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人工养殖斑鰶不同月龄表型性状的主成分与判别分析

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水产学报 2024年第3期48卷 135-144页

作者：平洪领张涛史会来付铁中何杰李彬卢斌俞学军浙江省海洋水产研究所浙江省海水增养殖重点实验室浙江海洋大学水产学院

为研究斑鰶不同月龄表型性状的生长规律和特征，及最佳生长季节各性状与月龄的关系。采用主成分和判别分析的方法对2、4、6和8月龄斑鰶的全长、体长、头长、躯干长、尾柄长、眼径、体高、尾柄高、体宽、眼间距和体重等11个性状进行分析... 详细信息

为研究斑鰶不同月龄表型性状的生长规律和特征，及最佳生长季节各性状与月龄的关系。采用主成分和判别分析的方法对2、4、6和8月龄斑鰶的全长、体长、头长、躯干长、尾柄长、眼径、体高、尾柄高、体宽、眼间距和体重等11个性状进行分析。结果显示，斑鰶不同月龄各性状指标间呈现不同程度的正相关，各月龄的体重与全长、体长、体高和体宽的相关系数均较大，眼径和眼间距2个性状与其他性状之间的相关系数均较小，8月龄各性状对体重的相关系数均小于2、4和6月龄。斑鰶不同月龄性状的主成分有所不同，各月龄第一主成分均以增重、增长的生长发育特性为主；第二主成分为2月龄指向体宽的发育情况，4、6和8月龄指向眼径发育情况；第三主成分为2和4月龄反映头部发育情况，6月龄反映眼径发育情况，8月龄反映体宽的发育情况。通过逐步判别分析法，剔除掉3个性状指标，建立各月龄的判别函数式，总的判别准确率为99.3%,2、4和8月龄的判别准确率达到100%。斑鰶2～8月龄的体长与体重的关系为W=0.017L2.929(R2=0.981)。研究表明，全长、体长、体高和体宽是影响斑鰶生长发育最重要的表型性状指标，建立了不同生长阶段的判别函数式，生长方式为等速生长(2～8月龄)。本研究为斑鰶的选择育种工作提供理论依据和建议测量指标。

关键词：斑鰶表型性状主成分分析判别分析

普通油茶良种资源表型性状多样性分析与综合评价

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浙江大学学报（农业与生命科学版） 2024年第2期50卷 244-257页

作者：邢凯峰张剑陈尚张立冬谢昊星赵耀戎俊南昌大学生命科学学院江西南昌330031

普通油茶(Camellia oleifera)是我国总产油量最高、栽培面积最广的木本油料作物。为促进我国普通油茶良种资源的挖掘与利用,本研究使用主成分分析、相关性分析、聚类分析、巢式方差分析、多元回归分析等方法以及变异系数、表型分化系数... 详细信息

普通油茶(Camellia oleifera)是我国总产油量最高、栽培面积最广的木本油料作物。为促进我国普通油茶良种资源的挖掘与利用,本研究使用主成分分析、相关性分析、聚类分析、巢式方差分析、多元回归分析等方法以及变异系数、表型分化系数、香农-维纳多样性指数,探究560份普通油茶良种资源的表型性状多样性及其与环境因子的相关性,并使用熵权TOPSIS法对560份普通油茶良种资源进行综合评价和排序。结果表明,560份普通油茶良种资源存在丰富的遗传多样性,34个表型性状的香农-维纳多样性指数为0.05~2.35,均值为1.06,数量性状的变异系数为3.02%~53.33%,均值为23.25%。普通油茶良种资源34个表型性状种源间和种源内的方差分量均值分别为53.591%和32.382%,说明普通油茶良种资源表型性状种源内相似性较高,其分化主要来自种源间。随着纬度的升高和年平均温度的降低,普通油茶良种资源平均单果质量、种仁含油率及饱和脂肪酸含量呈现下降趋势,而不饱和脂肪酸含量呈现上升趋势,表明纬度和年平均温度是限制普通油茶生长的主要因子。熵权TOPSIS法综合评价和排序结果显示,长林4号综合得分指数最高,浙江、云南、安徽、湖南等地区均有多个选育的良种综合排名在前30以内。本研究结果为普通油茶育种及良种推广提供了数据支撑。

