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人类的起源和进化(上)

知识就是力量 1999年第7期 46-47页

作者：吴汝康中国科学院

人类的出现是地球上的一个重大事件。那么人类是在什么时俟从猿的进化系统中分化出来?最早的人类的标志是什么?这些都是古人类学研究的问题。什么是人的标志? 1871年达尔文在《人类的由来和性的选择》一书中提出:人类的特征是两足直立... 详细信息

人类的出现是地球上的一个重大事件。那么人类是在什么时俟从猿的进化系统中分化出来?最早的人类的标志是什么?这些都是古人类学研究的问题。什么是人的标志? 1871年达尔文在《人类的由来和性的选择》一书中提出:人类的特征是两足直立行走、大的脑子和高的智力。

关键词：起源和进化直立人化石人类起源南方古猿直立行走北京猿人人类化石共同祖先人的系统爪哇猿人

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雉鸡冠状病毒起源和进化的新证据

中国预防兽医学报 2020年第1期42卷 100-100页

作者： Han Zong-xi Xu Li-wen Ren Meng-ting 机构不详

冠状病毒属的病毒是具囊膜结构的单股正链RNA病毒,可感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类等脊椎动物,引起包括哺乳动物和禽在内的多种动物呼吸系统、消化系统、泌尿生殖系统和神经系统等不同程度的疾病。近年来多种新型冠状病毒从不同动物中发... 详细信息

冠状病毒属的病毒是具囊膜结构的单股正链RNA病毒,可感染人、鼠、猪、猫、犬、禽类等脊椎动物,引起包括哺乳动物和禽在内的多种动物呼吸系统、消化系统、泌尿生殖系统和神经系统等不同程度的疾病。近年来多种新型冠状病毒从不同动物中发现,并证实了这些新型病毒具备跨物种感染的趋势,给动物或/和人类造成公共卫生安全隐患,因此探究冠状病毒的起源和进化研究越来越引起人们的重视。

关键词：冠状病毒属泌尿生殖系统公共卫生安全起源和进化呼吸系统新型病毒雉鸡单股正链RNA病毒

山茶属和非山茶属物种中茶氨酸调控模块的起源与进化研究

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山茶属和非山茶属物种中茶氨酸调控模块的起源与进化研究

作者：杜金科安徽农业大学

学位级别：硕士

茶氨酸(Theanine,Thea)是一种植物来源的重要次生代谢产物,为保健品的重要原料之一。大量的研究表明茶氨酸具有多方面显著的健康促进效应,比如保护神经,预防心血管疾病,安神等。茶氨酸主要在山茶属(Camellia)植物体内积累,在茶树(Camell... 详细信息

茶氨酸(Theanine,Thea)是一种植物来源的重要次生代谢产物,为保健品的重要原料之一。大量的研究表明茶氨酸具有多方面显著的健康促进效应,比如保护神经,预防心血管疾病,安神等。茶氨酸主要在山茶属(Camellia)植物体内积累,在茶树(Camellia sinensis)中含量相比最高。虽然茶氨酸代谢途径中关键的茶氨酸合成相关基因例如茶氨酸合成酶基因(Theanine synthetase1,TS1)、谷氨酰胺合成酶基因(Glutamine synthetase,GS)、谷氨酸合成酶基因(Glutamate synthase,GOGAT)等其功能都已经深入解析,但我们对这些重要基因如何互作形成茶氨酸调控模块,以及茶氨酸调控模块在山茶属物种和非山茶属物种之间的进化都知之甚少。针对上述问题,本研究利用茶树的mRNA测序数据,构建茶树的全局基因共表达网络,鉴定茶氨酸调控模块,进一步利用比较基因组学的方法,探究茶氨酸调控模块在山茶属物种和非山茶属物种的进化历史,挖掘高可信度的调控茶氨酸合成的转录因子。本课题主要结论如下:1)基于茶树不同组织(包括根和叶)的mRNA测序数据,我们构建茶树的全局基因共表达网络,成功挖掘到茶树体内茶氨酸相关的调控模块(Thea-associated regulatory module,TARM)。TARM与茶树根部具有很高的关联程度,模块中大部分基因在根部高表达,并且包含与茶氨酸合成(GS、TS1、Ala DC),转运(AAP8、LHT)相关的重要基因成员。2)84种绿色植物的比较基因组分析揭示TARM主要起源于藻类(algae)植物时期,TARM逐渐从不同进化节点招募新的基因成员加入,并且伴随着早期的大量的基因复制事件。3)基于进化分析和网络拓扑分析,我们从TARM中挖掘出两个高可信度的参与调控茶氨酸合成的转录因子NAC080和LBD38。我们的研究结果首次为茶氨酸调控模块的起源与进化提供了重要的见解,为茶氨酸代谢调控的研究提供高可信度的候选基因,同时提供了一种基于跨物种网络演化模型挖掘植物特征性代谢通路基因的范例。

