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鸡部分蛋用性状的主基因+多基因混合遗传模型分析

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鸡部分蛋用性状的主基因+多基因混合遗传模型分析

作者：马猛广东海洋大学

学位级别：硕士

本研究以苏禽绿壳蛋鸡黑羽纯系和单冠白来航鸡为亲本构建资源群体，对资源群体F2代的开产蛋品质、32、36、40、44、48、52和56周龄蛋品质进行测定，研究其蛋品质在整个产蛋周期中的变化规律;并且运用南京农业大学研发的主基因+多基因混... 详细信息

本研究以苏禽绿壳蛋鸡黑羽纯系和单冠白来航鸡为亲本构建资源群体，对资源群体F2代的开产蛋品质、32、36、40、44、48、52和56周龄蛋品质进行测定，研究其蛋品质在整个产蛋周期中的变化规律;并且运用南京农业大学研发的主基因+多基因混合遗传模型分析软件G4F2对鸡部分蛋用性状进行分析，探讨鸡部分蛋用性状的遗传规律，以期为鸡蛋用性状的QTL定位、全基因组关联分析和分子标记辅助选择提供基础，为苏禽绿壳蛋鸡的育种提供理论指导。其主要研究结果如下： 1)蛋品质的变化规律为蛋壳颜色的L值在整个产蛋周期中大体呈现出增长的趋势，而a值和b值则呈现出下降的趋势;蛋重、蛋黄重和蛋壳重在整个周期中的变化较为明显，均呈现出递增的趋势;蛋壳强度和哈氏单位在整个产蛋周期中总体上是随着周龄的增加而逐渐减小;蛋形指数和蛋壳厚度在整个产蛋周期中的变化均没有出现大的波动;蛋黄颜色和蛋白高度的变化较为复杂，蛋黄颜色从开产至32周龄是下降的趋势，32周龄到36周龄又逐渐变大，36周龄至40周龄之间又出现了下降的趋势，40周龄后大体上是逐渐变大的趋势，而蛋白高度的变化则为从开产至40周龄期间是递增的趋势，40周龄至48周龄之间逐渐变低，48周龄后又逐渐上升至52周龄又开始出现了下降的趋势。 2)40周龄产蛋数的遗传模型为E模型，即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型，主基因遗传力为0.215。 3)开产性状的主多基因混合遗传模型分析结果为：开产日龄的遗传模型为模型E，两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型，主基因遗传力为0.2506,;开产体重的适合模型为模型E-1，即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因混合遗传模型，其主基因遗传力达到了0.6328，说明开产体重主要是由主基因控制的。 4)40周龄蛋品质性状的主多基因混合模型分析结果为：40w蛋重、蛋壳颜色a、蛋壳重、蛋壳强度、哈氏单位和蛋形指数的遗传模型均为模型E，即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性-上位性多基因混合遗传模型，其对应的主基因遗传力分别为0.4307、0.9262、0.1233、0.1321、0.1471和0.1413，蛋重和蛋壳颜色a对应的多基因遗传率分别为0.0254和0.0055，其他指标对应的多基因遗传力均为0;蛋壳颜色L、b、蛋白高度、蛋黄颜色和蛋黄重的遗传模型为模型E-1，即两对加性-显性-上位性主基因+加性-显性多基因混合遗传模型，其对应的主基因遗传力分别为0.4991、0.7377、0.1932、0.358和0.2105，多基因遗传力为0。

关键词：蛋用性状主基因多基因遗传模型

母鸡300日龄血清及蛋黄胆固醇浓度与蛋用性状的关系研究

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中国家禽 2013年第11期35卷 11-15页

作者：杜晓惠熊婷刘俊莹张怀勇万火福朱庆四川农业大学动物科技学院四川雅安625014

选用500只优质肉用母鸡,测定其300日龄时的血清胆固醇浓度(SCC)和蛋黄胆固醇浓度(YCC),通过聚类分析,将SCC和YCC分别分为差异显著的5组和4组,研究其与蛋用性状的关系。结果表明,SCC和YCC的变动范围分别为35～200mg/dL和10～22mg/g蛋黄... 详细信息

