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血流感染碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌的耐药基因和毒力基因及分子流行病学研究

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四川大学学报（医学版） 2024年第2期55卷 391-396页

作者：廖全凤袁余张为利邓劲康梅四川大学华西医院实验医学科成都610041

目的本研究旨在了解西南地区某大型三甲综合医院血流感染碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae, CRKP)患者的临床特征和CRKP的分子流行病学。方法收集2015–2019年血流感染患者血培养分离的131株非重... 详细信息

目的本研究旨在了解西南地区某大型三甲综合医院血流感染碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌(carbapenemresistant Klebsiella pneumoniae, CRKP)患者的临床特征和CRKP的分子流行病学。方法收集2015–2019年血流感染患者血培养分离的131株非重复CRKP,采用VITEK-2全自动微生物分析仪和质谱MALDI-TOF进行菌株鉴定,微量肉汤稀释法检测最低抑菌浓度值(minimum inhibitory concentration, MIC),PCR检测常见碳青霉烯酶耐药基因和毒力因子,多位点序列分型对菌株进行同源性分析,全基因组测序方法检测不携带碳青霉烯酶菌株的基因组特征。结果 131株CRKP除多粘菌素B(耐药率1.6%)和替加环素(耐药率8.0%)外,对常见抗菌药物均耐药。105株(80.2%)CRKP携带Klebsiella pneumoniae carbapenemase (KPC)耐药基因,15株(11.4%)携带New Delhi Metallo-β-lactamase (NDM)基因,4株(3.1%)同时携带KPC和NDM基因,以序列(sequence typing, ST)11(74.0%)为优势序列类型,mrkD(96.2%)、fimH(98.5%)、entB(100%)等毒力基因检出率较高,检出1株高毒力CRKP。全基因组测序显示7株不产碳青霉烯酶的CRKP携带ESBL或AmpC基因,同时存在膜孔蛋白OMPK35和OMPK36的异常。结论某大型三甲综合医院CRKP主要携带KPC基因,对多种抗菌药物耐药率高,同时携带多种毒力基因,具有高毒力特性的CRKP应引起重视。

关键词：碳青霉烯耐药肺炎克雷伯菌碳青霉烯酶基因毒力基因 MLST分型血流感染

血流感染O139群霍乱弧菌的耐药性及基因组特征分析

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中华预防医学杂志 2023年第4期57卷 542-549页

作者：李杨逄波杜小莉胡锦瑞李臻鹏陈延莹王玥崔志刚周海健阚飙山东大学齐鲁医学院公共卫生学院济南250012 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所传染病预防控制国家重点实验室北京102206 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所国家致病菌识别网中心实验室北京102206

目的分析1株从菌血症患者血液中分离到的O139群霍乱弧菌产毒株的耐药性及基因组特征。方法使用肉汤稀释法和全自动药敏分析仪测定菌株的抗生素敏感性,使用二代基因测序和纳米孔测序获得菌株的完整基因组序列,使用BLAST在线比对与CARD、R... 详细信息

目的分析1株从菌血症患者血液中分离到的O139群霍乱弧菌产毒株的耐药性及基因组特征。方法使用肉汤稀释法和全自动药敏分析仪测定菌株的抗生素敏感性,使用二代基因测序和纳米孔测序获得菌株的完整基因组序列,使用BLAST在线比对与CARD、Resfinder、ISfinder、VFDB等数据库进行比对分析,明确菌株携带的耐药基因、插入序列和毒力基因等,使用MEGA 5.1软件构建基于核心基因组单核苷酸多态性的遗传系统发生树。结果霍乱弧菌SH400为O139群产霍乱毒素的菌株,携带了多个毒力相关基因和4个毒力岛。该菌株对链霉素、四环素、磺胺甲恶唑/甲氧苄啶耐药并携带了相应的耐药基因。该菌株携带了大小为172914 bp并且含有10种耐药基因的IncA/C型质粒。结合基因组进化关系发现,菌株间携带耐药基因和耐药质粒的情况呈现出一定聚集性。菌株SH400的传统ST型为ST69,cgMLST型为与cgST-252高度相似的新型别。结论该株O139群霍乱弧菌携带ctxAB毒力基因、多种耐药基因和IncA/C型质粒,且存在多重耐药岛。