关键词：普通油茶良种资源表型性状熵权TOPSIS法综合评价

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32份早熟禾种质资源表型性状遗传多样性分析

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草业科学 2024年第6期41卷 1324-1335页

作者：金玲宋美琪鲍根生刘勇徐航何霖魏小星青海大学畜牧兽医科学院/青海省青藏高原优良牧草种质资源利用重点实验室青海西宁810016

本研究以32份早熟禾(Poa)种质资源为研究对象,利用多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析,评价其表型性状的变异水平,为青藏高原高寒地区早熟禾种质资源的品种选育提供依据。结果表明:通过多样性分析,遗传多样性指数最高的是总... 详细信息

本研究以32份早熟禾(Poa)种质资源为研究对象,利用多样性分析、相关性分析、主成分分析和聚类分析,评价其表型性状的变异水平,为青藏高原高寒地区早熟禾种质资源的品种选育提供依据。结果表明:通过多样性分析,遗传多样性指数最高的是总生物量(H′=2.21),变异系数最大的是株高(31.70%),其次是根长(22.04%)、总生物量(19.21%)和茎粗(16.38%);通过主成分分析得出第1主成分贡献率最大(30.274%),载荷量由高到低分别是花序长(0.748)、叶面积(0.746)、叶宽(0.705)、茎粗(0.704);通过聚类分析和综合得分,将资源分为Ⅲ大类,第Ⅰ类具有植株高大、茎叶比大、花序多,茎秆粗壮等特点,筛选出18-182、18-004、17-060这3份材料适合在饲草生产、混播草地等方面应用;第Ⅱ类具有植株矮小、叶片短而宽等特点,筛选出14-061这1份材料适合在生态恢复方面加以利用;第Ⅲ类具有植株矮小、叶片长而窄、生物量大等特点,筛选出17-105、17-332、18-064、18-139、15-048、17-044这6份材料可作为观赏利用型目标亲本进行品种培育。

关键词：早熟禾种质资源遗传多样性表型性状筛选优质种质表型变异性表型多样性

基于材用云南松表型性状构建核心种质策略研究

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西北植物学报 2024年第2期44卷 288-299页

作者：李华付朴艳闫熙曹子林王晓丽西南林业大学林学院昆明650224 西南林业大学生态与环境学院昆明650224

【目的】研究旨在构建可靠的材用云南松核心种质,加强其种质资源选育、开发利用,解决其种质资源分布广、保存成本高、保存难度大等问题,促进云南松种质资源有效利用。【方法】以云南松26个天然居群的780株样株为原种质,以18个表型性状... 详细信息

【目的】研究旨在构建可靠的材用云南松核心种质,加强其种质资源选育、开发利用,解决其种质资源分布广、保存成本高、保存难度大等问题,促进云南松种质资源有效利用。【方法】以云南松26个天然居群的780株样株为原种质,以18个表型性状为原数据,利用2种不同构建策略(利用地理角度与改进的最小距离逐步取样法),探讨不同构建策略所构建的核心种质对原种质的代表性。【结果】(1)地理角度构建出的包含219株样株的种质子集,其遗传多样性指数显著低于改进的最小距离逐步取样法构建的4个种质子集,略高于原种质;该种质子集与原种质的MD值为3.921%,VD值为83.333%,CR值为82.207%,VR值为99.482%;通过对原种质与该种质子集18个性状做主成分分析,累计贡献率分别为79.376%和82.163%,其种质子集样株分布相对集中。(2)改进的最小距离逐步取样法构建的4个抽样比例分别为10%、20%、30%和40%的种质子集中,其中20%抽样比例的种质子集效果最好,该种质子集的多样性指数极显著大于原种质;20%抽样比例种质子集与原种质的MD值为6.363%,VD值为83.333%,CR值为91.099%,VR值为124.448%;对20%抽样比例的种质子集进行主成分分析,累计贡献率为83.539%,且高于原种质,该种质子集样株分布范围覆盖了整个取样范围。【结论】不同方法构建的核心种质均获得原种质不同程度遗传多样性,这2种构建结果均可代表材用云南松种质资源核心种质;而地理角度构建的种质子集在种质资源采集、保存和更新方面更具有优势,可为材用云南松种质资源保存和优良种质选育提供科学方法,同时为其他种质资源的构建提供一种新的参考方法。

关键词：云南松核心种质地理角度 Arcgis 表型性状

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中国皱木耳类群种质资源鉴定和表型性状分析

菌物学报 2024年

作者：曹雪莲陈影王迪唐杰谢丽源刘理旭四川省食用菌研究所国家农业微生物新都观测实验站

以我国27株皱木耳类群种质资源为材料，利用ITS进行分子鉴定，采用多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法，对16个表型性状进行评价。结果表明：供试菌株鉴定为皱木耳类群中的两个物种中国皱木耳和皱木耳；16个表型性状的... 详细信息

