检索结果-南通市图书馆

电场作用下Al_6CuMg_4准晶相自由能的计算

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

稀有金属材料与工程 2007年第9期36卷 1578-1583页

作者：张建军王永欣陈铮刘兵西北工业大学陕西西安710072

基于Thomas-Fermi模型,系统定量地计算研究了在电场作用下Al6CuMg4准晶相对于Al-Cu-Mg固溶体及普通化合物的自由能和吉氏自由能的变化趋势。结果表明:Al6CuMg4准晶相、Al2CuMg及Al-Cu-Mg固溶体的自由能与吉氏自由能,均随着电场强度的增... 详细信息

基于Thomas-Fermi模型,系统定量地计算研究了在电场作用下Al6CuMg4准晶相对于Al-Cu-Mg固溶体及普通化合物的自由能和吉氏自由能的变化趋势。结果表明:Al6CuMg4准晶相、Al2CuMg及Al-Cu-Mg固溶体的自由能与吉氏自由能,均随着电场强度的增大而升高。正电场作用要高于负电场作用,但差距不大。Al6CuMg4准晶相的自由能与吉氏自由能相对于固溶体对电场的变化更为敏感,随着电场的升高,Al6CuMg4与固溶体间的自由能与吉氏自由能的差值迅速增加。电场作用使得准晶相的不稳定性增加,Al2CuMg的稳定性显著高于Al6CuMg4的电场稳定性。对于Al-Cu-Mg固溶体,随着Mg含量的增加,合金对电场的敏感性增强,但增大幅度要远远小于化合物与准晶相的增大幅度。

关键词：自由能吉氏自由能电场 Al6CuMg4准晶 Thomas-Fermi模型

激酶ABL与肉豆蔻酰位点小分子作用机理的分子动力学模拟及自由能计算

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

物理化学学报 2013年第2期29卷 423-430页

作者：杨丽君刘茜袁文彬杨胜勇西华师范大学化学化工学院化学合成与污染控制四川省重点实验室四川南充637009 四川大学华西医院生物治疗国家重点实验室成都610041

采用分子动力学方法研究激酶ABL与ATP位点小分子imatinib、P16及变构位点小分子STJ、MS7、MS9、3YY、MYR等的结合,并用GBSA(generalized Born surface area)方法将结合自由能分解到各残基.自山能计算结果表明,小分子STJ、MS7、MS9有利于... 详细信息

采用分子动力学方法研究激酶ABL与ATP位点小分子imatinib、P16及变构位点小分子STJ、MS7、MS9、3YY、MYR等的结合,并用GBSA(generalized Born surface area)方法将结合自由能分解到各残基.自山能计算结果表明,小分子STJ、MS7、MS9有利于imatinib与ABL结合;小分子STJ、MS7、MS9与激酶ABL的结合自由能接近,绝对值均大于ABL与3YY、MYR的结合自由能.能量分解表明,ABL残基ILE502、VAL506、LEU510与STJ和MYR的相互作用是αl螺旋处于弯曲状态的重要原因.模拟过程中ABL肉豆蔻酰口袋残基均方根偏差(RMSD)变化值表明,STJ等小分子抑制剂与ABL结合后降低了肉豆蔻酰口袋残基的柔性.

关键词：分子动力学激酶豆蔻酰位点自由能抑制剂

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

通过自由能的差别划分蛋白质连续结构域

生物化学与生物物理学报 2001年第4期33卷 386-394页

作者：谢志群丁达夫许根俊中国科学院上海生命科学研究院生物化学和细胞生物学研究所!上海200031

结构域是蛋白质三级结构下面的结构层次 ,大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的三级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义。但目前对结构域的划分还没有一个十分... 详细信息

结构域是蛋白质三级结构下面的结构层次 ,大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的三级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义。但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。本文通过计算去折叠自由能来实现对蛋白质结构域的划分。用此方法对 5 0种不同蛋白质序列连续的双结构域进行了分析 ,大多数蛋白质的结构域划分结果与文献报道一致 ,另外一些虽然与文献报道结果不一致 ,但比文献报道的结果更合理

关键词：结构域自由能结构参数化可分离度划分

用密度泛函方法计算乙酰丙酮铁加氢反应的自由能

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

中国石油大学学报（自然科学版） 2009年第3期33卷 148-152页

作者：张宏玉步翠环刘东邓文安阙国和中国石油大学重质油国家重点实验室山东青岛266555

运用密度泛函量子力学的广义梯度近似方法对乙酰丙酮铁、氢气、乙酰丙酮3种分子以及铁的单晶胞进行结构优化计算,确定它们的对称群和总能量。根据频率分析结果,计算不同温度下乙酰丙酮铁加氢生成铁和乙酰丙酮两种互变异构体的吉布斯自... 详细信息

运用密度泛函量子力学的广义梯度近似方法对乙酰丙酮铁、氢气、乙酰丙酮3种分子以及铁的单晶胞进行结构优化计算,确定它们的对称群和总能量。根据频率分析结果,计算不同温度下乙酰丙酮铁加氢生成铁和乙酰丙酮两种互变异构体的吉布斯自由能。计算结果表明:相同温度下,乙酰丙酮铁加氢生成烯醇式乙酰丙酮的反应自由能小于生成酮式结构乙酰丙酮的反应自由能;乙酰丙酮铁加氢更倾向于生成烯醇式结构的产物。

