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13价肺炎球菌结合疫苗针对血清型19A所致儿童侵袭性肺炎球菌性疾病保护效果的Meta分析

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中华预防医学杂志 2023年第12期57卷 2181-2187页

作者：卢肇骏刘艳杜渐王骏车鑫仁江伟张小平顾雯雯许玉洋张学潮王婧谢启新杨瑛莹谷林涛杭州市疾病预防控制中心免疫所杭州310021

目的通过Meta分析系统评价13价肺炎球菌结合疫苗(PCV13)针对血清型19A所致侵袭性肺炎球菌性疾病(IPD)对<5岁儿童的保护效果。方法以Streptococcus pneumoniae infection、invasive pneumococcal disease、13-valent pneumococcal polysa... 详细信息

目的通过Meta分析系统评价13价肺炎球菌结合疫苗(PCV13)针对血清型19A所致侵袭性肺炎球菌性疾病(IPD)对型包括队列研究、病例对照研究和随机对照试验,由两位研究者独立进行文献筛选、数据提取并使用纽卡斯尔-渥太华量表(The Newcastle-Ottawa Scale,NOS)进行文献质量评价,采用Stata软件开展数据分析。结果共搜索到相关文献2340篇,最终纳入文献10篇,其中病例对照研究5篇,间接队列研究5篇,文献质量较好。PCV13针对血清型19A所致儿童IPD的保护效果为83.91%(95%CI:78.92%~88.89%),根据研究类型开展亚组分析,结果显示病例对照研究(VE=87.34%,95%CI:79.74%~94.94%)与间接队列研究(VE=81.30%,95%CI:74.69%~87.92%)之间不存在组间差异(P=0.240)。漏斗图和Egger检验认为存在发表偏倚可能性小。结论PCV13对血清型19A所致儿童IPD具有较好的保护效果,建议进一步提高PCV13接种率以降低<5岁儿童IPD的疾病负担。

关键词：肺炎球菌结合疫苗血清型疫苗效果 Meta分析

2017—2020年江苏省无锡市沙门菌的血清型与耐药性研究

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中国食品卫生杂志 2022年第6期34卷 1172-1178页

作者：韩毅沙丹张娜娜姚国君倪虹周虹无锡市疾病预防控制中心江苏无锡214023

目的分析2017—2020年江苏省无锡市沙门菌报告病例的血清型特点和抗生素耐药性流行特征及变化趋势。方法收集分离自2017—2020年无锡市食源性疾病哨点监测医院腹泻病例(住院和门诊患者)标本中的216株沙门菌菌株,采用玻片凝集法对216... 详细信息

目的分析2017—2020年江苏省无锡市沙门菌报告病例的血清型特点和抗生素耐药性流行特征及变化趋势。方法收集分离自2017—2020年无锡市食源性疾病哨点监测医院腹泻病例(住院和门诊患者)标本中的216株沙门菌菌株,采用玻片凝集法对216株菌进行血清型鉴定及分析,并采用微量肉汤稀释法检测沙门菌对13种抗生素的药物敏感性。结果 216株沙门菌分为42种血清型,优势血清型分别为肠炎沙门菌28.70%(62/216)占比,鼠伤寒沙门菌26.39%(57/216)。耐药性分析结果显示,216株沙门菌对美洛培南、阿米卡星、阿奇霉素和头孢他啶高度敏感,高敏菌株占比均高于90%;所有沙门菌对氨苄西林的耐药率最高,达到68.06%,对美洛培南的耐药率最低,仅0.46%;沙门菌在2017—2020年对氨苄西林的耐药率呈逐年增高的趋势,且每年沙门菌分离株对氨苄西林耐药性最高;共130株菌株产生了多重耐药性(60.19%),耐药菌株数最多的耐药谱为AMP-TET-STR,占比5.56%(12/216),优势耐药谱不明显。结论无锡市沙门菌的流行血清型以肠炎沙门菌和鼠伤寒沙门菌为主,且沙门菌耐药性形势严峻,应该尽快建立高效的管控机制,加强药敏监测,优化治疗方案,避免抗生素滥用。

关键词：沙门菌血清型耐药性

2015—2020年宜宾市肉类食品沙门菌血清型及分子分型研究

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中国食品卫生杂志 2023年第3期35卷 321-325页

作者：刘欣玲王烜邓开旗黄玥张莹李玖洪毛俐张红成都医学院公共卫生学院四川成都610500 宜宾市疾病预防控制中心四川宜宾644600

目的研究宜宾市肉类食品中沙门菌分离株的血清型和分子分型特征,分析沙门菌污染的危险因素。方法收集2015—2020年宜宾市辖区(县)肉类食品沙门菌分离株29株,进行血清型鉴定和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析,并就地域、物种来源和售... 详细信息

