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蔷薇科植物的红外光谱分类研究

激光与光电子学进展 2024年第9期61卷 492-500页

作者：郑钧文宋霄雪甘玉佳吴衷宇杨忠钰欧全宏时有明刘刚云南师范大学物理与电子信息学院云南昆明650500 曲靖师范学院物理与电子工程学院云南曲靖655011

不同蔷薇科植物种类资源信息的收集与明确其科、属间亲缘关系对蔷薇科植物资源的开发利用有重要意义。以不同种类蔷薇科植物的叶片、花瓣及雄蕊为材料,用傅里叶变换红外(FTIR)光谱结合主成分分析(PCA)、系统聚类分析(HCA)、簇类独立软... 详细信息

不同蔷薇科植物种类资源信息的收集与明确其科、属间亲缘关系对蔷薇科植物资源的开发利用有重要意义。以不同种类蔷薇科植物的叶片、花瓣及雄蕊为材料,用傅里叶变换红外(FTIR)光谱结合主成分分析(PCA)、系统聚类分析(HCA)、簇类独立软模式法(SIMCA)判别模型对蔷薇科植物进行研究。结果表明,蔷薇科叶片、花瓣及雄蕊中均含有多糖、蛋白质、脂类、草酸钙、木质素等成分,花瓣和雄蕊中还含有酚类物质。不同种类叶片之间的FTIR光谱吸收特征相似,但在1660~1000 cm^(-1)范围内吸收峰强度存在明显差异,利用此范围进行PCA,前两个主成分可获得97%以上的累计方差贡献率,用HCA可将11种植物在亚科级别正确分类。结合SIMCA判别模型,对不同叶片、花瓣及雄蕊的蔷薇科植物进行分类,用全谱4000~400 cm^(-1)范围数据,正确分类率可达96.08%;用1800~800 cm^(-1)范围数据,正确分类率可达100%。研究表明,FTIR光谱结合统计分析方法及判别模型,可以将不同种类蔷薇科植物在亚科、属级别上正确分类。

关键词：红外光谱蔷薇科化学计量学主成分分析系统聚类分析簇类独立软模式法

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蔷薇科果树离体再生与遗传转化研究进展

园艺学报 2017年第9期44卷 1633-1644页

作者：李坤坤徐昌杰浙江大学农业与生物技术学院园艺系

蔷薇科果树在世界果品生产中占据重要地位。近年来,蔷薇科果树离体再生和遗传转化研究取得了较大进展,在较大的树种上均有报道,但对于离体再生与遗传转化体系的主要影响因素和技术参数细节等缺少系统总结。从离体再生途径、离体再生影... 详细信息

蔷薇科果树在世界果品生产中占据重要地位。近年来,蔷薇科果树离体再生和遗传转化研究取得了较大进展,在较大的树种上均有报道,但对于离体再生与遗传转化体系的主要影响因素和技术参数细节等缺少系统总结。从离体再生途径、离体再生影响因素、遗传转化概况、农杆菌介导的遗传转化体系影响因素等方面进行了重点总结,对未来研究趋势和热点进行了展望。

关键词：果树蔷薇科离体再生遗传转化影响因素

蔷薇科S-RNase基因型鉴定引物在仁用杏基因组中的通用性分析

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林业科学研究 2014年第6期27卷 860-865页

作者：刘梦培乌云塔娜朱高浦赵罕杜红岩中国林业科学研究院经济林研究开发中心国家林业局泡桐研究开发中心河南郑州450003

仁用杏为我国六大木本粮油战略性树种之一，是“三北”地区适应性最强、发展潜力最大的重要生态经济树种之一，被誉为“铁杆庄稼”，其抗逆性强，也是集抗旱、抗寒（可低至-35℃）、抗风沙为一体的“先锋”树种。杏仁油中不饱和脂肪酸含... 详细信息

仁用杏为我国六大木本粮油战略性树种之一，是“三北”地区适应性最强、发展潜力最大的重要生态经济树种之一，被誉为“铁杆庄稼”，其抗逆性强，也是集抗旱、抗寒（可低至-35℃）、抗风沙为一体的“先锋”树种。杏仁油中不饱和脂肪酸含量95％左右，其中单不饱和脂肪酸——油酸含量在70％以上，与橄榄油相近，富含丰富的蛋白质、不饱和脂肪酸、维生素、无机盐、膳食纤维及人体所需的微量元素，而且杏仁油还含有一定的异油酸，具有降血脂、调节血压、辅助治疗心脑血管疾病功效，苦杏仁甙更是公认的天然抗癌活性物质。可见，仁用杏蕴藏着巨大的产品开发潜力，应用前景十分广阔。

