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中国微生态学杂志 2025年第1期37卷 83-88+93页

作者：唐芳戴慧萍吴昌慧郭晓芬邱慧芳赣州市人民医院体检中心

目的本研究旨在探讨肿瘤微生物和肠道特异性菌群联合常规超声在乳腺癌辅助诊断中的相关性及其潜在应用价值。方法本研究纳入2020年1月至2023年12月期间确诊的108例乳腺癌患者及54例良性对照，采集患者及对照者的粪便样本，采用16S rRN... 详细信息

目的本研究旨在探讨肿瘤微生物和肠道特异性菌群联合常规超声在乳腺癌辅助诊断中的相关性及其潜在应用价值。方法本研究纳入2020年1月至2023年12月期间确诊的108例乳腺癌患者及54例良性对照，采集患者及对照者的粪便样本，采用16S rRNA基因高通量测序分析肠道菌群的多样性和组间差异。同时，采集乳腺癌组织样本及良性患者结节组织样本，利用宏基因组学技术解析肿瘤微生物群特征。通过常规超声技术评估乳腺癌病灶的形态学和声学特征，结合菌群特征分析其与乳腺癌的病理特征相关性。采用受试者工作特征（ROC）曲线评估肿瘤微生物、肠道菌群及超声影像特征对乳腺癌诊断的联合效能。结果乳腺癌患者的肠道菌群物种丰富度（Chao1指数）和多样性（Shannon指数）均显著低于健康良性组（P肿瘤微生物群表现出乳酸杆菌属和拟杆菌属丰度显著减少，普雷沃菌属和梭菌属丰度显著增加（P肿瘤微生物群及肠道特异性菌群与乳腺癌的发生、进展密切相关，联合常规超声检测有助于提高乳腺癌的辅助诊断效能，具有潜在临床应用价值。

关键词：乳腺癌肿瘤微生物肠道菌群常规超声高通量测序

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高通量测序分析乳腺癌微生物群落特征

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中华实验外科杂志 2023年第10期40卷 2000-2003页

作者：常靖杨慧李想李永杨淑敏夏庆欣张贺郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院医务部郑州450008 西北工业大学生命学院西安710072 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院乳腺科郑州450008 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院病理科郑州450008

目的分析乳腺癌患者肿瘤组织与癌旁组织微生物菌群多样性,筛选乳腺癌患者肿瘤组织中的特异性细菌。方法分析2021年2月至9月河南省肿瘤医院行乳腺癌根治术切除的20例乳腺癌患者的肿瘤组织(TT组)与配对瘤旁组织(TN组),采用Illumina HiSeq... 详细信息

目的分析乳腺癌患者肿瘤组织与癌旁组织微生物菌群多样性,筛选乳腺癌患者肿瘤组织中的特异性细菌。方法分析2021年2月至9月河南省肿瘤医院行乳腺癌根治术切除的20例乳腺癌患者的肿瘤组织(TT组)与配对瘤旁组织(TN组),采用Illumina HiSeq高通量测序技术对乳腺癌患者组织样本进行细菌V3-V4区的16S rDNA测序及生物信息学分析,采用t检验进行计数资料比较。结果在门水平上,TT组与TN组的微生物菌群主要由变形菌门、放线菌门、厚壁菌门和拟杆菌门组成,累计含量>60%。微生物多样性分析显示,Chao1指数TN组比TT组为10167.59±2929.38比9044.89±2735.11(t=1.09,P>0.05),Ace指数TN组比TT组为12571.96±2859.65比11704.53±2855.75(t=0.81,P>0.05)。Beta多样性显示两组菌群结构差异有统计学意义(R=0.27,P微生物群落结构存在明显差异,其中假单胞菌属、链球菌属等为差异微生物有助于筛选标志物。

关键词：肿瘤微生物 16S rDNA 乳腺癌多样性

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多形拟杆菌对肺癌细胞生物学行为及转录组基因表达的影响

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中华实验外科杂志 2023年第12期40卷 2511-2515页

作者：常靖李想崔湘铧王总飞郭永军张贺郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院医务部郑州450008 西北工业大学生命学院西安710072 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院病理科郑州450008 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院胸外科郑州450008 郑州大学附属肿瘤医院/河南省肿瘤医院分子病理科郑州450008 河南省分子病理学重点实验室郑州450008

目的探讨多形拟杆菌对肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及转录组基因表达的影响。方法选用肺癌细胞系H1975和SK-MES-1,以细菌培养基为对照组,多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)上清液为处理组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析两组细胞... 详细信息

