腔医学会第九次全科口腔医学学术会议

作者：琚燕琴刘上峰赵守亮复旦大学附属华山医院

目的:探讨硝苯地平诱导药物性牙龈增生发病的关键基因。材料和方法:随机选取40-70岁的需要拔除智齿的正常患者、慢性牙周炎患者、服用硝苯地平未导致牙龈增生的患者及服用硝苯地平引起牙龈增生患者各3例,拍摄临床照片,观察其临床表现。... 详细信息

目的:探讨硝苯地平诱导药物性牙龈增生发病的关键基因。材料和方法:随机选取40-70岁的需要拔除智齿的正常患者、慢性牙周炎患者、服用硝苯地平未导致牙龈增生的患者及服用硝苯地平引起牙龈增生患者各3例,拍摄临床照片,观察其临床表现。分别对四组样本的牙龈成纤维细胞进行培养,用CCK8和Transwell法检测细胞增殖和迁移能力;进一步对四组患者来源的成纤维细胞进行RNA-seq检测与分析。结果:硝苯地平诱导的药物性牙龈增生患者来源的成纤维细胞较其他组相比具有更高的增殖和迁移能力。通过蛋白-蛋白相互作用网络分析,本实验发现TGFB2、ITGA8、ITGA11、FGF5、PLA2GD、PLA2G2F、PTGS1、CSF1、LPAR1、CCL3、NKX3-1等参与了硝苯地平诱导的药物性牙龈增生的发病。这些因素可能与花生四烯酸代谢和PI3K/AKT信号通路有关。结论:通过对牙龈成纤维细胞的转录组测序分析发现了一些可能与硝苯地平引起的牙龈增生发病密切相关的差异基因。本研究为硝苯地平诱导的牙龈增生的分子机制研究提供了重要的实验基础。

关键词：转录组测序分析牙龈增生硝苯地平牙龈成纤维细胞

来源： cnki会议评论

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食品科学 2022年第22期43卷 166-174页

作者：杨克慧董鹏程刘昀阁张一敏毛衍伟梁荣蓉罗欣朱立贤山东农业大学食品科学与工程学院山东泰安271018 国家牛肉加工技术研发专业中心山东泰安271018 江苏省肉类生产与加工质量安全控制协同创新中心江苏南京210095

目的:探究酸胁迫和非酸胁迫条件下鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)的转录组反应,分析差异基因(differentially expressed genes,DEGs)表达水平,阐明酸胁迫影响鼠伤寒沙门氏菌耐酸反应(acid tolerance response,ATR)的相关代谢... 详细信息

目的:探究酸胁迫和非酸胁迫条件下鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium)的转录组反应,分析差异基因(differentially expressed genes,DEGs)表达水平,阐明酸胁迫影响鼠伤寒沙门氏菌耐酸反应(acid tolerance response,ATR)的相关代谢通路。方法:对鼠伤寒沙门氏菌进行酸胁迫处理,利用转录组测序技术和生物信息学分析相关DEGs,并通过实时聚合酶链式反应(real-time polymerase chain reaction,real-time PCR)进行验证。结果:经酸胁迫后,共筛选到683个DEGs,其中上调343个,下调340个。其中涉及细胞运动、氨基酸代谢、细胞膜组成等通路上调能够使鼠伤寒沙门氏菌快速适应酸环境;碳水化合物代谢相关通路上调能够为鼠伤寒沙门氏菌快速适应酸环境提供更多的能量,与此同时,嘧啶代谢等能量代谢通路下调能够使鼠伤寒沙门氏菌降低能量消耗以维持上述的必需代谢过程;细菌应激调控相关通路上调赋予鼠伤寒沙门氏菌交叉保护抗性;鞭毛、外膜蛋白、脂多糖等毒力相关基因表达上调增强了鼠伤寒沙门氏菌的毒力。real-time PCR验证结果与转录组测序分析表达趋势一致。结论:酸胁迫显著提高了鼠伤寒沙门氏菌的耐酸能力,其中与代谢和细胞过程相关的通路发挥主要作用,本研究结果为进一步了解该菌的酸胁迫反应及更好地控制其在食品中的污染提供了理论依据。

关键词：鼠伤寒沙门氏菌酸胁迫耐酸反应转录组测序分析实时聚合酶链式反应

基于转录组分析干扰FABP1基因对猪肌内脂肪沉积的影响

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南方农业学报 2023年第3期54卷 724-734页

作者：熊讯阮涌许厚强贵州大学动物科学学院/高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州贵阳550025