目的研究宜宾市肉类食品中沙门菌分离株的血清型和分子分型特征,分析沙门菌污染的危险因素。方法收集2015—2020年宜宾市辖区(县)肉类食品沙门菌分离株29株,进行血清型鉴定和脉冲场凝胶电泳(PFGE)分子分型分析,并就地域、物种来源和售卖方式对沙门菌血清群检出构成比的影响进行多因素Logistic回归分析。结果29株沙门菌分离株共检出14种血清型(分属4个群),主要优势血清型为鼠伤寒沙门菌、吉韦沙门菌和肠炎沙门菌。聚类分析显示PFGE分子分型为18种带型。肠炎沙门菌带型相似度100%,来自同一传染链;吉韦沙门菌有2种带型,鼠伤寒沙门菌有4种带型,相似度较差;多因素Logistic分析显示,影响D群沙门菌检出的主要危险因素为地域分布(OR=1.053,P<0.05);影响E群沙门菌检出的主要危险因素为物种来源(OR=3.887,P<0.05)和地域分布(OR=1.227,P<0.05)。结论监管部门应从家禽养殖地地域来源和肉类物种来源两个方面加强宜宾市肉类食品安全监督。

关键词：沙门菌血清型分子分型多因素分析

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侵袭性非伤寒沙门菌血清型和耐药性分析

中华流行病学杂志 2021年第3期42卷 549-554页

作者：胡豫杰许学斌王艳王伟崔鑫楠何琼玉李孟寒徐进李凤琴国家食品安全风险评估中心国家卫生健康委员会食品安全风险评估重点实验室北京100021 上海市疾病预防控制中心病原微生物所 200336 北京积水潭医院检验科 100035 北京农学院食品科学与工程学院 102206 都柏林大学学院食品安全中心都柏林D04 N2E5

目的分析7株侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的血清型和耐药性。方法针对收集的7株iNTS菌株,开展血清学鉴定、药物敏感性实验以及全基因组测序,并对血清型、MLST型和耐药基因进行鉴定、注释和分析。结果7株iNTS菌株中,包含1株鼠伤寒血清型和2... 详细信息

目的分析7株侵袭性非伤寒沙门菌(iNTS)的血清型和耐药性。方法针对收集的7株iNTS菌株,开展血清学鉴定、药物敏感性实验以及全基因组测序,并对血清型、MLST型和耐药基因进行鉴定、注释和分析。结果7株iNTS菌株中,包含1株鼠伤寒血清型和2株Ⅰ4,[5],12:i:-(ST34型)、2株肠炎血清型、1株科瓦利斯血清型和1株未知血清型Ⅰ4,[5],12:d:-(ST279型),其中6株为单相菌,沙门菌二相鞭毛基因缺失或假基因化可能有助于增强沙门菌侵袭性。未发现替加环素、氨曲南、阿米卡星及头孢类、碳青霉烯类抗生素耐药株,存在1株八重耐药鼠伤寒沙门菌。耐药基因与耐药表型基本相符。结论本研究中的iNTS菌株存在八重耐药株,整体耐药水平尚低但不可忽视。

关键词：侵袭性非伤寒沙门菌血清型耐药性

住院患儿感染流感嗜血杆菌的血清型和耐药特点分析

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中华实用儿科临床杂志 2022年第2期37卷 112-115页

作者：李静周林徐文健马丽娟首都儿科研究所附属儿童医院检验中心北京100020

目的探讨分离住院患儿流感嗜血杆菌血清型、耐药性及β-内酰胺酶基因型特征,为临床诊治提供参考。方法回顾性分析2016年1月至2018年12月首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿临床培养分离的流感嗜血杆菌148株,应用乳胶凝集法进行荚膜血... 详细信息

目的探讨分离住院患儿流感嗜血杆菌血清型、耐药性及β-内酰胺酶基因型特征,为临床诊治提供参考。方法回顾性分析2016年1月至2018年12月首都儿科研究所附属儿童医院住院患儿临床培养分离的流感嗜血杆菌148株,应用乳胶凝集法进行荚膜血清分型,PCR法检测荚膜基因。E-test和纸片扩散法检测分离株对氨苄西林等抗菌药物的敏感性,采用χ^(2)检验进行耐药率的比较。头孢硝噻吩纸片法检测细菌产β-内酰胺酶表型,PCR法检测β-内酰胺酶基因TEM-1和ROB-1的携带情况。结果148株流感嗜血杆菌荚膜血清分型均为不可分型,未扩增出荚膜基因。菌株对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦、头孢呋辛和阿奇霉素的耐药率分别为68.9%(102/148株)、40.5%(60/148株)、53.4%(79/148株)和56.1%(83/148株),对甲氧苄啶-磺胺甲唑的耐药率最高,达91.9%(136/148株)。分离株对头孢曲松、美罗培南和左氧氟沙星100.0%(148/148株)敏感。β-内酰胺酶阳性菌株占64.8%(96/148株),基因型均为TEM-1。β-内酰胺酶阳性菌株对氨苄西林、氨苄西林/舒巴坦和阿奇霉素的耐药率显著高于β-内酰胺酶阴性菌株(χ;=123.222,27.973,70.273,均P型流感嗜血杆菌是当前儿童临床感染分离株的主要型别。不可分型流感嗜血杆菌对氨苄西林耐药率较高,主要耐药机制为携带TEM-1基因。头孢曲松和美罗培南对流感嗜血杆菌保持着高度抗菌活性。

