检索结果-南通市图书馆

植物学报 2019年第1期54卷 37-45页

作者：陶乃奇张斌刘信凯周和达钟乃盛严丹峰张敏高继银张文驹复旦大学生命科学学院生物多样性科学研究所生物多样性与生态工程教育部重点实验室上海200433 上海星源农业实验场上海201417 上海市农业发展促进中心上海200335 棕榈生态城镇发展股份有限公司广州510627

利用杜鹃红山茶(Camellia azalea)转录组数据和前人研究中获得的12个高多态性的ssr位点,采用荧光毛细管电泳分析了21个茶花杂交新品种的基因型。结果显示,12对ssr引物都能获得稳定清晰的扩增产物,且上述12个ssr位点的基因型能够完全区... 详细信息

利用杜鹃红山茶(Camellia azalea)转录组数据和前人研究中获得的12个高多态性的ssr位点,采用荧光毛细管电泳分析了21个茶花杂交新品种的基因型。结果显示,12对ssr引物都能获得稳定清晰的扩增产物,且上述12个ssr位点的基因型能够完全区分上述21个茶花新品种。其中,来自同一杂交组合后代的多个品种,基因型间有差异的位点数为2–10个,来自不同杂交组合后代的品种间,其基因型有差异的位点数为5–12个。研究结果表明,上述21个茶花新品种均获得了独特的基因型标记,能准确地进行品种身份鉴定,这对以扦插或嫁接扩大生产的茶花品种的鉴定和品种权保护具有重要意义。

关键词：山茶属荧光标记ssr 新品种保护品种鉴定

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

桃品种特异性荧光ssr分子标记数据库构建

引用

果树学报 2013年第6期30卷 924-932页

作者：李雄伟孟宪桥贾惠娟王力荣王志强马瑞娟吴大军董冰 Maria Jose Aranzana Pere Arús 高中山浙江大学果树科学研究所·农业部园艺植物生长发育与生物技术重点开放实验室杭州310058 中国农业科学院郑州果树研究所郑州450009 江苏省农业科学院园艺研究所南京210014 浙江奉化水蜜桃研究所浙江奉化315521 山西省农业科学研究院果树研究所山西太谷030815 Centre de Recerca en Agrigenomica CSIC-IRTA-UAB Campus UAB-Edifici CRAG Bellaterra-Cerdanyola del Valles 08193BarcelonaSpain

【目的】选择通用的荧光ssr分子标记建立桃种质资源基因型数据库便于进行种质特异性鉴定、资源交换、管理和利用。【方法】根据48个ssr标记对国内外669份桃品系的遗传多样性测试结果，从中选择出一部分多态信息含量较高、适合品种鉴别... 详细信息

【目的】选择通用的荧光ssr分子标记建立桃种质资源基因型数据库便于进行种质特异性鉴定、资源交换、管理和利用。【方法】根据48个ssr标记对国内外669份桃品系的遗传多样性测试结果，从中选择出一部分多态信息含量较高、适合品种鉴别的标记，采用不同荧光标识组合在ABI3130测序仪测试，为了使不同批次的测试结果准确可靠，6—8个参照品种纳入每次的测试中。结果用16个ssr标记基本可以判断品种的特异性，它们可以用4种荧光标识进行标记，便于分为4组在ABI遗传分析仪上测试。目前数据库包含641份材料．基因型一致的品系多为同一品种突变体和自交系演化的地方品种。文中列出了100份中国代表性种质资源分子标记数据库，并建议8个中国品系为参照。对17个桃品种进行系谱验证发现，我国资源圃所育成的7个品种系谱信息正确，但日本桃品种系谱信息与文献出现偏差。【结论】应用16个多态性高的ssr荧光标记可以构建精确的桃品种分子指纹数据库，测试方法及结果对品种特异性和系谱鉴定提供重要的参考．推动资源分子指纹数据库标准化建设工作。

关键词：桃荧光标记ssr 指纹图谱数据库品种鉴定系谱鉴定

来源：

维普期刊数据库

同方期刊数据库评论

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

山西糜子核心种质分子身份证的构建

山西糜子核心种质分子身份证的构建

引用

作者：林元香山西农业大学

学位级别：硕士

为快速鉴定糜子(Panicum miliaceum)资源,建立大数据管理平台,为种质身份标识和溯源管理提供理论依据。本试验以山西省272份糜子核心种质为研究材料,以实验室前期构建的85对ssr引物为检测工具,应用ID Analysis 4.0软件,构建材料的DNA分... 详细信息

