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巴马汀抗脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定

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中国现代应用药学 2018年第11期35卷 1602-1605页

作者：徐煜彬张洪伟陈赛贞陈桂荣郭松台州市中心医院台州学院附属医院药剂科浙江台州318000 辽宁中医药大学药学院辽宁大连116600 沈阳体育学院计算机教研室沈阳110102

目的研究巴马汀的分子特性,筛选并鉴定巴马汀抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)分析巴马汀的药理参数和分子特性;通过TCMSP和DRAR-CPI软件筛选巴马汀抗脓毒症的潜在靶点;进一步通过分子对接软件鉴定... 详细信息

目的研究巴马汀的分子特性,筛选并鉴定巴马汀抗脓毒症的潜在靶点。方法通过中药系统药理学数据库和分析平台(TCMSP)分析巴马汀的药理参数和分子特性;通过TCMSP和DRAR-CPI软件筛选巴马汀抗脓毒症的潜在靶点;进一步通过分子对接软件鉴定巴马汀抗脓毒症的潜在靶点,免疫组化法验证潜在靶点。结果巴马汀口服生物利用率为64.60%,血脑屏障渗透率为0.37,药物相似度为0.65,具有很好的成药性;通过TCMSP和DRAR-CPI软件共筛选到3个潜在靶点,经分子对接软件鉴定NOS3为巴马汀抗脓毒症的潜在靶点,免疫组化结果表明巴马汀能显著下调脓毒症大鼠NOS3的表达。结论巴马汀具有很好的成药性,其可能通过结合并激活NOS3保护心肌抑制起到抗脓毒症的作用。

关键词：巴马汀靶点计算钓靶法脓毒症

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木犀草素抗骨性关节炎潜在靶点的筛选与鉴定

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浙江中医药大学学报 2020年第4期44卷 381-386页

作者：徐强李海燕金刚台州恩泽医疗中心(集团)恩泽医院浙江台州318053 台州恩泽医疗中心(集团)路桥医院

[目的]研究木犀草素的分子特性,筛选并鉴定木犀草素抗骨性关节炎(osteoarthritis,OA)的潜在靶点。[方法]通过中药系统药理学数据库及分析平台(Traditional Chinese Medicine Systems Pharmacology Database and Analysis Platform,TCMSP)分析木犀草素的药理参数和分子特性;通过Swiss TargetPrediction和药物再定位及药物不良反应预测(predict drug repositioning and adverse drug reaction,DRAR-CPI)软件筛选木犀草素抗OA的潜在靶点;通过人类孟德尔遗传(Online Mendelian Inheritance in Man,OMIM)数据库、比较毒物遗传学数据库(The Comparative Toxicogenomics Database,CTD)和药物靶标数据库(Therapeutic Target Database,TTD)筛选已报道与OA相关的疾病靶点,并与木犀草素潜在靶点进行匹配,确定木犀草素抗OA的靶点,进一步采用分子对接软件对木犀草素抗OA的潜在靶点进行鉴定。[结果]木犀草素口服生物利用率为36.16%,药物相似度为0.25,具有很好的成药性;Swiss TargetPrediction和DRAR-CPI软件共筛选出6个潜在靶点,与OA直接相关的靶点有3个,经分子对接软件鉴定,间质胶原酶1/基质金属蛋白酶1(interstitial collagenase 1/matrix metalloproteinase 1,MMP1)和基质分解素-1/基质金属蛋白酶3(stromelysin-1/matrix metalloproteinase 3,MMP3)为木犀草素抗OA的潜在靶点。[结论]木犀草素可能通过结合MMP1和MMP3,下调其表达量,最终缓解OA的炎症反应。

关键词：木犀草素靶点计算钓靶法骨性关节炎分子对接 MMP1 MMP3

苏荠黄酮抗新型冠状病毒肺炎并发症-脓毒症潜在靶点的筛选与鉴定

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辽宁中医杂志 2021年第7期48卷 166-169,259页

作者：陈桂荣刘雨浓徐煜彬窦德强辽宁中医药大学辽宁大连116600 台州市中心医院台州学院附属医院浙江台州318000

目的研究苏荠黄酮的分子特性,筛选并鉴定苏荠黄酮抗新型冠状病毒肺炎并发症-脓毒症的潜在靶点。方法通过TCMSP数据库分析苏荠黄酮的药理参数和分子特性;通过Swiss Targetprediction和DRAR-CPI软件筛选苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点;通过O... 详细信息

目的研究苏荠黄酮的分子特性,筛选并鉴定苏荠黄酮抗新型冠状病毒肺炎并发症-脓毒症的潜在靶点。方法通过TCMSP数据库分析苏荠黄酮的药理参数和分子特性;通过Swiss Targetprediction和DRAR-CPI软件筛选苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点;通过OMIM、CTD和TTD数据库中已报道的与抗脓毒症相关疾病靶标进行筛选苏荠黄酮抗脓毒症的靶点,进一步通过分子对接软件鉴定苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点。结果苏荠黄酮口服生物利用率为44.09%,药物相似度为0.25,具有很好的成药性;通过Swiss Targetprediction和DRAR-CPI软件共筛选到108个潜在靶点,与脓毒症直接相关的靶点有9个,经分子对接软件鉴定F9、ADORA1、ADORA2A、NOS2、NOS3、CTSG、PROC、SERPINE1和PTGS2为苏荠黄酮抗脓毒症的潜在靶点。结论苏荠黄酮能通过与筛选的9个靶标进行结合,通过调控ADORA1、ADORA2A、PTGS2、CTSG、NOS2和NOS3减少炎症,调控PROC、SERPINE1和F9抑制凝血并较少脓毒症的炎症反应及降低脓毒症凝血疾病,最终预防和治疗脓毒症。该研究为新型冠状病毒肺炎患者脓毒症并发症的预治研究奠定基础,具有良好的研究前景。

关键词：苏荠黄酮靶点计算钓靶法脓毒症