选用500只优质肉用母鸡,测定其300日龄时的血清胆固醇浓度(SCC)和蛋黄胆固醇浓度(YCC),通过聚类分析,将SCC和YCC分别分为差异显著的5组和4组,研究其与蛋用性状的关系。结果表明,SCC和YCC的变动范围分别为35～200mg/dL和10～22mg/g蛋黄。其变化趋势一致,但两者在母鸡300日龄时的相关较弱。随着SCC的显著增大,开产体重、300日龄产蛋量和孵化率大体上呈现先升后降的趋势,开产蛋重呈现增加趋势,120～145mg/dL组表现出最佳的产蛋量和孵化率。随着YCC的显著增大,开产日龄显著提前,300日龄蛋重和蛋黄重呈显著增加趋势(P蛋黄组开产日龄最早,受精蛋孵化率最低,300日龄蛋重和蛋黄重最大。适中的血清胆固醇浓度(120～145mg/dL)和蛋黄胆固醇浓度(11～15mg/g蛋黄)对蛋用性状有利。

关键词：母鸡胆固醇浓度血清蛋黄蛋用性状

鸡卵细胞卵黄生成受体基因(ovr)SNPs检测及其与蛋用性状的关联分析

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农业生物技术学报 2009年第6期17卷 967-971页

作者：詹慧琴俸艳萍沈世学龚萍彭秀丽李世军龚炎长华中农业大学农业动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室漳州市农业学校畜牧兽医学科

以6个鸡(Gallusgallus)品种混交群体390个个体为研究材料,采用PCR-SSCP、PCR-RF-SSCP及测序的方法进行鸡卵细胞卵黄生成受体(occyte vitellogenesis receptor,ovr)基因内含子单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并与鸡群蛋用性状进行关联分... 详细信息

以6个鸡(Gallusgallus)品种混交群体390个个体为研究材料,采用PCR-SSCP、PCR-RF-SSCP及测序的方法进行鸡卵细胞卵黄生成受体(occyte vitellogenesis receptor,ovr)基因内含子单核苷酸多态性(SNPs)位点筛选,并与鸡群蛋用性状进行关联分析。结果表明,在鸡ovr基因中发现内含子2T3967G,内含子7C8099T和A8296G,内含子9A8839T和G9084A共5个突变位点;其中内含子2HinfⅠ突变位点与开产日龄和蛋壳厚度相关极显著(P蛋量、蛋重和蛋黄比例相关显著(P蛋量、蛋重、蛋黄比例等方面都优于其它基因型个体。研究结果证实了ovr基因对鸡的产蛋性能和蛋品质性状有重要的影响。

关键词：鸡卵细胞卵黄生成受体基因(ovr) 单核苷酸多态性(SNPs) 蛋用性状

鸡产蛋相关基因多态性检测及其与蛋用性状的关联分析

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鸡产蛋相关基因多态性检测及其与蛋用性状的关联分析

作者：杨桓华中农业大学

学位级别：硕士

品种是制约我国蛋鸡业发展的重要因素之一。产蛋性能和蛋品质性状是蛋鸡的重要经济性状,是影响蛋鸡业经济效益最重要的因素。但是,由于产蛋性能和蛋品质性状遗传力低,通过常规育种方法很难改进。分子标记辅助选择（MAS）的快速发展与应... 详细信息

