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基于高通量测序的西北太平洋柔鱼食性初步分析

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上海海洋大学学报 2024年第4期 900-910页

作者：王欣刘必林何骏杰宋林玮上海海洋大学海洋生物资源与管理学院国家远洋渔业工程技术研究中心大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室农业农村部大洋渔业可持续利用重点实验室

为深入了解柔鱼食性，探明其在食物网中的位置和生态功能价值，根据2022年6—8月于西北太平洋公海采集的15尾柔鱼样本，采用高通量测序技术分析其食物组成。结果显示，15尾样品的高通量序列为646980条，通过聚类分析共得到624个运算分... 详细信息

为深入了解柔鱼食性，探明其在食物网中的位置和生态功能价值，根据2022年6—8月于西北太平洋公海采集的15尾柔鱼样本，采用高通量测序技术分析其食物组成。结果显示，15尾样品的高通量序列为646980条，通过聚类分析共得到624个运算分类单元(OTU)，经筛选比对检测到的饵料共计65种，分属6门11纲22目37科51属。研究表明，柔鱼主要摄食头足类、鱼类以及多种浮游动物(包括磷虾类、介形类、水母类等)。优势饵料包括拟沙丁鱼、日本爪乌贼、北方拟黵乌贼、萤乌贼、尾棘背灯鱼等。柔鱼摄食范围广，饵料物种与海区的天然饵料有关；不同胴长组柔鱼表现出不同的摄食偏好。通过柔鱼胃含物的全组成分析，对深度挖掘摄食与柔鱼生长、洄游、繁殖等生活史的关系有重要作用，同时为基于生态系统角度的柔鱼资源可持续开发和养护提供科学依据。

关键词：柔鱼食性高通量测序西北太平洋胃含物

2019年夏季西白令海狭鳕胃含物组成及其影响因素

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上海海洋大学学报 2022年第6期31卷 1514-1521页

作者：朱国平林伊元上海海洋大学海洋科学学院上海201306 上海海洋大学极地研究中心上海201306 大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室极地海洋生态系统研究室上海201306 国家远洋渔业工程技术研究中心上海201306

基于西白令海外陆架水域的狭鳕(Gadus chalcogrammus)样本,分析了西白令海夏季狭鳕胃含物组成,采用广义狄利克雷多项分布模型(generalized dirichlet-multinomial model, GDM)分析了胃含物组成的影响因素。研究结果显示,狭鳕胃含物主要... 详细信息

基于西白令海外陆架水域的狭鳕(Gadus chalcogrammus)样本,分析了西白令海夏季狭鳕胃含物组成,采用广义狄利克雷多项分布模型(generalized dirichlet-multinomial model, GDM)分析了胃含物组成的影响因素。研究结果显示,狭鳕胃含物主要由5种浮游动物类群组成,即磷虾类、端足类、桡足类、毛颚类和甲壳动物幼体。其中,磷虾类和桡足类数目最多,占狭鳕胃含物浮游动物数量的85%。狭鳕存在同类相食的现象,约占29%,同类相食的狭鳕个体胃含物中浮游动物的数量明显减少,且体长大于50 cm的狭鳕个体胃含物中几乎仅摄食同类。GDM模型结果表明,狭鳕性腺指数(gonadosomatic index, GSI)与胃含物质量对胃含物组成具有较为显著的影响,胃含物中端足类、桡足类和磷虾类3种浮游动物的数量占比随性腺指数增加逐渐减少,随胃含物质量增加而增加。研究结果可为进一步探讨白令海食物网结构提供基础数据。

关键词：狭鳕摄食磷虾胃含物白令海

2020年夏季南极南奥克尼群岛裘氏鳄头冰鱼胃含物组成及食性分析

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上海海洋大学学报 2023年第2期32卷 369-376页

作者：朱久阳罗旭朱国平上海海洋大学海洋科学学院上海201306 上海海洋大学极地研究中心上海201306 大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室极地海洋生态系统研究室上海201306 国家远洋渔业工程技术研究中心上海201306

裘氏鳄头冰鱼(Champsocephalus gunnari)作为南大洋冰鱼科(Channichthyidae)的代表,不仅具有重要的经济价值,同时也是南大洋生态系统中的重要物种。裘氏鳄头冰鱼主要摄食南极磷虾,同时也是高营养级生物的捕食对象。研究裘氏鳄头冰鱼的食... 详细信息