关键词：流感嗜血杆菌儿童血清型 β-内酰胺酶耐药基因

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苏州市沙门氏菌血清型、耐药及分子分型分析

微生物学通报 2024年

作者：王小龙邹文燕朱莉勤张梦寒沈强苏州市疾病预防控制中心病原微生物与生物检验科

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST... 详细信息

【背景】沙门氏菌是一种人兽共患病病原菌，是引起人类感染性腹泻最常见的病原菌之一。【目的】分析苏州市2023年分离的176株沙门氏菌的血清型、耐药情况和分子分型。【方法】血清型鉴定采用玻片凝集法；药敏试验采用微量肉汤法；MLST分型采用全基因组测序，测序结果与PubMLST数据库进行比对得出菌株的ST型别。【结果】176株沙门氏菌共鉴定出了42种血清型分属于9个血清群。血清型以肠炎沙门氏菌(Salmonella enteritidis，26.70%）和鼠伤寒沙门氏菌(Salmonella typhimurium，18.75%），为优势血清型。176株菌对氨苄西林的耐药率最高(60.23%)，其次是链霉素(47.16%)。所有菌株均对头孢他啶/阿维巴坦、美罗培南、厄他培南和阿米卡星敏感。多重耐药率达到57.39%，多重耐药模式达到51种，其中包含青霉素类+β-内酰胺/β-内酰胺抑制剂复合物+头孢类的多重耐药模式有18种。176株菌共检出43种ST型别，检出率前三的ST型别分别为ST11、ST34和ST19，检出率分别为27.27%、10.80%和7.95%。【结论】苏州市沙门氏菌的血清型和ST型别种类多，血清型以肠炎沙门氏菌和鼠伤寒沙门氏菌为优势型别，ST型以ST11为优势型别。多重耐药现象严重，应加强监测。

关键词：沙门氏菌血清型耐药 ST型别

新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的分群、血清型鉴定及耐药性分析

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畜牧兽医学报 2023年第1期54卷 414-420页

作者：佟盼盼黄顺敏王芋丹施旭辉陈文霞宋鑫龙张毅苏战强谢金鑫新疆农业大学动物医学学院乌鲁木齐830052

旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR... 详细信息

旨在了解新疆地区腹泻仔猪源大肠杆菌的系统进化分群、血清型及耐药性。本研究对154份腹泻仔猪粪便样品进行大肠杆菌的分离鉴定,采用多重PCR方法对分离株进行系统进化分群和O血清型鉴定,通过K-B纸片法对其进行药物敏感性检测并通过PCR方法进行耐药基因检测。结果显示:共分离到154株大肠杆菌,包括ETEC(n=24)、STEC(n=21)、EPEC(n=1)、EPEC/STEC(n=2)、ETEC/STEC(n=1)和ETEC/EPEC(n=1),其他104株。系统进化分群显示,多数菌株属于B1(37%)和A群(31%)。定型菌株44株,分别属于10种血清型,以O154、O12、O8、O141和O175为主要流行血清型。151株(98%)为多重耐药菌,对复方新诺明、四环素、氨苄西林、链霉素和氯霉素的耐药率为81%~100%,对阿莫西林/克拉维酸、头孢噻肟、庆大霉素、头孢曲松、环丙沙星和阿米卡星的耐药率为31%~66%,对左氧氟沙星、多黏菌素B、头孢他啶、头孢吡肟、氨苄西林-舒巴坦、哌拉西林-他唑巴坦和亚胺培南的耐药率为1%~19%。耐药基因tetA(88%)、tetG(60%)和cmlA(45%)的携带率较高,而blaCTX-M-1G、aadA1、sul1、aac和blaCTX-M-9G均低于30%,未检测出blaCTX-M-2G、blaTEM、blaSHV和tetE。研究结果表明,新疆腹泻仔猪源大肠杆菌类型复杂,多重耐药形势严峻,耐药基因多样化,且检测出人医临床重要的抗生素耐药表型,应加强对猪场大肠杆菌的耐药性监测。