品种是制约我国蛋鸡业发展的重要因素之一。产蛋性能和蛋品质性状是蛋鸡的重要经济性状,是影响蛋鸡业经济效益最重要的因素。但是,由于产蛋性能和蛋品质性状遗传力低,通过常规育种方法很难改进。分子标记辅助选择（MAS）的快速发展与应用,为低遗传力性状的改良提供了新的方法。本研究以湖北省欣华生态畜禽有限公司的欣华鸡E系为试验材料,鸡催乳素基因（prolactin, PRL）、血管活性肠肽基因（vasoactine intrestinal peptide, VIP）和促卵泡激素β亚基基因（follicle-stimulating hormoneβ, FSHβ）为鸡产蛋性能及蛋品质性状相关的侯选基因,采用PCR-SSCP、测序及PCR-RFLP等方法进行基因的多态性检测、SNP位点筛选和基因分型,并与鸡蛋用性状进行关联分析。本研究主要研究结果如下： 1.VIP基因和FSHβ基因中分别发现了5个和4个SNP位点,且对PRL基因5’调控区的24bp插入/缺失突变、VIP基因5’调控区的A-3458G位点、FSHβ基因5’调控区的C-358T位点及其内含子2的T+259G位点进行了验证;2.对VIP基因5’调控区A-3458G位点、PRL基因24bp插入/缺失位点、FSHβ基因5’调控区的C-358T位点及其内含子2的T+259G位点等进行遗传平衡分析表明：VIP基因5’调控区A-3458G位点处于Hardy-Weinberg平衡状态,而其余三个位点偏离Hardy-Weinberg平衡状态;3.VIP基因5’调控区A-3458G位点,鸡的不同基因型与蛋形指数显著相关（P＜0.05）,且AA基因型个体优于GG基因型个体,建议在育种过程中选择携带A等位基因的个体;4. FSHβ基因内含子2的T+259G位点,鸡的不同基因型与开产日龄、蛋白重、蛋白比例和哈氏单位均显著相关（p＜0.05）,且TT基因型个体均优于GG基因型个体。FSHβ可以作为候选基因进行MAS育种,建议在育种过程中选择TT等位基因的个体以改良产蛋性状和蛋白品质性状。

关键词：鸡候选基因多态性蛋用性状关联分析

德化黑鸡专门化品系的选育研究及基因多态性与部分蛋用性状的关联分析

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德化黑鸡专门化品系的选育研究及基因多态性与部分蛋用性状的关联...

作者：张荣宗福建农林大学

学位级别：硕士

德化黑鸡是福建省珍稀的地方品种之一,具有野性强、耐粗饲、肉质细嫩鲜美、营养价值丰富、药用保健功能等优良特性,但是同时具有产蛋率低、个体较小等缺点。为了更好的利用德化黑鸡优良特性,在保种群基础上,通过提纯选育培育专门化品系... 详细信息