关键词：弧菌,霍乱血流感染耐药性基因组耐药质粒

血流感染细菌快速鉴定及药敏试验的方法学评价

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解放军医学杂志 2021年第5期46卷 468-473页

作者：丁毅伟吴思敏韩志海解放军总医院第六医学中心呼吸与危重症医学科北京100048 海南省肿瘤医院病理科海口570312

目的比较快速直接检测方法(简称快速法)与传统检测方法(简称传统法)对血培养阳性标本进行细菌鉴定和药敏试验的一致性及准确性。方法采集2019-2020年解放军总医院第六医学中心门急诊及住院患者血流感染标本,置于血培养仪中培养,血培养... 详细信息

目的比较快速直接检测方法(简称快速法)与传统检测方法(简称传统法)对血培养阳性标本进行细菌鉴定和药敏试验的一致性及准确性。方法采集2019-2020年解放军总医院第六医学中心门急诊及住院患者血流感染标本,置于血培养仪中培养,血培养报警后收集血培养阳性标本,同时用快速法和传统法进行培养,培养后分别进行细菌鉴定和药敏试验,记录并比较两种方法鉴定细菌及药敏试验的一致性。结果共收集149例血培养阳性标本,传统法鉴定出革兰阳性球菌79株、革兰阴性杆菌70株,快速法与传统法鉴定相符的革兰阳性球菌75株、革兰阴性杆菌67株。两种方法鉴定的一致率为95.3%(142/149),鉴定革兰阳性球菌、革兰阴性杆菌的一致率分别为94.9%(75/79)、95.7%(67/70)。传统法中,76株(96.2%)革兰阳性球菌和66株(94.3%)革兰阴性杆菌可有效鉴定到种,3株(3.8%)革兰阳性球菌和4株(5.7%)革兰阴性杆菌可有效鉴定到属;快速法中,52株(69.3%)革兰阳性球菌和63株(94.0%)革兰阴性杆菌可有效鉴定到种,20株(26.7%)革兰阳性球菌和3株(4.5%)革兰阴性杆菌可有效鉴定到属。根据药敏试验结果判断标准,革兰阳性球菌和革兰阴性杆菌快速法与传统法药敏试验可接受标准符合率均≥90.0%,一般错误率均≤10.0%,严重错误率除复方新诺明外均≤3.0%,极严重错误率均≤1.5%。结论快速法可有效缩短鉴定和药敏试验的时间且鉴定结果准确,有助于临床医师明确诊断并及时调整治疗方案,迅速从经验性使用广谱抗菌药物转向靶向治疗,为患者提供更加有效的治疗方案。

关键词：血流感染快速鉴定传统鉴定药敏鉴定

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血流感染病原菌的分布与耐药性分析

中国感染与化疗杂志 2017年第3期17卷 314-320页

作者：张艳君马秀珍秦琴李虎刘云黄晓春慎慧陈燕万玉香黄怡中国人民解放军第二军医大学附属长海医院感染控制科上海200433 中国人民解放军第二军医大学附属长海医院实验诊断科上海200433

目的了解上海长海医院血流感染患者的病原菌分布及其对抗菌药物的耐药性,为临床合理用药提供依据。方法采用自动化仪器法和纸片扩散法(K-B法)对分离于2013年1月至2014年12月的菌株进行药物敏感性试验,参照2014版CLSI M100-S24标准判断... 详细信息