关键词：蔷薇科 S-RNase基因仁用杏

蔷薇科Docynia之中文名宜为“多依属”

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生物多样性 2018年第12期26卷 1348-1349页

作者：刘华杰马金双刘夙刘冰北京大学哲学系北京100871 中国科学院上海辰山植物科学研究中心上海201602 上海辰山植物园上海201602 中国科学院植物研究所系统与进化植物学国家重点实验室北京100093

科学志书属于社会文化基础工程,影响巨大,为便于文化传播,其分类名称宜采用易输入的规范汉字。分布在我国云南、四川、贵州有较好开发前景的蔷薇科Docynia属乔木,结实率较高,果实类似小苹果,有不规则钝棱(图1)。此属全球有5种,中国2种。

关键词：蔷薇科中文名基础工程社会文化文化传播结实率小苹果

贵州悬钩子属(蔷薇科)一新种——务川悬钩子

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植物分类学报 2006年第3期44卷 345-347页

作者：何顺志贵阳中医学院药学系贵阳550002

报道了贵州省务川县发现的悬钩子属Rubus(蔷薇科Rosaceae)一新种——务川悬钩子*** ***。该种在体态上与锯叶悬钩子*** L．T Lu&Boafford相近,区别在于其叶片卵状披针形,边缘疏生小锯齿；叶柄较短,长0．7-1 cm；花序为项生稀疏总状花序... 详细信息

报道了贵州省务川县发现的悬钩子属Rubus(蔷薇科Rosaceae)一新种——务川悬钩子*** ***。该种在体态上与锯叶悬钩子*** L．T Lu&Boafford相近,区别在于其叶片卵状披针形,边缘疏生小锯齿；叶柄较短,长0．7-1 cm；花序为项生稀疏总状花序,具花8—10朵：花梗长3．5—5 cm；花瓣先端具骤突尖头。

关键词：悬钩子属务川悬钩子蔷薇科新种贵州中国

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蔷薇科植物MLO蛋白家族的生物信息学分析

基因组学与应用生物学 2018年第5期37卷 2043-2059页

作者：向贵生王开锦晏慧君李淑斌周宁宁唐开学邱显钦云南省农业科学院花卉研究所昆明650205 云南大学生命科学学院昆明650091 国家观赏园艺工程技术研究中心昆明650205

MLO基因家族是一类重要的植物抗病基因,MLO蛋白的突变体对白粉病真菌表现出广谱抗性,且能特异性调控细胞死亡,利用自发的细胞死亡来应答发育或非生物刺激。为了分析蔷薇科植物MLO蛋白的结构特征、系统进化及潜在功能,本研究利用生物信... 详细信息

MLO基因家族是一类重要的植物抗病基因,MLO蛋白的突变体对白粉病真菌表现出广谱抗性,且能特异性调控细胞死亡,利用自发的细胞死亡来应答发育或非生物刺激。为了分析蔷薇科植物MLO蛋白的结构特征、系统进化及潜在功能,本研究利用生物信息学方法对在Gen Bank中已登录的来自于蔷薇科的7个物种共计82条具有完整ORF的MLO基因进行了分析。分析显示这82条蛋白的氨基酸数量、碱基数、分子量差异较小,平均亲水系数为-0.191～0.253,绝大多数具有内含子结构;亚细胞定位主要分布于质膜中,包含5～8个跨膜结构;共有15个保守基序,长度在15～50个氨基酸之间。其中,等电点小于7的仅有1条,6条蛋白具有信号肽。系统进化关系揭示了这些物种间具有较高的同源性和保守性;将其与其它物种中已鉴定的MLO基因进行聚类分析,筛选出32个可能与抗白粉病相关的候选基因;进一步序列比对分析,发现仅有17条基因具有MLO型白粉病基因所有的典型结构。因此,本研究表明,所选用的82条蔷薇科MLO基因中,仅有17条基因可能参与寄主-白粉病菌的互作过程。本研究为进一步研究蔷薇科及其他植物MLO基因的抗病遗传机制提供了一些参考依据。

