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脉冲场凝胶电泳用于李斯特菌分型及分子流行病学研究

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中国人兽共患病杂志 2000年第1期16卷 90-93页

作者：陈太基封幼玲江苏省卫生防疫站南京210009

李斯特菌是一种重要的人畜共患病病原菌，该菌由于特殊的生物学特性，在自然界分布广泛，危害性大。文献报道，由该菌引起的李斯特菌病已在世界范围发生过4次大暴发，我国大连某饲养场也曾发生过一起猪李斯特菌病大暴发，小范围的流行... 详细信息

李斯特菌是一种重要的人畜共患病病原菌，该菌由于特殊的生物学特性，在自然界分布广泛，危害性大。文献报道，由该菌引起的李斯特菌病已在世界范围发生过4次大暴发，我国大连某饲养场也曾发生过一起猪李斯特菌病大暴发，小范围的流行也时有发生[1]。因此，对该病的病原学研究显得十分重要。国外已有数家实验室应用不同的方法对此进行了分子流行病学研究，结果显示，近年新发展起来的脉冲场凝胶电泳(pulsed field gel electropho-re-sis,PFGE)法为其最优异的方法之一[2～4]。本文将该方法用于李斯特菌的研究综述如下。

关键词：李斯特菌分子流行病学脉冲场凝胶电泳

脉冲场凝胶电泳中酵母完整染色体DNA标记的简化制备法

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中华医学遗传学杂志 1993年第3期10卷 165-166+195页

作者：陈金东鲁晓瑄黄鹰邱定红王世浚南京铁道医学院生物教研室

脉冲场凝胶电泳技术(pulsed field gel elecrtophoresis,PFGE)是近年来发展起来的一种能分离大分子DNA的新技术,它使电泳分离DNA片段的大小由原来的50kb跃迁到10000kb。但由于PFGE分离DNA大片段时,需要有相应大小的DNA分子标记。酵母菌... 详细信息

脉冲场凝胶电泳技术(pulsed field gel elecrtophoresis,PFGE)是近年来发展起来的一种能分离大分子DNA的新技术,它使电泳分离DNA片段的大小由原来的50kb跃迁到10000kb。但由于PFGE分离DNA大片段时,需要有相应大小的DNA分子标记。酵母菌染色体DNA大小范围在200～20000

关键词：凝胶电泳脉冲场染色体 DNA 制备法酵母

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深圳市志贺菌脉冲场电泳分子分型分析

中华预防医学杂志 2008年第5期42卷 317-320页

作者：兰全学扈庆华石晓路王冰林一曼程锦泉张顺祥深圳市疾病预防控制中心 518020

目的分析深圳市2001—2006年分离志贺菌菌株之间的相关性，初步建立志贺菌的脉冲场电泳（pulsed-field gel eleetrophoresis，PFGE）分子分型监测网络。方法55株志贺菌基因组DNA经Xba I酶切，通过PFGE获得电泳图谱，利用BioNumerics软... 详细信息

目的分析深圳市2001—2006年分离志贺菌菌株之间的相关性，初步建立志贺菌的脉冲场电泳（pulsed-field gel eleetrophoresis，PFGE）分子分型监测网络。方法55株志贺菌基因组DNA经Xba I酶切，通过PFGE获得电泳图谱，利用BioNumerics软件对图谱进行聚类分析。结果55株志贺菌被分为41种PFGE图谱，聚类分析显示32株细菌谱型属于同一个群，其余菌株谱型差异较大。结论深圳地区存在遗传紧密相关的志贺菌流行克隆，也存在遗传不相关克隆。PFGE分子分型崎测网络的建立，有助于细菌性痢疾的主动监测、暴发调查和传染源追踪。

关键词：志贺菌属电泳凝胶脉冲场细菌分型技术

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云南省鼠疫耶尔森菌脉冲场凝胶电泳分析

中华地方病学杂志 2013年第6期32卷 605-607页

作者：王鹏石丽媛叶蕊崔志刚李伟杨光璨董珊珊郭英宋志忠大理学院公共卫生学院、云南省地方病防治所云南省鼠疫防控技术重点实验室大理671000 大理学院公共卫生学院中国疾病预防控制中心传染病预防控制所

目的构建云南省鼠疫菌株脉冲场凝胶电泳（PFGE）图谱库，为云南鼠疫的溯源及分型防控提供依据。方法选取云南省家、野鼠型以及玉龙鼠疫菌株共29株，分别采用AscI和FseI两种内切酶对菌株进行酶切分析，并使用BioNumerics6．6软件对图谱... 详细信息