目的了解上海长海医院血流感染患者的病原菌分布及其对抗菌药物的耐药性,为临床合理用药提供依据。方法采用自动化仪器法和纸片扩散法(K-B法)对分离于2013年1月至2014年12月的菌株进行药物敏感性试验,参照2014版CLSI M100-S24标准判断药敏结果,替加环素的判读参照FDA标准,头孢哌酮-舒巴坦的判读参照头孢哌酮标准(2014年CLSI M100-S24)。结果从血流感染患者中共分离出非重复细菌1 048株,排名前3位的为大肠埃希菌(29.5%)、凝固酶阴性葡萄球菌(15.8%)和肺炎克雷伯菌(13.8%)。细菌总数位于前5位的科室分别为消化内科、血液内科、普外科、泌尿外科和感染科。不同科室分离出的细菌种类和数目不同。药敏结果显示,产超广谱β内酰胺酶(ESBL)的大肠埃希菌和肺炎克雷伯菌分别为63.8%和38.6%,耐甲氧西林凝固酶阴性葡萄球菌占该菌总数的77.6%。泌尿外科分离的大肠埃希菌对头孢菌素耐药率高于总体水平,而消化内科分离的大肠埃希菌对β内酰胺类-酶抑制剂复合制剂和碳青霉烯类抗生素的耐药率高于总体水平和其他科室。血液内科、泌尿外科和神经外科分离的凝固酶阴性葡萄球菌对甲氧西林的耐药率较高,神经外科分离菌耐药率更为100%。烧伤监护室的肺炎克雷伯菌对所有检测抗菌药物的耐药率均高于总体水平,消化内科的肺炎克雷伯菌对碳青霉烯类和替加环素的耐药率高于总体水平。结论不同科室分离出的血流感染细菌分布及其对常用抗菌药物的耐药性呈现不同特点,应加强监测各重点病区的病原菌分布及其耐药性,以指导抗生素的合理应用。

关键词：血流感染病原细菌耐药性

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血流感染流行病学研究进展

中国感染与化疗杂志 2019年第2期19卷 212-217页

作者：周梦兰杨启文于淑颖徐英春中国医学科学院北京协和医院检验科侵袭性真菌病机制研究与精准诊断重点实验室北京100730 中国医学科学院北京协和医学院研究生院

血流感染(bloodstream infection,BSI)是指病原微生物进入血流引起的播散感染,是危及人类生命的全身性感染疾病,主要病原微生物包括细菌、真菌及病毒等,可导致菌血症、败血症和脓毒症,严重者可引起休克、播散性血管内凝血(DIC)、多脏器... 详细信息

血流感染(bloodstream infection,BSI)是指病原微生物进入血流引起的播散感染,是危及人类生命的全身性感染疾病,主要病原微生物包括细菌、真菌及病毒等,可导致菌血症、败血症和脓毒症,严重者可引起休克、播散性血管内凝血(DIC)、多脏器功能衰竭乃至死亡。近年来,随着侵袭性操作的不断增加及广谱抗菌药物、皮质激素等药物的不合理应用,BSI的发病率及病死率逐年上升,造成了患者住院时间的延长和经济负担的增加。本文对BSI的发病率、病死率、危险因素及常见病原体作一综述。

关键词：血流感染发病率病死率危险因素常见病原体

血流感染和皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌耐药特征及多位点序列分型

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中国感染与化疗杂志 2018年第5期18卷 515-520页

作者：温伟洪徐令清李玉珍李介华汤英贤黄延峰广州医科大学附属第六医院清远市人民医院检验科广东清远511518

目的了解血流和皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌(金葡菌)耐药特征及多位点序列分型(MLST)特征。方法采用BD Phoenix^(TM) 100进行金葡菌鉴定与药敏检测,采用WHONET 5.6软件及SPSS 19.0软件对细菌耐药率进行统计分析,采用MLST方法对金葡菌... 详细信息