裘氏鳄头冰鱼(Champsocephalus gunnari)作为南大洋冰鱼科(Channichthyidae)的代表,不仅具有重要的经济价值,同时也是南大洋生态系统中的重要物种。裘氏鳄头冰鱼主要摄食南极磷虾,同时也是高营养级生物的捕食对象。研究裘氏鳄头冰鱼的食性,对于了解南极磷虾种群资源变动,预测高营养级生物的生存和发育至关重要。对南奥克尼群岛裘氏鳄头冰鱼的胃含物分析表明,该鱼种的饵料分为南极磷虾(Euphausia superba)和长脚虫戎(Themisto gaudichaudii)两大类,其中:南极磷虾在裘氏鳄头冰鱼食物组成中占绝对优势,其出现频率和数量百分比分别为100%和99.9%;剩余饵料为长脚虫戎。广义线性模型(Generalized linear model, GLM)分析结果显示,空间因素(经度)有显著影响,即裘氏鳄头冰鱼摄食南极磷虾的数量与距南奥克尼群岛的距离成正比。裘氏鳄头冰鱼体长-胃含物质量关系为S_(M)=6.639 6e^(0.017 9L),胃含物质量和日消化量随着体长的增加而增加,而日消化率为0.98%~2.08%。研究结果可为了解裘氏鳄头冰鱼摄食生态学提供基础信息,为南奥克尼群岛裘氏鳄头冰鱼资源养护提供参考。

关键词：裘氏鳄头冰鱼南极磷虾食性胃含物南极半岛北侧

基于镜检和高通量测序技术的铜锈环棱螺胃含物分析

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淡水渔业 2023年第2期53卷 84-93页

作者：张灿灿张丹丹王志强罗福广文衍红蒋明李艳和华中农业大学水产学院/水产养殖国家级实验教学示范中心武汉430070 广西柳州市渔业技术推广站广西柳州545006 中国水产科学研究院长江水产研究所武汉430223

以养殖的铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa)为研究对象,采用镜检和高通量测序技术分析其胃含物情况。结果显示:铜锈环棱螺的摄食率为86.87%,其胃含物以浮游植物和碎屑为主,其中胃内主要的食物成分是小球藻(Chlorella)和裸藻(Euglena),后... 详细信息

以养殖的铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa)为研究对象,采用镜检和高通量测序技术分析其胃含物情况。结果显示:铜锈环棱螺的摄食率为86.87%,其胃含物以浮游植物和碎屑为主,其中胃内主要的食物成分是小球藻(Chlorella)和裸藻(Euglena),后肠中则以隐藻和颤藻为主;铜锈环棱螺胃内微生物菌群主要由变形菌门、放线菌门、拟杆菌门、厚壁菌门等23门和盐单胞菌属(Halomonas)、乳球菌属(Lactococcus)、肉杆菌属(Carnobacterium)等88属组成,其中真菌类群主要由子囊菌门、担子菌门等5门和马拉色氏霉菌属(Malassezia)、曲霉菌属(Aspergillus)、被孢霉属(Mortierella)等50属组成。研究结果可为铜锈环棱螺饵料生物学和生态食物网研究提供基础资料,为开展其人工养殖提供基础生物学基础。

关键词：铜锈环棱螺(Bellamya aeruginosa) 胃含物高通量测序显微镜镜检

6种大型海洋掠食性鱼类胃含物角质颚分类研究

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渔业科学进展 2022年第4期43卷 105-115页

作者：欧利国顾心雨王冰妍刘必林上海海洋大学海洋科学学院上海201306 上海海洋大学信息学院上海201306 国家远洋渔业工程技术研究中心农业农村部大洋渔业开发重点实验室大洋渔业资源可持续开发教育部重点实验室上海201306

为了研究大型海洋掠食性鱼类胃含物中角质颚的分类效果,于2017年10月,2018年3、5和11月,收集了南大西洋、中东太平洋和西印度洋海域的大型海洋掠食性鱼类的36个胃并分析其残留角质颚的形态。对采集的角质颚形态侧视图和顶视图进行种类鉴... 详细信息