目的构建云南省鼠疫菌株脉冲场凝胶电泳（PFGE）图谱库，为云南鼠疫的溯源及分型防控提供依据。方法选取云南省家、野鼠型以及玉龙鼠疫菌株共29株，分别采用AscI和FseI两种内切酶对菌株进行酶切分析，并使用BioNumerics6．6软件对图谱聚类。结果PFGE分析可以将29株鼠疫菌分为20个基因型，这些基因型又归为3大簇，即家鼠基因簇、野鼠基因簇以及玉龙基因簇，家鼠基因簇又可分为德宏亚簇、文山亚簇及临沧亚簇。结论云南鼠疫菌PFGE分子分型具有区域聚集性；PFGE基因型与菌株生态型能够很好地对应；玉龙鼠疫菌是云南一个独立的PFGE基因型。

关键词：耶尔森菌鼠疫电泳凝胶脉冲场云南

福氏志贺菌4c型暴发和散发菌株的脉冲场凝胶电泳分型

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中华预防医学杂志 2007年第1期41卷 50-53页

作者：张蔚潘劲草孟冬梅叶榕汪皓秋杭州市疾病预防控制中心微生物检验科 310006

目的了解杭州地区福氏志贺菌4c 型暴发菌株和散发菌株的分子分型特征。方法对2003和2005年杭州地区的2次食物中毒暴发分离的福氏志贺菌菌株(暴发1和暴发2,菌株数分别为13株和12株)和2005年1例散发腹泻患者分离的福氏志贸菌4c 型离株(1株... 详细信息

目的了解杭州地区福氏志贺菌4c 型暴发菌株和散发菌株的分子分型特征。方法对2003和2005年杭州地区的2次食物中毒暴发分离的福氏志贺菌菌株(暴发1和暴发2,菌株数分别为13株和12株)和2005年1例散发腹泻患者分离的福氏志贸菌4c 型离株(1株)进行生化鉴定和血清分型,PCR 检测侵袭性抗原基因 ipaH,改良 Kirby-Bauer 纸片法检测菌株的耐药谱及脉冲场凝胶电泳(pulse fieht gel electrophoresis,PFGE)进行分子分型。结果暴发1中分离的13株菌株均为福氏4c 型,但检测的6株菌株间的 PFGE 图谱存在着相当的差异,Dice 系数为0.78至0.92。暴发2中分离的菌株有10株福氏4c 型和2株福氏 X 型,所有菌株的 PFGE 图谱几乎完全一致。暴发2分离株和暴发1的部分分离株可能存在着一定相关性(Dice 系数大于0.8),而散发菌株与2起暴发的绝大部分菌株间的距离较远(Dice 系数小于0.8)。暴发1、暴发2的分离株和1株散发菌株对14种抗生素的耐药谱略呈差异,暴发2中分离的福氏4c 型和 X 型菌株的耐药谱一致。结论 PFGE 能够很好地辨别福氏志贺菌4c 型的两起暴发菌株和1株散发菌株。福氏志贺菌4c 型菌株具有易变性,可在暴发流行过程中产生 PFGE 图谱的差异、血清亚型的转换、耐药谱的变化等。

关键词：志贺氏菌属细菌分型技术电泳凝胶脉冲场

脉冲场核磁共振FID信号的接收及其优化处理

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脉冲场核磁共振FID信号的接收及其优化处理

作者：袁乐华中科技大学

学位级别：硕士

脉冲场核磁共振(Pulsed Magnetic Field Nuclear Magnetic Resonance,PMF-NMR)不仅可以提高信噪比,改善频谱分辨率,还可能引发更显著的场致奇异现象。相比于稳态场NMR,PMF-NMR的高背景场强使样品共振频率更高,频带范围更宽,但由于脉冲... 详细信息