目的了解血流和皮肤软组织感染金黄色葡萄球菌(金葡菌)耐药特征及多位点序列分型(MLST)特征。方法采用BD Phoenix^(TM) 100进行金葡菌鉴定与药敏检测,采用WHONET 5.6软件及SPSS 19.0软件对细菌耐药率进行统计分析,采用MLST方法对金葡菌进行分子分型。结果共收集47株血流感染金葡菌和62株皮肤软组织感染金葡菌,血流和皮肤软组织感染金葡菌中MRSA检出率分别为21.3%(10株)和61.3%(38株),未发现对万古霉素、利奈唑胺、替考拉宁、夫西地酸和高水平莫匹罗星耐药菌株。血流感染MRSA株MLST分型以ST59为主(40.0%,4/10),MSSA株以ST7、ST188为主(各16.2%,6/37)。皮肤软组织感染MRSA株以ST338为主(47.4%,18/38),MSSA株以ST5、ST88为主(各12.5%,3/24)。结论血流感染MRSA检出率低于皮肤软组织感染(P血流感染和皮肤软组织感染MRSA株优势ST分别为ST59和ST338,MSSA株ST呈多样化分布。

关键词：金黄色葡萄球菌耐药性多位点序列分型血流感染皮肤软组织感染

血流感染在1265例造血干细胞移植患者中的发生情况及病原菌分析

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中华血液学杂志 2017年第11期38卷 930-933页

作者：韩清珍陈瑜杨涵张险峰陈佳吴德沛陈苏宁仇惠英苏州大学附属第一医院临床检测中心 215006 江苏省血液研究所、卫生部血栓与止血重点实验室、血液学协同创新中心南京医科大学第二附属医院肾病中心

目的分析造血干细胞移植（HSCT）患者血流感染的发生率、病原菌分布及药敏情况，为临床血流感染的经验性治疗提供依据。方法对2013-2015年在苏州大学附属第一医院行HSCT的1265例患者进行血流感染发生率、血培养阳性率、病原菌种类和耐... 详细信息

目的分析造血干细胞移植（HSCT）患者血流感染的发生率、病原菌分布及药敏情况，为临床血流感染的经验性治疗提供依据。方法对2013-2015年在苏州大学附属第一医院行HSCT的1265例患者进行血流感染发生率、血培养阳性率、病原菌种类和耐药情况分析。结果1265例HSCT患者中，有784例（61．98％）共发生1422例次血流感染，464例（59．2％）患者处于粒细胞缺乏期（ANC〈0．5×10^9／L）。2013-2015年病原菌检出率逐年上升，总体为20．07％。检出的401株病原菌中，革兰阴性菌221株（55．1％），革兰阳性菌165株（41．2％），真菌15株（3．7％）。排名前三位为大肠埃希菌（16．O％）、表皮葡萄球菌（15．5％）和肺炎克雷伯菌（11．2％）；细菌耐药情况严峻，多重耐药的鲍曼不动杆菌和嗜麦芽窄食单胞菌比例分别为64．70％与63．64％，耐甲氧西林金黄色葡萄球菌（MRSA）比例为57．14％，均超过50．0％。耐万古霉素肠球菌（VRE）与耐碳青霉烯类抗生素肠杆菌科细菌（CRE）比例分别为14．29％、6．78％。革兰阴性菌中肠杆菌科细菌对三、四代头孢类药物耐药率较高，对碳青霉烯类抗生素耐药率较低（6．4％）。非发酵菌对抗菌药物耐药情况差别较大，对碳青霉烯类抗生素耐药率较高（47．8％）；葡萄球菌属菌株对万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺的敏感率均为100．0％。结论HSCT患者血流感染发生率较高，病原菌仍以革兰阴性菌为主，非发酵菌的占比也较高，未检测到对万古霉素、替考拉宁和利奈唑胺耐药的葡萄球菌。

关键词：造血干细胞移植血流感染抗药性

血流感染产超广谱β-内酰胺酶细菌的药敏分析

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中国抗生素杂志 2012年第5期37卷 388-391页