为了研究大型海洋掠食性鱼类胃含物中角质颚的分类效果,于2017年10月,2018年3、5和11月,收集了南大西洋、中东太平洋和西印度洋海域的大型海洋掠食性鱼类的36个胃并分析其残留角质颚的形态。对采集的角质颚形态侧视图和顶视图进行种类鉴定,建立检索表,提取椭圆傅里叶描述子(EFDs)系数进行聚类分析。结果显示,通过对胃含物角质颚形态进行种类鉴定,共发现头足类2目10科17种。根据角质颚形态分类检索分析,17种头足类角质颚形态种间差异明显。枪形目(Teuthoidea)的13种头足类角质颚喙部形态分别为三角形和等腰三角形,侧壁为近似菱形,翼部发达;八腕目(Octopoda)的4种头足类角质颚有喙部发育,侧壁近似长四边形,有翼部发育。角质颚形态信息聚类分析在目级别区分效果显著。通过对胃含物角质颚形态进行分类研究,不仅可佐证胃含物头足类的识别,而且丰富了胃含物头足类的鉴定内容,也为大型海洋掠食性鱼类胃含物头足类分类鉴定体系奠定基础。

关键词：头足类角质颚下颚大型海洋掠食性鱼类胃含物分类检索聚类分析

长江口和杭州湾凤鲚胃含物与海洋浮游动物的种类组成比较

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生态学报 2011年第8期31卷 2263-2271页

作者：刘守海徐兆礼厦门大学海洋学系厦门361005 中国水产科学研究院东海水产研究所农业部海洋与河口渔业重点开放实验室上海200090

2009年6月—8月期间在长江口及杭州湾水域收集了1355尾的凤鲚(Coilia mystus)标本,对其胃含物进行分析,同步采集了取样点附近的浮游动物,比较了凤鲚胃含物食谱与该海域浮游动物种类组成的相似性。结果表明:对浮游动物主要种类而言,河口... 详细信息

2009年6月—8月期间在长江口及杭州湾水域收集了1355尾的凤鲚(Coilia mystus)标本,对其胃含物进行分析,同步采集了取样点附近的浮游动物,比较了凤鲚胃含物食谱与该海域浮游动物种类组成的相似性。结果表明:对浮游动物主要种类而言,河口性的长额刺糠虾(Acanthomysis longirostris)的相对重要性指数(IRI)为703.25,占相对重要性指数总和百分比(%IRI)为39.65%,远远超过其它种类,包括任何一个桡足类优势种,因而是凤鲚食谱中的最重要的种类。凤鲚摄食的其它主要种类包括:火腿许水蚤(Schmackeria poplesia)(IRI=261.04),虫肢歪水蚤(Tortanus vermiculus)(IRI=107.53)、真刺唇角水蚤(Labidocera euchaeta)(IRI=27.27)。以上4种浮游动物%IRI合计为61.96%。在被摄食种类中占优势。因而是凤鲚饵料中最重要的优势种。胃含物和海域浮游动物之间的相似度值大致在0.363—0.365之间;而两者桡足类之间的相似度值在0.521—0.575之间。由此推测凤鲚对个体较小的桡足类采用过滤性摄食,对这些种类的选择性较低。而对个体较大的糠虾则是有选择性追逐摄食。

关键词：凤鲚长江口杭州湾胃含物饵料组成浮游动物

长江口盐沼湿地无齿螳臂相手蟹(Chiromantes dehaani)胃含物特征与取食偏好

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生态学杂志 2018年第7期37卷 2059-2066页

作者：张元童春富华东师范大学河口海岸学国家重点实验室上海200062 崇明生态研究院上海200062

无齿螳臂相手蟹(Chiromantes dehaani)是长江口盐沼湿地大型底栖动物的优势物种,其食性及行为特征对区域生态系统结构与功能的维系具有重要作用。在崇明北滩盐沼湿地取样调研的基础上,通过胃含物分析与室内喂食实验,分析了无齿螳臂相手... 详细信息

无齿螳臂相手蟹(Chiromantes dehaani)是长江口盐沼湿地大型底栖动物的优势物种,其食性及行为特征对区域生态系统结构与功能的维系具有重要作用。在崇明北滩盐沼湿地取样调研的基础上,通过胃含物分析与室内喂食实验,分析了无齿螳臂相手蟹的食性及其影响因子。结果表明:植物叶片是无齿螳臂相手蟹的主要食物来源,沉积物次之;其对不同叶片的取食量有着明显的差异,具体表现为对芦苇嫩叶的取食量最高,占35.7%,对芦苇凋落叶片的取食量最少,占6.8%;不同样地间不同性别无齿螳臂相手蟹的食物组成也有明显的差异;在野外情况下,无齿螳臂相手蟹对植物的取食受其自身体重、壳宽、螯高的影响较大;室内投喂情况下,无齿螳臂相手蟹对新鲜芦苇嫩叶存在明显的取食偏好(P物及其自身生长特征等多种因素的影响。