关键词：茶氨酸调控模块山茶属起源和进化基因共表达网络比较基因组分析

新基因的起源进化及其在物种发育和进化中的作用

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新基因的起源进化及其在物种发育和进化中的作用

荞麦属(Fagopyrum Mill)植物资源的RAPD研究

中国遗传学会第八次代表大会暨学术讨论会

作者：王文中国科学院昆明动物研究所马普进化基因组学青年科学家小组遗传资源与进化国家重点实验室

新基因的起源进化是生物进化中的一个重要生物学过程,许多新基因的出现都可能伴随着新的适应性性状的出现(Long 等,Nat Rev Genet,2003)。我们首先通过大规模试验筛选的办法在果蝇中鉴别到了数十个年轻新基因。其中 sphinx 基因为首个... 详细信息

新基因的起源进化是生物进化中的一个重要生物学过程,许多新基因的出现都可能伴随着新的适应性性状的出现(Long 等,Nat Rev Genet,2003)。我们首先通过大规模试验筛选的办法在果蝇中鉴别到了数十个年轻新基因。其中 sphinx 基因为首个鉴定到的年轻非蛋白编码基因(Wang 等,PNAS,2002),monkey-king 基因提供了基因如何分裂的典型案例(Wang 等,Nature Genetics,2004),Hun 基因则说明了经典的基因重复模型如何产生具有新功能的基因(Arguell 等,PLoS Genetics,2007)。对所有那些经基因重复而来的年轻基因的结构分析发现散在型的基冈重复主要是通过非等位同源重组(non-allelic homologous recombination)实现,而不是传统上认为的非法重组(illegitimate recombination)进行 (Yang 等,PLoS Genetics,2008)。基于最新的果蝇基因组数据,我们新近在全基因组水平分析了新基因起源的一般特征,我们发现基因重复贡献了约78%的新基因,逆转座 (retroposition)产生了约10%的新基因,最令人惊奇的是基因的从头起源(de novo origination)产出了11%多的基因(Zhou et al.,Genome Research,2008)。此前一直认为基因的从头起源是很少的事件。我们在酵母中发现的一个从头起源的基因也证明了这一机制的将遍性(Cai 等,Genetics,2008)。针对这些新基因可能带来的功能后果,我们已经开始研究了一些年轻基因的生物学功能。初步结果提示新基因可以在发育和物种的适麻性状的形成中起到重要作用。如 sphinx 基因在果蝇雄性求偶行为中起着关键作用(Dai 等,PNAS, 2008),而一个年轻细胞凋亡基因家族的出现则在黑腹果蝇的精子形成中起着重要作用(丁昀等,未发表数据)。上述一系列结果揭示了新基因起源进化的机制和一般模式,也揭示新基因起源后对物种的进化和发育有重要后果。

关键词：新基因起源和进化功能

来源： cnki会议评论

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种子 2009年第11期28卷 37-44,48页

作者：任翠娟陈庆富贵州师范学院化学与生命科学学院贵阳550018 贵州师范大学生命科学学院植物遗传育种研究所贵阳550001

以10个随机引物对荞麦属(Fagopyrum)11个种(含大粒组7个种,小粒组4个种)共50份栽培及野生荞麦资源进行RAPD研究。初步建立了荞麦属不同物种的RAPD指纹图谱。系统聚类分析表明,荞麦属大粒组和小粒组组间以及不同荞麦种间在DNA水平上差异... 详细信息

以10个随机引物对荞麦属(Fagopyrum)11个种(含大粒组7个种,小粒组4个种)共50份栽培及野生荞麦资源进行RAPD研究。初步建立了荞麦属不同物种的RAPD指纹图谱。系统聚类分析表明,荞麦属大粒组和小粒组组间以及不同荞麦种间在DNA水平上差异极大。在大粒组中苦荞DNA与其他种之间有较大的差异。大野荞和毛野荞分别与甜荞和苦荞在RAPD水平上较近缘,支持它们分别是甜荞和苦荞祖先种的假说。

关键词：荞麦属植物随机扩增多态性DNA 系统关系起源和进化多态性

Chapaev转座子与Transib转座子与RAG1基因起源与进化的关系

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华中师范大学学报（自然科学版） 2016年第1期50卷 97-104页

作者：张化浩熊敏张小谷九江学院药学与生命科学学院江西九江332000 九江学院临床医学院江西九江332000

重组激活蛋白基因(recombination activating gene,RAG)是脊椎动物内特有的一类基因,在脊椎动物T细胞受体和免疫血球素基因的重排与重组过程中扮演着关键角色.基于V(D)J重组和DNA转座子重组机制的相似性,研究人员提出了"RAG转座子"模型... 详细信息

