检索结果-南通市图书馆

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

单峰高斯分布适应面上的误差阈

原子核物理评论 2007年第2期24卷 142-146页

作者：冯晓利李玉晓郑州大学物理工程学院河南郑州450052

在Eigen的单峰适应面模型基础上,提出了生物体的适应值为高斯分布的随机适应面模型。利用系综平均的方法,计算了在单峰高斯分布适应面上准物种的浓度分布和误差阈。结果表明,对于小的适应面涨落,准物种分布和误差阈与确定情形相比变化极... 详细信息

在Eigen的单峰适应面模型基础上,提出了生物体的适应值为高斯分布的随机适应面模型。利用系综平均的方法,计算了在单峰高斯分布适应面上准物种的浓度分布和误差阈。结果表明,对于小的适应面涨落,准物种分布和误差阈与确定情形相比变化极小,误差阈对于小的涨落是稳定的。然而,当适应值涨落较大时,从准物种到误差灾变的转变不再明显。误差阈变宽,并且在涨落增加时向大的突变率方向移动。

关键词：准物种误差阈高斯分布适应面

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

在不同适应值下误差阈的研究

在不同适应值下误差阈的研究

作者：陈丹华郑州大学

学位级别：硕士

本文主要介绍达尔文生物进化论以及对生物演化过程的探究,特别是在微观层次上,通过对简单的无性生殖物种演化的探究建立起理想化的理论模型。本文的重点在于对Eigen准物种模型的描述以及对此模型的求解。通过对Eigen准物种模型的求解我... 详细信息

本文主要介绍达尔文生物进化论以及对生物演化过程的探究,特别是在微观层次上,通过对简单的无性生殖物种演化的探究建立起理想化的理论模型。本文的重点在于对Eigen准物种模型的描述以及对此模型的求解。通过对Eigen准物种模型的求解我们得到：当物种超过某个阈值时,这个物种的分布将变为随机性的分布。也就是说当物种的错误率超过这个阈值时,这种物种将会灭亡,我们把这个阈值叫做误差阂。文章的正文可以分为四个部分,第一部分详细介绍了达尔文演化体系以及在此体系的基础上建立理想模型——准物种模型。第二部分通过对Eigen模型的精确求解以及对有微小突变情况的的微扰近似,从而得到误差阈的表达式。介绍了在几种不同情况下Eigen准物种模型的求解,并探究在这几种不同情况下的误差阈的情况。第三部分通过对多核苷酸复制的探究,讨论了在低维和高维情况下大分子聚合物的直接复制和互补(正-负)复制,并将其误差阈与统计学中的相变进行类比。最后,我们通过对Eigen模型选取不同情况的适应值来探究其误差阈的变化。通过分析可以发现,于单峰相比,当系统存在一系列孤立的峰值时,误差阈会有向较大值方向的平移。

关键词：序列误差阈准物种模型适应面

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

Eigen模型中误差阈展宽机制的研究

河北工业大学学报 2017年第2期46卷 32-35,112页

作者：田中修李多芳曹天光耿金鹏展永河北工业大学理学院天津300401

物种演化本质上是生物群体与他们周围环境之间相互作用的一个随机过程.即演化模型中的一些物理参量是受外界环境涨落的影响.本工作中,是把模型中的适应度和突变率这2个物理参量同时处理为高斯分布随机变量,当二者同步耦合随机化时,转变... 详细信息

物种演化本质上是生物群体与他们周围环境之间相互作用的一个随机过程.即演化模型中的一些物理参量是受外界环境涨落的影响.本工作中,是把模型中的适应度和突变率这2个物理参量同时处理为高斯分布随机变量,当二者同步耦合随机化时,转变区域的宽度与适应度和突变率的涨落强度分别呈线性和指数型关系;二者在非同步耦合随机化的情况下,转变区域的宽度与变量涨落强度间的关系与之前相一致.此时,不同的涨落强度下,变量与转变区域的宽度呈现出不同的趋势.当适应度和突变率二者同时随机化时,突变率随机化占据了主导地位,这就需要将突变概率矩阵中矩阵元作进一步的分析,进而研究误差阈的展宽机制.