目的探讨多形拟杆菌对肺癌细胞增殖、迁移、侵袭及转录组基因表达的影响。方法选用肺癌细胞系H1975和SK-MES-1,以细菌培养基为对照组,多形拟杆菌(Bacteroides thetaiotaomicron)上清液为处理组。采用细胞计数试剂盒(CCK-8)分析两组细胞的增殖能力,采用划痕实验和Transwell实验分析两组细胞迁移及侵袭能力,通过转录组筛选两组细胞差异表达的基因,通过基因本体(GO)富集分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)富集分析,探究差异基因集中的具体通路。组间比较采用t检验进行统计分析。结果与细菌培养基组比较,H1975细胞系和SK-MES-1细胞系中,细菌处理组细胞的增殖率显著下降(0.767±0.063比1.000±0.047、0.707±0.049比1.000±0.124),差异有统计学意义(t=7.827、5.838,P均生物学行为,发挥抑癌作用。

关键词：肿瘤微生物多形拟杆菌肺癌转录组测序

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嗜麦芽窄食单胞菌促进肺腺癌进展的机制研究

嗜麦芽窄食单胞菌促进肺腺癌进展的机制研究

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作者：沈吉禹江南大学

学位级别：硕士

背景:肺癌目前的发病率位居全球肿瘤发病率首位,且是目前癌症死亡的主要原因,而肺腺癌是肺癌中最常见的病理分型。近年来随着基因测序技术的发展,多项研究表明下呼吸道存在着丰富的微生物群,肺癌患者相较于健康人呼吸道的微生物组成存... 详细信息

背景:肺癌目前的发病率位居全球肿瘤发病率首位,且是目前癌症死亡的主要原因,而肺腺癌是肺癌中最常见的病理分型。近年来随着基因测序技术的发展,多项研究表明下呼吸道存在着丰富的微生物群,肺癌患者相较于健康人呼吸道的微生物组成存在明显差异,且在肺部肿瘤的内部也发现了细菌的存在。肺部共生菌群可以促进肺癌的发生发展,但其中关键微生物及其具体作用机制尚不明确。目的:本研究目的在于探究肺腺癌肿瘤内部微生物群落的构成,通过结合患者不同临床特征,对肺腺癌肿瘤内部的差异微生物进行分析,寻找与肿瘤发生发展密切相关的潜在关键微生物,并且利用动物实验及细胞实验探究其导致肺腺癌肿瘤进展的分子机制。方法:我们首先搜集了53名肺腺癌患者肿瘤组织样本的石蜡切块,使用16S r RNA基因高通量测序技术,对肺腺癌肿瘤内部的细菌进行检测,并且根据临床特征进行分组分析,寻找与肿瘤进展密切相关的潜在关键微生物,并利用荧光原位杂交技术(FISH)进行验证。进而利用肺癌易感A/JGpt小鼠,通过腹腔注射4-(甲基亚硝氨基)-1-(3-吡啶基)-1-丁酮(NNK)成功建立了小鼠原位肺腺癌肿瘤模型,通过支气管注射的方式将***注射进小鼠肺部,观察肺部细菌的改变对小鼠肿瘤进展的影响,通过转录组测序技术研究小鼠肺部基因变化的情况,随后将细菌与A549肺癌细胞系共培养,利用CCK-8及小室迁移检测细胞生长及迁移,并利用小RNA干扰沉默HDAC5基因,进一步验证结论。结果:我们通过对临床肺腺癌患者肿瘤组织样本的16S r RNA基因高通量测序数据分析发现原发肿瘤大小>3cm组比≤3cm组的细菌α多样性下调,表明其物种丰富度更低,而β多样性的分析表明吸烟组与非吸烟组肿瘤内部微生物的构成存在差异,且原始肿瘤大小不同的肺腺癌肿瘤内部的细菌β多样性也存在着明显差异。在细菌物种构成上,我们发现肿瘤样本内部丰度较高的细菌分别是变形菌门、放线菌门、厚壁菌门以及拟杆菌门;属水平上,肿瘤组织内主要富集的细菌为大肠志贺氏杆菌属、不动杆菌属、叶瘤杆菌属、鞘脂单胞菌属、寡养单胞菌属(Stenotrophomonas)、罗尔斯通菌属、棒状杆菌属、水杆状菌属以及甲基杆菌属。进一步通过LEf Se(LDA Effect Size)分析发现在非吸烟组和原发肿瘤大小>3cm组中Stenotrophomonas均具有显著性的丰度升高,并且我们发现Stenotrophomonas的丰度与原发肿瘤大小具有正相关,最后利用荧光原位杂交实验证实了***在肺腺癌组织内部存在。小鼠体内实验数据表明支气管注射***(ATCC 13637)可以引发肺部炎症反应并促进NNK诱导的肺癌小鼠模型的肿瘤进展。相比于CTL组,***组小鼠肺部出现了不同程度的炎性浸润的情况,部分肺泡间隔出现破坏,且部分气道黏膜上皮出现萎缩。相比于NNK造模组,NNK＿***组小鼠肺部肿瘤负荷更重,通过免疫组化实验观察到肿瘤内Ki-67阳性率也明显增加。肺组织转录组测序结果发现相比于NNK组,NNK＿***组中有多种肿瘤相关通路的上调,爱帕琳肽信号通路(Apelin signaling pathway)是在NNK组与NNK＿***组中差异最显著的富集通路,其中组蛋白去乙酰化酶5(HDAC5)基因在***组和NNK＿***组均有明显上调。体外细胞实验中,我们发现***直接接触可以显著促进A549肺腺癌肿瘤细胞的增殖和迁移能力,并且我们发现HDAC5的表达量在基因和蛋白水平均明显增高,在基因沉默实验中将HDAC5基因沉默后我们发现HDAC5沉默后可以显著抑制细胞增殖和迁移,并且还可以减弱***对肿瘤细胞增殖和迁移的效应。结论:我们的研究证实了临床原发肿瘤大小大于3cm的患者和从不吸烟的患者的肺腺癌组织中Stenotrophomonas丰度明显增加,小鼠肺部定植***促进肺腺癌进展,体外***直接作用肺腺癌细胞也可促进细胞增殖和迁移,具体作用机制可能与其上调HDAC5基因表达有关。