以我国27株皱木耳类群种质资源为材料，利用ITS进行分子鉴定，采用多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析等方法，对16个表型性状进行评价。结果表明：供试菌株鉴定为皱木耳类群中的两个物种中国皱木耳和皱木耳；16个表型性状的Shannon-Wiener’s多样性指数范围为0.42–1.60，平均值0.97；4个数量性状变异系数范围为4.35%–26.49%；部分表型性状间存在相关性；经聚类分析，在欧氏距离1.54处，划分为3个类群，5个表型性状即菌丝体胶质物、菌丝体（栽培种）菌棒颜色变化、鲜耳片腹面主要颜色、耳片质地和子实体成熟期为类群划分的指标性状；主成分分析将16个表型性状转化为5个主成分，累计贡献率为81.55%，第1主成分的方差贡献率26.67%，命名为子实体颜色性状因子、第2主成分的方差贡献率是23.05%，为菌丝体性状因子、第3主成分方差贡献率仅为12.89%，定为生育期-商品性状因子。经综合分析筛选出菌丝体胶质物、鲜耳片腹面主要颜色和子实体成熟期等3个表型性状作为种质评价关键指标。

关键词：皱木耳种质资源表型性状多样性

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新疆石榴表型性状分析及分子身份证构建

江苏农业学报 2024年第6期40卷 1098-1110页

作者：盛秀丽周茜马刘峰方志刚陈芸喀什大学生命与地理科学学院/新疆帕米尔高原生物资源与生态重点实验室

为快速鉴别石榴种质资源，解决石榴“同名异物”、“同物异名”现象，促进新疆石榴产业的发展，本研究在采集新疆石榴主产区24份种质的基础上，分析新疆石榴种质叶片及果实表型性状的变异特征，选择多态性较好的18条引物对石榴种质进行... 详细信息

为快速鉴别石榴种质资源，解决石榴“同名异物”、“同物异名”现象，促进新疆石榴产业的发展，本研究在采集新疆石榴主产区24份种质的基础上，分析新疆石榴种质叶片及果实表型性状的变异特征，选择多态性较好的18条引物对石榴种质进行遗传多样性分析及亲缘关系鉴定，并从中选出可将24份石榴种质鉴别出来的核心引物构建新疆石榴的分子身份证。结果表明：新疆石榴的果实、叶片形状变异较大，遗传多样性较为丰富，但仅从表型性状很难将石榴种质进行精准鉴别。18条引物共扩增出240条条带，其中多态性条带199条，占比为82.92%。24份种质的平均等位基因数为1.812 5,有效等位基因数为1.287 0,Nei’s基因多样性指数为0.177 0,Shannon’s多样性指数为0.282 0;和田地区石榴种质的Nei’s基因多样性指数及Shannon’s多样性指数高于喀什地区石榴种质。在遗传相似系数为0.85时，24份石榴种质被分为6大类群，且石榴的分类结果与果实风味和地理位置的关联性不大。5条核心引物UBC73、UBC880、UBC810、UBC841、UBC35可实现24份石榴种质的鉴别，以其扩增的电泳图谱所构建的新疆石榴的分子身份证也互不相同，表明24份种质不存在“同名异物”、“同物异名”现象。本研究结果为石榴种质鉴定提供了一种新方法。

关键词：石榴遗传多样性表型性状分子身份证

基于表型性状和SNP标记构建桂花主要品种资源的分子身份证

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南京林业大学学报（自然科学版） 2024年第4期48卷 12-24页

作者：王一涵刘姣姣金沛权李书情魏建芬郭朋尚富德河南农业大学生命科学学院河南省桂花种质创新与资源利用工程研究中心河南郑州450046 杭州桂花国家种质资源库浙江杭州310020

【目的】筛选核心单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,建立基于KASP平台的桂花(Osmanthus fragrans)品种基因型快速检测方法,构建品种特异性分子身份证,为桂花品种鉴定、溯源、知识产权保护等提供理论基础。【方... 详细信息