关键词：突变率高斯分布随机变量耦合随机化突变概率矩阵误差阈

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

随机化的Eigen模型研究

物理学报 2014年第10期63卷 427-431页

作者：乔丽华赵同军顾建中卓益忠河北工业大学理学院生物物理研究所天津300401 中国原子能科学研究院核物理研究所北京102413 河北医科大学基础医学院石家庄050017

为了使Eigen模型能够更真实地描述物种的演化过程,将确定性Eigen模型改造成随机模型.以Eigen模型为理论框架,把基因序列中每一个位点的突变率看作一个高斯随机变量,从而导出随机性Eigen模型.对于此随机性Eigen模型,当突变率的涨落强度... 详细信息

为了使Eigen模型能够更真实地描述物种的演化过程,将确定性Eigen模型改造成随机模型.以Eigen模型为理论框架,把基因序列中每一个位点的突变率看作一个高斯随机变量,从而导出随机性Eigen模型.对于此随机性Eigen模型,当突变率的涨落强度较小时,准物种的误差阈位置几乎没有改变,仍是个相变点;而当突变率的涨落强度变大时,误差阈由一个相变点变为一个转变区域.在真实的物种演化过程中,误差阈应是一个转变区域,而且在解决实际问题时应考虑该转变区域的上限.

关键词：高斯随机变量突变率准物种误差阈

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

单峰高斯分布适应面上准物种演化的研究

单峰高斯分布适应面上准物种演化的研究

作者：冯晓利郑州大学

学位级别：硕士

本文是对微观层次上特别是对于复制速率较快、突变率较高的无性生殖群体生物演化理论模型的介绍。理论模型是建立在一系列简化和假定之上，文章重点在于对Eigen准物种模型的描述。在适应面概念的基础上，Eigen模型能够得到两个重要结论... 详细信息

本文是对微观层次上特别是对于复制速率较快、突变率较高的无性生殖群体生物演化理论模型的介绍。理论模型是建立在一系列简化和假定之上，文章重点在于对Eigen准物种模型的描述。在适应面概念的基础上，Eigen模型能够得到两个重要结论：低突变率时的准物种分布和在临界突变率时到一种完全随机分布的转变，即误差阈。自然选择的目标是准物种，而误差阈的存在对生物体所能携带的基因组的长度施加了一个限制。这两种现象具有应用意义，均在实验上观察到。在该领域的所用的方法类似于统计物理学中的方法。正文分为四个部分。第一部分介绍达尔文体系及Eigen模型，包括适应面概念、Fisher的自然选择理论、准物种模型的解析解、微扰近似和数值解。第二部分给出准物种模型的统计描述，其中误差阈类似于统计物理中的相变，并讨论几种简单的和复杂的适应面。第三部分研究时间依赖适应面的情形，特别讨论在周期适应面的一般现象。最后，我们给出了单峰高斯分布适应面模型。考虑到有机体的生存环境通常存在许多不确定因素，我们用系综平均的方法给出准物种和误差阈的数值模拟。结果表明对于有限长度的序列，误差阈应处于一定的范围之内，与确定情形相比其上限向较大值有一定平移。

关键词：准物种误差阈适应面高斯分布适应面

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

物种演化的随机误差模型的研究

物种演化的随机误差模型的研究

作者：乔丽华河北工业大学

学位级别：硕士

众所周知，生命来源于演化，它是生物学的灵魂。而在演化中，突变又是演化的根源。所以在生物演化动力学理论工作中，我们应更好地处理突变率这一重要物理量，从而为解释生命中的一些实际现象做铺垫。在以前的一些关于演化的动力学模型... 详细信息