脉冲场核磁共振(Pulsed Magnetic Field Nuclear Magnetic Resonance,PMF-NMR)不仅可以提高信噪比,改善频谱分辨率,还可能引发更显著的场致奇异现象。相比于稳态场NMR,PMF-NMR的高背景场强使样品共振频率更高,频带范围更宽,但由于脉冲场持续时间短,导致在一次磁体放电时仅能进行少量PMF-NMR实验。此外,脉冲场的时变性导致接收的自由感应衰减(Free Induction Decay,FID)信号具有场致相位畸变。射频双工器是PMF-NMR谱仪中实现发射高功率射频脉冲和接收微弱NMR信号两种状态切换的核心器件,而目前的双工器大多数具有窄带、低功率容量或者大插入损耗的缺点。且现有FID信号相位校正算法普适性不足,不能应用于实验效率更高的平顶脉冲场NMR。为此,本文自主设计了高性能双工器和FID信号相位校正算法,为得到高信噪比FID信号频谱和准确读取频谱所携带的信息奠定基础。针对现有双工器的不足,本文提出了基于PIN二极管和多段不同阻抗共面波导线的近似对称串并联型双工器电路拓扑。通过采用梯度优化法确定电路优化方向和最小二乘法计算插入损耗和回波损耗的优化误差,确定了电路中电容电感的型号和共面波导线的参数,使射频双工器能在高频和宽带范围内进行阻抗匹配。双工器最终实现了频带0.25～1 GHz范围内,插入损耗小于0.56 d B、回波损耗大于13 d B、隔离度大于37 d B、功率容量500 W和开关时间小于0.9μs的工作性能,满足PMF-NMR实验对高频、宽带和低插入损耗高性能双工器的需求。针对脉冲场带来的相位畸变,本文提出了可适用于平顶和非平顶脉冲磁场下的“寻峰”算法。基于频域峰值点读取中心频率f,求出FID信号的理论估算相位,并基于时域信号的正、负峰值点,求出实际估算相位,利用二者差值对原始FID信号进行反卷积,校正畸变相位,得到了类似稳态场下无畸变的FID信号,缩小了谱线半峰宽,提高了频谱分辨率,确保了FID信号频谱信息的可读性和准确性。

关键词：脉冲场核磁共振高频宽带射频双工器自由感应衰减信号相位校正

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宽频带2D相控阵声束特性及脉冲场分析

压电与声光 2001年第3期23卷 240-243页

作者：周秦武丁爱玲戴启军卞正中西安交通大学电信学院西安710049 陕西长安大学计算机系西安710064

二维 (2 D)换能器阵列在横向和侧向两个方向上可实现超声波束的聚焦控制 ,在整个三维空间实现聚焦声束的扫描。文章通过对波束采用系统理论仿真的方法 ,确定优化适于医学成象的参数。研究了宽带 2 D阵列波束的频率特性 ,并对阵列阵元尺... 详细信息

二维 (2 D)换能器阵列在横向和侧向两个方向上可实现超声波束的聚焦控制 ,在整个三维空间实现聚焦声束的扫描。文章通过对波束采用系统理论仿真的方法 ,确定优化适于医学成象的参数。研究了宽带 2 D阵列波束的频率特性 ,并对阵列阵元尺寸和阵元数对波束特性的影响效果进行了研究。

关键词：超声换能器宽频带二维相控阵声束特性脉冲场

应用肠杆菌复制的属间同源序列-多聚酶链反应和脉冲场凝胶电泳对O11绿脓杆菌进行DNA指纹图分析

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国外医学(微生物学分册) 1996年第3期19卷 41-42页

作者：李大男

绿脓杆菌O11血清型是临床上常见的血清型,并且与暴发性医院内感染密切相关,特别是在免疫功能受抑制的患者。脉冲场凝胶电泳(PFGE)是用来进行绿脓杆菌感染的分子流行病学研究的一种有效的DNA指纹图谱,但此法费用昂贵且费时。Versalovic... 详细信息

绿脓杆菌O11血清型是临床上常见的血清型,并且与暴发性医院内感染密切相关,特别是在免疫功能受抑制的患者。脉冲场凝胶电泳(PFGE)是用来进行绿脓杆菌感染的分子流行病学研究的一种有效的DNA指纹图谱,但此法费用昂贵且费时。Versalovic等首先用肠杆菌复制的属间同源序列为引物做多聚酶链反应(PCR),即ERIC-PCR,对O11血清型的绿脓杆菌进行DNA指纹图分析,并与PFGE进行对比研究。

关键词：凝胶电泳绿脓杆菌极毛杆菌属肠道细菌脉冲场 O11 DNA 属间同源序列

脉冲场电泳分析恶性疟原虫6Kb线粒体DNA

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国际医学寄生虫病杂志 2000年第2期27卷 81-82页

作者：王晓黎

恶性疟原虫线粒体基因组由6Kb的线性重复单位构成,每个虫体约有20个拷贝。这个重复单位的大小界于6—23Kb之间。新近的研究用凝胶电泳和电镜观察到另外一些30—50Kb的环形寡聚体和较大的线形线粒体DNA(mtDNA)。电镜下发现这些大分子有... 详细信息

恶性疟原虫线粒体基因组由6Kb的线性重复单位构成,每个虫体约有20个拷贝。这个重复单位的大小界于6—23Kb之间。新近的研究用凝胶电泳和电镜观察到另外一些30—50Kb的环形寡聚体和较大的线形线粒体DNA(mtDNA)。电镜下发现这些大分子有分子结构的奇变,包括呈“Y”形和“H”

关键词：恶性疟原虫脉冲场 DNA 线粒体粒线体电泳分析