德化黑鸡是福建省珍稀的地方品种之一,具有野性强、耐粗饲、肉质细嫩鲜美、营养价值丰富、药用保健功能等优良特性,但是同时具有产蛋率低、个体较小等缺点。为了更好的利用德化黑鸡优良特性,在保种群基础上,通过提纯选育培育专门化品系,利用配套系杂交提高生产性能;并从分子水平探讨与经济性状相关的分子标记,为德化黑鸡经济性状辅助标记选择提供一定的理论依据。本实验开展了德化黑鸡专门化品系的研究,并对专门化品系的生产性能及选育进展进行了分析,同时采用PCR-RFLP的方法,以德化黑鸡保种场二代鸡500只德化黑鸡为试验材料,检测并分析了类胰岛素样生长因子-Ⅰ（ IGF-Ⅰ）基因的5’端调控区、血管活性肠肽受体-Ⅰ（VIPR-Ⅰ）基因的外显子2和6的多态性和蛋用性状之间的关联。主要研究结果如下: 1、通过对德化黑鸡专门化品系的研究发现,德化黑鸡具有明显的外貌特征,并且基本达到了整齐一致;生长规律明显,快速增重高峰在8周龄前后,6～12周期处于日增重高峰期,从12周龄以后生长速度逐渐变慢;选育后的产蛋性能较选育前高,蛋品质优良;公母鸡在屠宰性状方面存在差异,公鸡的活重、屠体、半净膛、全净膛、腿肌、腿肌率明显高于母鸡,表现为差异显著（P＜0.05）,并且胸肌重比母鸡的大,但差异不显著（P＞0.05）,母鸡的腹脂重、腹脂率显著高于公鸡（P＜0.05）;父系选育进展显著,其中10周龄体重从2世代的740.26 g（±127.95 g）增重到808.35 g（±102.11 g）,其变异系数从17.28%降低到12.63%,实现遗传力为0.3825,300日龄产蛋数从1世代61.94（±18.24）枚增加到82.83（±25.12）枚,提高了33.73%,实现遗传力为1.1938;母系选育进展显著,其中300日龄产蛋数从1世代62.65（±17.16）枚增加到90.18（±24.99）枚,提高了43.94%,实现遗传力为0.6858,10周龄体重从2世代的729.35 g（±122.71 g）增重到735.46 g（±85.28 g）,其变异系数从16.82%降低到11.6%,实现遗传力为0.8268。 2、德化黑鸡IGF-Ⅰ基因5’调控区、VIPR-Ⅰ基因外显子2区和VIPR-Ⅰ基因外显子6区PCR产物分别经PstⅠ酶、HpaⅡ酶、TaqⅠ酶酶切后,各出现3种基因型,PstⅠ位点存在A-T突变,HpaⅡ位点存在A-G突变,TaqⅠ位点存在A-C突变。PstⅠ位点的AA、AB、BB基因型频率分别为0.1937、0.4867和0.3196,等位基因A和B的基因频率分别为0.4370和0.5630,经χ~2检验,该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态;HpaⅡ位点的CC、CD、DD基因型频率分别为0.3285、0.4686和0.2029,等位基因C和D的基因频率分别为0.5628和0.4372,经χ~2检验,该位点处于Hardy-Weinberg平衡状态;TaqⅠ位点的EE、EF、FF基因型频率分别为0.0872、0.3390和0.5738,等位基因E和F的基因频率分别为0.2567、0.7433,经χ~2检验,该位点不符合Hardy-Weinberg平衡状态。经过基因位点遗传多态性分析,德化黑鸡具有的多态信息含量为中度多态（0.5＞PIC＞0.25）,具有较高的选择潜力。 3、在开产日龄和体重方面,PstⅠ酶切多态位点不同基因型对开产日龄、160日龄体重、240日龄体重、300日龄体重均没有显著影响（P＞0.05）,但总体上,A等位基因对应的德化黑鸡群体开产日龄和体重有低于B等位基因的趋势;HpaⅡ酶切多态位点不同基因型除了对开产日龄没有显著影响外（P＞0.05）,对160日龄体重、240日龄体重、300日龄体重均有显著影响（P＜0.05）,表现为DD基因型的160日龄体重、240日龄体重显著的高于CC基因型（P＜0.05）,DD基因型的300日龄体重显著的高于CD基因型（P＜0.05）,总体上,C等位基因对应的德化黑鸡群体的产蛋期体重低于D等位基因;TaqⅠ酶切多态位点不同基因型对开产日龄、体重均没有显著影响（P＞0.05）。 4、在产蛋性状和蛋重方面,PstⅠ酶切多态位点不同基因型对发现该多态位点不同基因型除了对300日龄蛋重没有显著影响外（P＞0.05）,对240日龄产蛋数、300日龄产蛋数、300日龄产蛋量均有显著影响（P＜0.05）,表现为AA基因型的240日龄产蛋数和300日龄产蛋数极显著地高于BB基因型（P＜0.01）,AA基因型的300日龄产蛋量显著高于BB基因型（P＜0.05）,总体上,A等位基因对应的德化黑鸡群体的产蛋性状要优于B等位基因对应的德化黑鸡群体的产蛋性状;HpaⅡ酶切多态位点不同基因型对240日龄产蛋数、300日龄产蛋数无显著影响（P＞0.05）,对300日龄蛋重、

关键词：德化黑鸡专门化品系选育进展 IGF-Ⅰ基因 VIPR-Ⅰ基因多态性蛋用性状 PCR-RFLP 单核苷酸多态性

鸡类胰岛素样生长因子-1（IGF-1）基因多态性与蛋用性状关系及其表达的研究

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鸡类胰岛素样生长因子-1（IGF-1）基因多态性与蛋用性状关系及其...