关键词：盐沼湿地无齿螳臂相手蟹胃含物取食偏好

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太平洋中东部海域大眼金枪鱼胃含物分析

南方水产科学 2015年第1期11卷 75-80页

作者：郑晓春戴小杰朱江峰陈彦高春霞吴峰张艳波上海海洋大学海洋科学学院、大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室、农业部大洋渔业资源环境科学观测实验站、国家远洋渔业工程技术研究中心上海201306

大眼金枪鱼(Thunnus obesus)是金枪鱼延绳钓的主要捕捞对象,分析其胃含物组成有助于更好地认识其摄食特征。根据2010年9月至2011年1月在太平洋中东部海域延绳钓渔业中采集的大眼金枪鱼胃含物样品,采样传统胃含物分析法对大眼金枪鱼摄食... 详细信息

大眼金枪鱼(Thunnus obesus)是金枪鱼延绳钓的主要捕捞对象,分析其胃含物组成有助于更好地认识其摄食特征。根据2010年9月至2011年1月在太平洋中东部海域延绳钓渔业中采集的大眼金枪鱼胃含物样品,采样传统胃含物分析法对大眼金枪鱼摄食种类组成、多样性和摄食强度进行研究。结果表明,大眼金枪鱼的胃含物主要包括鱼类、头足类和甲壳类,其中优势饵料生物隶属于柔鱼科、褶胸鱼科和蛇鲭科。摄食强度组成随叉长变化而显著变化(单因素方差分析,P胃的个体所占比例很高,且随性腺成熟度增加而增大,成熟度Ⅰ期至Ⅴ期的空胃率依次为32.7%、38.4%、47.5%、50.7%和50.7%。摄食强度组成不存在显著的性别间差异(K-S检验,P>0.05)。各月份摄食强度组成差异显著(单因素方差分析,P<0.05),10月平均摄食强度最高,1月最低。

关键词：太平洋中东部大眼金枪鱼胃含物摄食特性

西北太平洋公海日本鲭(Scomber japonicus)胃含物及其摄食等级研究

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中国农业科技导报 2020年第1期22卷 138-148页

作者：唐峰华戴澍蔚樊伟崔雪森张衡中国水产科学研究院东海水产研究所农业农村部东海与远洋渔业资源开发利用重点实验室上海200090 上海海洋大学海洋科学学院上海201306

为了解我国公海灯光围网渔业开发现状及其主要渔获经济品种的基础生物学及其食性特征,根据2016年8-11月及2017年4-11月在西北太平洋公海生产船取样的日本鲭(Scomber japonicus)基础生物学现场测定数据,对其食性特征、摄食等级、生态位... 详细信息

为了解我国公海灯光围网渔业开发现状及其主要渔获经济品种的基础生物学及其食性特征,根据2016年8-11月及2017年4-11月在西北太平洋公海生产船取样的日本鲭(Scomber japonicus)基础生物学现场测定数据,对其食性特征、摄食等级、生态位宽度等进行研究。结果表明,西北太平洋日本鲭主要摄食虾类、鱼类和桡足类等9大类16小类饵料生物,其中,虾类是最重要的饵料种类,以磷虾类最多;鱼类以未定种鱼类和远东拟沙丁鱼(Sardinops sagax)为主,鱼类饵料的质量百分比(W)比虾类高,但数量比例(N)不及虾类一半。日本鲭在夏、秋季比冬、春季胃含物种类的丰富度、摄食等级相对更高,具有一定的季节性变化。叉长小于300 mm或体质量小于300 g的日本鲭摄食强度与胃饱满指数(P)无明显变化;叉长大于300 mm或体质量大于300 g时,摄食等级与胃饱满指数均随体长或体质量增大呈现增大趋势;叉长大于300 mm的日本鲭由于摄食更多大型饵料,生态位宽度比叉长小于300mm的日本鲭普遍低。结果为今后西北太平洋日本鲭渔业的资源管理及可持续开发提供基础依据。

关键词：西北太平洋公海日本鲭胃含物食性特征摄食等级