众所周知，生命来源于演化，它是生物学的灵魂。而在演化中，突变又是演化的根源。所以在生物演化动力学理论工作中，我们应更好地处理突变率这一重要物理量，从而为解释生命中的一些实际现象做铺垫。在以前的一些关于演化的动力学模型中，演化都是确定性描述，把模型随机化还比较少，尤其把模型中突变率随机化的工作至今还没有发现。本项研究主要以Eigen模型为理论框架来研究突变率随机化问题。在Eigen模型中某一位点的突变率是一个确定值，但是我们知道演化在分子水平是受多方面因素影响的，无论是基因因素还是基因外环境因素，突变率都应该是随空间和时间改变的，应该是随机的。所以在本项研究中，我们首先把突变率看成是随机的高斯分布量，从而把确定性模型转化成随机模型，这样可以使Eigen模型更符合现实;其次，把这种突变率随机化的模型进一步延伸，通过定量改变适应度，观察其对突变率随机化的影响;再次，我们把适应度和突变率同时高斯随机化，并把这种同时随机化模型与之前的适应度和突变率单独随机化模型进行了对比。通过这些随机化模型与确定性模型的比较，我们发现随机模型的误差阈都是由一个相变点变成一个随变量涨落强度改变的相变区域;同时我们还发现适应度定量改变时，突变率随机模型的误差阈随适应度中主序列和突变序列的比值的增大而变宽，但与各序列适应度的大小无关;最后我们还发现，其它参数相同的时候，同时随机化模型与之前的适应度和突变率单独随机化模型得到的误差阈的宽度近似满足线性叠加的关系。这些结论可以为解释生活中的一些问题或现象做更好的铺垫。例如，病毒、突变育种及癌症等等。

关键词： Eigen模型高斯随机变量突变率准物种误差阈涨落强度

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

Eigen模型中突变率随机化的研究

Eigen模型中突变率随机化的研究

作者：田中修河北工业大学

学位级别：硕士

Eigen模型是描述微观分子物种演化的动力学模型,其用数学形式描述了选择与突变相互耦合的生物进化过程,对于物种的起源与进化、生物多样性的研究具有重要的理论意义。1989年,Eigen等提出了准物种和误差阈的预言,为研究病毒的演化和新的... 详细信息

Eigen模型是描述微观分子物种演化的动力学模型,其用数学形式描述了选择与突变相互耦合的生物进化过程,对于物种的起源与进化、生物多样性的研究具有重要的理论意义。1989年,Eigen等提出了准物种和误差阈的预言,为研究病毒的演化和新的抗病毒策略提供了理论基础。物种演化可以看做是生物群体与其周围环境相互作用的随机过程,而随机突变则为物种的自然选择提供了丰富的基础材料,是物种演化随机过程中的一个重要的因素。关于物种演化过程中突变随机效应的研究目前较少。在Eigen模型的基础上分析突变率的作用及随机效应对于理论模型的实际化具有重要意义。本文利用解析的方法求解准物种方程的精确解;利用系综平均的方法给出准物种和误差阈的数值模拟。物种演化模型中的一些物理参量是受外界环境涨落影响的,把模型中的物理参量处理为高斯分布随机变量,得到以下主要结果:1、把模型中的适应度和突变率这两个物理参量同时处理为高斯分布随机变量,当二者同步耦合随机化时,转变区域的宽度与适应度的涨落强度呈线性关系;转变区域的宽度与突变率的涨落强度呈指数型关系。2、把模型中的适应度和突变率这两个物理参量同时处理为高斯分布随机变量,当二者在非同步耦合随机化的情况下,转变区域的宽度与变量涨落强度间的关系与之前相一致。此时,不同的涨落强度下,变量与转变区域的宽度呈现出不同的趋势。3、当适应度和突变率二者同时随机化时,突变率随机化占据了主导地位,将突变概率矩阵中矩阵元作进一步的分析,进而研究误差阈的展宽机制。

关键词：准物种误差阈突变率突变概率矩阵