作者：万秋蓓扬州大学

学位级别：硕士

本实验采用PCR-RFLP的方法,以250只新扬州鸡和43只来航鸡为素材对类胰岛素样生长因子-1（IGF-1）基因的5’端调控区进行遗传多态性研究,并对IGF-1基因多态性与鸡蛋用性状间的关系进行了关联分析,且从蛋白质水平探索了基因变异影响表形... 详细信息

本实验采用PCR-RFLP的方法,以250只新扬州鸡和43只来航鸡为素材对类胰岛素样生长因子-1（IGF-1）基因的5’端调控区进行遗传多态性研究,并对IGF-1基因多态性与鸡蛋用性状间的关系进行了关联分析,且从蛋白质水平探索了基因变异影响表形性状的途径;同时本实验采用RT-PCR的方法研究了IGF-1基因的组织表达规律。主要研究结果如下: 1、PCR-RFLP分析表明,在新扬州鸡和来航鸡IGF-1基因5’非编码区存在PstI和HinfI两个酶切位点,PstI位点存在一个A-T突变,HinfI位点存在一个C-T突变。新扬州鸡PstI位点的等位基因A频率为0.3647,等位基因B频率为0.6353,HinfI位点的等位基因C频率为0.5780,等位基因D为0.4220;来航鸡PstI位点的等位基因A频率为0.2209,等位基因B频率为0.7791,HinfI位点的等位基因C频率为0.7674,等位基因D为0.2326。经χ2检验,新扬州鸡在两位点均处于Hardy-Weinberg平衡状态,而来航鸡在PstI位点不符合Hardy-Weinberg平衡,在HinfI位点符合Hardy-Weinberg平衡。 2、在开产性状方面,PstI位点基因型对开产性状有显著影响（P＜0.05）。LSD分析表明,新扬州鸡BB型开产蛋重显著大于AB型（P＜0.05）,来航鸡BB型开产日龄显著早于AB型（P＜0.05）,BB型开产胫长显著大于AA和AB型（P＜0.05）。HinfI位点基因型对新扬州鸡和来航鸡开产性状影响不显著（P＞0.05）。 3、PstI位点基因型对鸡产蛋数和产蛋量有显著影响（P＜0.05）,表现为来航鸡BB型29、39、49周产蛋数和29、39、49、59周产蛋量显著（P＜0.05）甚至极显著（P＜0.01）大于AA和AB型;BB和AB型新扬州鸡40周产蛋量显著大于AA型（P＜0.05）,而对于新扬州鸡30、40、50、60周产蛋数和30、50、60周产蛋量基因型间差异不显著（P＞0.05）,但BB和AB型均表现出高于AA型的优势。HinfI位点基因型对新扬州鸡50周产蛋数和50周产蛋量有显著影响,表现为CC型50周产蛋数和50周产蛋量显著大于CD型（P＜0.05）,而对于30、40、60周产蛋数和30、40、60产蛋量基因型间差异不显著（P＞0.05）,但CC型均表现出大于CD和DD型的优势。HinfI位点基因型对来航鸡各周产蛋数和产蛋量影响均不显著（P＞0.05）。 4、PstI位点基因型对新扬州鸡和来航鸡蛋品质有显著影响（P＜0.05）。在研究指标中,新扬州鸡的蛋重、蛋白重、蛋黄重、蛋壳重、蛋壳强度、蛋壳厚度、蛋壳颜色等指标的BB基因型效应均显著（P＜0.05）或极显著（P＜0.01）大于AA基因型。来航鸡的蛋白重、蛋壳重、蛋白比例、蛋形指数等指标的BB基因型效应均显著大于AA或AB型（P＜0.05）,而对于哈氏单位、蛋壳强度、蛋壳韧度AB型显著大于AA或BB型（P＜0.05）。 HinfI位点基因型对新扬州鸡和来航鸡蛋品质有显著影响（P＜0.05）。新扬州鸡的蛋重、蛋白重、蛋黄重、蛋壳强度、蛋黄颜色、蛋形指数等指标的CC基因型效应均显著（P＜0.05）或极显著（P＜0.01）大于DD或CD型,而对于新扬州鸡40周蛋白比例、40周哈氏单位、60周蛋壳强度CD型效应显著大于DD型（P＜0.05）。在该位点上,来航鸡59周蛋重、59周蛋白重、59周蛋黄重、39周蛋壳颜色的CD型效应显著大于CC型（P＜0.05）。 5、分析基因型与血清IGF-1浓度的关系发现,不同基因型鸡的血清IGF-1浓度差异不显著（P＞0.05）,但BB型血清IGF-1浓度在新扬州鸡20、40、58周均有高于AA型的趋势,且血清IGF-1浓度在基因型间的变化趋势与鸡蛋用性状在基因型间的变化趋势一致。 6、RT-PCR分析表明,IGF-1基因在新扬州鸡公鸡的肝脏、睾丸、胸肌、腿肌、肺、小肠、心、脾、肾、垂体、肌胃均有表达;在新扬州鸡母鸡的肝脏、卵巢、胸肌、腿肌、肺、小肠、心、脾、肾、垂体、肌胃也均有表达。