【目的】探究FABP1基因对猪肌内脂肪细胞生物学功能的影响机制,为进一步研究FABP1对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供参考依据。【方法】将sh-FABP1干扰载体和空载体sh-NC分别转染至香苏杂交猪肌内脂肪细胞中,36 h后收集转染后... 详细信息

【目的】探究FABP1基因对猪肌内脂肪细胞生物学功能的影响机制,为进一步研究FABP1对猪肌内脂肪沉积和脂质代谢的调控作用提供参考依据。【方法】将sh-FABP1干扰载体和空载体sh-NC分别转染至香苏杂交猪肌内脂肪细胞中,36 h后收集转染后的肌内脂肪细胞,采用TRIzol^(®)Reagent总RNA提取试剂盒提取总RNA,待样本质检合格后,每个样品制备1µg的RNA总量用于测序。运用生物信息学进行基因表达水平分析(基因表达水平计算、样本间相关性评估)、基因差异表达分析[差异表达基因(DEGs)筛选和统计、DEGs火山图]和功能富集分析(GO富集分析、KEGG富集分析)。最后分别挑选4个上调基因和4个下调基因运用实时荧光定量PCR验证转录组测序数据。【结果】sh-FABP1与sh-NC之间总共筛选出1129个DEGs,与sh-NC组相比,sh-FABP1上调基因有624个,包括PRKAR2A、ACSL5、ELOVL5和MAPK1等;下调基因有505个,包括LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等。对sh-FABP1与sh-NC之间的DEGs进行功能富集分析,KEGG富集发现上调基因主要在细胞周期(Cell cycle)、肿瘤抑制蛋白(p53)和Notch信号通路中富集,下调基因主要富集在过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)、磷脂酰肌醇3激酶-蛋白激酶B(PI3K-Akt)信号通路中。GO注释表明,有22个、15个和9个GO术语分别在生物过程(BP)、细胞成分(CC)和分子功能(MF)中显著富集(P<0.05,下同),显示与脂肪沉积相关具有显著差异的GO术语包括生物粘附(Biological adhesion)、生物调节(Biological regulation)、生物过程调节(Regulation of biological process)和代谢过程(Metabolic process)。【结论】FABP1基因可能通过调节LPL、FABP3、IGFBP4和OLR1等相关基因的表达、脂肪沉积和脂质代谢相关通路,从而调节脂质生成和代谢。

关键词：猪 FABP1基因脂肪沉积脂质代谢转录组测序分析

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猪轮状病毒感染小鼠肠道组织的转录组分析

病毒学报 2023年第4期39卷 1072-1083页

作者：李颖李树东秦达曲艺程荣叶侯喜林余丽芸黑龙江八一农垦大学生命科学技术学院大庆163319 黑龙江八一农垦大学动物科学技术学院大庆163319

猪轮状病毒(Porcine rotavirus,PoRV)是在世界范围内与严重腹泻疾病相关的主要肠道病原体,是新生仔猪肠炎和腹泻致死的重要原因之一。为了深入了解猪轮状病毒感染肠道后其致病机制以及引起宿主的抗病毒和修复机制,我们分别饲喂培养基和... 详细信息

猪轮状病毒(Porcine rotavirus,PoRV)是在世界范围内与严重腹泻疾病相关的主要肠道病原体,是新生仔猪肠炎和腹泻致死的重要原因之一。为了深入了解猪轮状病毒感染肠道后其致病机制以及引起宿主的抗病毒和修复机制,我们分别饲喂培养基和猪轮状病毒病毒液5d后,采取5 d、10 d、15 d、20 d、25 d小鼠空肠组织进行高通量转录组测序分析。利用基因本体论(Gene Ontology,GO)数据库功能富集分析、京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析差异表达基因(Differentially Expressed Gene,DEGs),选取部分差异表达基因,进行qRT⁃PCR验证。结果显示,与对照组相比,5个时间段上调DEGs有849个,下调DEGs有824个。对DEGs进行5个功能富集,有共同差异基因15个。这些差异表达基因广泛参与脂质合成与代谢、免疫、细胞增殖、细胞凋亡等活动,主要注释到PPAR、NOD⁃like、IL⁃17等信号通路中。qRT⁃PCR验证上皮细胞增殖相关基因PBLD、CCL24、Nr1d1、Fst表达趋势与RNA⁃seq结果趋势一致。此分析提示PoRV感染小鼠肠上皮细胞后可能通过细胞增殖相关基因的高表达或其信号通路的激活进行受损的肠上皮的修复。