作者：王欢张成龙陈素明张菊玲鲍春梅崔恩博曲芬解放军302医院临床检验医学中心北京100039

目的筛选对超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的敏感抗生素,为提高ESBLs感染患者临床治愈率提供指导。方法血液感染患者用BacT/Alert全自动血培养仪细菌培养、VitekⅡ细菌鉴定仪进行鉴定,K-B药敏纸片测定法进行药敏试验并筛选出ESBLs细菌160株,... 详细信息

目的筛选对超广谱β-内酰胺酶(ESBLs)的敏感抗生素,为提高ESBLs感染患者临床治愈率提供指导。方法血液感染患者用BacT/Alert全自动血培养仪细菌培养、VitekⅡ细菌鉴定仪进行鉴定,K-B药敏纸片测定法进行药敏试验并筛选出ESBLs细菌160株,肉汤稀释法测定最低抑菌浓度(MIC)。结果 ESBLs菌以大肠埃希菌为主,对亚胺培南、美罗培南、头孢美唑、替加环素、黏菌素和阿米卡星的敏感性分别为100%、100%、94.38%、100%、100%和95.63%,而对头孢他啶和四代头孢菌素的头孢吡肟的敏感率仅达58%,加酶抑制剂的复合抗生素敏感性分别为哌拉西林/三唑巴坦、头孢哌酮/舒巴坦、替卡西林/克拉维酸和氨苄西林/舒巴坦,敏感率分别为82.50%、80.63%、13.13%和3.75%。结论治疗ESBLs感染应以抗生素敏感性试验为指导,提高救治率。

关键词：血流感染超广谱β-内酰胺酶药物敏感性

血流感染中分离的耐甲氧西林溶血葡萄球菌的药物敏感性、SCCmec基因分型及同源性分析

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中国抗生素杂志 2021年第4期46卷 332-338页

作者：姜斌彭娜周海健付陈超欧阳鹏文谢良伊湖南省人民医院(湖南师范大学附属第一医院)检验科长沙410005 中国疾病预防控制中心传染病预防控制所北京102200 中南大学湘雅医院感染控制中心长沙410008

目的调查分析本地区血流感染中分离耐甲氧西林溶血葡萄球菌(MRSH)的药物敏感性、葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型及分子流行病学特征。方法收集2013年1月1日—2014年12月31日湖南省20家三甲医院血流感染患者的MRSH 78株,采用微量肉汤... 详细信息

目的调查分析本地区血流感染中分离耐甲氧西林溶血葡萄球菌(MRSH)的药物敏感性、葡萄球菌盒染色体mec(SCCmec)分型及分子流行病学特征。方法收集2013年1月1日—2014年12月31日湖南省20家三甲医院血流感染患者的MRSH 78株,采用微量肉汤稀释法进行体外药敏试验;PCR扩增mecA基因及SCCmec基因;脉冲场凝胶电泳(PFGE)检测MRSH的同源性。结果78株MRSH中,96.1%的菌株存在mecA基因,MRSH对红霉素、左氧氟沙星和克林霉素的耐药率分别为94.9%、80.7%和53.8%,2株对利奈唑胺耐药,1株对替考拉宁耐药,没有菌株对万古霉素耐药。SCCmec可分型为50%(39/78),不可分型为50%(39/78)。39株可分型菌株中,单个SCCmec类型以Ⅰ型为主(18/39,46.1%),混合型SCCmec类型以Ⅰ+Ⅱ型为主(12/39,30.8%)。PFGE带型整体较为分散,但有6组菌株间存在100%同源性。结论本地区血流感染中MRSH的耐药形势严峻;在SCCmec可分型的菌株中,以Ⅰ型SCCmec为主,SCCmec多样且不同SCCmec型别之间的耐药性存在差异;本地区MRSH以散发为主,但存在院间及院内交叉感染的可能性,应加强对其监测,减少MRSH的进一步传播。

关键词：溶血葡萄球菌血流感染耐药性 SCCmec PFGE