重组激活蛋白基因(recombination activating gene,RAG)是脊椎动物内特有的一类基因,在脊椎动物T细胞受体和免疫血球素基因的重排与重组过程中扮演着关键角色.基于V(D)J重组和DNA转座子重组机制的相似性,研究人员提出了"RAG转座子"模型.本文通过序列比对,发现RAG1与Chapaev转座子整条序列(包括N端及C端)都有一定的相似性.基于它们的N端及C端分别构建系统发生树,结果显示RAG1的N末端可能起源于与Chapaev转座子关系更近的转座子,而RAG1的C末端可能起源于与Transib转座子关系更近的转座子.故此,本文提出了两种RAG1基因可能的起源模型,以期为RAG1基因的起源与进化研究提供一定参考.

关键词： RAG1 Chapaev Transib 起源和进化

日本七鳃鳗Vav3基因克隆、表达及多克隆抗体制备研究

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日本七鳃鳗Vav3基因克隆、表达及多克隆抗体制备研究

作者：冯波辽宁师范大学

学位级别：硕士

Vav3是在生物体内广泛表达的一种Rho家族GTPase的鸟嘌呤核苷酸转移因子,在进化上高度保守,能够通过调节Rho家族不同成员的活性参与多条T、B细胞信号通路的调控,并在细胞增殖、分化和免疫功能的调节方面发挥重要作用。七鳃鳗作为现存最... 详细信息

Vav3是在生物体内广泛表达的一种Rho家族GTPase的鸟嘌呤核苷酸转移因子,在进化上高度保守,能够通过调节Rho家族不同成员的活性参与多条T、B细胞信号通路的调控,并在细胞增殖、分化和免疫功能的调节方面发挥重要作用。七鳃鳗作为现存最古老的无颌类脊椎动物,拥有其独特的适应性免疫系统,是研究脊椎动物适应性免疫系统起源与进化的模式生物。目前,对于Vav3的研究大多集中于高等脊椎动物,七鳃鳗中是否存在Vav3尚不清楚。本论文运用生物信息学和分子生物学方法,从日本七鳃鳗白细胞cDNA文库中搜索到一条能够表达Vav3的EST序列。对其进行基因克隆、表达及生物信息学分析,有助于阐明脊椎动物Vav3基因的起源与进化。抗体的制备为进一步研究七鳃鳗适应性免疫机制及脊椎动物适应性免疫系统的起源提供了材料。本研究通过对本实验室构建的日本七鳃鳗白细胞cDNA3,000多条有效EST序列进行生物信息学分析,筛选得到能够翻译Vav3的核苷酸序列。通过RACE方法成功获得cDNA全长序列,共2,866bp,其中编码区2,511bp,编码837个氨基酸,理论分子量92.07kD。通过一级序列分析、比对和高级结构预测,表明七鳃鳗Vav3具有典型的3个酪氨酸磷酸化位点,与其他物种具有较高的同源性。为了进一步阐明七鳃鳗Vav3与其他脊椎动物Vav3的亲缘关系,通过邻接法构建系统发育树,发现七鳃鳗Vav3进化地位比较低,符合生物由低等到高等的客观自然进化规律。利用基因工程手段,以GAPDH基因作为内参,设计特异性引物,Real-time PCR法检测Vav3基因在七鳃鳗心脏、白细胞、肝脏、肠、鳃、肾脏和脂肪小体中的相对表达量。发现Vav3在各个组织中广泛表达,进一步经脂多糖（LPS）刺激后,发现其在脂肪小体、鳃和白细胞中的表达量显著上调。以上结果说明,七鳃鳗Vav3参与类淋巴细胞免疫应答,在对病原菌的防御反应中也发挥重要作用。进一步构建pET-32a-Vav3原核表达载体,并在*** BL21中进行表达,得到可溶性表达的重组蛋白。组氨酸亲和层析柱纯化,获得七鳃鳗Vav3重组蛋白纯品。以纯化的重组蛋白为抗原免疫新西兰兔,制备兔抗七鳃鳗Vav3多克隆抗体。流式细胞术检测七鳃鳗Vav3在白细胞中的表达量,结果显示Vav3能够在白细胞中表达,进一步证明Vav3在七鳃鳗免疫应答中发挥重要作用。综上所述,Vav3蛋白能够在无颌类脊椎动物中表达。对其功能的推测为无颌类脊椎动物适应性免疫应答机制及脊椎动物适应性免疫应答的起源提供了重要线索。

关键词：日本七鳃鳗 Vav3 适应性免疫起源和进化

基于探针Ab-T148和Ast-T125的燕麦属物种染色体识别和种间关系研究

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基于探针Ab-T148和Ast-T125的燕麦属物种染色体识别和种间关系研究