关键词：猪轮状病毒差异表达基因转录组测序分析小鼠肠道组织

日粮中添加复方中药对AA肉鸡肌肉发育及肉质的影响

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日粮中添加复方中药对AA肉鸡肌肉发育及肉质的影响

作者：冯泽伟云南农业大学

学位级别：硕士

鸡肉是人类优质的动物性蛋白来源之一,随着畜禽养殖产业的快速发展,人们对于肉品质的要求也越来越高,绿色添加剂替代化学合成抗生素成为国内外的研究热点。复方中药作为一类天然绿色添加剂,除了具有良好的药用价值、无残留、无毒无害和... 详细信息

鸡肉是人类优质的动物性蛋白来源之一,随着畜禽养殖产业的快速发展,人们对于肉品质的要求也越来越高,绿色添加剂替代化学合成抗生素成为国内外的研究热点。复方中药作为一类天然绿色添加剂,除了具有良好的药用价值、无残留、无毒无害和不易产生耐药性等特点外,是理想的抗生素替代品,但是机体机理尚未阐明。因此,本试验选择1日龄AA肉鸡120只,随机分为4个组,分别为对照组（CG）、复方中药低剂量组（CL）、复方中药中剂量组（CM）和复方中药高剂量组（CH）,每组3个重复,每个重复10只鸡。对照组饲喂基础日粮,CL组、CM组和CH组分别饲喂在基础日粮水平中添加0.3%、0.5%、0.8%复方中药的日粮。试验期间,测定1日龄和42日龄体重;饲养至42天,在各组中每个重复随机抽取4只鸡进行屠宰,测定屠宰性能、肉品质、肌肉常规营养成分,对胸肌进行转录组测序分析,筛选出影响肌肉发育及肉质的差异表达基因,并采用RT-PCR进行检测。本试验旨在探究复方中药对肉鸡肌肉发育及肉质的影响,以期推动复方中药的科学研究与实际应用。研究结果如下:1.体重和屠宰性能结果:1日龄体重无显著差异;42日龄时,CM组体重显著高于CG组（P组半净膛率极显著高于CG组（P组半净膛率极显著高于CG组（P组半净膛率极显著高于CL组（P组全净膛率显著高于CG组（P组全净膛率显著高于CG组（P组肉色a值显著高于CG组（P组肉色b、L值显著低于CG组（P组剪切力显著低于CG组（P组粗蛋白含量显著高于CG组（P组粗脂肪含量显著高于CG组（P组（P组肉色a值显著高于CG组（P组肉色b、L值显著低于CG组（P组蒸煮损失显著低于CG组（P组粗蛋白含量极显著高于CG组（P组（P组粗脂肪含量显著高于CG组（P转录组测序分析结果:共有109个差异表达基因,在cyclic-nucleotide phosphodiesterase activity、extrinsic component of mitochondrial outer membran、c AMP metabolic process、guanine deaminase activity等10个GO条目;KEGG pathway富集分析发现,差异表达基因参与Wnt signaling pathway、ECM-receptor interaction、Oxidative phosphorylation 3条信号通路,初步筛选出:TNC、SPP1、THBS4、NPY、TPM4、HACD4、PDE10A、ADCY2、HOPX、UCP3等10个影响肉品质的差异表达基因,通过RT-PCR功能验证,结果与转录组分析结果一致。综上所述,复方中药能促进肉鸡肌肉发育以及改善肉品质,且本次试验得出复方中药最适添加量为0.5%。转录组分析得到的差异表达基因参与了Wnt signaling pathway、ECM-receptor interaction、Oxidative phosphorylation等通路,筛选得到的TNC、SPP1、THBS4、NPY、TPM4、HACD4、PDE10A、ADCY2、HOPX、UCP3基因是影响肉鸡肌肉发育和肉品质的候选基因;该结果为复方中药作为抗生素理想的替代品提供了理论依据。

关键词：复方中药肉鸡肉品质转录组测序分析候选基因

酒饼簕种子和幼苗对盐胁迫的响应及其AbNHX1基因克隆

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酒饼簕种子和幼苗对盐胁迫的响应及其AbNHX1基因克隆

作者：陈建妙长江大学

学位级别：硕士

盐胁迫影响了植物的生长发育,从而阻碍着农业的生产以及发展。如何增强植物的耐盐性是如今农业学家和植物学家需要面对的重大课题。本文以滨海植物酒饼簕为实验材料,对其种子和幼苗进行盐胁迫处理,观察其生长状况,并分析其形态和生理生... 详细信息