【目的】筛选核心单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点,建立基于KASP平台的桂花(Osmanthus fragrans)品种基因型快速检测方法,构建品种特异性分子身份证,为桂花品种鉴定、溯源、知识产权保护等提供理论基础。【方法】实地调查主流桂花栽培品种的重要表型特征。通过两轮严格筛选,从基因组SNP中保留一组能够完全鉴别测序品种的最优SNP标记,计算SNP位点的多态信息含量(PIC)、期望杂合度(He)等信息。以‘日香桂’(‘Rixianggui’)基因组为参考,设计桂花特异性KASP引物并进行批量扩增,根据基因分型结果建立品种指纹图谱,评估核心SNP标记的品种鉴别力。结合品种表型信息码和品种分子指纹码构建桂花品种资源的分子身份证。【结果】筛选出14个能够完全鉴别测序品种的核心SNP位点。各位点PIC值的变化范围为0.246~0.375,平均值为0.335;He的变化范围为0.288~0.500,平均值为0.431。针对核心位点设计的KASP引物基因分型准确。根据扩增结果构建DNA指纹图谱,可区分全部包括未测序品种在内的90个参试品种。对品种表型特征赋值,结合指纹码构建由34位数字组成的桂花品种资源分子身份证。【结论】确定了SNP1—SNP14共14个核心SNP位点,能够实现至少90个桂花品种的有效鉴别。结合品种群类型、表型特征和分子指纹码构建了90个桂花品种的唯一分子身份证,并生成对应的条形码和二维码。

关键词：桂花品种鉴别单核苷酸多态性表型性状分子身份证

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基于表型性状和品质性状的苦荞核心种质构建

植物遗传资源学报 2024年

作者：马名川赵少迪胡传伟刘璋张丽君刘龙龙山西农业大学农业基因资源研究中心/农业农村部黄土高原作物基因资源与种质创制重点实验室/杂粮种质资源发掘与遗传改良山西省重点实验室山西农业大学农学院

本研究利用708份国内外苦荞资源的22个表型性状和3个品质性状数据，进行苦荞核心种质构建。通过比较遗传距离、取样方法、取样比例和聚类方法4个层面的不同组合策略优劣，确定了苦荞核心种质的最佳取样策略为“欧氏距离+多次聚类偏离度... 详细信息

本研究利用708份国内外苦荞资源的22个表型性状和3个品质性状数据，进行苦荞核心种质构建。通过比较遗传距离、取样方法、取样比例和聚类方法4个层面的不同组合策略优劣，确定了苦荞核心种质的最佳取样策略为“欧氏距离+多次聚类偏离度取样法+20%取样比例+最长距离法”，构建了包含141份苦荞资源的核心种质。核心种质和原始种质的均值差异百分率、方差差异百分率、极差符合率和变异系数变化率分别为 0、84%、97.60%和115.42%。比较核心种质与原始种质各性状的均值、方差、极值、变异系数、多样性指数和主成分对核心种质进行验证和评价，核心种质与原始种质在25个性状上的均值无显著差异，核心种质方差和变异系数大于原始种质，有更强的异质性，多样性指数t检验表明，核心种质与原始种质多样性指数在所有性状上差异均不显著；主成分检验表明，核心种质与原始种质均有8个主成分，累计贡献率分别为77.525%和76.191%，所构建核心种质能较好地代表原始种质，可作为苦荞种质资源收集保存和有效利用的依据。

关键词：苦荞表型性状品质性状核心种质

牛肉红朱橘种质表型性状和果实内在品质多样性分析

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种子 2024年第08期43卷 20-26页

作者：王丽丽王贵周凤文雅安李蕊蕊乔光贵州省农业科学院贵州大学农业生物工程研究院/山地植物资源保护与种质创新教育部重点实验室

为了解牛肉红朱橘种质性状遗传多样性，本研究以24份牛肉红朱橘特异种质为材料，选取37个表型性状和果实内在品质性状进行遗传多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明，牛肉红朱橘果实性状多样性较为丰富，其中果顶形... 详细信息

为了解牛肉红朱橘种质性状遗传多样性，本研究以24份牛肉红朱橘特异种质为材料，选取37个表型性状和果实内在品质性状进行遗传多样性分析、相关性分析、聚类分析和主成分分析。结果表明，牛肉红朱橘果实性状多样性较为丰富，其中果顶形状、果面颜色、种子数、种子重量和单果重等性状变异程度较高。相关性分析表明，果实表型间呈显著正相关，但与可溶性固形物和可滴定酸含量等呈极显著负相关。聚类分析将24份牛肉红朱橘种质分为两大类，分别作为以果实外观品质和内在品质为目标性状的育种材料。主成分分析提取前5个主成分，其累积贡献率达82.257%。

关键词：牛肉红朱橘种质资源表型性状果实品质遗传多样性