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药物靶标发现的技术

药物生物技术 2009年第1期16卷 90-94页

作者：郜瑞赵霞霞李发荣陕西师范大学生命科学学院陕西西安710062

药物靶标发现是创新药物的前提,也是药物筛选的基础。文章从有效单体化合物、基因表达差异、蛋白质表达差异、蛋白质相互作用和RNA干扰方面着手总结了一些可用于寻找药物靶标的技术,并就这些技术在药物靶标发现中的应用、优缺点加以综述。

关键词：药物靶标基因表达差异差异蛋白质组学蛋白质相互作用 RNA干扰

FXYD2:治疗炎症性机械刺激痛的新型药物靶标（英文）

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Science Bulletin 2015年第9期60卷 896-898,M0004页

作者：王韵 Neuroscience Research Institute and Department of Neurobiology School of Basic Medical Sciences Key Laboratory for Neuroscience Ministry of Education/National Health and Family Planning Commission Peking University PKU-IDG/Mc Govern Institute for Brain Research Peking University

Pain,an unpleasant sensory and emotional experience associated with actual and potential tissue damage,is divided into acute pain and chronic pain by duration.Acute pain assists individuals in adapting to and survivin... 详细信息

关键词：疼痛药物靶标机械性治疗炎症保护价值报警系统健康问题

基于药物靶标识别中药活性成分的研究方法及应用

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药物评价研究 2023年第7期46卷 1578-1586页

作者：赵珊张文青张欣悦阎星旭钱文秀李遇伯天津中医药大学中药学院天津301617

中药小分子与生物体内靶标蛋白的相互作用是中药发挥药理作用的基础,现代科学技术的发展和药物作用靶标的揭示为中药活性成分的研究提供了新的技术和手段。基于已知的药物作用靶标,阐明中药的有效成分及其作用机制已成为中药学研究和发... 详细信息

中药小分子与生物体内靶标蛋白的相互作用是中药发挥药理作用的基础,现代科学技术的发展和药物作用靶标的揭示为中药活性成分的研究提供了新的技术和手段。基于已知的药物作用靶标,阐明中药的有效成分及其作用机制已成为中药学研究和发展的重要方向。基于化学和生物技术与计算机虚拟筛选技术两大视角,总结了亲和超滤质谱技术、分子生物色谱技术、磁珠富集技术、等离子共振技术、生物膜干涉技术、分子对接技术、药效团模型和机器学习8种基于药物靶标识别中药活性成分的研究方法与应用现状,以期补充传统药物发现的方法,为该领域研究提供借鉴与参考。

关键词：中药药物靶标药物筛选活性成分分析技术

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药物靶标的发现与验证技术研究进展

时珍国医国药 2010年第10期21卷 2634-2636页

作者：黄娅琳国家林业局野生动植物物证鉴定中心江苏南京210046 中国药科大学江苏南京211198

药物靶标的发现和验证是新药研发的第一步,也是药物筛选及药物定向合成成败的关键因素之一。随着基因组学、蛋白组学、生物信息学的快速发展,以及RNA干扰、噬菌体展示等新兴技术的出现,药物靶标的发现和验证技术日新月异。该文综述了在... 详细信息

药物靶标的发现和验证是新药研发的第一步,也是药物筛选及药物定向合成成败的关键因素之一。随着基因组学、蛋白组学、生物信息学的快速发展,以及RNA干扰、噬菌体展示等新兴技术的出现,药物靶标的发现和验证技术日新月异。该文综述了在基因水平、转录水平、蛋白水平药物靶标发现和验证的各种技术的研究进展及其成功案例。

关键词：药物靶标靶标发现靶标验证

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抗红色毛癣菌药物靶标研究进展

中国新药杂志 2014年第24期23卷 2886-2891页

作者：吕婧王万能张潇骏张家亮周林生余有平重庆理工大学药学与生物工程学院重庆400054

红色毛癣菌是引起皮肤癣菌病的主要致病菌,现有治疗药物多以酶、核酸及化学键作为抗红色毛癣菌药物靶标,尤其是以真菌细胞膜合成途径中的酶为"药靶"发现的新型酶抑制剂具有良好的开发应用。作为抗真菌剂关键特异性代谢的另一个重要途径... 详细信息

红色毛癣菌是引起皮肤癣菌病的主要致病菌,现有治疗药物多以酶、核酸及化学键作为抗红色毛癣菌药物靶标,尤其是以真菌细胞膜合成途径中的酶为"药靶"发现的新型酶抑制剂具有良好的开发应用。作为抗真菌剂关键特异性代谢的另一个重要途径——细胞壁生物合成途径,其药物靶标的研究和开发却并不理想。根据现有药物靶标,设计和合成新的抗真菌药物以及其衍生药物,运用现代生物技术发现新的药物靶标,对临床治疗皮肤癣菌引起的浅部真菌病有重要的意义。

关键词：红色毛癣菌浅部真菌病药物靶标抗真菌药物

致病菌生物被膜形成的调节机制及潜在的药物靶标

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药学学报 2012年第2期47卷 135-143页

作者：石廷玉邓万燕谢建平西南大学生命科学学院现代生物医药研究所三峡库区生态环境和生物资源国家重点实验室培育基地重庆400715

自然界的细菌群落往往形成生物被膜。生物被膜的形成是一个连续而复杂的过程,受到多种因素的调控。现在研究得比较清楚的是细菌双组分系统和群体感应系统。生物被膜对多种病原菌的毒力有重要影响。因此,针对细菌生物被膜形成过程中的关... 详细信息