为快速鉴定糜子(Panicum miliaceum)资源,建立大数据管理平台,为种质身份标识和溯源管理提供理论依据。本试验以山西省272份糜子核心种质为研究材料,以实验室前期构建的85对ssr引物为检测工具,应用ID Analysis 4.0软件,构建材料的DNA分子身份证。主要结果如下:1.对85对ssr引物进行筛选,发现20对引物可区分全部种质。用20对引物扩增272份糜子资源,共检测到等位变异(Na)60个,平均每个位点检出3个;有效等位变异(Ne)为2.4145(RYW16)～2.9882(RYW5),平均值为2.7873;Shannon多样性指数(I)为0.9578(RYW16)～1.0967(RYW5),平均值为1.0552;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.5858(RYW16)～0.6654(RYW5),平均值为0.6402;多态性信息含量(PIC)为0.6044(RYW77)～0.7530(RYW37),平均值为0.6921。综合PIC和I值,高于平均值的引物共有9对,分别为RYW37、RYW28、RYW5、RYW18、RYW54、RYW11、RYW49、RYW53和RYW8。利用ID Analysis 4.0软件分析,发现20对引物组合(RYW67、RYW53、RYW37、RYW65、RYW62、RYW77、RYW5、RYW49、RYW84、RYW19、RYW11、RYW40、RYW54、RYW28、RYW31、RYW7、RYW16、RYW8、RYW9和RYW18)可区分272份材料。利用这20对引物构建糜子核心种质的字符串、条形码和二维码DNA分子身份证。2.根据UPGMA聚类图,将272份材料可划分为3个大类群:类群1材料118份,其中黄土高原春夏糜子区材料77份,占比65.3%,北方春糜子区材料41份,占比34.7%。类群2材料104份,其中黄土高原春夏糜子区材料71份,占比68.3%,北方春糜子区材料33份,占比31.7%。类群3材料50份,其中黄土高原春夏糜子区材料34份,占比68%,北方春糜子区材料16份,占比32%。3.基于7对荧光标记ssr引物对272份材料进行PCR扩增及毛细管电泳,读取条带并分析得到各引物的遗传参数。272份材料在7个位点中共检出164个等位变异,每个位点检出12-52个(平均23.4286个);Ne为1.9929(RYW3)～8.7375(RYW146),平均值为4.7151;I值为1.1551(RYW3)～2.8526(RYW146),平均值为1.9088;Nei’s基因多样性指数(Nei)为0.4982(RYW3)～0.8856(RYW146),平均值为0.7416;PIC为0.5804(RYW3)～0.9657(RYW146),平均值为0.7514。分析不同生态区的遗传多样性参数,黄土高原春夏糜子区的I值和PIC值均高于北方春糜子区。分析不同来源的遗传多样性参数,就Na值而言,长治最低(2.8182±1.7787),太原最高(9.1818±5.6182);就Ne值而言,长治最低(1.9753±1.2122),晋中最高(3.7364±2.9835);就I值而言,长治最低(0.6208±0.7017),太原最高(1.3224±0.8113);就PIC值而言,长治最低(0.3455),太原最高(0.6198)。就I和PIC而言,长治最低,太原最高。4.根据UPGMA聚类,272份糜子材料划归3个类群(GⅠ-GⅢ)。272份糜子材料可分成3个类群(GⅠ-GⅢ)。GⅠ有86份材料,其中黄土高原春夏糜子区65份,占75.6%,北方春糜子区材料21份,占比24.4%;GⅡ有110份材料,其中黄土高原春夏糜子区70份,占63.6%,北方春糜子区材料40份,占比36.4%;GⅢ包括76份材料,其中黄土高原春夏糜子区47份,占69.1%,北方春糜子区材料29份,占比30.9%。5.鉴定了7对荧光ssr引物对供试材料的区分程度。结果发现任何1对引物均不能分开全部资源。整合PIC值大和区分率高的引物,发现用7对引物组合可区分272份材料。其中,组合RYW146+RYW124可区分材料190份;组合RYW146+RYW124+RYW37可区分材料232份;组合RYW146+RYW124+RYW37+RYW43可区分材料251份;组合RYW146+RYW124+RYW37+RYW43+RYW40可区分材料257份;组合RYW146+RYW124+RYW37+RYW43+RYW40+RYW3可区分材料270份;组合RYW146+RYW124+RYW37+RYW43+RYW40+RYW3+RYW6可区分材料272份。利用此7对引物构建了糜子核心种质的字符串和二维码DNA分子身份证。

关键词：糜子核心种质山西荧光标记ssr 分子身份证

来源：

同方学位论文库评论

在线全文

同方学位论文库

学校读者我要写书评

暂无评论

欢迎您,

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：

通借通还

欢迎您,

建议与咨询 留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

时间限定

文献类型

馆藏选择

核心期刊

语言

文献类型

帮助

文字说明：

检索规则说明：

检索范例：

分类表

所选分类

限定检索结果

文献类型

馆藏范围

日期分布

学科分类号

主题

机构

作者

语言

在线全文

在线全文

在线全文

请选择保存的检索档案： 新增检索档案 确定 取消

请选择收藏分类： 新增自定义分类 确定 取消

通借通还

建议与咨询留下您的常用邮箱和电话号码，以便我们向您反馈解决方案和替代方法

请选择保存的检索档案：

请选择收藏分类：