作者：杨闯四川农业大学

学位级别：硕士

燕麦属(Avena L)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae),全世界约30个种,包含A、B、C、D 4种基因组,共有AA、CC、AABB、CCCC、AACC/CCDD、AACCDD 6种基因组组成,其染色体基数为7。燕麦基因组庞大复杂,种间关系不... 详细信息

燕麦属(Avena L)隶属于禾本科(Poaceae),早熟禾亚科(Pooideae),燕麦族(Aveneae),全世界约30个种,包含A、B、C、D 4种基因组,共有AA、CC、AABB、CCCC、AACC/CCDD、AACCDD 6种基因组组成,其染色体基数为7。燕麦基因组庞大复杂,种间关系不清晰,各染色体间同源关系不明确。基于此,本研究利用在燕麦基因组中大量分布的重复序列作为探针,筛选在燕麦属二倍体、四倍体、六倍体物种的各染色体中具有较高多态性的探针,以此对燕麦基因组各染色体进行区分识别。同时将不同探针的标记结果进行比对,对不同基因组和不同物种间的亲缘关系和进化关系进行了研究。1.利用两个重复序列探针与5s探针和基因组特异性探针进行标记,同时与染色体核型相结合,成功区分了燕麦属物种的不同染色体,完善了前人的燕麦染色体命名系统,推进了燕麦各染色体的细胞学鉴定工作。***基因组四倍体中的A、B基因组分别与现存的不同A基因组二倍体物种亲缘关系较近,前者与As基因组二倍体相似度较高,而后者则被认为起源于Ad基因组二倍体。而其它多倍体物种均未能找到确切的二倍体供体种,说明前者在进化过程中发生的变化较小。多倍体中的A、B、D 3个基因组的来源都与不同A基因组二倍体物种有着密切的关系,而C基因组则被认定为是起源于C基因组二倍体,C基因组的探针信号模式也与其它3个基因组差异较大。推测A、B、D基因组起源于与C基因组不同的另一祖先。3.在A基因组二倍体中,各个亚型之间探针标记情况差异较大,每个亚型都有自己独特的信号标记模式。As基因组中的***与***与其它种的信号标记情况存在着一定的差异,但总体来说它们的信号模式依然与As基因组亚型更相似。供试的3个C基因组二倍体物种中,两个Cp基因组物种***和***的信号分布几乎一致,Cv基因组物种***与它们存在着较小的差异,3个物种的亲缘关系较近。4.结合探针信号可以发现***、***和***这3个物种的A基因组和B基因组之间信号差异较大,更支持AB基因组四倍体为异源起源的观点。AB基因组四倍体中***与其它三个种的结果差异较大,基于本研究结果认为AB基因组四倍体的起源可以分为2个分支,其中***、***和***为一个起源路径、***为独立的起源路径。AC(CD)基因组四倍体中,***和***的亲缘关系更近,与***的差异较大;通过对结果的比较分析认为AC(CD)基因组四倍体燕麦物种的基因组组成为CCDD,而不是AACC。燕麦六倍体的各个种之间差异较小,对比AC(CD)基因组四倍体和六倍体的结果,发现***和***与六倍体中C、D基因组的信号模式相似度较高,其中四倍体***的信号模式更为相似,支持了六倍体燕麦是由A基因组二倍体与CD基因组四倍体杂交加倍形成。

关键词：燕麦属荧光原位杂交重复序列探针信号模式起源和进化

荞麦属（Fagopyrum）植物资源的RAPD研究

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荞麦属（Fagopyrum）植物资源的RAPD研究

作者：任翠娟贵州师范大学

学位级别：硕士

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,筛选出10个随机引物对荞麦属(Fagopyrum)11个种(含大粒组7个种,小粒组4个种)共50份栽培及野生荞麦资源进行了研究。所获结果如下:1、建立了荞麦属种类的RAPD指纹图谱,可以为荞麦属种类鉴别和遗传图谱... 详细信息

利用随机扩增多态性DNA(RAPD)技术,筛选出10个随机引物对荞麦属(Fagopyrum)11个种(含大粒组7个种,小粒组4个种)共50份栽培及野生荞麦资源进行了研究。所获结果如下:1、建立了荞麦属种类的RAPD指纹图谱,可以为荞麦属种类鉴别和遗传图谱建立提供依据和资料。2、建立荞麦属种间RAPD系统关系图,为荞麦属种间系统关系及栽培荞麦起源研究提供了重要证据。3、荞麦属大粒组和小粒组组间在DNA水平上差异极大。4、在大粒组中苦荞DNA歧异最大,与大粒组其他种之间在DNA水平上有最大的差异。5、大野荞种内在DNA水平上差异很大,而且明显被分为两个大类:黔西南类和其他地区类。上述研究结果对于荞麦属分类学和遗传标记图谱建立有一定的意义。

关键词：荞麦随机扩增多态性DNA 系统学起源和进化