盐胁迫影响了植物的生长发育,从而阻碍着农业的生产以及发展。如何增强植物的耐盐性是如今农业学家和植物学家需要面对的重大课题。本文以滨海植物酒饼簕为实验材料,对其种子和幼苗进行盐胁迫处理,观察其生长状况,并分析其形态和生理生化的变化,同时进行转录组测序分析和Ab NHX1基因克隆,以期能够挖掘新的耐盐植物及其相关耐盐基因,为园艺植物遗传改良提供相关依据。研究结果如下:(1)在种子发芽方面,盐胁迫对酒饼簕种子发芽具有抑制作用。Na Cl浓度增加引起酒饼簕种子的发芽率、发芽势、发芽指数、活力指数、上胚轴和胚根的长度、生物量和相对含水量均呈下降的趋势,而相对盐害率呈现增加的趋势。然而酒饼簕的种子在一定程度上能适应100 m M Na Cl浓度生长,其中发芽率、发芽势、相对盐害率、生物量和相对含水量与对照处理相比无明显变化,并且300 m M的高浓度盐胁迫下酒饼簕的种子仍具有38.67%的发芽率。(2)在幼苗生长方面,随着Na Cl浓度的增加,叶片逐渐黄化,高浓度下叶片出现枯萎现象;株高、根长和根尖数形成下降趋势;地径、鲜重、干重、相关含水量和根表面积在0和100 m M Na Cl处理间呈现增加的趋势,而在100 m M浓度之后这些指标表现下降的趋势;根直径则随着盐浓度增加而增加;盐胁迫下酒饼簕幼苗叶片的叶绿素含量减少,进而导致气体交换的下降;随着Na Cl浓度的增加,超氧化物歧化酶(SOD)、过氧化氢酶(CAT)、过氧化物酶(POD)、抗坏血酸过氧化物酶(APX)和谷胱甘肽还原酶(GR)的活性总体上呈现增加的趋势,而CAT和SOD在100 m M Na Cl浓度时活性最低,导致过氧化氢(HO)在该浓度时含量也为最低,另外APX在200 m M浓度时达到最高;Na Cl浓度从0 m M到200 m M时,抗坏血酸(As A)和谷胱甘肽(GSH)含量形成上升的趋势,高于200 m M时这2个指标含量则表现下降趋势;可溶性蛋白和脯氨酸的含量随着盐浓度的增加而提高,而可溶性糖(SS)含量在0 m M到100 m M浓度时表现出下降趋势,在100m M之后SS的含量表现为增加趋势;进而影响丙二醛(MDA)和相对电导率的随着Na Cl浓度增加呈现上升的趋势。而Na Cl浓度在100 m M时,酒饼簕幼苗的株高、地径、干重、根系相关指标、相对含水量、POD、CAT、APX、GSH、As A、HO、MDA和相对电导率指标与对照组无显著性变化,这表明酒饼簕幼苗在该浓度下具有一定的耐受性。(3)转录组测序结果分析表明,共获得有效数据(Clean bases)59.3 Gb,定位到参考基因组的比对率在92.83%～94.87%之间,共注释了29,959个Unigene。GO表明共注释12,081个Unigene,787条GO详细的注释信息。GO富集表明三大分类子节点中分别主要富集于各类代谢过程、生物合成过程、膜以及结合。根据KEGG富集通路表明,差异基因主要富集于光合作用-天线蛋白、植物激素信号转导、谷胱甘肽代谢和淀粉与蔗糖的代谢等途径。另外差异表达基因注释到45个转录因子家族,其中包含数目最多的是b HLH家族,NAC家族,WRKY家族,MYB-related家族和b ZIP家族等。(4)成功克隆了酒饼簕Ab NHX1基因并成功构建植物表达载体p BI121-Ab NHX1,为后续该基因的功能研究提供了基础。综上所述,最终本研究认为随着Na Cl浓度的增加抑制酒饼簕种子的发芽和幼苗的生长发育。然而盐浓度在300 m M时酒饼簕的种子和幼苗仍然具备一定的活力;并能诱导相关基因的表达来抵御盐胁迫的危害,这说明酒饼簕具有一定的耐盐性。

关键词：盐胁迫酒饼簕生理生化转录组测序分析 AbNHX1基因克隆