关键词：肺腺癌肿瘤微生物嗜麦芽窄食单胞菌高通量测序爱帕琳肽信号通路

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乳酸菌及其代谢物吲哚乙酸通过AhR激活TAM免疫改善胃癌的发生发展

乳酸菌及其代谢物吲哚乙酸通过AhR激活TAM免疫改善胃癌的发生发展

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浙江省免疫学会第十三次学术大会

作者：杨睿杨艳何凯凯滕理送浙江大学医学院附属第一医院西安交通大学附属第二医院

背景:胃癌是世界范围内普遍存在的胃肠道恶性肿瘤,具有很高的发病率和死亡率。胃癌的发病是一个复杂且多因素的过程,受遗传和环境因素的影响,具有不同的发病机制。越来越多的证据表明胃内微生物群的失衡以及微生物衍生代谢物的改变与胃... 详细信息

背景:胃癌是世界范围内普遍存在的胃肠道恶性肿瘤,具有很高的发病率和死亡率。胃癌的发病是一个复杂且多因素的过程,受遗传和环境因素的影响,具有不同的发病机制。越来越多的证据表明胃内微生物群的失衡以及微生物衍生代谢物的改变与胃癌有关。研究目的:探究胃内微生物菌群失调导致的微生物衍生代谢物3-吲哚乙酸的减少对胃癌发生发展的影响。材料和方法:16s rRNA、scRNA-seq和靶向代谢组检测结果:我们发现AhR是TAM促瘤表型和抑制炎性T细胞成熟的核心驱动因素,其抑制作用改善了对免疫检查点封闭的反应,使TAM表型极化转移到促炎状态。TAMs中的AhR功能缺失可激活自身免疫功能进而调控T细胞,促进IFNγ释放以杀伤更多的肿瘤细胞。胃部微生物代谢失衡导致乳酸菌含量下降,乳酸菌代谢产生的吲哚乙酸(IAA)可激活GC TAMs中AhR活性,促进肿瘤生长和免疫抑制过程。同时,在GC小鼠中胃部乳酸菌可借助饮食中获取的吲哚乙酸激活AhR功能活性,促进GC肿瘤生长和免疫抑制过程。结论:胃部微生物群失衡导致乳酸菌及其代谢物吲哚乙酸含量下降,导致AhR功能缺失,促进肿瘤生长,抑制TAM免疫功能。综上,该研究为开发IAA治疗或益生菌和饮食结合的肿瘤治疗策略提供了新线索,并提示微生物产生的AhR配体(IAA)或有助于患者对ICI的应答

关键词：胃癌 AhR 免疫检查点抑制剂吲哚乙酸肿瘤微生物

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