关键词：密度泛函自由能乙酰丙酮铁加氢反应

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

塑性损伤本构模型的自由能势函数研究

固体力学学报 2010年第3期31卷 237-243页

作者：邵长江李建中同济大学土木工程防灾国家重点实验室上海200092

自由能势函数是不可逆热力学量及其共轭量的标量泛函,是广义标准材料模型的重要组成.论文根据损伤状态、过程、作用和伪势的定义和定理,分析了损伤耗散势的数学和物理含义,探讨了损伤耗散势的理论基础和描述耗散势的一般理论方法.研究... 详细信息

自由能势函数是不可逆热力学量及其共轭量的标量泛函,是广义标准材料模型的重要组成.论文根据损伤状态、过程、作用和伪势的定义和定理,分析了损伤耗散势的数学和物理含义,探讨了损伤耗散势的理论基础和描述耗散势的一般理论方法.研究了耗散势、损伤作用和自由能势函数的相互关系,给出了满足上述基本原理的自由能表达式,基于增量最小原理的变分形式得到了损伤理论基本方程的数值离散方程,实验模拟验证了该文理论和数值方法的正确性和有效性.

关键词：热力学耗散势自由能损伤本构作用泛函变分原理

基于去折叠自由能的蛋白质结构域划分方法——适用于连续与不连续结构域

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

生物化学与生物物理学报 2003年第12期35卷 1090-1098页

作者：谢志群许根俊中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所中国科学院上海生命科学研究院生物化学与细胞生物学研究所上海200031

结构域是蛋白质的一个结构层次 ,可以看作是蛋白质结构、折叠、功能、进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的三级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都... 详细信息

结构域是蛋白质的一个结构层次 ,可以看作是蛋白质结构、折叠、功能、进化和设计的基本单位。大多数的蛋白质都可分为若干个结构域 ,结构域的不同组合使蛋白质具有不同的三级结构并具有不同的功能。蛋白质结构域的划分在理论与应用上都具有重要意义 ,但目前对结构域的划分还没有一个十分理想的方法。作者曾经发展了一种通过计算去折叠自由能划分蛋白质结构域的方法 ,但该方法只适用于连续双结构域的划分。现在 ,作者通过构造氨基酸残基相互作用矩阵 ,并进行对应分析 (correspondenceanalysis) ,然后根据去折叠自由能和一些经验打分函数对蛋白质进行切割和优选 ,发展了可以同时处理连续和不连续结构域的划分方法。该方法与晶体结构作者手工分析相比较 ,二者的结果有 76 %的相似。

关键词：结构域作用矩阵自由能打分函数划分

外势场作用对Al-Cu-Fe准晶自由能影响的计算

在线全文

同方期刊数据库

学校读者我要写书评

暂无评论

材料热处理学报 2008年第1期29卷 146-151页

作者：张建军王永欣陈铮刘兵西北工业大学材料学院陕西西安710072

基于Thomas-Fermi模型,计算研究了电场作用下Al-Cu-Fe系合金及其Al62.5Cu25Fe12.5准晶相的自由能和吉氏自由能的变化趋势。结果表明:固溶温度下Al62.5Cu25Fe12.5准晶的电场稳定性最低,其次是化合物Al7Cu2Fe,二元化合物Al2Cu的稳定性要... 详细信息

基于Thomas-Fermi模型,计算研究了电场作用下Al-Cu-Fe系合金及其Al62.5Cu25Fe12.5准晶相的自由能和吉氏自由能的变化趋势。结果表明:固溶温度下Al62.5Cu25Fe12.5准晶的电场稳定性最低,其次是化合物Al7Cu2Fe,二元化合物Al2Cu的稳定性要远高于前两者,但比固溶体的电场稳定性要低。正、负边界势和极板电压作用下,准晶、化合物、固溶体的自由能与吉氏自由能随边界势和极板电压的升高而升高,且近似零点对称,但正边界势和正极板电压的作用要比负边界势和负极板电压的作用强。

关键词：自由能吉氏自由能电场准晶 Thomas—Fermi模型

基于分子动力学模拟和连续介质模型的自由能计算方法

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

化学进展 2004年第2期16卷 153-158页

作者：侯廷军徐筱杰北京大学化学与分子工程学院北京100871

近些年 ,基于分子动力学模拟和连续介质模型的自由能计算方法受到了越来越多的关注 ,其中MM PBSA就是最具代表性的方法。在MM PBSA中 ,体系的焓变采用分子力学 (MM )的方法计算得到 ;溶剂效应中极性部分对自由能的贡献通过解Poisson Bol... 详细信息

近些年 ,基于分子动力学模拟和连续介质模型的自由能计算方法受到了越来越多的关注 ,其中MM PBSA就是最具代表性的方法。在MM PBSA中 ,体系的焓变采用分子力学 (MM )的方法计算得到 ;溶剂效应中极性部分对自由能的贡献通过解Poisson Boltzmann(PB)方程的方法计算得到 ;溶液效应中非极性部分对自由能的贡献则通过分子表面积 (SA)计算得到。本文结合我们科研组的工作 ,就近几年MM PBSA方法的最新进展做了较为详细的阐述 ,同时对MM PBSA的发展前景进行了展望。

关键词：分子动力学模拟连续介质模型自由能计算方法 MM/PBSA 药物分子设计计算机辅助设计去溶剂化能熵效应

在线全文

学校读者我要写书评

暂无评论

低自由能固体表面的制备及其应用

化学进展 2002年第3期14卷 158-166页

作者：谷国团张治军党鸿辛中国科学院兰州化学物理研究所固体润滑国家重点实验室兰州730000 河南大学润滑与功能材料重点实验室开封475001

低自由能表面具有一些独特的性能 ,在工业和日常生活中具有广泛的应用。本文就低自由能表面的制备及其发展概况进行综述 ,共引用文献

关键词：低自由能固体表面制备氟聚合物自由能测试表面张力