关键词：鸡 IGF-1基因多态性蛋用性状表达关系

鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与部分蛋用性状的关系

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鸡胰岛素样生长因子-1基因的遗传多态性与部分蛋用性状的关系

第十一次全国家禽学术讨论会

作者：欧阳建华柳小春施启顺林树茂孙汉李海华潘珂江西农业大学动物科学技术学院湖南农业大学动物科学技术学院

对万载康乐黄鸡、泰和乌骨鸡两个鸡种共324个样本,采用PCR—RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF—1)基因的5’端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经Pst Ⅰ酶切后出现三种基因型(AA、AB、BB)。分析这三种基因型与其部分... 详细信息

对万载康乐黄鸡、泰和乌骨鸡两个鸡种共324个样本,采用PCR—RFLP技术对胰岛素样生长因子—1(cIGF—1)基因的5’端调控区进行遗传变异研究,发现该调控区的扩增产物经Pst Ⅰ酶切后出现三种基因型(AA、AB、BB)。分析这三种基因型与其部分蛋用性状的关系发现:在泰和乌骨鸡中,这三种基因型对其开产日龄、280日龄、300日龄及500日龄产蛋量影响差异均不显著(P>0.05)。在万载康乐黄鸡中,这三种基因型在开产体重、开产日龄、开产蛋重及280日龄产蛋量表现为差异不显著(P>0.05),而在300日龄及500日龄时表现为差异显著(P<0.05)。

关键词：鸡 cIGF-l基因遗传多态性 PCR—RFLPs 蛋用性状

来源： cnki会议评论

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鸡蛋用性状遗传基础研究进展

家畜生态学报 2022年第12期43卷 8-14页

作者：张伟图董静超李华康慧敏佛山科学技术学院/广东省动物分子设计与精准育种重点实验室广东佛山528225 广东天农食品有限公司广东清远511827

鸡蛋用性状由遗传和环境共同决定,多数蛋用性状具有中、高遗传力,受遗传影响较大。蛋用性状在遗传上受到复杂的基因网络调控。文章对蛋用性状的遗传参数和重要候选基因的研究进展进行综述,主要包括调控繁殖性能的下丘脑-垂体-性腺轴相... 详细信息

鸡蛋用性状由遗传和环境共同决定,多数蛋用性状具有中、高遗传力,受遗传影响较大。蛋用性状在遗传上受到复杂的基因网络调控。文章对蛋用性状的遗传参数和重要候选基因的研究进展进行综述,主要包括调控繁殖性能的下丘脑-垂体-性腺轴相关基因和钙磷代谢相关基因,并对未来蛋用性状分子机制研究方向进行展望。