关键词：蔷薇科 MLO基因抗白粉病系统进化生物信息学

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蔷薇科果树TMT基因家族生物信息学分析

南京农业大学学报 2017年第4期40卷 601-610页

作者：程瑞张虎平程寅胜王英珍刘兴王国明张绍铃南京农业大学园艺学院/梨工程技术研究中心江苏南京210095

[目的]本文旨在对蔷薇科果树液泡膜单糖转运蛋白(TMT)基因家族成员进行鉴定,分析其染色体定位、序列特性、进化关系及在白梨中的表达特征,为蔷薇科果树TMT基因功能研究和利用奠定基础。[方法]基于苹果、草莓、梅、桃、白梨、西洋梨和黑... 详细信息

[目的]本文旨在对蔷薇科果树液泡膜单糖转运蛋白(TMT)基因家族成员进行鉴定,分析其染色体定位、序列特性、进化关系及在白梨中的表达特征,为蔷薇科果树TMT基因功能研究和利用奠定基础。[方法]基于苹果、草莓、梅、桃、白梨、西洋梨和黑树莓7个蔷薇科果树物种的全基因组测序结果,应用生物信息学方法进行序列分析,通过RT-q PCR技术分析白梨TMT基因在各器官组织中和果实不同发育阶段的表达特性。[结果]苹果、草莓、梅、桃、白梨、西洋梨和黑树莓等TMT基因家族成员数量分别为5、2、4、4、6、4、2,各物种TMT基因不均匀地分布在2~4条染色体上。TMT蛋白结构高度保守,均存在11个α螺旋跨膜结构域,氨基酸序列长度700左右,等电点(p I)为4.79~5.93,最大疏水系数为0.312~0.438,为疏水性蛋白,亚细胞定位预测均位于液泡膜。系统进化分析表明,7个蔷薇科果树物种的TMT家族基因明显聚为两组,组Ⅰ中的TMT基因可能为其主要的功能基因。TMT基因家族经历过2次全基因组复制事件,进化过程中主要受纯化选择作用。定量分析发现,白梨中鉴定的Pb TMT1、Pb TMT2、Pb TMT3在成熟叶中和果实膨大期表达量最高,Pb TMT4的表达量随着果实发育不断增高,Pb TMT6的表达量在成熟叶中最高,而在果实发育后期急剧下降。[结论]蔷薇科果树TMT基因家族成员高度保守,主要在液泡膜上起重要功能,不仅在果实糖分积累过程中发挥重要作用,还参与了植物发育和抗逆过程。

关键词：液泡膜单糖转运蛋白(TMT) 蔷薇科糖表达

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蔷薇科6个属植物EST-SSR特征分析

植物研究 2014年第6期34卷 810-815页

作者：张得芳李淑娴夏涛南京林业大学林木遗传与生物技术省部共建教育部重点实验室南京210037 南京林业大学森林资源与环境学院南京210037

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,具有较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用。本研究通过下载公共数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生... 详细信息

EST-SSR是基于功能基因组开发的分子标记,由于其在基因组中广泛均匀分布,具有较好的种属通用性及与表型性状相关联等优点而得到广泛应用。本研究通过下载公共数据库中蔷薇科蔷薇属,苹果属,梨属,李属,草莓属和悬钩子属的EST序列,运用生物信息学的方法,调查6个属中SSR的分布规律及特点。结果表明6个属间SSR分布频率差别较大,从悬钩子属的10.94%到梨属的43.49%。二碱基和三碱基重复类型在6个属中占据优势,其中二碱基重复类型主要为AG/CT、GA/TC及AT/TA,而三碱基重复类型在6个属中差异较大,优势类型为AGA/TCT、GAA/TTC和AAG/CTT及CAC/GTG和ACA/TGT等,显示出较好的属间特异性。该结果对于研究蔷薇科植物的分子系统发育与进化,种质资源鉴定,遗传多样性以及遗传作图提供了研究平台。

关键词：蔷薇科 SSR EST

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蔷薇科植物二新异名

植物研究 2003年第3期23卷 276-277页

作者：朱长山李贺敏万四新河南农业大学郑州450002 周口职业技术学院周口466001

将太行梨 (PyrustaihangshanensisS .Y .WangetC .L .Chang)作为新异名归并入木梨(P .xerophilaY櫣) ;将小瓣委陵菜 (PotentillaparvipetalaB .C .DingetS .Y .Wang)作为新异名归并入三叶朝天委陵菜 (P .supinaL .*** .)。

关键词：蔷薇科植物新异名太行梨小瓣委陵菜