关键词：腹泻仔猪大肠杆菌系统进化分群血清型耐药性

基于毛细电泳的多重PCR方法检测儿童呼吸道腺病毒感染常见血清型的价值

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中华实用儿科临床杂志 2022年第4期37卷 256-259页

作者：张悦吕芳芳贾晓慧林祖潘温顺航徐智朱浩威张海邻温州医科大学附属第二医院育英儿童医院儿童呼吸科温州325027 瑞安市人民医院儿科温州325200 宁波海尔施基因科技有限公司宁波315040

目的建立一种呼吸道腺病毒常见血清型检测方法,并利用该方法检测温州地区儿童呼吸道人腺病毒(HAdV)感染的主要血清型。方法利用基于毛细电泳的多重PCR法建立呼吸道腺病毒常见12种血清型检测方法,将2018年1月至2019年12月收治于温州医科... 详细信息

目的建立一种呼吸道腺病毒常见血清型检测方法,并利用该方法检测温州地区儿童呼吸道人腺病毒(HAdV)感染的主要血清型。方法利用基于毛细电泳的多重PCR法建立呼吸道腺病毒常见12种血清型检测方法,将2018年1月至2019年12月收治于温州医科大学附属育英儿童医院,经直接免疫荧光法检测HAdV阳性的1059例急性呼吸道感染患儿的呼吸道标本作为研究对象,对其进行回顾性分析,采用多重PCR方法测定HAdV-1、2、3、4、5、7、14、21、37、40、41和55型等12种血清型,同时随机抽取部分标本与一代测序法比较检测结果一致性。结果共收集到1059份HAdV抗原阳性的呼吸道标本,多重PCR法检测发现,1种血清型阳性947例(89.4%),2种血清型混合感染13例(1.2%),阴性24例(2.3%),阳性但不能分型75例(7.1%)。947例单种血清型阳性儿童中,B亚群的HAdV-3型415例(43.8%),HAdV-7型318例(33.6%),HAdV-55型12例(1.2%),HAdV-21型2例(0.2%);C亚群的HAdV-2型108例(11.4%),HAdV-1型70例(7.4%),HAdV-5型16例(1.7%);E亚群的HAdV-4型6例(0.6%)。未检出HAdV-14、HAdV-37、HAdV-40和HAdV-41。随机抽取多重PCR法检测的HAdV分型阳性的标本51例,与一代测序的检测进行比较,均符合。结论建立并验证了基于毛细电泳的多重PCR法对儿童呼吸道腺病毒感染常见血清型的诊断价值。B亚群的HAdV-3、HAdV-7和C亚群的HAdV-2、HAdV-1为温州地区儿童呼吸道腺病毒感染的主要血清型,HAdV-14、HAdV-37、HAdV-40和HAdV-41未检出。

关键词：腺病毒血清型多重聚合酶链反应毛细电泳

不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白氨基酸残基序列分析

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药物分析杂志 2023年第12期43卷 2017-2024页

作者：侯宗文秦玺陶磊史新昌张怡轩沈阳药科大学沈阳117004 中国食品药品检定研究院北京100050

目的:分析不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白(VP1)氨基酸残基序列,建立相似性比较方法和数据库,预测VP1氨基酸残基序列突变后可能隶属的血清型。方法:对不同血清型腺相关病毒VP1氨基酸残基序列分析,找出共同序列,并对序列进行对齐。分别对... 详细信息

目的:分析不同血清型腺相关病毒衣壳蛋白(VP1)氨基酸残基序列,建立相似性比较方法和数据库,预测VP1氨基酸残基序列突变后可能隶属的血清型。方法:对不同血清型腺相关病毒VP1氨基酸残基序列分析,找出共同序列,并对序列进行对齐。分别对疏水氨基酸残基、亲水氨基酸残基和酸/碱氨基酸残基进行单独赋值,赋值参数包括侧链长度、基团数量和解离/结合强度等,再用相关系数法和差值法计算相似度。规定全局电荷决定界值,判断电荷的变化是否会引起蛋白质周围电场的显著变化。最后综合考虑四者的关系,给出与已知血清型VP1氨基酸残基序相似度。通过其他已知血清型的VP1氨基酸残基序进行验证。结果:基本上可以区分不同的血清型,并且对相同血清型中的不同亚型具有一定的容忍度。结论:对腺相关病毒衣壳蛋白VP1氨基酸残基序列与其血清型间的联系进行了探讨,希望对重组腺相关病毒为载体的基因治疗研发提供支持。

关键词：腺相关病毒血清型衣壳蛋白氨基酸残基序列相似性比较蛋白序列突变预测