自然界的细菌群落往往形成生物被膜。生物被膜的形成是一个连续而复杂的过程,受到多种因素的调控。现在研究得比较清楚的是细菌双组分系统和群体感应系统。生物被膜对多种病原菌的毒力有重要影响。因此,针对细菌生物被膜形成过程中的关键因子设计药物具有重要意义,可能发现全新的治疗方法。

关键词：生物被膜双组分系统群体感应药物靶标

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药物靶标热点领域的共词聚类分析研究

中国新药杂志 2008年第23期17卷 2078-2080页

作者：张音王松俊刁天喜楼铁柱军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所北京100850

后基因组时代的药物靶标是创新药物开发的源泉,了解药物靶标的热点领域有利于针对性地开展创新药物的研究工作。现对2003-2007年MEDLINE数据库收录的药物靶标文献的高频主题词进行共词聚类统计分析,并通过聚类映射图和战略坐标等分析结... 详细信息

后基因组时代的药物靶标是创新药物开发的源泉,了解药物靶标的热点领域有利于针对性地开展创新药物的研究工作。现对2003-2007年MEDLINE数据库收录的药物靶标文献的高频主题词进行共词聚类统计分析,并通过聚类映射图和战略坐标等分析结果与专业知识相结合,揭示药物靶标的热点领域。研究发现,目前的靶标研究主要聚焦在抗肿瘤领域,尤其是酶的药理学研究;结晶学、计算机模拟、生物模型等药靶开发技术也应值得重点关注。

关键词：药物靶标热点领域共词聚类

药物发现的新靶标、新策略与抗病毒药物研究专栏

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药学学报 2022年第10期57卷 I0002-I0003页

众所周知,新药研发是一项高投资、长周期、高风险的技术密集型产业。在传统的药物研发范式中,分子设计、合成和筛选各个环节的效率相对低下,导致长期以来模拟创新成为新药创制的重要策略。此外,靶向治疗在世界范围内都出现靶点扎堆或耗... 详细信息

众所周知,新药研发是一项高投资、长周期、高风险的技术密集型产业。在传统的药物研发范式中,分子设计、合成和筛选各个环节的效率相对低下,导致长期以来模拟创新成为新药创制的重要策略。此外,靶向治疗在世界范围内都出现靶点扎堆或耗尽的现象,且相当比例的药物靶标属于所谓的“无药可靶”或“不可成药”蛋白。近年来,随着组学技术、生物信息学、分子生物学、结构生物学等现代学科的迅速发展,涌现出一些药物研发新靶标与新策略。

关键词：现代学科技术密集型产业药物研发新药创制结构生物学抗病毒药物组学技术药物靶标

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基于多网络融合的药物靶标预测算法研究

基于多网络融合的药物靶标预测算法研究

作者：李永杰广西大学

学位级别：硕士

药物靶标相互作用预测以解释当前药物的作用机制和可能存在的未知靶标活性为目标,是药理学发展的重要组成的部分,也是当前研究的热点。传统的生物学实验可以有效地发现药物靶标相互作用,但是不仅耗时且成本较高。随着各种药物、靶点和... 详细信息

药物靶标相互作用预测以解释当前药物的作用机制和可能存在的未知靶标活性为目标,是药理学发展的重要组成的部分,也是当前研究的热点。传统的生物学实验可以有效地发现药物靶标相互作用,但是不仅耗时且成本较高。随着各种药物、靶点和相互作用数据的不断增加和更新,作为一种经济有效的代替手段,计算方法预测可能存在的药物靶标相互作用逐渐成为研究的热点,为进一步实验提供高可靠性。现有的相关研究主要是基于计算的方法通过融合多种药物靶标关联网络来预测药物靶点,但大多数方法容易忽略不同网络之间拓扑结构所蕴含的信息,很难准确地提取不同网络的特征信息进行预测,并且没有考虑药物靶标关联矩阵稀疏性对计算结果带来的影响,难以满足日益增长药物靶标研究需求。因此本文在前人工作的工作基础上,将从以下两个方面进行研究:(1)针对于多网络融合中存在的特征融合和降维问题,本文提出了一种基于多模态降噪自编码器药物靶标预测算法MDADTI。该算法在使用重启随机游走和正点互信息计算得到药物和靶标拓扑相似性矩阵的基础上,应用多模态降噪自编码器,根据不同的输入矩阵,自适应地将数据从高维顶点向量生成压缩的低维向量。最后重构出药物靶标矩阵,进行药物靶标关系预测。为了验证方法的有效性,我们将算法与传统的机器学习算法相比,模型效果要远优于其他方法,与其他先进算法相比,准确率远高于其他方法。(2)针对多网络融合中存在的特征更新和矩阵稀疏问题,本文提出了一种基于注意力图卷积药物靶标预测算法NAGCN。NAGCN在扩散成分分析得到初始药物靶标特征的基础上,通过使用注意力图卷积来更新药物靶标特征,重构药物靶标预测模型。通过十折交叉验证法,我们将NAGCN与其他现有的基于多网络融合特征更新的预测算法进行比较,结果显示我们的方法预测效果较优。此外,我们还用鲁棒性检验和实际案例分析来进一步验证了NAGCN的有效性。

关键词：药物靶标多网络融合自编码器图卷积特征更新