关键词：蛋用性状遗传力遗传相关候选基因

常规PCR结合CNVplex技术在检测鸡CNVs中的应用研究

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常规PCR结合CNVplex技术在检测鸡CNVs中的应用研究

作者：程圣启华中农业大学

学位级别：硕士

长期进化导致鸡的基因组产生了大量的突变,这些突变对于研究鸡的基因功能和生物学机制提供了思路。鸡的一些性状,如鸡肉品质,蛋用质,羽色,鸡冠,喙色等一直是科研人员研究的重点。拷贝数变异（Copy number variations,CNVs）是指DNA长度... 详细信息

长期进化导致鸡的基因组产生了大量的突变,这些突变对于研究鸡的基因功能和生物学机制提供了思路。鸡的一些性状,如鸡肉品质,蛋用质,羽色,鸡冠,喙色等一直是科研人员研究的重点。拷贝数变异（Copy number variations,CNVs）是指DNA长度在50bp以上的碱基序列的缺失、重复、插入或这些类型的组合形式。相对于单碱基突变的SNP,CNVs所含有的遗传信息更为丰富,也更有可能改变个体的基因表达水平进而影响个体的表型。本研究以本实验室与湖北省欣华生态畜禽有限公司联合培育的隐性白羽矮脚欣华鸡专门化父本品系第三世代群体的443个个体为实验材料。首先,应用CNVplex技术对上述群体的17个候选CNVs位点进行拷贝数检测;其次,用常规PCR对CNVplex检测的结果进行验证和校正,以此评估CNVplex技术在鸡CNVs检测中的应用前景,并初步摸索出一套结合常规PCR和CNVplex检测鸡CNVs的方法;最后用校正后的拷贝数与鸡的蛋用性状进行关联分析,以期通过CNVs位点与蛋用性状之间的关联来深入了解分子育种的基础,并为后续的研究奠定基础。本论文具体研究结果如下:（1）筛选了可信度较高的17个候选CNVs位点。应用CNVplex技术对所有443个样本的17个候选CNVs位点进行拷贝数检测,然后筛选出拷贝数变异较大的位点进行下一步研究。结果显示02A、05A、14A、14B这四个探针拷贝数变异显著。（2）对上述4个探针序列的SNP进行检测,并评估SNP对CNVplex技术检测拷贝数的影响。结果显示02A探针序列存在3个SNP（G＞A、C＞T、T＞A）,05A探针序列存在2个SNP（A＞T、C＞T）,在本实验群体中,这些SNP位点在各自探针序列上是同时出现的;14A、14B探针序列无SNP。（3）分别对包括02A、05A、14A、14B探针序列在内的片段进行常规PCR扩增,校正相应小数数值为整数数值。结果显示,探针序列存在SNP的02A、05A探针检测的拷贝数为0（包括接近0）的样本都能扩出相应的目的条带;而不存在SNP的14A、14B探针检测的拷贝数为0（包括接近0）的样本都不能扩出相应的目的条带。最后确定14A探针和14B探针检测结果是准确可靠的。（4）以探针序列为核心区域,在14B探针上、下游每隔1kb左右设计一对引物,查找14BCNV区域的缺失边界。最终确定在chr13:286368-292611区域约6kb的DNA片段在欣华鸡中是缺失;且在14BCNV下游得到一个1.5kb的片段,该片段首次在欣华鸡中报道。（5）对14BCNV和14ACNV与欣华鸡开产日龄等13个蛋用性状进行关联分析,结果显示:14ACNV位点2种拷贝数变异,即奇数拷贝数组（1、3、5）和偶数拷贝数组（0、2、4）与欣华鸡蛋壳厚度和蛋黄颜色是显著相关的（P＜0.05）。14BCNV位点6种拷贝数变异（0、1、2、3、4、5）与欣华鸡的开产日龄存在极显著相关（P＜0.01）,拷贝数为5的群体开产日龄127.1天要显著早于拷贝数为0的群体开产日龄131.9天。

关键词：欣华鸡拷贝数变异 CNVplex 蛋用性状关联分析开产日龄